More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_2137 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_2137  MscS mechanosensitive ion channel  100 
 
 
288 aa  583  1e-166  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.857102  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1162  MscS Mechanosensitive ion channel  53.82 
 
 
294 aa  302  4.0000000000000003e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.102088  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0955  MscS mechanosensitive ion channel  52.94 
 
 
298 aa  302  5.000000000000001e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1010  MscS Mechanosensitive ion channel  52.85 
 
 
292 aa  265  5.999999999999999e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.877455 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3627  MscS mechanosensitive ion channel  43.27 
 
 
268 aa  208  7e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.143912 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2546  small-conductance mechanosensitive channel  38.65 
 
 
286 aa  205  9e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.748104  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0452  MscS mechanosensitive ion channel  41.1 
 
 
283 aa  204  2e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00426986  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3061  mechanosensitive channel MscS  38.81 
 
 
291 aa  204  2e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.397816  normal  0.219365 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0786  mechanosensitive channel MscS  40.39 
 
 
286 aa  203  3e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0797  MscS Mechanosensitive ion channel  38.93 
 
 
268 aa  202  4e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02755  mechanosensitive channel  39.31 
 
 
286 aa  201  9e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0769  MscS Mechanosensitive ion channel  39.31 
 
 
286 aa  201  9e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3082  mechanosensitive channel MscS  39.31 
 
 
286 aa  201  9e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4221  mechanosensitive channel MscS  39.31 
 
 
286 aa  201  9e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02718  hypothetical protein  39.31 
 
 
286 aa  201  9e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3349  mechanosensitive channel MscS  39.31 
 
 
286 aa  201  9e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3251  mechanosensitive channel MscS  39.31 
 
 
286 aa  201  9e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1140  MscS mechanosensitive ion channel  38.29 
 
 
274 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.15609  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1245  MscS mechanosensitive ion channel  37.92 
 
 
274 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.016266  normal  0.622604 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2469  putative transport protein  36.94 
 
 
269 aa  200  3e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1345  MscS mechanosensitive ion channel  38.29 
 
 
274 aa  200  3e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000767633  hitchhiker  0.0000248019 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03562  hypothetical protein  40.67 
 
 
288 aa  198  1.0000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1856  hypothetical protein  41.6 
 
 
281 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.130527  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1359  MscS mechanosensitive ion channel  37.08 
 
 
275 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2740  MscS mechanosensitive ion channel  39.52 
 
 
288 aa  195  6e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1152  MscS mechanosensitive ion channel  36.16 
 
 
274 aa  195  7e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0163398  normal  0.0148083 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1350  MscS Mechanosensitive ion channel  37.92 
 
 
275 aa  195  9e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000676183  hitchhiker  0.0000000000523866 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3171  MscS mechanosensitive ion channel  37.92 
 
 
275 aa  195  9e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000563606  hitchhiker  0.0000513684 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2296  MscS mechanosensitive ion channel  37.45 
 
 
270 aa  194  1e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1205  MscS mechanosensitive ion channel  37.17 
 
 
275 aa  194  1e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00184527  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1276  MscS mechanosensitive ion channel  37.17 
 
 
275 aa  194  1e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000188457  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3028  MscS mechanosensitive ion channel  37.92 
 
 
275 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000445897  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3409  mechanosensitive channel MscS  39.83 
 
 
286 aa  193  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.427229  normal  0.109816 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3240  mechanosensitive channel MscS  39.83 
 
 
286 aa  193  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3229  mechanosensitive channel MscS  39.83 
 
 
286 aa  193  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.550002  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3307  mechanosensitive channel MscS  39.83 
 
 
286 aa  193  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002474  small-conductance mechanosensitive channel  39.39 
 
 
288 aa  193  3e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3013  MscS mechanosensitive ion channel  37.55 
 
 
275 aa  193  3e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000253066  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1206  MscS mechanosensitive ion channel  37.45 
 
 
275 aa  193  3e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0281  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3304  mechanosensitive channel MscS  39.41 
 
 
286 aa  192  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03290  MscS Mechanosensitive ion channel  36.12 
 
 
280 aa  192  8e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0527  MscS mechanosensitive ion channel  39.76 
 
 
276 aa  191  1e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.546646 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3818  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  36.69 
 
 
289 aa  190  2.9999999999999997e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.905722  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0851  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  36.69 
 
 
289 aa  190  2.9999999999999997e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.17895  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0854  MscS mechanosensitive ion channel  36.69 
 
 
289 aa  190  2.9999999999999997e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.11552  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5803  Small-conductance mechanosensitive channel  41.81 
 
 
284 aa  189  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.528701 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01095  mechanosensitive ion channel family protein  35.87 
 
 
280 aa  190  2.9999999999999997e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0940  MscS mechanosensitive ion channel  38.43 
 
 
275 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.546965 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3778  MscS mechanosensitive ion channel  39.36 
 
 
276 aa  189  4e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.981923 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2465  putative small-conductance mechanosensitive channel  36.43 
 
 
275 aa  189  4e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.404234  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3200  MscS Mechanosensitive ion channel  38.28 
 
 
275 aa  189  5e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126037  normal  0.165541 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3340  small-conductance mechanosensitive channel  36.43 
 
 
275 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0032  hypothetical protein  35.71 
 
 
287 aa  189  7e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.20954  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3333  MscS mechanosensitive ion channel  36.6 
 
 
275 aa  187  1e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2675  MscS mechanosensitive ion channel  35.87 
 
 
275 aa  187  2e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00133263  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2803  MscS mechanosensitive ion channel  34.69 
 
 
277 aa  185  6e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00165  mechanosensitive ion channel family protein  41.82 
 
 
276 aa  182  4.0000000000000006e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0515  MscS Mechanosensitive ion channel  35.09 
 
 
292 aa  182  5.0000000000000004e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0047  MscS mechanosensitive ion channel  35.91 
 
 
270 aa  181  1e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3337  mechanosensitive channel MscS  39.55 
 
 
284 aa  181  1e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.306942  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5106  MscS mechanosensitive ion channel  39 
 
 
292 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0140126  decreased coverage  0.0019989 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3256  MscS mechanosensitive ion channel  39 
 
 
292 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00789281  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00921  small conductance mechanosensitive ion channel  36.19 
 
 
322 aa  178  8e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.230623  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1533  MscS Mechanosensitive ion channel  35.55 
 
 
276 aa  177  1e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5331  MscS mechanosensitive ion channel  37.6 
 
 
301 aa  176  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2423  MscS Mechanosensitive ion channel  40 
 
 
297 aa  175  7e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.591216  normal  0.0692547 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2942  MscS mechanosensitive ion channel  36.84 
 
 
288 aa  175  7e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.711571 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3699  MscS Mechanosensitive ion channel  35.79 
 
 
283 aa  175  7e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4309  MscS mechanosensitive ion channel  38.78 
 
 
289 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000550538  decreased coverage  0.0000000451244 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1967  MscS Mechanosensitive ion channel  39.91 
 
 
279 aa  174  1.9999999999999998e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.340778 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4989  MscS mechanosensitive ion channel  39 
 
 
321 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0847315  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3171  MscS mechanosensitive ion channel  39 
 
 
321 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.10941 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3942  MscS mechanosensitive ion channel  35.19 
 
 
288 aa  172  5.999999999999999e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.639966 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4503  MscS Mechanosensitive ion channel  36.58 
 
 
285 aa  172  7.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1342  MscS Mechanosensitive ion channel  34.75 
 
 
266 aa  171  1e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00293598  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0812  small-conductance mechanosensitive channel  36.1 
 
 
274 aa  170  2e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4433  MscS Mechanosensitive ion channel  36.19 
 
 
285 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4349  MscS Mechanosensitive ion channel  36.19 
 
 
285 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0556  MscS Mechanosensitive ion channel  34.89 
 
 
293 aa  170  2e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0390  MscS mechanosensitive ion channel  34.88 
 
 
274 aa  171  2e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.855015  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4436  MscS Mechanosensitive ion channel  36.19 
 
 
285 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.312478 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0949  MscS Mechanosensitive ion channel  35.43 
 
 
273 aa  169  4e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3896  MscS Mechanosensitive ion channel  35.44 
 
 
283 aa  168  1e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4603  mechanosensitive ion channel family protein  38.13 
 
 
275 aa  167  2e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3271  putative small conductance mechanosensitive ion channel  40 
 
 
306 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.451043 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01983  MscS Mechanosensitive ion channel ei VT8  36.78 
 
 
279 aa  166  4e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.865643  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3620  MscS mechanosensitive ion channel  35.61 
 
 
277 aa  166  4e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.812148  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1746  mechanosensitive ion channel family protein  37.13 
 
 
531 aa  165  9e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2565  hypothetical protein  36.02 
 
 
283 aa  165  9e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3803  MscS mechanosensitive ion channel  35.38 
 
 
549 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.717222  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3929  MscS mechanosensitive ion channel  35.38 
 
 
549 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3747  MscS Mechanosensitive ion channel  35.38 
 
 
549 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1584  MscS mechanosensitive ion channel  34.34 
 
 
279 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00518641  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3719  MscS mechanosensitive ion channel  36.58 
 
 
538 aa  161  1e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00173633  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3397  MscS mechanosensitive ion channel  33.07 
 
 
291 aa  160  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1280  MscS Mechanosensitive ion channel  38.75 
 
 
269 aa  161  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.138834  normal  0.117258 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3521  MscS mechanosensitive ion channel  36.82 
 
 
547 aa  160  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0585  putative small-conductance mechanosensitive channel  35.32 
 
 
277 aa  160  3e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000591532  normal  0.0145572 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0541  MscS mechanosensitive ion channel  33.46 
 
 
273 aa  159  6e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1674  MscS mechanosensitive ion channel  32.05 
 
 
270 aa  159  7e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.702305  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>