More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5803 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5803  Small-conductance mechanosensitive channel  100 
 
 		 284 aa  570  1.0000000000000001e-162  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.528701 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5331  MscS mechanosensitive ion channel  68.61 
 
 		 301 aa  404  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2942  MscS mechanosensitive ion channel  51.8 
 
 		 288 aa  260  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.711571 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5106  MscS mechanosensitive ion channel  52.94 
 
 		 292 aa  259  3e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0140126  decreased coverage  0.0019989 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3256  MscS mechanosensitive ion channel  52.94 
 
 		 292 aa  259  4e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00789281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4989  MscS mechanosensitive ion channel  52.31 
 
 		 321 aa  247  1e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0847315  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3171  MscS mechanosensitive ion channel  52.31 
 
 		 321 aa  247  1e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.10941 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4309  MscS mechanosensitive ion channel  51.47 
 
 		 289 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000550538  decreased coverage  0.0000000451244 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0955  MscS mechanosensitive ion channel  44.81 
 
 		 298 aa  226  4e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1162  MscS Mechanosensitive ion channel  48.22 
 
 		 294 aa  222  4e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.102088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1856  hypothetical protein  41.61 
 
 		 281 aa  206  3e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.130527  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3271  putative small conductance mechanosensitive ion channel  45.71 
 
 		 306 aa  203  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.451043 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1280  MscS Mechanosensitive ion channel  46.12 
 
 		 269 aa  202  4e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.138834  normal  0.117258 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03290  MscS Mechanosensitive ion channel  36.4 
 
 		 280 aa  201  9.999999999999999e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3627  MscS mechanosensitive ion channel  40.17 
 
 		 268 aa  196  3e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.143912 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0797  MscS Mechanosensitive ion channel  36.76 
 
 		 268 aa  196  4.0000000000000005e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0452  MscS mechanosensitive ion channel  39.74 
 
 		 283 aa  196  5.000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00426986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2137  MscS mechanosensitive ion channel  42.32 
 
 		 288 aa  195  6e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.857102  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0786  mechanosensitive channel MscS  38.73 
 
 		 286 aa  194  1e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3333  MscS mechanosensitive ion channel  35.43 
 
 		 275 aa  193  2e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02755  mechanosensitive channel  38.38 
 
 		 286 aa  193  3e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0769  MscS Mechanosensitive ion channel  38.38 
 
 		 286 aa  193  3e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3082  mechanosensitive channel MscS  38.38 
 
 		 286 aa  193  3e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02718  hypothetical protein  38.38 
 
 		 286 aa  193  3e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3349  mechanosensitive channel MscS  38.38 
 
 		 286 aa  193  3e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3251  mechanosensitive channel MscS  38.38 
 
 		 286 aa  193  3e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4221  mechanosensitive channel MscS  38.38 
 
 		 286 aa  193  3e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3061  mechanosensitive channel MscS  38.69 
 
 		 291 aa  192  4e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.397816  normal  0.219365 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1220  MscS mechanosensitive ion channel  43.43 
 
 		 305 aa  192  4e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0859387 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0940  MscS mechanosensitive ion channel  40.82 
 
 		 275 aa  191  1e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.546965 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01095  mechanosensitive ion channel family protein  36.84 
 
 		 280 aa  191  1e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0527  MscS mechanosensitive ion channel  35.02 
 
 		 276 aa  189  5e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.546646 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2296  MscS mechanosensitive ion channel  35.74 
 
 		 270 aa  187  2e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2740  MscS mechanosensitive ion channel  36.72 
 
 		 288 aa  187  2e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2469  putative transport protein  38.37 
 
 		 269 aa  185  8e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3200  MscS Mechanosensitive ion channel  36.23 
 
 		 275 aa  183  2.0000000000000003e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126037  normal  0.165541 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2546  small-conductance mechanosensitive channel  33.33 
 
 		 286 aa  184  2.0000000000000003e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.748104  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1010  MscS Mechanosensitive ion channel  47.43 
 
 		 292 aa  183  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.877455 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1342  MscS Mechanosensitive ion channel  36.4 
 
 		 266 aa  178  8e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00293598  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1533  MscS Mechanosensitive ion channel  32.83 
 
 		 276 aa  177  1e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0047  MscS mechanosensitive ion channel  32.7 
 
 		 270 aa  177  2e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002474  small-conductance mechanosensitive channel  31.64 
 
 		 288 aa  175  8e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0854  MscS mechanosensitive ion channel  39.77 
 
 		 289 aa  174  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.11552  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1140  MscS mechanosensitive ion channel  35.14 
 
 		 274 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.15609  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03562  hypothetical protein  31.27 
 
 		 288 aa  174  9.999999999999999e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0851  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  39.77 
 
 		 289 aa  174  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.17895  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3818  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  39.77 
 
 		 289 aa  174  9.999999999999999e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.905722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1206  MscS mechanosensitive ion channel  35.14 
 
 		 275 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1205  MscS mechanosensitive ion channel  35.91 
 
 		 275 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00184527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1276  MscS mechanosensitive ion channel  35.91 
 
 		 275 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000188457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1359  MscS mechanosensitive ion channel  32.94 
 
 		 275 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1152  MscS mechanosensitive ion channel  33.59 
 
 		 274 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0163398  normal  0.0148083 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3340  small-conductance mechanosensitive channel  33.98 
 
 		 275 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1345  MscS mechanosensitive ion channel  33.09 
 
 		 274 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000767633  hitchhiker  0.0000248019 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0032  hypothetical protein  33.59 
 
 		 287 aa  172  6.999999999999999e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.20954  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3337  mechanosensitive channel MscS  39.47 
 
 		 284 aa  172  6.999999999999999e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.306942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1967  MscS Mechanosensitive ion channel  37.97 
 
 		 279 aa  171  9e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.340778 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2465  putative small-conductance mechanosensitive channel  34.5 
 
 		 275 aa  171  1e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.404234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00165  mechanosensitive ion channel family protein  36.44 
 
 		 276 aa  171  2e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2803  MscS mechanosensitive ion channel  35.27 
 
 		 277 aa  169  4e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3942  MscS mechanosensitive ion channel  39.3 
 
 		 288 aa  169  6e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.639966 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0515  MscS Mechanosensitive ion channel  37.74 
 
 		 292 aa  168  7e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0585  putative small-conductance mechanosensitive channel  35.27 
 
 		 277 aa  168  7e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000591532  normal  0.0145572 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3240  mechanosensitive channel MscS  37.55 
 
 		 286 aa  168  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3229  mechanosensitive channel MscS  37.55 
 
 		 286 aa  168  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.550002  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3409  mechanosensitive channel MscS  37.55 
 
 		 286 aa  168  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.427229  normal  0.109816 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3307  mechanosensitive channel MscS  37.55 
 
 		 286 aa  168  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3171  MscS mechanosensitive ion channel  34.12 
 
 		 275 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000563606  hitchhiker  0.0000513684 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1245  MscS mechanosensitive ion channel  32.05 
 
 		 274 aa  168  1e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.016266  normal  0.622604 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3304  mechanosensitive channel MscS  37.13 
 
 		 286 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1350  MscS Mechanosensitive ion channel  34.12 
 
 		 275 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000676183  hitchhiker  0.0000000000523866 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65040  hypothetical protein  37.08 
 
 		 283 aa  167  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0222155  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4603  mechanosensitive ion channel family protein  31.14 
 
 		 275 aa  167  2e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0541  MscS mechanosensitive ion channel  31.23 
 
 		 273 aa  166  2.9999999999999998e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3013  MscS mechanosensitive ion channel  34.12 
 
 		 275 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000253066  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3028  MscS mechanosensitive ion channel  33.73 
 
 		 275 aa  166  4e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000445897  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0556  MscS Mechanosensitive ion channel  38.87 
 
 		 293 aa  166  5e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02189  hypothetical protein  33.6 
 
 		 249 aa  165  9e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5651  hypothetical protein  36.67 
 
 		 283 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0812  small-conductance mechanosensitive channel  35.02 
 
 		 274 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2675  MscS mechanosensitive ion channel  33.59 
 
 		 275 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00133263  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3671  MscS mechanosensitive ion channel  32.93 
 
 		 277 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2423  MscS Mechanosensitive ion channel  35.86 
 
 		 297 aa  164  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.591216  normal  0.0692547 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3778  MscS mechanosensitive ion channel  32.26 
 
 		 276 aa  164  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.981923 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4392  mechanosensitive ion channel family protein  41.37 
 
 		 276 aa  161  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.49232  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1674  MscS mechanosensitive ion channel  33.46 
 
 		 270 aa  161  1e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.702305  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4086  MscS mechanosensitive ion channel  40.96 
 
 		 276 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3896  MscS Mechanosensitive ion channel  35.98 
 
 		 283 aa  160  3e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3397  MscS mechanosensitive ion channel  32.57 
 
 		 291 aa  159  4e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3699  MscS Mechanosensitive ion channel  37.2 
 
 		 283 aa  159  6e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3620  MscS mechanosensitive ion channel  34.01 
 
 		 277 aa  158  1e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.812148  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0204  mechanosensitive ion channel family protein  30.47 
 
 		 271 aa  158  1e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.171183  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0202  mechanosensitive ion channel family protein  30.35 
 
 		 271 aa  157  1e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4436  MscS Mechanosensitive ion channel  32.84 
 
 		 285 aa  156  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.312478 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4420  MscS mechanosensitive ion channel  38.55 
 
 		 279 aa  157  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0689552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1584  MscS mechanosensitive ion channel  32.84 
 
 		 279 aa  157  3e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00518641  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4433  MscS Mechanosensitive ion channel  32.84 
 
 		 285 aa  156  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0390  MscS mechanosensitive ion channel  29.41 
 
 		 274 aa  156  4e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.855015  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2565  hypothetical protein  33.33 
 
 		 283 aa  155  6e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4503  MscS Mechanosensitive ion channel  32.84 
 
 		 285 aa  155  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>