More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1335 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_1335  MscS mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 275 aa  560  1e-158  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000063147 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0971  MscS mechanosensitive ion channel  49.81 
 
 		 272 aa  283  3.0000000000000004e-75  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0975842 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1775  MscS mechanosensitive ion channel  43.39 
 
 		 283 aa  202  5e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2981  hypothetical protein  39.71 
 
 		 298 aa  193  3e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0759175  normal  0.0858863 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0514  MscS Mechanosensitive ion channel  38.31 
 
 		 288 aa  185  6e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0476  MscS mechanosensitive ion channel  45.75 
 
 		 279 aa  182  6e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.139506  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0359  MscS mechanosensitive ion channel  43.89 
 
 		 360 aa  177  1e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.821631  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1074  MscS mechanosensitive ion channel  39.02 
 
 		 360 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.287098  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1552  MscS mechanosensitive ion channel  39.02 
 
 		 359 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.101944 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1689  MscS mechanosensitive ion channel  38.29 
 
 		 356 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1701  phosphoglycerate mutase  34.72 
 
 		 310 aa  155  6e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1062  MscS Mechanosensitive ion channel  32.44 
 
 		 310 aa  149  3e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.771269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2381  MscS mechanosensitive ion channel  32.16 
 
 		 287 aa  149  7e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.42777  hitchhiker  0.00000285336 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0569  MscS Mechanosensitive ion channel  31.54 
 
 		 280 aa  139  3e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.912877  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0047  MscS mechanosensitive ion channel  30.47 
 
 		 270 aa  136  3.0000000000000003e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3521  MscS mechanosensitive ion channel  34.09 
 
 		 547 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1093  MscS Mechanosensitive ion channel  29.06 
 
 		 389 aa  129  5.0000000000000004e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.464677  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0032  hypothetical protein  29.84 
 
 		 287 aa  129  7.000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.20954  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3333  MscS mechanosensitive ion channel  32.42 
 
 		 275 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3051  MscS mechanosensitive ion channel  32.34 
 
 		 285 aa  128  1.0000000000000001e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0787633 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1856  hypothetical protein  28.31 
 
 		 281 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.130527  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2355  MscS mechanosensitive ion channel  32.79 
 
 		 295 aa  127  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0549147  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0914  MscS mechanosensitive ion channel  31.28 
 
 		 842 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707445 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002474  small-conductance mechanosensitive channel  30.98 
 
 		 288 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0730  MscS mechanosensitive ion channel  30.92 
 
 		 267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.506108  normal  0.245277 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2740  MscS mechanosensitive ion channel  28.31 
 
 		 288 aa  127  3e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2284  MscS mechanosensitive ion channel  31.77 
 
 		 273 aa  126  3e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1152  MscS mechanosensitive ion channel  32.2 
 
 		 274 aa  127  3e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0163398  normal  0.0148083 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0949  MscS Mechanosensitive ion channel  42.46 
 
 		 273 aa  126  4.0000000000000003e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0955  MscS mechanosensitive ion channel  30.18 
 
 		 298 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3747  MscS Mechanosensitive ion channel  32.21 
 
 		 549 aa  125  5e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3929  MscS mechanosensitive ion channel  32.21 
 
 		 549 aa  125  6e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3803  MscS mechanosensitive ion channel  32.21 
 
 		 549 aa  125  6e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.717222  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0091  MscS mechanosensitive ion channel  31.13 
 
 		 267 aa  125  8.000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1188  MscS mechanosensitive ion channel  30.92 
 
 		 267 aa  124  1e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.765639  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0797  MscS Mechanosensitive ion channel  31.54 
 
 		 268 aa  124  1e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1202  MscS Mechanosensitive ion channel  29.44 
 
 		 270 aa  124  1e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.49703  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3200  MscS Mechanosensitive ion channel  29.18 
 
 		 275 aa  124  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126037  normal  0.165541 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03562  hypothetical protein  29.13 
 
 		 288 aa  124  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1533  MscS Mechanosensitive ion channel  30.15 
 
 		 276 aa  124  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0444  MscS mechanosensitive ion channel  31.71 
 
 		 540 aa  123  3e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0521  MscS mechanosensitive ion channel  36.04 
 
 		 200 aa  123  3e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.108923  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2646  MscS mechanosensitive ion channel  30.62 
 
 		 322 aa  123  3e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1746  mechanosensitive ion channel family protein  33.98 
 
 		 531 aa  122  4e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03290  MscS Mechanosensitive ion channel  31.6 
 
 		 280 aa  123  4e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0786  mechanosensitive channel MscS  29.44 
 
 		 286 aa  122  4e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2295  mechanosensitive ion channel family protein  31.23 
 
 		 289 aa  122  5e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02755  mechanosensitive channel  29.44 
 
 		 286 aa  122  6e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0769  MscS Mechanosensitive ion channel  29.44 
 
 		 286 aa  122  6e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02718  hypothetical protein  29.44 
 
 		 286 aa  122  6e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3082  mechanosensitive channel MscS  29.44 
 
 		 286 aa  122  6e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3251  mechanosensitive channel MscS  29.44 
 
 		 286 aa  122  6e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00921  small conductance mechanosensitive ion channel  28.06 
 
 		 322 aa  122  6e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.230623  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4221  mechanosensitive channel MscS  29.44 
 
 		 286 aa  122  6e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3349  mechanosensitive channel MscS  29.44 
 
 		 286 aa  122  6e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3778  MscS mechanosensitive ion channel  30.38 
 
 		 276 aa  122  6e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.981923 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3061  mechanosensitive channel MscS  29.44 
 
 		 291 aa  122  7e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.397816  normal  0.219365 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0390  MscS mechanosensitive ion channel  30 
 
 		 274 aa  122  7e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.855015  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2393  MscS Mechanosensitive ion channel  28.3 
 
 		 408 aa  122  8e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1709  small conductance mechanosensitive channel  33.33 
 
 		 494 aa  122  8e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0466336 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2105  MscS Mechanosensitive ion channel  31.25 
 
 		 414 aa  122  9e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0600957  normal  0.059013 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1186  MscS mechanosensitive ion channel  27.56 
 
 		 256 aa  121  9.999999999999999e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.757811 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2296  MscS mechanosensitive ion channel  30.92 
 
 		 270 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4338  MscS mechanosensitive ion channel  30.94 
 
 		 533 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3468  MscS mechanosensitive ion channel  33.08 
 
 		 550 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1674  MscS mechanosensitive ion channel  31.15 
 
 		 270 aa  121  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.702305  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03062  hypothetical protein  31.62 
 
 		 563 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1036  putative mechanosensitive ion channel protein  30.04 
 
 		 534 aa  120  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2546  small-conductance mechanosensitive channel  29.77 
 
 		 286 aa  120  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.748104  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3719  MscS mechanosensitive ion channel  30.83 
 
 		 538 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00173633  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3145  mechanosensitive ion channel  32.81 
 
 		 544 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.187903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0562  MscS mechanosensitive ion channel  33.08 
 
 		 551 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2803  MscS mechanosensitive ion channel  30 
 
 		 277 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0561  MscS mechanosensitive ion channel  33.08 
 
 		 551 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0625  small-conductance mechanosensitive ion channel  30.87 
 
 		 291 aa  120  3e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.286405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1350  hypothetical protein  33.49 
 
 		 292 aa  119  3.9999999999999996e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.136839  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3699  MscS Mechanosensitive ion channel  29.76 
 
 		 283 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0360  MscS mechanosensitive ion channel  34.11 
 
 		 393 aa  119  4.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2101  MscS Mechanosensitive ion channel  32.02 
 
 		 299 aa  119  7e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172333  normal  0.177745 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0613  MscS mechanosensitive ion channel  34.01 
 
 		 547 aa  119  7e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000873032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1034  MscS mechanosensitive ion channel  34.55 
 
 		 288 aa  119  7.999999999999999e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1967  MscS Mechanosensitive ion channel  32.47 
 
 		 279 aa  118  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.340778 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3229  mechanosensitive channel MscS  28.95 
 
 		 286 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.550002  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1245  MscS mechanosensitive ion channel  30.71 
 
 		 274 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.016266  normal  0.622604 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1140  MscS mechanosensitive ion channel  28.97 
 
 		 274 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.15609  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002898  small-conductance mechanosensitive channel  32.38 
 
 		 532 aa  118  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.341732  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3409  mechanosensitive channel MscS  28.95 
 
 		 286 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.427229  normal  0.109816 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1345  MscS mechanosensitive ion channel  29.37 
 
 		 274 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000767633  hitchhiker  0.0000248019 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3307  mechanosensitive channel MscS  28.95 
 
 		 286 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0209  MscS mechanosensitive ion channel  32.35 
 
 		 685 aa  118  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0673077 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1205  MscS mechanosensitive ion channel  29.37 
 
 		 275 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00184527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1276  MscS mechanosensitive ion channel  29.37 
 
 		 275 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000188457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3240  mechanosensitive channel MscS  28.95 
 
 		 286 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1797  mechanosensitive ion channel  32.55 
 
 		 561 aa  118  9.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.433096  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1206  MscS mechanosensitive ion channel  28.74 
 
 		 275 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0281  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01095  mechanosensitive ion channel family protein  31.35 
 
 		 280 aa  117  1.9999999999999998e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0515  MscS Mechanosensitive ion channel  29.41 
 
 		 292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0592  small conductance mechanosensitive ion channel  29.6 
 
 		 305 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.311151  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3304  mechanosensitive channel MscS  28.51 
 
 		 286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1359  MscS mechanosensitive ion channel  31.56 
 
 		 275 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124466  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>