More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01983 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01983  MscS Mechanosensitive ion channel ei VT8  100 
 
 		 279 aa  568  1e-161  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.865643  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3620  MscS mechanosensitive ion channel  72.83 
 
 		 277 aa  438  9.999999999999999e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.812148  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4603  mechanosensitive ion channel family protein  55.69 
 
 		 275 aa  291  8e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0940  MscS mechanosensitive ion channel  52.19 
 
 		 275 aa  275  4e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.546965 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0541  MscS mechanosensitive ion channel  48.63 
 
 		 273 aa  268  1e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1967  MscS Mechanosensitive ion channel  55.16 
 
 		 279 aa  267  1e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.340778 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2296  MscS mechanosensitive ion channel  45.72 
 
 		 270 aa  266  4e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1419  mechanosensitive ion channel family protein  49.07 
 
 		 278 aa  263  2e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01095  mechanosensitive ion channel family protein  50 
 
 		 280 aa  258  9e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0812  small-conductance mechanosensitive channel  50.19 
 
 		 274 aa  250  2e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3671  MscS mechanosensitive ion channel  46.24 
 
 		 277 aa  249  4e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1533  MscS Mechanosensitive ion channel  45.74 
 
 		 276 aa  247  2e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03290  MscS Mechanosensitive ion channel  45.06 
 
 		 280 aa  241  9e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02189  hypothetical protein  47.56 
 
 		 249 aa  240  2e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3333  MscS mechanosensitive ion channel  42.91 
 
 		 275 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1674  MscS mechanosensitive ion channel  45.35 
 
 		 270 aa  234  1.0000000000000001e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.702305  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3200  MscS Mechanosensitive ion channel  42.49 
 
 		 275 aa  231  1e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126037  normal  0.165541 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0047  MscS mechanosensitive ion channel  42.11 
 
 		 270 aa  229  3e-59  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2465  putative small-conductance mechanosensitive channel  43.23 
 
 		 275 aa  229  5e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.404234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1140  MscS mechanosensitive ion channel  42.86 
 
 		 274 aa  228  7e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.15609  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2469  putative transport protein  44.19 
 
 		 269 aa  227  2e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0204  mechanosensitive ion channel family protein  42.48 
 
 		 271 aa  226  3e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.171183  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0202  mechanosensitive ion channel family protein  42.48 
 
 		 271 aa  226  3e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1584  MscS mechanosensitive ion channel  45.62 
 
 		 279 aa  225  6e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00518641  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4965  hypothetical protein  49.07 
 
 		 278 aa  224  1e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57110  hypothetical protein  48.33 
 
 		 278 aa  223  3e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4420  MscS mechanosensitive ion channel  45.93 
 
 		 279 aa  222  4e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0689552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3778  MscS mechanosensitive ion channel  43.8 
 
 		 276 aa  222  4e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.981923 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1245  MscS mechanosensitive ion channel  40.23 
 
 		 274 aa  221  7e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.016266  normal  0.622604 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2546  small-conductance mechanosensitive channel  42.25 
 
 		 286 aa  221  9.999999999999999e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.748104  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1205  MscS mechanosensitive ion channel  42.91 
 
 		 275 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00184527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1276  MscS mechanosensitive ion channel  42.91 
 
 		 275 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000188457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0032  hypothetical protein  43.92 
 
 		 287 aa  220  1.9999999999999999e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.20954  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1206  MscS mechanosensitive ion channel  42.11 
 
 		 275 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3028  MscS mechanosensitive ion channel  42.54 
 
 		 275 aa  218  7e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000445897  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1359  MscS mechanosensitive ion channel  41.73 
 
 		 275 aa  218  7e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3013  MscS mechanosensitive ion channel  42.16 
 
 		 275 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000253066  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002474  small-conductance mechanosensitive channel  43.92 
 
 		 288 aa  218  1e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1345  MscS mechanosensitive ion channel  42.11 
 
 		 274 aa  217  2e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000767633  hitchhiker  0.0000248019 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1350  MscS Mechanosensitive ion channel  42.16 
 
 		 275 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000676183  hitchhiker  0.0000000000523866 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3171  MscS mechanosensitive ion channel  42.16 
 
 		 275 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000563606  hitchhiker  0.0000513684 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03562  hypothetical protein  43.14 
 
 		 288 aa  216  4e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1152  MscS mechanosensitive ion channel  40.6 
 
 		 274 aa  216  5e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0163398  normal  0.0148083 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3340  small-conductance mechanosensitive channel  41.42 
 
 		 275 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4086  MscS mechanosensitive ion channel  47.17 
 
 		 276 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0585  putative small-conductance mechanosensitive channel  39.55 
 
 		 277 aa  213  1.9999999999999998e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000591532  normal  0.0145572 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4392  mechanosensitive ion channel family protein  47.17 
 
 		 276 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.49232  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2675  MscS mechanosensitive ion channel  40.67 
 
 		 275 aa  210  2e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00133263  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2803  MscS mechanosensitive ion channel  41.57 
 
 		 277 aa  209  3e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2565  hypothetical protein  39.71 
 
 		 283 aa  209  6e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1746  mechanosensitive ion channel family protein  40 
 
 		 531 aa  207  1e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4496  MscS mechanosensitive ion channel  47.31 
 
 		 280 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.737667  normal  0.727724 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0527  MscS mechanosensitive ion channel  40 
 
 		 276 aa  206  3e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.546646 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0589  MscS mechanosensitive ion channel  39.86 
 
 		 291 aa  206  4e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.516163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0444  MscS mechanosensitive ion channel  43.26 
 
 		 540 aa  205  7e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0955  MscS mechanosensitive ion channel  40.61 
 
 		 298 aa  204  9e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0613  MscS mechanosensitive ion channel  44.24 
 
 		 547 aa  204  1e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000873032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4338  MscS mechanosensitive ion channel  42.4 
 
 		 533 aa  204  1e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3747  MscS Mechanosensitive ion channel  38.83 
 
 		 549 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3803  MscS mechanosensitive ion channel  38.83 
 
 		 549 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.717222  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2402  hypothetical protein  42.17 
 
 		 279 aa  203  2e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.267781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3929  MscS mechanosensitive ion channel  38.83 
 
 		 549 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3468  MscS mechanosensitive ion channel  45.89 
 
 		 550 aa  204  2e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0562  MscS mechanosensitive ion channel  45.89 
 
 		 551 aa  203  3e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0561  MscS mechanosensitive ion channel  45.89 
 
 		 551 aa  203  3e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0390  MscS mechanosensitive ion channel  38.52 
 
 		 274 aa  202  6e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.855015  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3521  MscS mechanosensitive ion channel  42.33 
 
 		 547 aa  201  8e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3627  MscS mechanosensitive ion channel  42.5 
 
 		 268 aa  201  9.999999999999999e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.143912 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3719  MscS mechanosensitive ion channel  45.41 
 
 		 538 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00173633  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0556  MscS Mechanosensitive ion channel  39.92 
 
 		 293 aa  200  3e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0625  small-conductance mechanosensitive ion channel  39.05 
 
 		 291 aa  199  5e-50  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.286405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0521  MscS mechanosensitive ion channel  45.92 
 
 		 200 aa  198  9e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.108923  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0949  MscS Mechanosensitive ion channel  38.32 
 
 		 273 aa  197  2.0000000000000003e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1036  putative mechanosensitive ion channel protein  38.13 
 
 		 534 aa  197  2.0000000000000003e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02755  mechanosensitive channel  37.02 
 
 		 286 aa  194  9e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0769  MscS Mechanosensitive ion channel  37.02 
 
 		 286 aa  194  9e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3082  mechanosensitive channel MscS  37.02 
 
 		 286 aa  194  9e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3349  mechanosensitive channel MscS  37.02 
 
 		 286 aa  194  9e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3251  mechanosensitive channel MscS  37.02 
 
 		 286 aa  194  9e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4221  mechanosensitive channel MscS  37.02 
 
 		 286 aa  194  9e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02718  hypothetical protein  37.02 
 
 		 286 aa  194  9e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3145  mechanosensitive ion channel  42.13 
 
 		 544 aa  194  1e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.187903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3818  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  37.07 
 
 		 289 aa  194  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.905722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3061  mechanosensitive channel MscS  37.5 
 
 		 291 aa  194  2e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.397816  normal  0.219365 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0854  MscS mechanosensitive ion channel  37.07 
 
 		 289 aa  194  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.11552  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0851  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  37.07 
 
 		 289 aa  194  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.17895  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1199  mechanosensitive ion channel component  39.6 
 
 		 281 aa  193  3e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000786613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0452  MscS mechanosensitive ion channel  39.17 
 
 		 283 aa  192  4e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00426986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0786  mechanosensitive channel MscS  36.64 
 
 		 286 aa  192  5e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0797  MscS Mechanosensitive ion channel  35.5 
 
 		 268 aa  192  5e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00165  mechanosensitive ion channel family protein  36.56 
 
 		 276 aa  191  8e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0515  MscS Mechanosensitive ion channel  37.31 
 
 		 292 aa  191  1e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1709  small conductance mechanosensitive channel  38.04 
 
 		 494 aa  190  2e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0466336 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2423  MscS Mechanosensitive ion channel  37.55 
 
 		 297 aa  189  2.9999999999999997e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.591216  normal  0.0692547 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1856  hypothetical protein  37.66 
 
 		 281 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.130527  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3375  MscS mechanosensitive ion channel  38.63 
 
 		 302 aa  189  4e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.190462  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0960  MscS mechanosensitive ion channel  48 
 
 		 280 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1353  MscS mechanosensitive ion channel  48 
 
 		 282 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.512703  normal  0.132094 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4371  MscS mechanosensitive ion channel  47.31 
 
 		 280 aa  188  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.053495 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1797  mechanosensitive ion channel  40.65 
 
 		 561 aa  188  7e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.433096  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>