More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2381 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_2381  MscS mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 287 aa  574  1.0000000000000001e-163  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.42777  hitchhiker  0.00000285336 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0569  MscS Mechanosensitive ion channel  65.83 
 
 		 280 aa  374  1e-102  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.912877  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1062  MscS Mechanosensitive ion channel  57.35 
 
 		 310 aa  329  3e-89  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.771269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3051  MscS mechanosensitive ion channel  59.38 
 
 		 285 aa  327  1.0000000000000001e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0787633 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2355  MscS mechanosensitive ion channel  53.82 
 
 		 295 aa  306  4.0000000000000004e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0549147  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2109  MscS Mechanosensitive ion channel  46.75 
 
 		 306 aa  224  1e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1320  MscS Mechanosensitive ion channel  39.63 
 
 		 300 aa  199  5e-50  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.23225 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1775  MscS mechanosensitive ion channel  37.76 
 
 		 283 aa  177  1e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0359  MscS mechanosensitive ion channel  38.24 
 
 		 360 aa  176  4e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.821631  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1552  MscS mechanosensitive ion channel  37.25 
 
 		 359 aa  170  2e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.101944 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2295  mechanosensitive ion channel family protein  33.89 
 
 		 289 aa  170  3e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1074  MscS mechanosensitive ion channel  36.23 
 
 		 360 aa  168  7e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.287098  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1689  MscS mechanosensitive ion channel  39.22 
 
 		 356 aa  168  1e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0971  MscS mechanosensitive ion channel  35.83 
 
 		 272 aa  157  2e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0975842 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1701  phosphoglycerate mutase  32.13 
 
 		 310 aa  154  1e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2981  hypothetical protein  29.32 
 
 		 298 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0759175  normal  0.0858863 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0514  MscS Mechanosensitive ion channel  31.35 
 
 		 288 aa  151  1e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1335  MscS mechanosensitive ion channel  32.16 
 
 		 275 aa  149  7e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000063147 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0476  MscS mechanosensitive ion channel  32.03 
 
 		 279 aa  149  7e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.139506  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0047  MscS mechanosensitive ion channel  30.77 
 
 		 270 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03562  hypothetical protein  30.51 
 
 		 288 aa  145  1e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2641  MscS Mechanosensitive ion channel  34.82 
 
 		 280 aa  144  1e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3200  MscS Mechanosensitive ion channel  32.82 
 
 		 275 aa  144  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126037  normal  0.165541 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0955  MscS mechanosensitive ion channel  30.83 
 
 		 298 aa  143  4e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0032  hypothetical protein  32.4 
 
 		 287 aa  142  5e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.20954  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0091  MscS mechanosensitive ion channel  31.35 
 
 		 267 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2546  small-conductance mechanosensitive channel  30.45 
 
 		 286 aa  140  1.9999999999999998e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.748104  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002474  small-conductance mechanosensitive channel  30.97 
 
 		 288 aa  141  1.9999999999999998e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2988  putative small-conductance mechanosensitive channel  34.05 
 
 		 806 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000510417  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0940  MscS mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 275 aa  139  6e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.546965 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1533  MscS Mechanosensitive ion channel  31.22 
 
 		 276 aa  139  7.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00921  small conductance mechanosensitive ion channel  32.92 
 
 		 322 aa  138  8.999999999999999e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.230623  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1438  MscS mechanosensitive ion channel  36.73 
 
 		 840 aa  138  1e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.139296  normal  0.137989 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0730  MscS mechanosensitive ion channel  30.16 
 
 		 267 aa  138  1e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.506108  normal  0.245277 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0390  MscS mechanosensitive ion channel  29.46 
 
 		 274 aa  137  1e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.855015  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1188  MscS mechanosensitive ion channel  30.16 
 
 		 267 aa  137  2e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.765639  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0360  MscS mechanosensitive ion channel  33.2 
 
 		 393 aa  137  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0625  small-conductance mechanosensitive ion channel  31.19 
 
 		 291 aa  137  3.0000000000000003e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.286405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2296  MscS mechanosensitive ion channel  29.85 
 
 		 270 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3719  MscS mechanosensitive ion channel  32.53 
 
 		 538 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00173633  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0209  MscS mechanosensitive ion channel  37.62 
 
 		 685 aa  137  3.0000000000000003e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0673077 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1632  MscS mechanosensitive ion channel  36.3 
 
 		 877 aa  136  4e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.253181  normal  0.172693 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1746  mechanosensitive ion channel family protein  31.15 
 
 		 531 aa  135  9.999999999999999e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2101  MscS Mechanosensitive ion channel  32.66 
 
 		 299 aa  134  9.999999999999999e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172333  normal  0.177745 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2137  MscS mechanosensitive ion channel  29.53 
 
 		 288 aa  135  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.857102  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2332  MscS Mechanosensitive ion channel  30.9 
 
 		 362 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1202  MscS Mechanosensitive ion channel  27.87 
 
 		 270 aa  134  1.9999999999999998e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.49703  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1888  MscS Mechanosensitive ion channel  31.62 
 
 		 362 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2565  hypothetical protein  31.37 
 
 		 283 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1034  MscS mechanosensitive ion channel  30.42 
 
 		 288 aa  133  3.9999999999999996e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3168  MscS Mechanosensitive ion channel  33.78 
 
 		 311 aa  133  3.9999999999999996e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0116515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4338  MscS mechanosensitive ion channel  30.74 
 
 		 533 aa  132  5e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3627  MscS mechanosensitive ion channel  30.29 
 
 		 268 aa  132  6e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.143912 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0452  MscS mechanosensitive ion channel  30.94 
 
 		 283 aa  132  9e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00426986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2148  small conductance mechanosensitive Ion channel  34.94 
 
 		 847 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.667496  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2469  putative transport protein  31.73 
 
 		 269 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1569  MscS mechanosensitive ion channel  37.63 
 
 		 342 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.50156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1856  hypothetical protein  34.72 
 
 		 281 aa  130  3e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.130527  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03062  hypothetical protein  29.75 
 
 		 563 aa  130  3e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01983  MscS Mechanosensitive ion channel ei VT8  30.96 
 
 		 279 aa  130  3e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.865643  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1350  hypothetical protein  31.5 
 
 		 292 aa  130  3e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.136839  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0914  MscS mechanosensitive ion channel  36.04 
 
 		 842 aa  129  4.0000000000000003e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707445 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2803  MscS mechanosensitive ion channel  31.69 
 
 		 277 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0822  MscS mechanosensitive ion channel  34.96 
 
 		 847 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0649099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2740  MscS mechanosensitive ion channel  30.71 
 
 		 288 aa  129  6e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2675  MscS mechanosensitive ion channel  31.38 
 
 		 275 aa  129  6e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00133263  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0521  MscS mechanosensitive ion channel  33.5 
 
 		 200 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.108923  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2065  MscS mechanosensitive ion channel  35.16 
 
 		 359 aa  128  9.000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0589  MscS mechanosensitive ion channel  30.56 
 
 		 291 aa  128  9.000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.516163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0851  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  30.08 
 
 		 289 aa  128  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.17895  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1967  MscS Mechanosensitive ion channel  28.79 
 
 		 279 aa  128  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.340778 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0854  MscS mechanosensitive ion channel  30.08 
 
 		 289 aa  128  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.11552  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3818  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  30.08 
 
 		 289 aa  128  1.0000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.905722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3375  MscS mechanosensitive ion channel  37.13 
 
 		 302 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.190462  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1339  MscS Mechanosensitive ion channel  38.3 
 
 		 636 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000323872 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1994  MscS mechanosensitive ion channel  35.46 
 
 		 796 aa  127  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.952395 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0820  MscS mechanosensitive ion channel  34.15 
 
 		 849 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0343003  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02755  mechanosensitive channel  29.34 
 
 		 286 aa  126  3e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0769  MscS Mechanosensitive ion channel  29.34 
 
 		 286 aa  126  3e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0786  mechanosensitive channel MscS  29.34 
 
 		 286 aa  127  3e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3349  mechanosensitive channel MscS  29.34 
 
 		 286 aa  126  3e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3082  mechanosensitive channel MscS  29.34 
 
 		 286 aa  126  3e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3061  mechanosensitive channel MscS  29.34 
 
 		 291 aa  127  3e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.397816  normal  0.219365 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3251  mechanosensitive channel MscS  29.34 
 
 		 286 aa  126  3e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3333  MscS mechanosensitive ion channel  29.76 
 
 		 275 aa  127  3e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02718  hypothetical protein  29.34 
 
 		 286 aa  126  3e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1311  MscS Mechanosensitive ion channel  38.3 
 
 		 636 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4221  mechanosensitive channel MscS  29.34 
 
 		 286 aa  126  3e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2465  putative small-conductance mechanosensitive channel  30.96 
 
 		 275 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.404234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3747  MscS Mechanosensitive ion channel  29.6 
 
 		 549 aa  126  5e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2316  mechanosensitive ion channel family protein  35.89 
 
 		 291 aa  126  5e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.176359  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00165  mechanosensitive ion channel family protein  32.22 
 
 		 276 aa  126  5e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3803  MscS mechanosensitive ion channel  29.6 
 
 		 549 aa  126  5e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.717222  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1709  small conductance mechanosensitive channel  28.04 
 
 		 494 aa  126  5e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0466336 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3929  MscS mechanosensitive ion channel  29.6 
 
 		 549 aa  126  5e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0444  MscS mechanosensitive ion channel  31.5 
 
 		 540 aa  125  6e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3145  mechanosensitive ion channel  31.34 
 
 		 544 aa  125  6e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.187903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0592  small conductance mechanosensitive ion channel  28.05 
 
 		 305 aa  125  7e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.311151  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1152  MscS mechanosensitive ion channel  30.51 
 
 		 274 aa  125  7e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0163398  normal  0.0148083 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3778  MscS mechanosensitive ion channel  30.58 
 
 		 276 aa  125  7e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.981923 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>