More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2109 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2109  MscS Mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 306 aa  618  1e-176  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0569  MscS Mechanosensitive ion channel  45.83 
 
 		 280 aa  237  2e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.912877  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1062  MscS Mechanosensitive ion channel  46.88 
 
 		 310 aa  228  8e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.771269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2381  MscS mechanosensitive ion channel  46.75 
 
 		 287 aa  224  1e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.42777  hitchhiker  0.00000285336 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3051  MscS mechanosensitive ion channel  45.08 
 
 		 285 aa  223  3e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0787633 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2355  MscS mechanosensitive ion channel  38.25 
 
 		 295 aa  195  7e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0549147  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1320  MscS Mechanosensitive ion channel  38.83 
 
 		 300 aa  154  2e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.23225 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2295  mechanosensitive ion channel family protein  35.6 
 
 		 289 aa  142  8e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1775  MscS mechanosensitive ion channel  30.71 
 
 		 283 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1552  MscS mechanosensitive ion channel  30.49 
 
 		 359 aa  125  8.000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.101944 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0359  MscS mechanosensitive ion channel  30.08 
 
 		 360 aa  124  1e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.821631  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1074  MscS mechanosensitive ion channel  29 
 
 		 360 aa  120  3e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.287098  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1689  MscS mechanosensitive ion channel  31.07 
 
 		 356 aa  116  6e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0476  MscS mechanosensitive ion channel  28.93 
 
 		 279 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.139506  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1746  mechanosensitive ion channel family protein  29.18 
 
 		 531 aa  113  4.0000000000000004e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0613  MscS mechanosensitive ion channel  29.13 
 
 		 547 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000873032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2981  hypothetical protein  29.63 
 
 		 298 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0759175  normal  0.0858863 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1438  MscS mechanosensitive ion channel  30 
 
 		 840 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.139296  normal  0.137989 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3200  MscS Mechanosensitive ion channel  33.51 
 
 		 275 aa  110  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126037  normal  0.165541 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1770  MscS mechanosensitive ion channel  36.75 
 
 		 406 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0955  MscS mechanosensitive ion channel  27.49 
 
 		 298 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1034  MscS mechanosensitive ion channel  28.65 
 
 		 288 aa  110  3e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0971  MscS mechanosensitive ion channel  33.17 
 
 		 272 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0975842 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2546  small-conductance mechanosensitive channel  26.39 
 
 		 286 aa  107  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.748104  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1701  phosphoglycerate mutase  26.8 
 
 		 310 aa  107  2e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2469  putative transport protein  28.78 
 
 		 269 aa  107  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0553  MscS mechanosensitive ion channel  31.17 
 
 		 874 aa  106  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.362584 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0625  small-conductance mechanosensitive ion channel  25.96 
 
 		 291 aa  105  1e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.286405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2101  MscS Mechanosensitive ion channel  27.71 
 
 		 299 aa  105  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172333  normal  0.177745 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0444  MscS mechanosensitive ion channel  27.75 
 
 		 540 aa  104  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00921  small conductance mechanosensitive ion channel  28.29 
 
 		 322 aa  104  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.230623  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03562  hypothetical protein  26.3 
 
 		 288 aa  103  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3468  MscS mechanosensitive ion channel  28.17 
 
 		 550 aa  103  3e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0592  small conductance mechanosensitive ion channel  27.83 
 
 		 305 aa  103  3e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.311151  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3168  MscS Mechanosensitive ion channel  28.33 
 
 		 311 aa  103  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0116515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3659  MscS mechanosensitive ion channel  32.54 
 
 		 439 aa  103  4e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.19276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0091  MscS mechanosensitive ion channel  24.29 
 
 		 267 aa  103  4e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5986  MscS Mechanosensitive ion channel  27.45 
 
 		 337 aa  103  5e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0562  MscS mechanosensitive ion channel  28.17 
 
 		 551 aa  103  5e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0561  MscS mechanosensitive ion channel  28.17 
 
 		 551 aa  103  5e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3719  MscS mechanosensitive ion channel  27.27 
 
 		 538 aa  102  6e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00173633  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0547  MscS mechanosensitive ion channel  27.36 
 
 		 305 aa  102  6e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.881892  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0822  MscS mechanosensitive ion channel  31.71 
 
 		 847 aa  102  7e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0649099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2148  small conductance mechanosensitive Ion channel  31.71 
 
 		 847 aa  102  7e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.667496  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1895  MscS Mechanosensitive ion channel  32.4 
 
 		 286 aa  102  7e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.461855 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0730  MscS mechanosensitive ion channel  24.29 
 
 		 267 aa  102  8e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.506108  normal  0.245277 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1152  MscS mechanosensitive ion channel  28.71 
 
 		 274 aa  102  8e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0163398  normal  0.0148083 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1417  MscS Mechanosensitive ion channel  26.87 
 
 		 304 aa  102  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5106  MscS mechanosensitive ion channel  29.76 
 
 		 292 aa  102  8e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0140126  decreased coverage  0.0019989 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1533  MscS Mechanosensitive ion channel  27.63 
 
 		 276 aa  102  9e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1350  hypothetical protein  28.23 
 
 		 292 aa  102  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.136839  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01983  MscS Mechanosensitive ion channel ei VT8  26.19 
 
 		 279 aa  101  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.865643  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4338  MscS mechanosensitive ion channel  26.87 
 
 		 533 aa  101  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1036  putative mechanosensitive ion channel protein  24.43 
 
 		 534 aa  100  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1345  MscS mechanosensitive ion channel  30.34 
 
 		 274 aa  101  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000767633  hitchhiker  0.0000248019 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002474  small-conductance mechanosensitive channel  26.67 
 
 		 288 aa  100  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1188  MscS mechanosensitive ion channel  23.48 
 
 		 267 aa  101  2e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.765639  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3256  MscS mechanosensitive ion channel  29.76 
 
 		 292 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00789281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0360  MscS mechanosensitive ion channel  24.71 
 
 		 393 aa  100  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2326  MscS mechanosensitive ion channel  30.61 
 
 		 1127 aa  100  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3375  MscS mechanosensitive ion channel  31.25 
 
 		 302 aa  100  3e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.190462  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3803  MscS mechanosensitive ion channel  27.75 
 
 		 549 aa  100  4e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.717222  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4903  MscS mechanosensitive ion channel  28.26 
 
 		 327 aa  100  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3929  MscS mechanosensitive ion channel  27.75 
 
 		 549 aa  100  4e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0521  MscS mechanosensitive ion channel  27.98 
 
 		 200 aa  100  4e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.108923  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0514  MscS Mechanosensitive ion channel  29.94 
 
 		 288 aa  100  4e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3747  MscS Mechanosensitive ion channel  27.75 
 
 		 549 aa  100  4e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002898  small-conductance mechanosensitive channel  27.27 
 
 		 532 aa  99.8  5e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.341732  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0032  hypothetical protein  26.02 
 
 		 287 aa  99.4  7e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.20954  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0820  MscS mechanosensitive ion channel  31.53 
 
 		 849 aa  99.4  7e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0343003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2137  MscS mechanosensitive ion channel  22.26 
 
 		 288 aa  99.4  7e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.857102  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3620  MscS mechanosensitive ion channel  28.02 
 
 		 277 aa  99  9e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.812148  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1856  hypothetical protein  27.31 
 
 		 281 aa  98.2  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.130527  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0589  MscS mechanosensitive ion channel  25 
 
 		 291 aa  98.2  1e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.516163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2842  MscS mechanosensitive ion channel  26.97 
 
 		 369 aa  98.6  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3521  MscS mechanosensitive ion channel  28.27 
 
 		 547 aa  98.6  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2465  putative small-conductance mechanosensitive channel  26.09 
 
 		 275 aa  98.6  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.404234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2529  MscS Mechanosensitive ion channel  30 
 
 		 864 aa  97.8  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03062  hypothetical protein  27.75 
 
 		 563 aa  98.2  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3343  mechanosensitive ion channel protein  32.66 
 
 		 813 aa  97.8  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.183155 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1797  mechanosensitive ion channel  26.58 
 
 		 561 aa  97.1  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.433096  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3045  potassium efflux protein KefA  27.66 
 
 		 1133 aa  97.4  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2983  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  30.18 
 
 		 1144 aa  97.4  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0945  potassium efflux protein KefA  29.17 
 
 		 1115 aa  96.7  4e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.612496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0914  MscS mechanosensitive ion channel  27.59 
 
 		 842 aa  97.1  4e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707445 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1245  MscS mechanosensitive ion channel  26.92 
 
 		 274 aa  96.7  4e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.016266  normal  0.622604 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2740  MscS mechanosensitive ion channel  25.2 
 
 		 288 aa  96.3  5e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1674  MscS mechanosensitive ion channel  28.02 
 
 		 270 aa  96.3  5e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.702305  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1967  MscS Mechanosensitive ion channel  28.36 
 
 		 279 aa  96.7  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.340778 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1862  MscS mechanosensitive ion channel  26.98 
 
 		 867 aa  95.9  7e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3013  MscS mechanosensitive ion channel  32.26 
 
 		 843 aa  95.9  7e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0767  small-conductance mechanosensitive ion channel  28.39 
 
 		 401 aa  95.9  7e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.967765  normal  0.366005 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3340  small-conductance mechanosensitive channel  30.1 
 
 		 275 aa  95.9  8e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4989  MscS mechanosensitive ion channel  28.5 
 
 		 321 aa  95.5  9e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0847315  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3171  MscS mechanosensitive ion channel  28.5 
 
 		 321 aa  95.5  9e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.10941 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1709  small conductance mechanosensitive channel  26.51 
 
 		 494 aa  95.1  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0466336 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0940  MscS mechanosensitive ion channel  32.45 
 
 		 275 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.546965 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0399  potassium efflux protein KefA  29.39 
 
 		 1102 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2675  MscS mechanosensitive ion channel  29.47 
 
 		 275 aa  95.1  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00133263  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0427  MscS mechanosensitive ion channel  28.69 
 
 		 288 aa  95.1  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0918944  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>