More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1320 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_1320  MscS Mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 300 aa  611  9.999999999999999e-175  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.23225 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0569  MscS Mechanosensitive ion channel  41.22 
 
 		 280 aa  211  1e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.912877  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1062  MscS Mechanosensitive ion channel  38.6 
 
 		 310 aa  203  4e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.771269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2381  MscS mechanosensitive ion channel  39.63 
 
 		 287 aa  199  5e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.42777  hitchhiker  0.00000285336 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3051  MscS mechanosensitive ion channel  39.43 
 
 		 285 aa  188  1e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0787633 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2355  MscS mechanosensitive ion channel  35.98 
 
 		 295 aa  179  5.999999999999999e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0549147  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2295  mechanosensitive ion channel family protein  36.78 
 
 		 289 aa  169  5e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2109  MscS Mechanosensitive ion channel  38.83 
 
 		 306 aa  154  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2546  small-conductance mechanosensitive channel  30.22 
 
 		 286 aa  147  3e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.748104  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2284  MscS mechanosensitive ion channel  31.06 
 
 		 273 aa  144  2e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1689  MscS mechanosensitive ion channel  35.91 
 
 		 356 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0359  MscS mechanosensitive ion channel  34.03 
 
 		 360 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.821631  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3719  MscS mechanosensitive ion channel  33.97 
 
 		 538 aa  139  6e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00173633  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2469  putative transport protein  31.33 
 
 		 269 aa  138  8.999999999999999e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1202  MscS Mechanosensitive ion channel  27.76 
 
 		 270 aa  138  1e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.49703  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1775  MscS mechanosensitive ion channel  31.02 
 
 		 283 aa  138  1e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03562  hypothetical protein  29.92 
 
 		 288 aa  137  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1552  MscS mechanosensitive ion channel  32.66 
 
 		 359 aa  137  2e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.101944 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2465  putative small-conductance mechanosensitive channel  27.97 
 
 		 275 aa  137  2e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.404234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1188  MscS mechanosensitive ion channel  27.66 
 
 		 267 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.765639  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0047  MscS mechanosensitive ion channel  30.15 
 
 		 270 aa  135  6.0000000000000005e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0730  MscS mechanosensitive ion channel  27.23 
 
 		 267 aa  135  8e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.506108  normal  0.245277 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2273  MscS mechanosensitive ion channel  27.78 
 
 		 258 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0562  MscS mechanosensitive ion channel  34.12 
 
 		 551 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1152  MscS mechanosensitive ion channel  31.3 
 
 		 274 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0163398  normal  0.0148083 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0561  MscS mechanosensitive ion channel  34.12 
 
 		 551 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0091  MscS mechanosensitive ion channel  26.81 
 
 		 267 aa  133  3e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1074  MscS mechanosensitive ion channel  31.98 
 
 		 360 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.287098  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1746  mechanosensitive ion channel family protein  28.23 
 
 		 531 aa  133  3.9999999999999996e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0032  hypothetical protein  33 
 
 		 287 aa  132  5e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.20954  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3521  MscS mechanosensitive ion channel  32.06 
 
 		 547 aa  132  5e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002474  small-conductance mechanosensitive channel  28.8 
 
 		 288 aa  132  7.999999999999999e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3468  MscS mechanosensitive ion channel  33.65 
 
 		 550 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0390  MscS mechanosensitive ion channel  27 
 
 		 274 aa  132  7.999999999999999e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.855015  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3028  MscS mechanosensitive ion channel  29.89 
 
 		 275 aa  132  9e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000445897  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3013  MscS mechanosensitive ion channel  29.89 
 
 		 275 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000253066  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3145  mechanosensitive ion channel  32.54 
 
 		 544 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.187903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3171  MscS mechanosensitive ion channel  29.5 
 
 		 275 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000563606  hitchhiker  0.0000513684 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1350  MscS Mechanosensitive ion channel  29.5 
 
 		 275 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000676183  hitchhiker  0.0000000000523866 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2675  MscS mechanosensitive ion channel  28.8 
 
 		 275 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00133263  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1206  MscS mechanosensitive ion channel  28.8 
 
 		 275 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1245  MscS mechanosensitive ion channel  29.12 
 
 		 274 aa  130  3e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.016266  normal  0.622604 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1345  MscS mechanosensitive ion channel  30.62 
 
 		 274 aa  130  3e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000767633  hitchhiker  0.0000248019 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1205  MscS mechanosensitive ion channel  28.4 
 
 		 275 aa  130  3e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00184527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1276  MscS mechanosensitive ion channel  28.4 
 
 		 275 aa  130  3e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000188457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2803  MscS mechanosensitive ion channel  30.27 
 
 		 277 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4338  MscS mechanosensitive ion channel  32.81 
 
 		 533 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0476  MscS mechanosensitive ion channel  31.33 
 
 		 279 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.139506  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3929  MscS mechanosensitive ion channel  31.75 
 
 		 549 aa  129  6e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3747  MscS Mechanosensitive ion channel  31.75 
 
 		 549 aa  129  6e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1438  MscS mechanosensitive ion channel  32.56 
 
 		 840 aa  129  6e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.139296  normal  0.137989 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0521  MscS mechanosensitive ion channel  32.81 
 
 		 200 aa  129  6e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.108923  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3803  MscS mechanosensitive ion channel  31.75 
 
 		 549 aa  129  6e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.717222  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0444  MscS mechanosensitive ion channel  32.54 
 
 		 540 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2296  MscS mechanosensitive ion channel  28.08 
 
 		 270 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1036  putative mechanosensitive ion channel protein  26.38 
 
 		 534 aa  127  3e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3620  MscS mechanosensitive ion channel  27.06 
 
 		 277 aa  125  6e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.812148  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0452  MscS mechanosensitive ion channel  30.96 
 
 		 283 aa  125  7e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00426986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1140  MscS mechanosensitive ion channel  27.13 
 
 		 274 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.15609  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1701  phosphoglycerate mutase  27.85 
 
 		 310 aa  125  1e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3024  MscS Mechanosensitive ion channel  28.37 
 
 		 282 aa  124  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000332583  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0795  MscS mechanosensitive ion channel  28.98 
 
 		 269 aa  124  2e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0204  mechanosensitive ion channel family protein  28.29 
 
 		 271 aa  123  3e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.171183  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0613  MscS mechanosensitive ion channel  30.62 
 
 		 547 aa  123  4e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000873032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0104  MscS mechanosensitive ion channel  29.43 
 
 		 278 aa  123  4e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00989653  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1533  MscS Mechanosensitive ion channel  29.96 
 
 		 276 aa  123  4e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0202  mechanosensitive ion channel family protein  28.29 
 
 		 271 aa  123  4e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0940  MscS mechanosensitive ion channel  27.45 
 
 		 275 aa  123  4e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.546965 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3340  small-conductance mechanosensitive channel  27.6 
 
 		 275 aa  122  5e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1797  mechanosensitive ion channel  28.44 
 
 		 561 aa  122  6e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.433096  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3778  MscS mechanosensitive ion channel  34.55 
 
 		 276 aa  122  7e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.981923 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03062  hypothetical protein  28.24 
 
 		 563 aa  122  8e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01983  MscS Mechanosensitive ion channel ei VT8  25.27 
 
 		 279 aa  121  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.865643  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0592  small conductance mechanosensitive ion channel  27.76 
 
 		 305 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.311151  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0955  MscS mechanosensitive ion channel  27.76 
 
 		 298 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1350  hypothetical protein  31.55 
 
 		 292 aa  120  3e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.136839  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002898  small-conductance mechanosensitive channel  27.1 
 
 		 532 aa  120  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.341732  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1342  MscS Mechanosensitive ion channel  28.22 
 
 		 266 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00293598  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03290  MscS Mechanosensitive ion channel  27.05 
 
 		 280 aa  120  3.9999999999999996e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2981  hypothetical protein  27 
 
 		 298 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0759175  normal  0.0858863 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0812  small-conductance mechanosensitive channel  28.69 
 
 		 274 aa  119  6e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3333  MscS mechanosensitive ion channel  27.69 
 
 		 275 aa  119  6e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3397  MscS mechanosensitive ion channel  33.17 
 
 		 291 aa  119  7e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2148  small conductance mechanosensitive Ion channel  33.94 
 
 		 847 aa  119  9e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.667496  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0514  MscS Mechanosensitive ion channel  32.09 
 
 		 288 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0547  MscS mechanosensitive ion channel  28.37 
 
 		 305 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.881892  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0822  MscS mechanosensitive ion channel  34.65 
 
 		 847 aa  117  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0649099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0914  MscS mechanosensitive ion channel  37.95 
 
 		 842 aa  117  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707445 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1335  MscS mechanosensitive ion channel  31.98 
 
 		 275 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000063147 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0971  MscS mechanosensitive ion channel  32.89 
 
 		 272 aa  116  5e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0975842 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1093  MscS Mechanosensitive ion channel  26.13 
 
 		 389 aa  116  6e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.464677  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1226  MscS mechanosensitive ion channel  29.92 
 
 		 268 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.735162  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1229  MscS mechanosensitive ion channel  30.8 
 
 		 268 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00337735  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1709  small conductance mechanosensitive channel  31.72 
 
 		 494 aa  115  6.9999999999999995e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0466336 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0820  MscS mechanosensitive ion channel  33.01 
 
 		 849 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0343003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3627  MscS mechanosensitive ion channel  25.83 
 
 		 268 aa  115  8.999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.143912 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0797  MscS Mechanosensitive ion channel  29.62 
 
 		 268 aa  115  1.0000000000000001e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3168  MscS Mechanosensitive ion channel  28.74 
 
 		 311 aa  114  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0116515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0427  MscS mechanosensitive ion channel  27.31 
 
 		 288 aa  114  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0918944  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0949  MscS Mechanosensitive ion channel  32.18 
 
 		 273 aa  113  3e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>