More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3051 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_3051  MscS mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 285 aa  571  1.0000000000000001e-162  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0787633 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0569  MscS Mechanosensitive ion channel  63.67 
 
 		 280 aa  347  1e-94  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.912877  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2381  MscS mechanosensitive ion channel  58.58 
 
 		 287 aa  338  5.9999999999999996e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.42777  hitchhiker  0.00000285336 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1062  MscS Mechanosensitive ion channel  54.58 
 
 		 310 aa  298  5e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.771269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2355  MscS mechanosensitive ion channel  51.3 
 
 		 295 aa  281  1e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0549147  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2109  MscS Mechanosensitive ion channel  45.08 
 
 		 306 aa  236  2e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1320  MscS Mechanosensitive ion channel  39.15 
 
 		 300 aa  196  3e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.23225 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2295  mechanosensitive ion channel family protein  33.71 
 
 		 289 aa  188  1e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1552  MscS mechanosensitive ion channel  36.16 
 
 		 359 aa  159  7e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.101944 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0359  MscS mechanosensitive ion channel  35.56 
 
 		 360 aa  156  3e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.821631  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1689  MscS mechanosensitive ion channel  34.33 
 
 		 356 aa  152  4e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1074  MscS mechanosensitive ion channel  33.62 
 
 		 360 aa  151  1e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.287098  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1701  phosphoglycerate mutase  30.22 
 
 		 310 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1775  MscS mechanosensitive ion channel  30.65 
 
 		 283 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0971  MscS mechanosensitive ion channel  32.1 
 
 		 272 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0975842 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0047  MscS mechanosensitive ion channel  31.75 
 
 		 270 aa  139  4.999999999999999e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2137  MscS mechanosensitive ion channel  27.67 
 
 		 288 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.857102  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1188  MscS mechanosensitive ion channel  28.4 
 
 		 267 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.765639  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2641  MscS Mechanosensitive ion channel  31.44 
 
 		 280 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0091  MscS mechanosensitive ion channel  28 
 
 		 267 aa  133  3e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3200  MscS Mechanosensitive ion channel  31.08 
 
 		 275 aa  133  3e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126037  normal  0.165541 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1202  MscS Mechanosensitive ion channel  27.38 
 
 		 270 aa  132  9e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.49703  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0730  MscS mechanosensitive ion channel  27.6 
 
 		 267 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.506108  normal  0.245277 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1335  MscS mechanosensitive ion channel  32.08 
 
 		 275 aa  130  3e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000063147 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2981  hypothetical protein  27.63 
 
 		 298 aa  130  3e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0759175  normal  0.0858863 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0625  small-conductance mechanosensitive ion channel  27.69 
 
 		 291 aa  129  4.0000000000000003e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.286405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0360  MscS mechanosensitive ion channel  29.93 
 
 		 393 aa  128  9.000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01983  MscS Mechanosensitive ion channel ei VT8  30.12 
 
 		 279 aa  128  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.865643  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0476  MscS mechanosensitive ion channel  28.52 
 
 		 279 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.139506  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1746  mechanosensitive ion channel family protein  34.7 
 
 		 531 aa  127  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2469  putative transport protein  30.65 
 
 		 269 aa  127  3e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3719  MscS mechanosensitive ion channel  31.5 
 
 		 538 aa  127  3e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00173633  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2803  MscS mechanosensitive ion channel  29.34 
 
 		 277 aa  127  3e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0444  MscS mechanosensitive ion channel  30.5 
 
 		 540 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1152  MscS mechanosensitive ion channel  30.29 
 
 		 274 aa  125  9e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0163398  normal  0.0148083 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0514  MscS Mechanosensitive ion channel  30.1 
 
 		 288 aa  125  9e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3172  MscS Mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 784 aa  123  3e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2675  MscS mechanosensitive ion channel  31.31 
 
 		 275 aa  123  3e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00133263  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0209  MscS mechanosensitive ion channel  36.84 
 
 		 685 aa  123  3e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0673077 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3521  MscS mechanosensitive ion channel  30.35 
 
 		 547 aa  123  3e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3620  MscS mechanosensitive ion channel  30.59 
 
 		 277 aa  123  4e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.812148  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1967  MscS Mechanosensitive ion channel  34.81 
 
 		 279 aa  122  5e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.340778 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1856  hypothetical protein  32.86 
 
 		 281 aa  122  6e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.130527  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1438  MscS mechanosensitive ion channel  31.7 
 
 		 840 aa  122  8e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.139296  normal  0.137989 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2529  MscS Mechanosensitive ion channel  33.18 
 
 		 864 aa  122  8e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2546  small-conductance mechanosensitive channel  26.98 
 
 		 286 aa  122  9e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.748104  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1533  MscS Mechanosensitive ion channel  27.95 
 
 		 276 aa  122  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0032  hypothetical protein  25.94 
 
 		 287 aa  121  9.999999999999999e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.20954  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1345  MscS mechanosensitive ion channel  28.98 
 
 		 274 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000767633  hitchhiker  0.0000248019 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03562  hypothetical protein  26.59 
 
 		 288 aa  121  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4338  MscS mechanosensitive ion channel  31.22 
 
 		 533 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2090  hypothetical protein  25.79 
 
 		 301 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1350  hypothetical protein  27.86 
 
 		 292 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.136839  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002474  small-conductance mechanosensitive channel  26.59 
 
 		 288 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0613  MscS mechanosensitive ion channel  29.5 
 
 		 547 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000873032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1034  MscS mechanosensitive ion channel  33.15 
 
 		 288 aa  121  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3778  MscS mechanosensitive ion channel  29.54 
 
 		 276 aa  120  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.981923 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002898  small-conductance mechanosensitive channel  28 
 
 		 532 aa  120  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.341732  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1797  mechanosensitive ion channel  30.35 
 
 		 561 aa  119  3.9999999999999996e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.433096  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0955  MscS mechanosensitive ion channel  27.82 
 
 		 298 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1770  MscS mechanosensitive ion channel  31.58 
 
 		 406 aa  119  4.9999999999999996e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0589  MscS mechanosensitive ion channel  28.12 
 
 		 291 aa  119  6e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.516163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3375  MscS mechanosensitive ion channel  39.23 
 
 		 302 aa  119  6e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.190462  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1205  MscS mechanosensitive ion channel  29.44 
 
 		 275 aa  119  6e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00184527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1276  MscS mechanosensitive ion channel  29.44 
 
 		 275 aa  119  6e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000188457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1206  MscS mechanosensitive ion channel  29.91 
 
 		 275 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00921  small conductance mechanosensitive ion channel  26.75 
 
 		 322 aa  119  7.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.230623  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3333  MscS mechanosensitive ion channel  24.42 
 
 		 275 aa  118  9e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0592  small conductance mechanosensitive ion channel  26.98 
 
 		 305 aa  118  9.999999999999999e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.311151  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0145  MscS Mechanosensitive ion channel  32.09 
 
 		 795 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.584574 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00165  mechanosensitive ion channel family protein  34.46 
 
 		 276 aa  118  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2296  MscS mechanosensitive ion channel  27.2 
 
 		 270 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03062  hypothetical protein  28.5 
 
 		 563 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0851  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  26.98 
 
 		 289 aa  117  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.17895  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2273  MscS mechanosensitive ion channel  23.89 
 
 		 258 aa  116  3e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3818  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  26.98 
 
 		 289 aa  117  3e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.905722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0562  MscS mechanosensitive ion channel  28.45 
 
 		 551 aa  117  3e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0561  MscS mechanosensitive ion channel  28.45 
 
 		 551 aa  117  3e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0854  MscS mechanosensitive ion channel  26.98 
 
 		 289 aa  117  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.11552  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3013  MscS mechanosensitive ion channel  28.85 
 
 		 275 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000253066  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0390  MscS mechanosensitive ion channel  28.79 
 
 		 274 aa  116  5e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.855015  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2423  MscS Mechanosensitive ion channel  27.13 
 
 		 297 aa  115  6e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.591216  normal  0.0692547 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1245  MscS mechanosensitive ion channel  27.27 
 
 		 274 aa  115  6e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.016266  normal  0.622604 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3747  MscS Mechanosensitive ion channel  29.5 
 
 		 549 aa  115  6e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3803  MscS mechanosensitive ion channel  29.5 
 
 		 549 aa  115  6e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.717222  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3468  MscS mechanosensitive ion channel  28.02 
 
 		 550 aa  115  6e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2465  putative small-conductance mechanosensitive channel  27.42 
 
 		 275 aa  115  6e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.404234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3929  MscS mechanosensitive ion channel  29.5 
 
 		 549 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3171  MscS mechanosensitive ion channel  29.33 
 
 		 275 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000563606  hitchhiker  0.0000513684 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1350  MscS Mechanosensitive ion channel  29.33 
 
 		 275 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000676183  hitchhiker  0.0000000000523866 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1140  MscS mechanosensitive ion channel  26.67 
 
 		 274 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.15609  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0795  MscS mechanosensitive ion channel  29.51 
 
 		 269 aa  115  8.999999999999998e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1036  putative mechanosensitive ion channel protein  27.86 
 
 		 534 aa  114  1.0000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1569  MscS mechanosensitive ion channel  32.64 
 
 		 342 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.50156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3168  MscS Mechanosensitive ion channel  29.59 
 
 		 311 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0116515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0521  MscS mechanosensitive ion channel  30.21 
 
 		 200 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.108923  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3028  MscS mechanosensitive ion channel  28.85 
 
 		 275 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000445897  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3340  small-conductance mechanosensitive channel  28.97 
 
 		 275 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0773  MscS mechanosensitive ion channel  30.92 
 
 		 401 aa  114  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2740  MscS mechanosensitive ion channel  28.83 
 
 		 288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>