More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2295 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2295  mechanosensitive ion channel family protein  100 
 
 		 289 aa  572  1.0000000000000001e-162  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3051  MscS mechanosensitive ion channel  36.75 
 
 		 285 aa  186  3e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0787633 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1062  MscS Mechanosensitive ion channel  34.14 
 
 		 310 aa  186  5e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.771269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0569  MscS Mechanosensitive ion channel  34.45 
 
 		 280 aa  186  5e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.912877  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2355  MscS mechanosensitive ion channel  36.25 
 
 		 295 aa  175  8e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0549147  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2381  MscS mechanosensitive ion channel  33.89 
 
 		 287 aa  170  3e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.42777  hitchhiker  0.00000285336 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1320  MscS Mechanosensitive ion channel  36.78 
 
 		 300 aa  169  5e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.23225 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2981  hypothetical protein  33.2 
 
 		 298 aa  156  4e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0759175  normal  0.0858863 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03562  hypothetical protein  31.85 
 
 		 288 aa  150  3e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002474  small-conductance mechanosensitive channel  32.59 
 
 		 288 aa  150  3e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0032  hypothetical protein  31.46 
 
 		 287 aa  149  4e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.20954  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2546  small-conductance mechanosensitive channel  32.46 
 
 		 286 aa  148  1.0000000000000001e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.748104  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0047  MscS mechanosensitive ion channel  34.54 
 
 		 270 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1202  MscS Mechanosensitive ion channel  30.04 
 
 		 270 aa  145  7.0000000000000006e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.49703  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1689  MscS mechanosensitive ion channel  32.88 
 
 		 356 aa  145  1e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0514  MscS Mechanosensitive ion channel  31.8 
 
 		 288 aa  142  6e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2109  MscS Mechanosensitive ion channel  35.6 
 
 		 306 aa  142  7e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1552  MscS mechanosensitive ion channel  31.06 
 
 		 359 aa  142  8e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.101944 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1775  MscS mechanosensitive ion channel  30.61 
 
 		 283 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0359  MscS mechanosensitive ion channel  32.55 
 
 		 360 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.821631  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0786  mechanosensitive channel MscS  29.06 
 
 		 286 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1074  MscS mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 360 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.287098  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02755  mechanosensitive channel  29.06 
 
 		 286 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0769  MscS Mechanosensitive ion channel  29.06 
 
 		 286 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4221  mechanosensitive channel MscS  29.06 
 
 		 286 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3082  mechanosensitive channel MscS  29.06 
 
 		 286 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3251  mechanosensitive channel MscS  29.06 
 
 		 286 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02718  hypothetical protein  29.06 
 
 		 286 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3349  mechanosensitive channel MscS  29.06 
 
 		 286 aa  139  4.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3061  mechanosensitive channel MscS  28.68 
 
 		 291 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.397816  normal  0.219365 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00921  small conductance mechanosensitive ion channel  27.46 
 
 		 322 aa  138  1e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.230623  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0204  mechanosensitive ion channel family protein  34.02 
 
 		 271 aa  136  4e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.171183  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0444  MscS mechanosensitive ion channel  31.51 
 
 		 540 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0202  mechanosensitive ion channel family protein  33.61 
 
 		 271 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3337  mechanosensitive channel MscS  30.54 
 
 		 284 aa  132  5e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.306942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0940  MscS mechanosensitive ion channel  29.17 
 
 		 275 aa  132  6e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.546965 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3304  mechanosensitive channel MscS  30.25 
 
 		 286 aa  132  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3229  mechanosensitive channel MscS  29.83 
 
 		 286 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.550002  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3240  mechanosensitive channel MscS  29.83 
 
 		 286 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3307  mechanosensitive channel MscS  29.83 
 
 		 286 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3409  mechanosensitive channel MscS  29.83 
 
 		 286 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.427229  normal  0.109816 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0955  MscS mechanosensitive ion channel  28.02 
 
 		 298 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3778  MscS mechanosensitive ion channel  28.38 
 
 		 276 aa  131  1.0000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.981923 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3896  MscS Mechanosensitive ion channel  24.29 
 
 		 283 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3699  MscS Mechanosensitive ion channel  24.64 
 
 		 283 aa  130  3e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3200  MscS Mechanosensitive ion channel  28.68 
 
 		 275 aa  130  3e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126037  normal  0.165541 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3375  MscS mechanosensitive ion channel  30.27 
 
 		 302 aa  129  4.0000000000000003e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.190462  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2469  putative transport protein  30.28 
 
 		 269 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3333  MscS mechanosensitive ion channel  27.99 
 
 		 275 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2090  hypothetical protein  27.24 
 
 		 301 aa  129  6e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0971  MscS mechanosensitive ion channel  32.03 
 
 		 272 aa  129  6e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0975842 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0592  small conductance mechanosensitive ion channel  25.57 
 
 		 305 aa  129  6e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.311151  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0556  MscS Mechanosensitive ion channel  25.26 
 
 		 293 aa  129  6e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3719  MscS mechanosensitive ion channel  30.08 
 
 		 538 aa  129  6e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00173633  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2296  MscS mechanosensitive ion channel  29.46 
 
 		 270 aa  129  8.000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4338  MscS mechanosensitive ion channel  29.57 
 
 		 533 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1438  MscS mechanosensitive ion channel  31.54 
 
 		 840 aa  129  8.000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.139296  normal  0.137989 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0547  MscS mechanosensitive ion channel  26.47 
 
 		 305 aa  127  1.0000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.881892  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1569  MscS mechanosensitive ion channel  30.56 
 
 		 342 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.50156  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01095  mechanosensitive ion channel family protein  27.4 
 
 		 280 aa  127  2.0000000000000002e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1205  MscS mechanosensitive ion channel  29.46 
 
 		 275 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00184527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1276  MscS mechanosensitive ion channel  29.46 
 
 		 275 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000188457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0613  MscS mechanosensitive ion channel  28.32 
 
 		 547 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000873032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2988  putative small-conductance mechanosensitive channel  31.56 
 
 		 806 aa  127  3e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000510417  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1888  MscS Mechanosensitive ion channel  27.09 
 
 		 362 aa  127  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1188  MscS mechanosensitive ion channel  25.93 
 
 		 267 aa  126  3e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.765639  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3340  small-conductance mechanosensitive channel  30.13 
 
 		 275 aa  126  5e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1350  MscS Mechanosensitive ion channel  29.02 
 
 		 275 aa  126  5e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000676183  hitchhiker  0.0000000000523866 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3171  MscS mechanosensitive ion channel  29.02 
 
 		 275 aa  126  5e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000563606  hitchhiker  0.0000513684 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03290  MscS Mechanosensitive ion channel  27.48 
 
 		 280 aa  125  6e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3028  MscS mechanosensitive ion channel  28.57 
 
 		 275 aa  125  7e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000445897  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1206  MscS mechanosensitive ion channel  27.24 
 
 		 275 aa  124  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1245  MscS mechanosensitive ion channel  29.2 
 
 		 274 aa  124  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.016266  normal  0.622604 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3013  MscS mechanosensitive ion channel  28.57 
 
 		 275 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000253066  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2065  MscS mechanosensitive ion channel  29.13 
 
 		 359 aa  124  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2803  MscS mechanosensitive ion channel  29.2 
 
 		 277 aa  124  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2675  MscS mechanosensitive ion channel  29.91 
 
 		 275 aa  124  2e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00133263  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2465  putative small-conductance mechanosensitive channel  28.09 
 
 		 275 aa  124  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.404234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2332  MscS Mechanosensitive ion channel  26.72 
 
 		 362 aa  124  3e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2273  MscS mechanosensitive ion channel  28.52 
 
 		 258 aa  123  3e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2137  MscS mechanosensitive ion channel  27.48 
 
 		 288 aa  123  3e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.857102  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1152  MscS mechanosensitive ion channel  27.88 
 
 		 274 aa  123  4e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0163398  normal  0.0148083 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0730  MscS mechanosensitive ion channel  25.51 
 
 		 267 aa  123  4e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.506108  normal  0.245277 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0914  MscS mechanosensitive ion channel  27.47 
 
 		 842 aa  123  4e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707445 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0562  MscS mechanosensitive ion channel  31.9 
 
 		 551 aa  123  4e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2284  MscS mechanosensitive ion channel  28.63 
 
 		 273 aa  123  4e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0561  MscS mechanosensitive ion channel  31.9 
 
 		 551 aa  123  4e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1335  MscS mechanosensitive ion channel  31.23 
 
 		 275 aa  122  5e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000063147 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3390  MscS mechanosensitive ion channel  35.16 
 
 		 861 aa  122  6e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3468  MscS mechanosensitive ion channel  31.91 
 
 		 550 aa  122  6e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0091  MscS mechanosensitive ion channel  25.51 
 
 		 267 aa  122  6e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1746  mechanosensitive ion channel family protein  30.85 
 
 		 531 aa  122  8e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3145  mechanosensitive ion channel  28.16 
 
 		 544 aa  122  8e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.187903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2696  MscS Mechanosensitive ion channel  28.46 
 
 		 369 aa  122  9e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.415509  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0390  MscS mechanosensitive ion channel  28.1 
 
 		 274 aa  122  9e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.855015  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0515  MscS Mechanosensitive ion channel  24.72 
 
 		 292 aa  121  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2641  MscS Mechanosensitive ion channel  34.62 
 
 		 280 aa  121  9.999999999999999e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3521  MscS mechanosensitive ion channel  29.2 
 
 		 547 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0851  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  27.1 
 
 		 289 aa  120  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.17895  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1934  mechanosensitive ion channel family protein  29.26 
 
 		 287 aa  120  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.117079  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>