More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0971 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0971  MscS mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 272 aa  537  9.999999999999999e-153  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0975842 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1335  MscS mechanosensitive ion channel  49.81 
 
 		 275 aa  285  5.999999999999999e-76  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000063147 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1775  MscS mechanosensitive ion channel  43.55 
 
 		 283 aa  210  2e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2981  hypothetical protein  38.43 
 
 		 298 aa  206  3e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0759175  normal  0.0858863 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0514  MscS Mechanosensitive ion channel  41.57 
 
 		 288 aa  195  7e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1689  MscS mechanosensitive ion channel  46.7 
 
 		 356 aa  189  5e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0476  MscS mechanosensitive ion channel  38.28 
 
 		 279 aa  186  4e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.139506  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0359  MscS mechanosensitive ion channel  45.24 
 
 		 360 aa  183  3e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.821631  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1074  MscS mechanosensitive ion channel  44.29 
 
 		 360 aa  181  1e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.287098  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1552  MscS mechanosensitive ion channel  45.24 
 
 		 359 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.101944 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1701  phosphoglycerate mutase  33.73 
 
 		 310 aa  160  2e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2381  MscS mechanosensitive ion channel  34.66 
 
 		 287 aa  158  7e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.42777  hitchhiker  0.00000285336 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1062  MscS Mechanosensitive ion channel  34.66 
 
 		 310 aa  157  2e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.771269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0569  MscS Mechanosensitive ion channel  34.69 
 
 		 280 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.912877  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2355  MscS mechanosensitive ion channel  34.13 
 
 		 295 aa  139  3.9999999999999997e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0549147  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3051  MscS mechanosensitive ion channel  32.5 
 
 		 285 aa  139  6e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0787633 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1709  small conductance mechanosensitive channel  33.6 
 
 		 494 aa  135  5e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0466336 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2295  mechanosensitive ion channel family protein  31.52 
 
 		 289 aa  130  2.0000000000000002e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02755  mechanosensitive channel  32.64 
 
 		 286 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0769  MscS Mechanosensitive ion channel  32.64 
 
 		 286 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3349  mechanosensitive channel MscS  32.64 
 
 		 286 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3251  mechanosensitive channel MscS  32.64 
 
 		 286 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02718  hypothetical protein  32.64 
 
 		 286 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4221  mechanosensitive channel MscS  32.64 
 
 		 286 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3082  mechanosensitive channel MscS  32.64 
 
 		 286 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0786  mechanosensitive channel MscS  32.64 
 
 		 286 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3061  mechanosensitive channel MscS  32.64 
 
 		 291 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.397816  normal  0.219365 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0625  small-conductance mechanosensitive ion channel  34.17 
 
 		 291 aa  126  3e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.286405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3304  mechanosensitive channel MscS  31.9 
 
 		 286 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3240  mechanosensitive channel MscS  31.47 
 
 		 286 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3409  mechanosensitive channel MscS  31.47 
 
 		 286 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.427229  normal  0.109816 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3307  mechanosensitive channel MscS  31.47 
 
 		 286 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0955  MscS mechanosensitive ion channel  31.23 
 
 		 298 aa  123  3e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3229  mechanosensitive channel MscS  31.47 
 
 		 286 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.550002  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0940  MscS mechanosensitive ion channel  32.68 
 
 		 275 aa  122  4e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.546965 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0556  MscS Mechanosensitive ion channel  33.75 
 
 		 293 aa  123  4e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0914  MscS mechanosensitive ion channel  30.04 
 
 		 842 aa  121  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707445 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00921  small conductance mechanosensitive ion channel  28.63 
 
 		 322 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.230623  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01095  mechanosensitive ion channel family protein  33.04 
 
 		 280 aa  120  3e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0515  MscS Mechanosensitive ion channel  31.67 
 
 		 292 aa  120  3e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2284  MscS mechanosensitive ion channel  32.81 
 
 		 273 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2137  MscS mechanosensitive ion channel  30.2 
 
 		 288 aa  119  6e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.857102  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0589  MscS mechanosensitive ion channel  32.8 
 
 		 291 aa  119  7e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.516163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2469  putative transport protein  30.8 
 
 		 269 aa  118  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1856  hypothetical protein  30.65 
 
 		 281 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.130527  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1797  mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 561 aa  117  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.433096  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1350  hypothetical protein  34.3 
 
 		 292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.136839  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0047  MscS mechanosensitive ion channel  32.09 
 
 		 270 aa  116  3e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1320  MscS Mechanosensitive ion channel  31.84 
 
 		 300 aa  117  3e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.23225 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3747  MscS Mechanosensitive ion channel  33.83 
 
 		 549 aa  117  3e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3929  MscS mechanosensitive ion channel  33.83 
 
 		 549 aa  116  3e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3803  MscS mechanosensitive ion channel  33.83 
 
 		 549 aa  116  3e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.717222  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3699  MscS Mechanosensitive ion channel  32.37 
 
 		 283 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0592  small conductance mechanosensitive ion channel  27.99 
 
 		 305 aa  115  6e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.311151  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1438  MscS mechanosensitive ion channel  34.54 
 
 		 840 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.139296  normal  0.137989 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2740  MscS mechanosensitive ion channel  30.88 
 
 		 288 aa  114  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1034  MscS mechanosensitive ion channel  35.42 
 
 		 288 aa  115  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3521  MscS mechanosensitive ion channel  32.2 
 
 		 547 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3145  mechanosensitive ion channel  32.1 
 
 		 544 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.187903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0521  MscS mechanosensitive ion channel  33.51 
 
 		 200 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.108923  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0547  MscS mechanosensitive ion channel  30.33 
 
 		 305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.881892  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1036  putative mechanosensitive ion channel protein  31.08 
 
 		 534 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3468  MscS mechanosensitive ion channel  34.83 
 
 		 550 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1206  MscS mechanosensitive ion channel  30.43 
 
 		 275 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2423  MscS Mechanosensitive ion channel  29.37 
 
 		 297 aa  113  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.591216  normal  0.0692547 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2000  MscS Mechanosensitive ion channel  36.31 
 
 		 302 aa  113  3e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.03582 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2646  MscS mechanosensitive ion channel  32.59 
 
 		 322 aa  113  3e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1533  MscS Mechanosensitive ion channel  31.73 
 
 		 276 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3719  MscS mechanosensitive ion channel  32.84 
 
 		 538 aa  112  5e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00173633  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2641  MscS Mechanosensitive ion channel  31.8 
 
 		 280 aa  112  5e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0562  MscS mechanosensitive ion channel  34.33 
 
 		 551 aa  112  6e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0561  MscS mechanosensitive ion channel  34.33 
 
 		 551 aa  112  6e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3200  MscS Mechanosensitive ion channel  31.94 
 
 		 275 aa  112  7.000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126037  normal  0.165541 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0209  MscS mechanosensitive ion channel  31.48 
 
 		 685 aa  112  8.000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0673077 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5091  MscS Mechanosensitive ion channel  31.9 
 
 		 637 aa  112  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00148956  normal  0.0183068 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03062  hypothetical protein  30.59 
 
 		 563 aa  112  9e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4338  MscS mechanosensitive ion channel  33 
 
 		 533 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0663  MscS Mechanosensitive ion channel  33.49 
 
 		 336 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1205  MscS mechanosensitive ion channel  30.97 
 
 		 275 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00184527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1276  MscS mechanosensitive ion channel  30.97 
 
 		 275 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000188457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2988  putative small-conductance mechanosensitive channel  29.3 
 
 		 806 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000510417  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3337  mechanosensitive channel MscS  29.82 
 
 		 284 aa  110  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.306942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3896  MscS Mechanosensitive ion channel  30.71 
 
 		 283 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0527  MscS mechanosensitive ion channel  29.72 
 
 		 276 aa  110  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.546646 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0613  MscS mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 547 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000873032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002898  small-conductance mechanosensitive channel  33.82 
 
 		 532 aa  110  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.341732  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0452  MscS mechanosensitive ion channel  28.39 
 
 		 283 aa  110  3e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00426986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1189  MscS Mechanosensitive ion channel  29.2 
 
 		 445 aa  110  3e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1746  mechanosensitive ion channel family protein  29.5 
 
 		 531 aa  109  4.0000000000000004e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03290  MscS Mechanosensitive ion channel  31.64 
 
 		 280 aa  109  4.0000000000000004e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2109  MscS Mechanosensitive ion channel  33.17 
 
 		 306 aa  109  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1202  MscS Mechanosensitive ion channel  29.61 
 
 		 270 aa  110  4.0000000000000004e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.49703  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0091  MscS Mechanosensitive ion channel  35.06 
 
 		 297 aa  109  5e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2675  MscS mechanosensitive ion channel  31.28 
 
 		 275 aa  109  5e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00133263  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0390  MscS mechanosensitive ion channel  29.84 
 
 		 274 aa  109  6e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.855015  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3028  MscS mechanosensitive ion channel  29.25 
 
 		 275 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000445897  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2332  MscS Mechanosensitive ion channel  28.46 
 
 		 362 aa  108  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2316  mechanosensitive ion channel family protein  32.39 
 
 		 291 aa  108  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.176359  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0444  MscS mechanosensitive ion channel  32 
 
 		 540 aa  108  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2273  MscS mechanosensitive ion channel  28.57 
 
 		 258 aa  107  2e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>