More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0569 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0569  MscS Mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 280 aa  560  1.0000000000000001e-159  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.912877  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2381  MscS mechanosensitive ion channel  65.83 
 
 		 287 aa  374  1e-102  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.42777  hitchhiker  0.00000285336 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1062  MscS Mechanosensitive ion channel  63.27 
 
 		 310 aa  359  3e-98  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.771269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3051  MscS mechanosensitive ion channel  63.97 
 
 		 285 aa  338  5e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0787633 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2355  MscS mechanosensitive ion channel  56.36 
 
 		 295 aa  308  5e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0549147  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2109  MscS Mechanosensitive ion channel  45.83 
 
 		 306 aa  237  1e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1320  MscS Mechanosensitive ion channel  41.22 
 
 		 300 aa  211  1e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.23225 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2295  mechanosensitive ion channel family protein  34.45 
 
 		 289 aa  186  5e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1689  MscS mechanosensitive ion channel  35.09 
 
 		 356 aa  167  1e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1701  phosphoglycerate mutase  34.21 
 
 		 310 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1775  MscS mechanosensitive ion channel  34.17 
 
 		 283 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0359  MscS mechanosensitive ion channel  39.13 
 
 		 360 aa  159  5e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.821631  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1552  MscS mechanosensitive ion channel  38.59 
 
 		 359 aa  157  1e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.101944 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1074  MscS mechanosensitive ion channel  34.82 
 
 		 360 aa  155  8e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.287098  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2981  hypothetical protein  29.81 
 
 		 298 aa  150  2e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0759175  normal  0.0858863 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0971  MscS mechanosensitive ion channel  34.98 
 
 		 272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0975842 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3719  MscS mechanosensitive ion channel  32.71 
 
 		 538 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00173633  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0047  MscS mechanosensitive ion channel  31.23 
 
 		 270 aa  145  8.000000000000001e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3172  MscS Mechanosensitive ion channel  38.71 
 
 		 784 aa  142  6e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03562  hypothetical protein  29.32 
 
 		 288 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1202  MscS Mechanosensitive ion channel  28.69 
 
 		 270 aa  140  1.9999999999999998e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.49703  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1335  MscS mechanosensitive ion channel  31.54 
 
 		 275 aa  139  3e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000063147 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3200  MscS Mechanosensitive ion channel  32.2 
 
 		 275 aa  140  3e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126037  normal  0.165541 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0091  MscS mechanosensitive ion channel  29.62 
 
 		 267 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2469  putative transport protein  34.29 
 
 		 269 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0476  MscS mechanosensitive ion channel  29.72 
 
 		 279 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.139506  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0514  MscS Mechanosensitive ion channel  30.54 
 
 		 288 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2296  MscS mechanosensitive ion channel  32.26 
 
 		 270 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0145  MscS Mechanosensitive ion channel  33.46 
 
 		 795 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.584574 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1188  MscS mechanosensitive ion channel  28.41 
 
 		 267 aa  139  6e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.765639  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0730  MscS mechanosensitive ion channel  28.78 
 
 		 267 aa  138  8.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.506108  normal  0.245277 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02755  mechanosensitive channel  32.92 
 
 		 286 aa  138  1e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0769  MscS Mechanosensitive ion channel  32.92 
 
 		 286 aa  138  1e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4221  mechanosensitive channel MscS  32.92 
 
 		 286 aa  138  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3251  mechanosensitive channel MscS  32.92 
 
 		 286 aa  138  1e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3349  mechanosensitive channel MscS  32.92 
 
 		 286 aa  138  1e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3061  mechanosensitive channel MscS  32.92 
 
 		 291 aa  137  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.397816  normal  0.219365 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3082  mechanosensitive channel MscS  32.92 
 
 		 286 aa  138  1e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0786  mechanosensitive channel MscS  32.92 
 
 		 286 aa  138  1e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02718  hypothetical protein  32.92 
 
 		 286 aa  138  1e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1587  MscS mechanosensitive ion channel  36.08 
 
 		 807 aa  136  4e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.370206  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1746  mechanosensitive ion channel family protein  32.85 
 
 		 531 aa  135  7.000000000000001e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1036  putative mechanosensitive ion channel protein  28.97 
 
 		 534 aa  134  9.999999999999999e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2675  MscS mechanosensitive ion channel  31.85 
 
 		 275 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00133263  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3447  mechanosensitive ion channel family protein  38.53 
 
 		 816 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.597927  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1438  MscS mechanosensitive ion channel  39.71 
 
 		 840 aa  134  9.999999999999999e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.139296  normal  0.137989 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0854  MscS mechanosensitive ion channel  32.36 
 
 		 289 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.11552  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3818  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  32.36 
 
 		 289 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.905722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4338  MscS mechanosensitive ion channel  31.23 
 
 		 533 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2546  small-conductance mechanosensitive channel  28.98 
 
 		 286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.748104  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0851  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  32.36 
 
 		 289 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.17895  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2803  MscS mechanosensitive ion channel  31.35 
 
 		 277 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1797  mechanosensitive ion channel  30.12 
 
 		 561 aa  133  3e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.433096  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002474  small-conductance mechanosensitive channel  29.39 
 
 		 288 aa  132  5e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2641  MscS Mechanosensitive ion channel  30.21 
 
 		 280 aa  132  6e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0032  hypothetical protein  29.48 
 
 		 287 aa  132  6e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.20954  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0444  MscS mechanosensitive ion channel  31.65 
 
 		 540 aa  132  9e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0390  MscS mechanosensitive ion channel  30.27 
 
 		 274 aa  132  9e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.855015  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2101  MscS Mechanosensitive ion channel  36.08 
 
 		 299 aa  130  3e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172333  normal  0.177745 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2090  hypothetical protein  28.28 
 
 		 301 aa  130  3e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0955  MscS mechanosensitive ion channel  29.01 
 
 		 298 aa  130  3e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3145  mechanosensitive ion channel  29.88 
 
 		 544 aa  130  3e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.187903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1205  MscS mechanosensitive ion channel  32.3 
 
 		 275 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00184527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1276  MscS mechanosensitive ion channel  32.3 
 
 		 275 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000188457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0360  MscS mechanosensitive ion channel  29.97 
 
 		 393 aa  129  7.000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2273  MscS mechanosensitive ion channel  28.23 
 
 		 258 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3521  MscS mechanosensitive ion channel  29.1 
 
 		 547 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002898  small-conductance mechanosensitive channel  30.2 
 
 		 532 aa  128  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.341732  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3229  mechanosensitive channel MscS  31.65 
 
 		 286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.550002  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0625  small-conductance mechanosensitive ion channel  28.57 
 
 		 291 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.286405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3240  mechanosensitive channel MscS  31.65 
 
 		 286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3307  mechanosensitive channel MscS  31.65 
 
 		 286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3168  MscS Mechanosensitive ion channel  35.27 
 
 		 311 aa  127  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0116515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3409  mechanosensitive channel MscS  31.65 
 
 		 286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.427229  normal  0.109816 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1206  MscS mechanosensitive ion channel  30.74 
 
 		 275 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2465  putative small-conductance mechanosensitive channel  30.04 
 
 		 275 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.404234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3304  mechanosensitive channel MscS  31.65 
 
 		 286 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3397  MscS mechanosensitive ion channel  32.92 
 
 		 291 aa  127  3e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4349  MscS Mechanosensitive ion channel  31.62 
 
 		 285 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2529  MscS Mechanosensitive ion channel  36.27 
 
 		 864 aa  126  3e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1350  hypothetical protein  32.29 
 
 		 292 aa  127  3e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.136839  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0452  MscS mechanosensitive ion channel  31.58 
 
 		 283 aa  126  4.0000000000000003e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00426986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4433  MscS Mechanosensitive ion channel  31.62 
 
 		 285 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4436  MscS Mechanosensitive ion channel  31.62 
 
 		 285 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.312478 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0562  MscS mechanosensitive ion channel  32.51 
 
 		 551 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0561  MscS mechanosensitive ion channel  32.51 
 
 		 551 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2988  putative small-conductance mechanosensitive channel  36.92 
 
 		 806 aa  126  5e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000510417  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1533  MscS Mechanosensitive ion channel  30.68 
 
 		 276 aa  126  5e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3013  MscS mechanosensitive ion channel  30.61 
 
 		 275 aa  125  9e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000253066  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4503  MscS Mechanosensitive ion channel  31.23 
 
 		 285 aa  125  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3468  MscS mechanosensitive ion channel  32.1 
 
 		 550 aa  125  9e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1152  MscS mechanosensitive ion channel  30.51 
 
 		 274 aa  124  1e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0163398  normal  0.0148083 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0613  MscS mechanosensitive ion channel  30.04 
 
 		 547 aa  125  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000873032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01983  MscS Mechanosensitive ion channel ei VT8  31.6 
 
 		 279 aa  125  1e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.865643  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2137  MscS mechanosensitive ion channel  28.14 
 
 		 288 aa  125  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.857102  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3171  MscS mechanosensitive ion channel  30.61 
 
 		 275 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000563606  hitchhiker  0.0000513684 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3028  MscS mechanosensitive ion channel  30.61 
 
 		 275 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000445897  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1350  MscS Mechanosensitive ion channel  30.61 
 
 		 275 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000676183  hitchhiker  0.0000000000523866 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0795  MscS mechanosensitive ion channel  31.87 
 
 		 269 aa  125  1e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0592  small conductance mechanosensitive ion channel  26.98 
 
 		 305 aa  125  1e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.311151  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>