More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0476 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_0476  MscS mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 279 aa  553  1e-156  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.139506  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1775  MscS mechanosensitive ion channel  55.92 
 
 		 283 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2981  hypothetical protein  55.04 
 
 		 298 aa  280  2e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0759175  normal  0.0858863 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0514  MscS Mechanosensitive ion channel  47.73 
 
 		 288 aa  258  6e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1701  phosphoglycerate mutase  46.01 
 
 		 310 aa  248  1e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0359  MscS mechanosensitive ion channel  49.06 
 
 		 360 aa  210  3e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.821631  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1074  MscS mechanosensitive ion channel  48.58 
 
 		 360 aa  206  4e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.287098  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1552  MscS mechanosensitive ion channel  48.11 
 
 		 359 aa  205  8e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.101944 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1689  MscS mechanosensitive ion channel  46.05 
 
 		 356 aa  199  5e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0971  MscS mechanosensitive ion channel  39.84 
 
 		 272 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0975842 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1335  MscS mechanosensitive ion channel  45.75 
 
 		 275 aa  182  6e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000063147 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2355  MscS mechanosensitive ion channel  33.73 
 
 		 295 aa  155  8e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0549147  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0390  MscS mechanosensitive ion channel  36.08 
 
 		 274 aa  150  2e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.855015  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2381  MscS mechanosensitive ion channel  32.03 
 
 		 287 aa  149  6e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.42777  hitchhiker  0.00000285336 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1533  MscS Mechanosensitive ion channel  36.07 
 
 		 276 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1856  hypothetical protein  32.79 
 
 		 281 aa  146  3e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.130527  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1062  MscS Mechanosensitive ion channel  31.78 
 
 		 310 aa  146  3e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.771269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0955  MscS mechanosensitive ion channel  32.4 
 
 		 298 aa  144  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1152  MscS mechanosensitive ion channel  34.25 
 
 		 274 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0163398  normal  0.0148083 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0569  MscS Mechanosensitive ion channel  29.72 
 
 		 280 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.912877  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2740  MscS mechanosensitive ion channel  32.94 
 
 		 288 aa  138  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2137  MscS mechanosensitive ion channel  31.71 
 
 		 288 aa  137  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.857102  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0452  MscS mechanosensitive ion channel  31.4 
 
 		 283 aa  138  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00426986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1584  MscS mechanosensitive ion channel  33.86 
 
 		 279 aa  137  2e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00518641  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2546  small-conductance mechanosensitive channel  32.7 
 
 		 286 aa  137  2e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.748104  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1205  MscS mechanosensitive ion channel  33.19 
 
 		 275 aa  137  2e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00184527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1276  MscS mechanosensitive ion channel  33.19 
 
 		 275 aa  137  2e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000188457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3620  MscS mechanosensitive ion channel  30.95 
 
 		 277 aa  137  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.812148  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2675  MscS mechanosensitive ion channel  30.22 
 
 		 275 aa  136  4e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00133263  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0527  MscS mechanosensitive ion channel  31.58 
 
 		 276 aa  136  4e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.546646 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0360  MscS mechanosensitive ion channel  33.85 
 
 		 393 aa  136  4e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0890  MscS mechanosensitive ion channel  31.56 
 
 		 330 aa  135  6.0000000000000005e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000201965 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01983  MscS Mechanosensitive ion channel ei VT8  29.04 
 
 		 279 aa  135  6.0000000000000005e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.865643  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3013  MscS mechanosensitive ion channel  32.77 
 
 		 275 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000253066  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4090  MscS mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 349 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1206  MscS mechanosensitive ion channel  31.51 
 
 		 275 aa  135  8e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1967  MscS Mechanosensitive ion channel  32.93 
 
 		 279 aa  134  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.340778 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02755  mechanosensitive channel  30.74 
 
 		 286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0769  MscS Mechanosensitive ion channel  30.74 
 
 		 286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0786  mechanosensitive channel MscS  30.74 
 
 		 286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3171  MscS mechanosensitive ion channel  32.77 
 
 		 275 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000563606  hitchhiker  0.0000513684 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3349  mechanosensitive channel MscS  30.74 
 
 		 286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3340  small-conductance mechanosensitive channel  32.35 
 
 		 275 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3082  mechanosensitive channel MscS  30.74 
 
 		 286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4221  mechanosensitive channel MscS  30.74 
 
 		 286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0047  MscS mechanosensitive ion channel  34.16 
 
 		 270 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02718  hypothetical protein  30.74 
 
 		 286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1359  MscS mechanosensitive ion channel  32.46 
 
 		 275 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3627  MscS mechanosensitive ion channel  31.18 
 
 		 268 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.143912 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1350  MscS Mechanosensitive ion channel  32.77 
 
 		 275 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000676183  hitchhiker  0.0000000000523866 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3251  mechanosensitive channel MscS  30.74 
 
 		 286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4338  MscS mechanosensitive ion channel  32.26 
 
 		 533 aa  133  3e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3028  MscS mechanosensitive ion channel  32.35 
 
 		 275 aa  133  3e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000445897  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002474  small-conductance mechanosensitive channel  33.2 
 
 		 288 aa  132  6e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0797  MscS Mechanosensitive ion channel  30.27 
 
 		 268 aa  132  6e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3061  mechanosensitive channel MscS  30.23 
 
 		 291 aa  132  7.999999999999999e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.397816  normal  0.219365 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3719  MscS mechanosensitive ion channel  30.86 
 
 		 538 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00173633  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3333  MscS mechanosensitive ion channel  32.57 
 
 		 275 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1093  MscS Mechanosensitive ion channel  30.22 
 
 		 389 aa  132  9e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.464677  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1746  mechanosensitive ion channel family protein  33.83 
 
 		 531 aa  130  2.0000000000000002e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0613  MscS mechanosensitive ion channel  35.57 
 
 		 547 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000873032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03290  MscS Mechanosensitive ion channel  31.73 
 
 		 280 aa  130  3e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3778  MscS mechanosensitive ion channel  30.49 
 
 		 276 aa  130  3e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.981923 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3803  MscS mechanosensitive ion channel  30.8 
 
 		 549 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.717222  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0032  hypothetical protein  31.54 
 
 		 287 aa  129  4.0000000000000003e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.20954  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2469  putative transport protein  32.43 
 
 		 269 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03562  hypothetical protein  32.43 
 
 		 288 aa  129  4.0000000000000003e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1320  MscS Mechanosensitive ion channel  31.33 
 
 		 300 aa  129  5.0000000000000004e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.23225 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3747  MscS Mechanosensitive ion channel  30.8 
 
 		 549 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3929  MscS mechanosensitive ion channel  30.8 
 
 		 549 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3468  MscS mechanosensitive ion channel  31.6 
 
 		 550 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2465  putative small-conductance mechanosensitive channel  34.34 
 
 		 275 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.404234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2803  MscS mechanosensitive ion channel  31.58 
 
 		 277 aa  129  6e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2284  MscS mechanosensitive ion channel  31.43 
 
 		 273 aa  129  6e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0592  small conductance mechanosensitive ion channel  30.53 
 
 		 305 aa  129  7.000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.311151  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2402  hypothetical protein  33.46 
 
 		 279 aa  129  8.000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.267781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3521  MscS mechanosensitive ion channel  34.54 
 
 		 547 aa  128  8.000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1140  MscS mechanosensitive ion channel  32.88 
 
 		 274 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.15609  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0730  MscS mechanosensitive ion channel  35.68 
 
 		 267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.506108  normal  0.245277 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0521  MscS mechanosensitive ion channel  34 
 
 		 200 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.108923  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0561  MscS mechanosensitive ion channel  34.33 
 
 		 551 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3307  mechanosensitive channel MscS  33.82 
 
 		 286 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3229  mechanosensitive channel MscS  33.82 
 
 		 286 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.550002  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3409  mechanosensitive channel MscS  33.82 
 
 		 286 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.427229  normal  0.109816 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3240  mechanosensitive channel MscS  33.82 
 
 		 286 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0562  MscS mechanosensitive ion channel  34.33 
 
 		 551 aa  127  3e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2296  MscS mechanosensitive ion channel  30.61 
 
 		 270 aa  127  3e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4603  mechanosensitive ion channel family protein  34.02 
 
 		 275 aa  126  4.0000000000000003e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3304  mechanosensitive channel MscS  33.82 
 
 		 286 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0444  MscS mechanosensitive ion channel  33.51 
 
 		 540 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0795  MscS mechanosensitive ion channel  37.5 
 
 		 269 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1709  small conductance mechanosensitive channel  31.08 
 
 		 494 aa  125  5e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0466336 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1188  MscS mechanosensitive ion channel  33.47 
 
 		 267 aa  126  5e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.765639  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1162  MscS Mechanosensitive ion channel  29.58 
 
 		 294 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.102088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2000  MscS Mechanosensitive ion channel  32.4 
 
 		 302 aa  125  9e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.03582 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1036  putative mechanosensitive ion channel protein  29.37 
 
 		 534 aa  124  1e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3337  mechanosensitive channel MscS  33.05 
 
 		 284 aa  124  1e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.306942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0625  small-conductance mechanosensitive ion channel  32.67 
 
 		 291 aa  125  1e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.286405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00921  small conductance mechanosensitive ion channel  29.12 
 
 		 322 aa  125  1e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.230623  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1345  MscS mechanosensitive ion channel  33.64 
 
 		 274 aa  125  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000767633  hitchhiker  0.0000248019 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>