More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1062 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1062  MscS Mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 310 aa  624  1e-178  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.771269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0569  MscS Mechanosensitive ion channel  63.27 
 
 		 280 aa  360  2e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.912877  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2381  MscS mechanosensitive ion channel  56.1 
 
 		 287 aa  330  1e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.42777  hitchhiker  0.00000285336 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3051  MscS mechanosensitive ion channel  53.91 
 
 		 285 aa  291  8e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0787633 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2355  MscS mechanosensitive ion channel  45.99 
 
 		 295 aa  266  2.9999999999999995e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0549147  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2109  MscS Mechanosensitive ion channel  44.06 
 
 		 306 aa  235  6e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1320  MscS Mechanosensitive ion channel  38.6 
 
 		 300 aa  204  2e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.23225 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2295  mechanosensitive ion channel family protein  34.14 
 
 		 289 aa  186  4e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1775  MscS mechanosensitive ion channel  37.1 
 
 		 283 aa  179  7e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1689  MscS mechanosensitive ion channel  40.89 
 
 		 356 aa  166  5e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2981  hypothetical protein  32.95 
 
 		 298 aa  156  4e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0759175  normal  0.0858863 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0971  MscS mechanosensitive ion channel  35.71 
 
 		 272 aa  156  5.0000000000000005e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0975842 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3200  MscS Mechanosensitive ion channel  32.58 
 
 		 275 aa  155  6e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126037  normal  0.165541 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0359  MscS mechanosensitive ion channel  34.98 
 
 		 360 aa  155  8e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.821631  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1552  MscS mechanosensitive ion channel  36.5 
 
 		 359 aa  151  1e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.101944 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1701  phosphoglycerate mutase  29.33 
 
 		 310 aa  150  2e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1074  MscS mechanosensitive ion channel  36 
 
 		 360 aa  150  3e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.287098  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0514  MscS Mechanosensitive ion channel  32.92 
 
 		 288 aa  150  3e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1335  MscS mechanosensitive ion channel  32.44 
 
 		 275 aa  149  5e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000063147 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0047  MscS mechanosensitive ion channel  32.35 
 
 		 270 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03562  hypothetical protein  29.23 
 
 		 288 aa  147  3e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0476  MscS mechanosensitive ion channel  31.78 
 
 		 279 aa  147  3e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.139506  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0209  MscS mechanosensitive ion channel  37.8 
 
 		 685 aa  144  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0673077 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002474  small-conductance mechanosensitive channel  29.23 
 
 		 288 aa  143  3e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0390  MscS mechanosensitive ion channel  32.51 
 
 		 274 aa  143  3e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.855015  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1202  MscS Mechanosensitive ion channel  30 
 
 		 270 aa  142  8e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.49703  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0625  small-conductance mechanosensitive ion channel  30.32 
 
 		 291 aa  141  9.999999999999999e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.286405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0955  MscS mechanosensitive ion channel  30.66 
 
 		 298 aa  139  4.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2803  MscS mechanosensitive ion channel  30.63 
 
 		 277 aa  139  6e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002898  small-conductance mechanosensitive channel  29.59 
 
 		 532 aa  138  1e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.341732  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1746  mechanosensitive ion channel family protein  32.09 
 
 		 531 aa  137  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1856  hypothetical protein  33.2 
 
 		 281 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.130527  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00921  small conductance mechanosensitive ion channel  31.76 
 
 		 322 aa  137  3.0000000000000003e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.230623  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2469  putative transport protein  33.47 
 
 		 269 aa  136  4e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2675  MscS mechanosensitive ion channel  32.89 
 
 		 275 aa  136  5e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00133263  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2546  small-conductance mechanosensitive channel  29.05 
 
 		 286 aa  135  6.0000000000000005e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.748104  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3719  MscS mechanosensitive ion channel  35.64 
 
 		 538 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00173633  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0589  MscS mechanosensitive ion channel  29.5 
 
 		 291 aa  135  8e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.516163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0032  hypothetical protein  27.59 
 
 		 287 aa  135  8e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.20954  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2101  MscS Mechanosensitive ion channel  31.72 
 
 		 299 aa  134  9.999999999999999e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172333  normal  0.177745 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2641  MscS Mechanosensitive ion channel  30.97 
 
 		 280 aa  135  9.999999999999999e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2090  hypothetical protein  32.45 
 
 		 301 aa  134  3e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5091  MscS Mechanosensitive ion channel  39.41 
 
 		 637 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00148956  normal  0.0183068 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0940  MscS mechanosensitive ion channel  33.71 
 
 		 275 aa  133  3e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.546965 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1152  MscS mechanosensitive ion channel  32.33 
 
 		 274 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0163398  normal  0.0148083 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2465  putative small-conductance mechanosensitive channel  31.56 
 
 		 275 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.404234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1350  hypothetical protein  33.84 
 
 		 292 aa  133  3.9999999999999996e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.136839  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0592  small conductance mechanosensitive ion channel  29.5 
 
 		 305 aa  132  6e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.311151  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1438  MscS mechanosensitive ion channel  37.81 
 
 		 840 aa  132  6.999999999999999e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.139296  normal  0.137989 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03062  hypothetical protein  28.62 
 
 		 563 aa  132  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1350  MscS Mechanosensitive ion channel  32.43 
 
 		 275 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000676183  hitchhiker  0.0000000000523866 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3013  MscS mechanosensitive ion channel  31.64 
 
 		 275 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000253066  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3172  MscS Mechanosensitive ion channel  33.64 
 
 		 784 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3171  MscS mechanosensitive ion channel  32.43 
 
 		 275 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000563606  hitchhiker  0.0000513684 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3028  MscS mechanosensitive ion channel  31.64 
 
 		 275 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000445897  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1205  MscS mechanosensitive ion channel  31.86 
 
 		 275 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00184527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1276  MscS mechanosensitive ion channel  31.86 
 
 		 275 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000188457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1206  MscS mechanosensitive ion channel  32.3 
 
 		 275 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1569  MscS mechanosensitive ion channel  34.92 
 
 		 342 aa  130  3e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.50156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1034  MscS mechanosensitive ion channel  32.12 
 
 		 288 aa  130  3e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1888  MscS Mechanosensitive ion channel  30.8 
 
 		 362 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1797  mechanosensitive ion channel  28.09 
 
 		 561 aa  129  4.0000000000000003e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.433096  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0452  MscS mechanosensitive ion channel  32.61 
 
 		 283 aa  129  4.0000000000000003e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00426986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2423  MscS Mechanosensitive ion channel  29.43 
 
 		 297 aa  129  6e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.591216  normal  0.0692547 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3333  MscS mechanosensitive ion channel  30.34 
 
 		 275 aa  129  6e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0360  MscS mechanosensitive ion channel  30.28 
 
 		 393 aa  129  7.000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2296  MscS mechanosensitive ion channel  30.86 
 
 		 270 aa  129  7.000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3521  MscS mechanosensitive ion channel  30.45 
 
 		 547 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3340  small-conductance mechanosensitive channel  32.59 
 
 		 275 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0444  MscS mechanosensitive ion channel  32.37 
 
 		 540 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2332  MscS Mechanosensitive ion channel  30.38 
 
 		 362 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4338  MscS mechanosensitive ion channel  27.21 
 
 		 533 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3061  mechanosensitive channel MscS  31.44 
 
 		 291 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.397816  normal  0.219365 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0547  MscS mechanosensitive ion channel  29.66 
 
 		 305 aa  128  1.0000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.881892  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02755  mechanosensitive channel  31.44 
 
 		 286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0769  MscS Mechanosensitive ion channel  31.44 
 
 		 286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3251  mechanosensitive channel MscS  31.44 
 
 		 286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0786  mechanosensitive channel MscS  31.44 
 
 		 286 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3082  mechanosensitive channel MscS  31.44 
 
 		 286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3349  mechanosensitive channel MscS  31.44 
 
 		 286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02718  hypothetical protein  31.44 
 
 		 286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3375  MscS mechanosensitive ion channel  33.2 
 
 		 302 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.190462  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4221  mechanosensitive channel MscS  31.44 
 
 		 286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1533  MscS Mechanosensitive ion channel  29.28 
 
 		 276 aa  127  3e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1359  MscS mechanosensitive ion channel  31.67 
 
 		 275 aa  127  3e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1967  MscS Mechanosensitive ion channel  35.57 
 
 		 279 aa  127  3e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.340778 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4892  MscS Mechanosensitive ion channel  35.35 
 
 		 560 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00165  mechanosensitive ion channel family protein  31.8 
 
 		 276 aa  126  5e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2284  MscS mechanosensitive ion channel  29.72 
 
 		 273 aa  126  5e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1770  MscS mechanosensitive ion channel  28.98 
 
 		 406 aa  125  6e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1311  MscS Mechanosensitive ion channel  36.32 
 
 		 636 aa  125  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1339  MscS Mechanosensitive ion channel  36.32 
 
 		 636 aa  125  9e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000323872 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1036  putative mechanosensitive ion channel protein  26.22 
 
 		 534 aa  125  1e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0822  MscS mechanosensitive ion channel  34.06 
 
 		 847 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0649099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0091  MscS mechanosensitive ion channel  29.34 
 
 		 267 aa  124  2e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0556  MscS Mechanosensitive ion channel  30.96 
 
 		 293 aa  124  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3818  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  30.92 
 
 		 289 aa  124  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.905722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0562  MscS mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 551 aa  124  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0851  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  30.92 
 
 		 289 aa  124  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.17895  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0561  MscS mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 551 aa  124  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>