More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1569 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_1569  MscS mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 342 aa  685    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.50156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1300  MscS mechanosensitive ion channel  39.07 
 
 		 343 aa  248  1e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.987941  hitchhiker  0.00895683 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1852  MscS Mechanosensitive ion channel  33.72 
 
 		 344 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.390235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2065  MscS mechanosensitive ion channel  38.96 
 
 		 359 aa  195  1e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2332  MscS Mechanosensitive ion channel  34.85 
 
 		 362 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2696  MscS Mechanosensitive ion channel  45.85 
 
 		 369 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.415509  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1146  MscS mechanosensitive ion channel  46.34 
 
 		 366 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.779955  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1633  hypothetical protein  33.44 
 
 		 364 aa  172  6.999999999999999e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246622  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1888  MscS Mechanosensitive ion channel  33.88 
 
 		 362 aa  172  7.999999999999999e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0935  MscS Mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 484 aa  171  2e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1942  MscS mechanosensitive ion channel  33.12 
 
 		 360 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1250  MscS mechanosensitive ion channel  35.31 
 
 		 361 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000414305  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2842  MscS mechanosensitive ion channel  32.46 
 
 		 369 aa  153  4e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2479  MscS Mechanosensitive ion channel  33.65 
 
 		 383 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.827266 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0209  MscS mechanosensitive ion channel  36.5 
 
 		 685 aa  147  4.0000000000000006e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0673077 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2101  MscS Mechanosensitive ion channel  34.2 
 
 		 299 aa  146  6e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172333  normal  0.177745 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5283  MscS Mechanosensitive ion channel  29.65 
 
 		 376 aa  136  6.0000000000000005e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1062  MscS Mechanosensitive ion channel  33.99 
 
 		 310 aa  135  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.771269  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2316  mechanosensitive ion channel family protein  34.88 
 
 		 291 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.176359  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0359  MscS mechanosensitive ion channel  34.02 
 
 		 360 aa  133  3e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.821631  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2381  MscS mechanosensitive ion channel  34.91 
 
 		 287 aa  133  6e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.42777  hitchhiker  0.00000285336 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2837  MscS Mechanosensitive ion channel  29.19 
 
 		 366 aa  132  7.999999999999999e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.426677  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1311  MscS Mechanosensitive ion channel  36.27 
 
 		 636 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1339  MscS Mechanosensitive ion channel  36.27 
 
 		 636 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000323872 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2295  mechanosensitive ion channel family protein  30.04 
 
 		 289 aa  130  3e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3013  MscS mechanosensitive ion channel  35.89 
 
 		 843 aa  130  3e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3172  MscS Mechanosensitive ion channel  33.81 
 
 		 784 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2357  hypothetical protein  28.96 
 
 		 348 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.116724  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1074  MscS mechanosensitive ion channel  33.2 
 
 		 360 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.287098  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1202  MscS Mechanosensitive ion channel  34.7 
 
 		 270 aa  128  1.0000000000000001e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.49703  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2529  MscS Mechanosensitive ion channel  33.02 
 
 		 864 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2568  MscS mechanosensitive ion channel  30.77 
 
 		 358 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1903  MscS Mechanosensitive ion channel  37.74 
 
 		 303 aa  127  2.0000000000000002e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1552  MscS mechanosensitive ion channel  33.2 
 
 		 359 aa  127  3e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.101944 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0207  MscS Mechanosensitive ion channel  31.16 
 
 		 981 aa  127  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0941  MscS mechanosensitive ion channel  27.78 
 
 		 467 aa  126  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.884334  normal  0.631146 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0935  MscS Mechanosensitive ion channel  27.65 
 
 		 433 aa  126  5e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.940167  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0938  MscS Mechanosensitive ion channel  28.65 
 
 		 433 aa  126  6e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.466834  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3390  MscS mechanosensitive ion channel  38.89 
 
 		 861 aa  125  7e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1689  MscS mechanosensitive ion channel  34.85 
 
 		 356 aa  125  1e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1934  mechanosensitive ion channel family protein  34.25 
 
 		 287 aa  125  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.117079  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03115  MscS Mechanosensitive ion channel  28.65 
 
 		 378 aa  125  1e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4892  MscS Mechanosensitive ion channel  35.24 
 
 		 560 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0101  putative AefA  37.87 
 
 		 338 aa  124  2e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.0000000159695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1124  MscS Mechanosensitive ion channel  27.95 
 
 		 345 aa  124  3e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.745547  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0569  MscS Mechanosensitive ion channel  31.92 
 
 		 280 aa  124  3e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.912877  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2988  putative small-conductance mechanosensitive channel  29.92 
 
 		 806 aa  123  4e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000510417  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0887  MscS mechanosensitive ion channel  27.81 
 
 		 431 aa  123  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0881194  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2581  MscS mechanosensitive ion channel  34.5 
 
 		 298 aa  123  5e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.391196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2035  MscS Mechanosensitive ion channel  34.33 
 
 		 447 aa  122  8e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.200455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5091  MscS Mechanosensitive ion channel  31.43 
 
 		 637 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00148956  normal  0.0183068 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1856  hypothetical protein  35.05 
 
 		 281 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.130527  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0032  hypothetical protein  31.75 
 
 		 287 aa  120  3e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.20954  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0538  potassium efflux protein KefA  27.78 
 
 		 1118 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0522  potassium efflux protein KefA  27.78 
 
 		 1118 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.97346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0581  potassium efflux protein KefA  27.78 
 
 		 1118 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.467495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0528  potassium efflux protein KefA  27.78 
 
 		 1120 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2641  MscS Mechanosensitive ion channel  36.2 
 
 		 280 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1350  hypothetical protein  31.09 
 
 		 292 aa  120  3.9999999999999996e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.136839  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0905  MscS Mechanosensitive ion channel  27.55 
 
 		 373 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.285162  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0384  mechanosensitive ion channel  32.56 
 
 		 752 aa  120  3.9999999999999996e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2010  MscS Mechanosensitive ion channel  33.83 
 
 		 447 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0519  potassium efflux protein KefA  27.78 
 
 		 1120 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2608  mechanosensitive ion channel family protein  30.04 
 
 		 825 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.349131  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3447  mechanosensitive ion channel family protein  33.33 
 
 		 816 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.597927  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2829  MscS mechanosensitive ion channel  32.42 
 
 		 294 aa  119  7e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3071  hypothetical protein  30.63 
 
 		 366 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.962312  normal  0.378174 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4427  MscS Mechanosensitive ion channel  27.24 
 
 		 349 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0238849  normal  0.125106 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0592  small conductance mechanosensitive ion channel  28.72 
 
 		 305 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.311151  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0689  MscS mechanosensitive ion channel  27.56 
 
 		 351 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.13803  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1587  MscS mechanosensitive ion channel  30.26 
 
 		 807 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.370206  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00416  fused conserved protein  26.59 
 
 		 1120 aa  117  3e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3145  MscS Mechanosensitive ion channel  26.59 
 
 		 1120 aa  117  3e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.178032  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0397  potassium efflux protein KefA  26.59 
 
 		 1120 aa  117  3e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0500  potassium efflux protein KefA  26.59 
 
 		 1120 aa  117  3e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.527944  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00421  hypothetical protein  26.59 
 
 		 1120 aa  117  3e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3151  potassium efflux protein KefA  26.59 
 
 		 1120 aa  117  3e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.800258  normal  0.703774 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0508  potassium efflux protein KefA  26.59 
 
 		 1120 aa  117  3e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000540502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0541  potassium efflux protein KefA  26.59 
 
 		 1120 aa  117  3e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0555  potassium efflux protein KefA  26.59 
 
 		 1118 aa  117  3e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.364262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2983  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  28.46 
 
 		 1144 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0945  potassium efflux protein KefA  27.09 
 
 		 1115 aa  117  3.9999999999999997e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.612496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0047  MscS mechanosensitive ion channel  32.58 
 
 		 270 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0613  MscS mechanosensitive ion channel  31.85 
 
 		 547 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000873032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0795  MscS mechanosensitive ion channel  34.55 
 
 		 269 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0664  cyclic nucleotide-binding  31.75 
 
 		 449 aa  115  7.999999999999999e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0101822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1188  MscS mechanosensitive ion channel  29.34 
 
 		 267 aa  115  7.999999999999999e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.765639  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1438  MscS mechanosensitive ion channel  33.81 
 
 		 840 aa  115  7.999999999999999e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.139296  normal  0.137989 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2393  MscS Mechanosensitive ion channel  30 
 
 		 408 aa  115  8.999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1409  MscS mechanosensitive ion channel  28.16 
 
 		 351 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2090  hypothetical protein  31.11 
 
 		 301 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2284  MscS mechanosensitive ion channel  28.57 
 
 		 273 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03290  MscS Mechanosensitive ion channel  32.88 
 
 		 280 aa  115  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3051  MscS mechanosensitive ion channel  31.4 
 
 		 285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0787633 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1465  hypothetical protein  34.26 
 
 		 753 aa  114  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0195  MscS mechanosensitive ion channel  30.46 
 
 		 354 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.0052728  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002474  small-conductance mechanosensitive channel  31.36 
 
 		 288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2646  MscS mechanosensitive ion channel  30.84 
 
 		 322 aa  114  2.0000000000000002e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4003  MscS mechanosensitive ion channel  29.87 
 
 		 362 aa  114  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0737574  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1206  potassium efflux protein KefA  33.71 
 
 		 1098 aa  114  3e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>