More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2981 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2981  hypothetical protein  100 
 
 		 298 aa  594  1e-169  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0759175  normal  0.0858863 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0476  MscS mechanosensitive ion channel  55.04 
 
 		 279 aa  280  3e-74  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.139506  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1775  MscS mechanosensitive ion channel  50.39 
 
 		 283 aa  275  9e-73  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0514  MscS Mechanosensitive ion channel  42.05 
 
 		 288 aa  241  7e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1701  phosphoglycerate mutase  45.35 
 
 		 310 aa  228  1e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0971  MscS mechanosensitive ion channel  39.17 
 
 		 272 aa  202  5e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0975842 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1335  MscS mechanosensitive ion channel  39.71 
 
 		 275 aa  193  3e-48  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000063147 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0359  MscS mechanosensitive ion channel  43.66 
 
 		 360 aa  192  6e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.821631  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1074  MscS mechanosensitive ion channel  42.79 
 
 		 360 aa  191  2e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.287098  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1689  MscS mechanosensitive ion channel  44.71 
 
 		 356 aa  188  9e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1552  MscS mechanosensitive ion channel  40.24 
 
 		 359 aa  187  2e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.101944 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2295  mechanosensitive ion channel family protein  33.2 
 
 		 289 aa  156  4e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1062  MscS Mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 310 aa  155  9e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.771269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2381  MscS mechanosensitive ion channel  29.32 
 
 		 287 aa  153  2.9999999999999998e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.42777  hitchhiker  0.00000285336 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0569  MscS Mechanosensitive ion channel  29.81 
 
 		 280 aa  150  2e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.912877  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0914  MscS mechanosensitive ion channel  31.34 
 
 		 842 aa  143  3e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707445 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2355  MscS mechanosensitive ion channel  31.65 
 
 		 295 aa  140  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0549147  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00921  small conductance mechanosensitive ion channel  34.11 
 
 		 322 aa  140  3e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.230623  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0047  MscS mechanosensitive ion channel  30.51 
 
 		 270 aa  139  7e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1533  MscS Mechanosensitive ion channel  34.78 
 
 		 276 aa  137  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3521  MscS mechanosensitive ion channel  31.47 
 
 		 547 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002474  small-conductance mechanosensitive channel  32.53 
 
 		 288 aa  135  8e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2546  small-conductance mechanosensitive channel  33.76 
 
 		 286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.748104  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1746  mechanosensitive ion channel family protein  34.65 
 
 		 531 aa  132  5e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2565  hypothetical protein  32 
 
 		 283 aa  133  5e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0032  hypothetical protein  31.33 
 
 		 287 aa  131  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.20954  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0390  MscS mechanosensitive ion channel  31.4 
 
 		 274 aa  130  3e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.855015  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1856  hypothetical protein  31.25 
 
 		 281 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.130527  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2284  MscS mechanosensitive ion channel  31.46 
 
 		 273 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4338  MscS mechanosensitive ion channel  30.8 
 
 		 533 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3747  MscS Mechanosensitive ion channel  33.05 
 
 		 549 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3719  MscS mechanosensitive ion channel  30.12 
 
 		 538 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00173633  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3803  MscS mechanosensitive ion channel  33.05 
 
 		 549 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.717222  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3929  MscS mechanosensitive ion channel  33.05 
 
 		 549 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3145  mechanosensitive ion channel  30.53 
 
 		 544 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.187903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3337  mechanosensitive channel MscS  32.23 
 
 		 284 aa  128  9.000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.306942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0955  MscS mechanosensitive ion channel  30 
 
 		 298 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3051  MscS mechanosensitive ion channel  28.22 
 
 		 285 aa  128  1.0000000000000001e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0787633 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03562  hypothetical protein  30.92 
 
 		 288 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1162  MscS Mechanosensitive ion channel  28.39 
 
 		 294 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.102088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3200  MscS Mechanosensitive ion channel  30.08 
 
 		 275 aa  127  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126037  normal  0.165541 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0521  MscS mechanosensitive ion channel  35.45 
 
 		 200 aa  127  3e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.108923  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0625  small-conductance mechanosensitive ion channel  31.93 
 
 		 291 aa  126  4.0000000000000003e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.286405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3627  MscS mechanosensitive ion channel  30.86 
 
 		 268 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.143912 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3468  MscS mechanosensitive ion channel  35.45 
 
 		 550 aa  126  5e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1709  small conductance mechanosensitive channel  28.68 
 
 		 494 aa  125  6e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0466336 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1967  MscS Mechanosensitive ion channel  32.32 
 
 		 279 aa  126  6e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.340778 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0795  MscS mechanosensitive ion channel  30.4 
 
 		 269 aa  125  7e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0091  MscS mechanosensitive ion channel  28.92 
 
 		 267 aa  125  7e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0730  MscS mechanosensitive ion channel  28.92 
 
 		 267 aa  125  8.000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.506108  normal  0.245277 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03062  hypothetical protein  31.82 
 
 		 563 aa  125  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3333  MscS mechanosensitive ion channel  31.55 
 
 		 275 aa  125  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0527  MscS mechanosensitive ion channel  28.46 
 
 		 276 aa  125  1e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.546646 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1350  hypothetical protein  31.31 
 
 		 292 aa  124  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.136839  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1188  MscS mechanosensitive ion channel  29.32 
 
 		 267 aa  124  2e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.765639  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2296  MscS mechanosensitive ion channel  29.22 
 
 		 270 aa  124  2e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0562  MscS mechanosensitive ion channel  35.45 
 
 		 551 aa  124  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0561  MscS mechanosensitive ion channel  35.45 
 
 		 551 aa  124  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02755  mechanosensitive channel  29.55 
 
 		 286 aa  123  4e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0769  MscS Mechanosensitive ion channel  29.55 
 
 		 286 aa  123  4e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3349  mechanosensitive channel MscS  29.55 
 
 		 286 aa  123  4e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2469  putative transport protein  30.28 
 
 		 269 aa  123  4e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0786  mechanosensitive channel MscS  29.55 
 
 		 286 aa  123  4e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0940  MscS mechanosensitive ion channel  32.31 
 
 		 275 aa  123  4e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.546965 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3251  mechanosensitive channel MscS  29.55 
 
 		 286 aa  123  4e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02718  hypothetical protein  29.55 
 
 		 286 aa  123  4e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3082  mechanosensitive channel MscS  29.55 
 
 		 286 aa  123  4e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1797  mechanosensitive ion channel  32.63 
 
 		 561 aa  123  4e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.433096  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4221  mechanosensitive channel MscS  29.55 
 
 		 286 aa  123  4e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0104  MscS mechanosensitive ion channel  30.5 
 
 		 278 aa  123  5e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00989653  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2423  MscS Mechanosensitive ion channel  30.04 
 
 		 297 aa  122  5e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.591216  normal  0.0692547 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3061  mechanosensitive channel MscS  29.69 
 
 		 291 aa  122  7e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.397816  normal  0.219365 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2229  MscS Mechanosensitive ion channel  30.83 
 
 		 400 aa  122  9.999999999999999e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.224666  normal  0.568068 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1036  putative mechanosensitive ion channel protein  28.4 
 
 		 534 aa  121  9.999999999999999e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002898  small-conductance mechanosensitive channel  31.31 
 
 		 532 aa  122  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.341732  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1093  MscS Mechanosensitive ion channel  30.55 
 
 		 389 aa  121  9.999999999999999e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.464677  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0613  MscS mechanosensitive ion channel  32.27 
 
 		 547 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000873032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3229  mechanosensitive channel MscS  29.18 
 
 		 286 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.550002  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3307  mechanosensitive channel MscS  29.18 
 
 		 286 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0444  MscS mechanosensitive ion channel  33.85 
 
 		 540 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3620  MscS mechanosensitive ion channel  32.18 
 
 		 277 aa  120  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.812148  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3409  mechanosensitive channel MscS  29.18 
 
 		 286 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.427229  normal  0.109816 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1647  MscS Mechanosensitive ion channel  29.84 
 
 		 429 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2137  MscS mechanosensitive ion channel  29.18 
 
 		 288 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.857102  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3240  mechanosensitive channel MscS  29.18 
 
 		 286 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3304  mechanosensitive channel MscS  28.76 
 
 		 286 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0547  MscS mechanosensitive ion channel  31.91 
 
 		 305 aa  120  3.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.881892  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1320  MscS Mechanosensitive ion channel  27 
 
 		 300 aa  119  4.9999999999999996e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.23225 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0452  MscS mechanosensitive ion channel  28.37 
 
 		 283 aa  119  7.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00426986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2740  MscS mechanosensitive ion channel  29.43 
 
 		 288 aa  119  7.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03290  MscS Mechanosensitive ion channel  28.81 
 
 		 280 aa  118  9e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3818  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  27.48 
 
 		 289 aa  119  9e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.905722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0854  MscS mechanosensitive ion channel  27.48 
 
 		 289 aa  119  9e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.11552  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0851  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  27.48 
 
 		 289 aa  119  9e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.17895  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1202  MscS Mechanosensitive ion channel  26.02 
 
 		 270 aa  118  9.999999999999999e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.49703  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3013  MscS mechanosensitive ion channel  28.46 
 
 		 275 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000253066  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0592  small conductance mechanosensitive ion channel  31.91 
 
 		 305 aa  118  9.999999999999999e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.311151  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01095  mechanosensitive ion channel family protein  29.03 
 
 		 280 aa  118  9.999999999999999e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01983  MscS Mechanosensitive ion channel ei VT8  31.05 
 
 		 279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.865643  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1206  MscS mechanosensitive ion channel  27.07 
 
 		 275 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0281  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>