More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_1202 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_1202  MscS Mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 270 aa  541  1e-153  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.49703  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0730  MscS mechanosensitive ion channel  56.39 
 
 		 267 aa  316  2e-85  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.506108  normal  0.245277 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0091  MscS mechanosensitive ion channel  55.26 
 
 		 267 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1188  MscS mechanosensitive ion channel  55.26 
 
 		 267 aa  311  4.999999999999999e-84  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.765639  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0795  MscS mechanosensitive ion channel  53.49 
 
 		 269 aa  288  5.0000000000000004e-77  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2273  MscS mechanosensitive ion channel  51.82 
 
 		 258 aa  282  5.000000000000001e-75  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2284  MscS mechanosensitive ion channel  47.33 
 
 		 273 aa  278  5e-74  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2090  hypothetical protein  48.66 
 
 		 301 aa  267  2e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03290  MscS Mechanosensitive ion channel  39.37 
 
 		 280 aa  194  9e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3145  mechanosensitive ion channel  37.01 
 
 		 544 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.187903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3719  MscS mechanosensitive ion channel  35.43 
 
 		 538 aa  180  2e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00173633  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002898  small-conductance mechanosensitive channel  36.82 
 
 		 532 aa  179  4.999999999999999e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.341732  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03062  hypothetical protein  36.23 
 
 		 563 aa  179  5.999999999999999e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3333  MscS mechanosensitive ion channel  37.4 
 
 		 275 aa  177  1e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1746  mechanosensitive ion channel family protein  37.35 
 
 		 531 aa  177  2e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1709  small conductance mechanosensitive channel  36.9 
 
 		 494 aa  175  5e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0466336 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1350  hypothetical protein  37.67 
 
 		 292 aa  176  5e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.136839  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4338  MscS mechanosensitive ion channel  34.94 
 
 		 533 aa  175  7e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2546  small-conductance mechanosensitive channel  37.15 
 
 		 286 aa  175  8e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.748104  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0444  MscS mechanosensitive ion channel  37.05 
 
 		 540 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0047  MscS mechanosensitive ion channel  36.8 
 
 		 270 aa  174  9.999999999999999e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3521  MscS mechanosensitive ion channel  33.08 
 
 		 547 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0613  MscS mechanosensitive ion channel  35.71 
 
 		 547 aa  171  9e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000873032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1797  mechanosensitive ion channel  32.58 
 
 		 561 aa  170  2e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.433096  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03562  hypothetical protein  35.18 
 
 		 288 aa  171  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002474  small-conductance mechanosensitive channel  35.18 
 
 		 288 aa  169  6e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1245  MscS mechanosensitive ion channel  37.55 
 
 		 274 aa  169  6e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.016266  normal  0.622604 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0032  hypothetical protein  34.39 
 
 		 287 aa  168  9e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.20954  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3778  MscS mechanosensitive ion channel  32.96 
 
 		 276 aa  167  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.981923 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1205  MscS mechanosensitive ion channel  35.18 
 
 		 275 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00184527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1276  MscS mechanosensitive ion channel  35.18 
 
 		 275 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000188457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3171  MscS mechanosensitive ion channel  35.57 
 
 		 275 aa  166  4e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000563606  hitchhiker  0.0000513684 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1350  MscS Mechanosensitive ion channel  35.57 
 
 		 275 aa  166  4e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000676183  hitchhiker  0.0000000000523866 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3028  MscS mechanosensitive ion channel  35.57 
 
 		 275 aa  166  4e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000445897  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1140  MscS mechanosensitive ion channel  35.18 
 
 		 274 aa  166  5e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.15609  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3013  MscS mechanosensitive ion channel  35.18 
 
 		 275 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000253066  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0812  small-conductance mechanosensitive channel  39.34 
 
 		 274 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1206  MscS mechanosensitive ion channel  34.39 
 
 		 275 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1345  MscS mechanosensitive ion channel  36.59 
 
 		 274 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000767633  hitchhiker  0.0000248019 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2465  putative small-conductance mechanosensitive channel  35.46 
 
 		 275 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.404234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0541  MscS mechanosensitive ion channel  36.84 
 
 		 273 aa  162  6e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1533  MscS Mechanosensitive ion channel  34.76 
 
 		 276 aa  161  1e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1036  putative mechanosensitive ion channel protein  34.43 
 
 		 534 aa  161  1e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3929  MscS mechanosensitive ion channel  32.8 
 
 		 549 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3747  MscS Mechanosensitive ion channel  32.8 
 
 		 549 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3803  MscS mechanosensitive ion channel  32.8 
 
 		 549 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.717222  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2803  MscS mechanosensitive ion channel  33.6 
 
 		 277 aa  160  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3468  MscS mechanosensitive ion channel  32.54 
 
 		 550 aa  160  3e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0562  MscS mechanosensitive ion channel  32.94 
 
 		 551 aa  159  5e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0561  MscS mechanosensitive ion channel  32.94 
 
 		 551 aa  159  5e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2675  MscS mechanosensitive ion channel  33.47 
 
 		 275 aa  158  7e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00133263  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3340  small-conductance mechanosensitive channel  33.6 
 
 		 275 aa  158  9e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1152  MscS mechanosensitive ion channel  34.35 
 
 		 274 aa  157  1e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0163398  normal  0.0148083 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0797  MscS Mechanosensitive ion channel  34.67 
 
 		 268 aa  157  2e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2469  putative transport protein  33.33 
 
 		 269 aa  156  4e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1359  MscS mechanosensitive ion channel  34.51 
 
 		 275 aa  154  1e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1856  hypothetical protein  31.4 
 
 		 281 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.130527  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0521  MscS mechanosensitive ion channel  36.73 
 
 		 200 aa  152  5e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.108923  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0202  mechanosensitive ion channel family protein  33.48 
 
 		 271 aa  149  3e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0204  mechanosensitive ion channel family protein  33.48 
 
 		 271 aa  149  6e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.171183  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2296  MscS mechanosensitive ion channel  30.74 
 
 		 270 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1584  MscS mechanosensitive ion channel  32 
 
 		 279 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00518641  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0955  MscS mechanosensitive ion channel  31.17 
 
 		 298 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1967  MscS Mechanosensitive ion channel  34.03 
 
 		 279 aa  147  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.340778 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0625  small-conductance mechanosensitive ion channel  33.6 
 
 		 291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.286405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0452  MscS mechanosensitive ion channel  33.19 
 
 		 283 aa  147  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00426986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2740  MscS mechanosensitive ion channel  30.98 
 
 		 288 aa  146  3e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2295  mechanosensitive ion channel family protein  30.04 
 
 		 289 aa  145  6e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2402  hypothetical protein  33.73 
 
 		 279 aa  145  7.0000000000000006e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.267781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3627  MscS mechanosensitive ion channel  31.85 
 
 		 268 aa  145  1e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.143912 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0390  MscS mechanosensitive ion channel  32.92 
 
 		 274 aa  143  3e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.855015  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0585  putative small-conductance mechanosensitive channel  34.3 
 
 		 277 aa  143  3e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000591532  normal  0.0145572 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1342  MscS Mechanosensitive ion channel  31.42 
 
 		 266 aa  142  4e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00293598  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01095  mechanosensitive ion channel family protein  33.2 
 
 		 280 aa  142  6e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1062  MscS Mechanosensitive ion channel  30 
 
 		 310 aa  142  7e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.771269  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1966  hypothetical protein  30.08 
 
 		 268 aa  141  9e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2565  hypothetical protein  33.77 
 
 		 283 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0569  MscS Mechanosensitive ion channel  28.69 
 
 		 280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.912877  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0786  mechanosensitive channel MscS  30.98 
 
 		 286 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02755  mechanosensitive channel  30.98 
 
 		 286 aa  140  3e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0769  MscS Mechanosensitive ion channel  30.98 
 
 		 286 aa  140  3e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3620  MscS mechanosensitive ion channel  32.11 
 
 		 277 aa  139  3e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.812148  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3251  mechanosensitive channel MscS  30.98 
 
 		 286 aa  140  3e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3061  mechanosensitive channel MscS  30.98 
 
 		 291 aa  140  3e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.397816  normal  0.219365 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3349  mechanosensitive channel MscS  30.98 
 
 		 286 aa  140  3e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02718  hypothetical protein  30.98 
 
 		 286 aa  140  3e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3082  mechanosensitive channel MscS  30.98 
 
 		 286 aa  140  3e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1034  MscS mechanosensitive ion channel  33.46 
 
 		 288 aa  139  3e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4221  mechanosensitive channel MscS  30.98 
 
 		 286 aa  140  3e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0940  MscS mechanosensitive ion channel  30.89 
 
 		 275 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.546965 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1701  phosphoglycerate mutase  31.33 
 
 		 310 aa  139  4.999999999999999e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1320  MscS Mechanosensitive ion channel  27.76 
 
 		 300 aa  138  1e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.23225 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2137  MscS mechanosensitive ion channel  30.33 
 
 		 288 aa  137  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.857102  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1775  MscS mechanosensitive ion channel  28.68 
 
 		 283 aa  137  2e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0514  MscS Mechanosensitive ion channel  32.52 
 
 		 288 aa  137  2e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0949  MscS Mechanosensitive ion channel  30.65 
 
 		 273 aa  137  2e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2641  MscS Mechanosensitive ion channel  32.61 
 
 		 280 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3200  MscS Mechanosensitive ion channel  30.7 
 
 		 275 aa  136  4e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126037  normal  0.165541 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0589  MscS mechanosensitive ion channel  31.87 
 
 		 291 aa  135  5e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.516163  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4603  mechanosensitive ion channel family protein  30.71 
 
 		 275 aa  135  6.0000000000000005e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>