More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1186 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1186  MscS mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 256 aa  506  9.999999999999999e-143  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.757811 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1701  phosphoglycerate mutase  32.93 
 
 		 310 aa  148  8e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1775  MscS mechanosensitive ion channel  31.12 
 
 		 283 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0476  MscS mechanosensitive ion channel  31.15 
 
 		 279 aa  139  6e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.139506  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1335  MscS mechanosensitive ion channel  27.85 
 
 		 275 aa  135  7.000000000000001e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000063147 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1689  MscS mechanosensitive ion channel  36.13 
 
 		 356 aa  132  5e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1074  MscS mechanosensitive ion channel  35.16 
 
 		 360 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.287098  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0359  MscS mechanosensitive ion channel  32.66 
 
 		 360 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.821631  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1552  MscS mechanosensitive ion channel  34.62 
 
 		 359 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.101944 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0514  MscS Mechanosensitive ion channel  28.23 
 
 		 288 aa  124  1e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2981  hypothetical protein  28.29 
 
 		 298 aa  124  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0759175  normal  0.0858863 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5331  MscS mechanosensitive ion channel  28.81 
 
 		 301 aa  113  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5803  Small-conductance mechanosensitive channel  32.78 
 
 		 284 aa  113  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.528701 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0971  MscS mechanosensitive ion channel  26.25 
 
 		 272 aa  112  5e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0975842 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2284  MscS mechanosensitive ion channel  27.13 
 
 		 273 aa  109  5e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0047  MscS mechanosensitive ion channel  29.44 
 
 		 270 aa  108  7.000000000000001e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2381  MscS mechanosensitive ion channel  24.79 
 
 		 287 aa  107  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.42777  hitchhiker  0.00000285336 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0955  MscS mechanosensitive ion channel  29.55 
 
 		 298 aa  106  4e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1062  MscS Mechanosensitive ion channel  24.6 
 
 		 310 aa  106  4e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.771269  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1162  MscS Mechanosensitive ion channel  28.37 
 
 		 294 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.102088  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02755  mechanosensitive channel  24.11 
 
 		 286 aa  103  3e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0769  MscS Mechanosensitive ion channel  24.11 
 
 		 286 aa  103  3e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3082  mechanosensitive channel MscS  24.11 
 
 		 286 aa  103  3e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0786  mechanosensitive channel MscS  24.11 
 
 		 286 aa  103  3e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3061  mechanosensitive channel MscS  24.11 
 
 		 291 aa  103  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.397816  normal  0.219365 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02718  hypothetical protein  24.11 
 
 		 286 aa  103  3e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2137  MscS mechanosensitive ion channel  26.54 
 
 		 288 aa  103  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.857102  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4221  mechanosensitive channel MscS  24.11 
 
 		 286 aa  103  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3251  mechanosensitive channel MscS  24.11 
 
 		 286 aa  103  3e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3349  mechanosensitive channel MscS  24.11 
 
 		 286 aa  103  3e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2295  mechanosensitive ion channel family protein  23.17 
 
 		 289 aa  102  5e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2469  putative transport protein  26.64 
 
 		 269 aa  100  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2273  MscS mechanosensitive ion channel  25.3 
 
 		 258 aa  100  2e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1674  MscS mechanosensitive ion channel  30.4 
 
 		 270 aa  100  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.702305  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03562  hypothetical protein  25.6 
 
 		 288 aa  100  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0569  MscS Mechanosensitive ion channel  23.79 
 
 		 280 aa  99.4  5e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.912877  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0390  MscS mechanosensitive ion channel  28.42 
 
 		 274 aa  99  7e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.855015  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4349  MscS Mechanosensitive ion channel  25.4 
 
 		 285 aa  99  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0032  hypothetical protein  26.88 
 
 		 287 aa  98.6  8e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.20954  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1140  MscS mechanosensitive ion channel  29.08 
 
 		 274 aa  98.6  8e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.15609  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002474  small-conductance mechanosensitive channel  26 
 
 		 288 aa  98.6  9e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4436  MscS Mechanosensitive ion channel  25.4 
 
 		 285 aa  97.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.312478 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1746  mechanosensitive ion channel family protein  28.27 
 
 		 531 aa  97.8  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1967  MscS Mechanosensitive ion channel  27.87 
 
 		 279 aa  97.8  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.340778 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3229  mechanosensitive channel MscS  25 
 
 		 286 aa  96.7  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.550002  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4503  MscS Mechanosensitive ion channel  25.4 
 
 		 285 aa  96.7  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3240  mechanosensitive channel MscS  25 
 
 		 286 aa  96.7  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4090  MscS mechanosensitive ion channel  29.07 
 
 		 349 aa  97.1  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3307  mechanosensitive channel MscS  25 
 
 		 286 aa  96.7  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4433  MscS Mechanosensitive ion channel  25.4 
 
 		 285 aa  97.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3409  mechanosensitive channel MscS  25 
 
 		 286 aa  96.7  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.427229  normal  0.109816 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1152  MscS mechanosensitive ion channel  28.57 
 
 		 274 aa  96.7  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0163398  normal  0.0148083 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0527  MscS mechanosensitive ion channel  24.9 
 
 		 276 aa  96.3  4e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.546646 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0556  MscS Mechanosensitive ion channel  24.71 
 
 		 293 aa  96.3  4e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3304  mechanosensitive channel MscS  24.58 
 
 		 286 aa  96.3  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0851  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  25.95 
 
 		 289 aa  96.3  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.17895  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3818  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  25.95 
 
 		 289 aa  96.3  4e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.905722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0854  MscS mechanosensitive ion channel  25.95 
 
 		 289 aa  96.3  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.11552  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1245  MscS mechanosensitive ion channel  27.56 
 
 		 274 aa  95.9  6e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.016266  normal  0.622604 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1339  MscS Mechanosensitive ion channel  29.1 
 
 		 636 aa  95.5  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000323872 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1311  MscS Mechanosensitive ion channel  29.1 
 
 		 636 aa  95.5  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2229  MscS Mechanosensitive ion channel  28.19 
 
 		 400 aa  95.5  7e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.224666  normal  0.568068 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3778  MscS mechanosensitive ion channel  25.86 
 
 		 276 aa  95.5  7e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.981923 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1856  hypothetical protein  25.67 
 
 		 281 aa  94.4  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.130527  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1345  MscS mechanosensitive ion channel  29.08 
 
 		 274 aa  94.4  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000767633  hitchhiker  0.0000248019 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3620  MscS mechanosensitive ion channel  25.61 
 
 		 277 aa  94  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.812148  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0613  MscS mechanosensitive ion channel  30.22 
 
 		 547 aa  93.6  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000873032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1202  MscS Mechanosensitive ion channel  23.35 
 
 		 270 aa  93.6  3e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.49703  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2546  small-conductance mechanosensitive channel  29.1 
 
 		 286 aa  93.6  3e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.748104  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1036  putative mechanosensitive ion channel protein  25.21 
 
 		 534 aa  92.8  5e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3337  mechanosensitive channel MscS  24.89 
 
 		 284 aa  92.4  6e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.306942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2296  MscS mechanosensitive ion channel  26.25 
 
 		 270 aa  92.4  6e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3392  MscS Mechanosensitive ion channel  31.95 
 
 		 833 aa  91.3  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1447  MscS mechanosensitive ion channel  27.06 
 
 		 1166 aa  91.3  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3671  MscS mechanosensitive ion channel  26.24 
 
 		 277 aa  91.7  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0515  MscS Mechanosensitive ion channel  23.28 
 
 		 292 aa  91.3  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0559  potassium efflux protein KefA  27.8 
 
 		 1111 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000200237 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1647  MscS Mechanosensitive ion channel  29.15 
 
 		 429 aa  90.5  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4338  MscS mechanosensitive ion channel  28.57 
 
 		 533 aa  90.9  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1599  MscS Mechanosensitive ion channel  31.07 
 
 		 862 aa  90.9  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1569  MscS mechanosensitive ion channel  27.51 
 
 		 342 aa  90.9  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.50156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3627  MscS mechanosensitive ion channel  25.1 
 
 		 268 aa  90.5  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.143912 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5106  MscS mechanosensitive ion channel  28.43 
 
 		 292 aa  90.9  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0140126  decreased coverage  0.0019989 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3256  MscS mechanosensitive ion channel  28.43 
 
 		 292 aa  90.5  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00789281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01752  putative mechanosensitive channel protein (MscS family)  28.37 
 
 		 328 aa  91.3  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.249612  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01983  MscS Mechanosensitive ion channel ei VT8  25.31 
 
 		 279 aa  90.5  3e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.865643  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0949  MscS Mechanosensitive ion channel  30.46 
 
 		 273 aa  90.1  3e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2465  putative small-conductance mechanosensitive channel  28.06 
 
 		 275 aa  90.1  3e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.404234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1709  small conductance mechanosensitive channel  25.31 
 
 		 494 aa  89.7  4e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0466336 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0541  MscS mechanosensitive ion channel  26.26 
 
 		 273 aa  89.7  4e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3340  small-conductance mechanosensitive channel  28.96 
 
 		 275 aa  89.4  6e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03062  hypothetical protein  29.1 
 
 		 563 aa  89  7e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0914  MscS mechanosensitive ion channel  28.84 
 
 		 842 aa  89  8e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707445 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0444  MscS mechanosensitive ion channel  28.49 
 
 		 540 aa  88.6  8e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0588  transporter, putative  27.2 
 
 		 1067 aa  87.8  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3719  MscS mechanosensitive ion channel  26.4 
 
 		 538 aa  87.4  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00173633  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0812  small-conductance mechanosensitive channel  27.72 
 
 		 274 aa  87.4  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0587  MscS mechanosensitive ion channel  27.97 
 
 		 1067 aa  87  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0226105 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3443  MscS mechanosensitive ion channel  27.97 
 
 		 1067 aa  87.4  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0586  MscS mechanosensitive ion channel  27.97 
 
 		 1067 aa  87.4  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0875624 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>