More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A4503 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A4503  MscS Mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 285 aa  571  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4436  MscS Mechanosensitive ion channel  99.3 
 
 		 285 aa  569  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.312478 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4433  MscS Mechanosensitive ion channel  98.95 
 
 		 285 aa  567  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4349  MscS Mechanosensitive ion channel  98.95 
 
 		 285 aa  567  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3397  MscS mechanosensitive ion channel  57.8 
 
 		 291 aa  316  3e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0786  mechanosensitive channel MscS  54.09 
 
 		 286 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0515  MscS Mechanosensitive ion channel  52.46 
 
 		 292 aa  302  5.000000000000001e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02755  mechanosensitive channel  53.74 
 
 		 286 aa  301  6.000000000000001e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0769  MscS Mechanosensitive ion channel  53.74 
 
 		 286 aa  301  6.000000000000001e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3349  mechanosensitive channel MscS  53.74 
 
 		 286 aa  301  6.000000000000001e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02718  hypothetical protein  53.74 
 
 		 286 aa  301  6.000000000000001e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3082  mechanosensitive channel MscS  53.74 
 
 		 286 aa  301  6.000000000000001e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3251  mechanosensitive channel MscS  53.74 
 
 		 286 aa  301  6.000000000000001e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4221  mechanosensitive channel MscS  53.74 
 
 		 286 aa  301  6.000000000000001e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3061  mechanosensitive channel MscS  53.74 
 
 		 291 aa  301  7.000000000000001e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.397816  normal  0.219365 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3942  MscS mechanosensitive ion channel  54.55 
 
 		 288 aa  300  1e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.639966 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3818  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  53.57 
 
 		 289 aa  301  1e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.905722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0854  MscS mechanosensitive ion channel  53.57 
 
 		 289 aa  301  1e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.11552  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0851  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  53.57 
 
 		 289 aa  301  1e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.17895  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0556  MscS Mechanosensitive ion channel  51.25 
 
 		 293 aa  294  1e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3699  MscS Mechanosensitive ion channel  51.62 
 
 		 283 aa  286  2e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3896  MscS Mechanosensitive ion channel  51.26 
 
 		 283 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002474  small-conductance mechanosensitive channel  48.69 
 
 		 288 aa  283  2.0000000000000002e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03562  hypothetical protein  48.31 
 
 		 288 aa  278  9e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3409  mechanosensitive channel MscS  54.45 
 
 		 286 aa  277  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.427229  normal  0.109816 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3307  mechanosensitive channel MscS  54.45 
 
 		 286 aa  277  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3229  mechanosensitive channel MscS  54.45 
 
 		 286 aa  277  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.550002  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3240  mechanosensitive channel MscS  54.45 
 
 		 286 aa  277  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3304  mechanosensitive channel MscS  54.09 
 
 		 286 aa  276  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3337  mechanosensitive channel MscS  54.09 
 
 		 284 aa  276  2e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.306942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0032  hypothetical protein  46.99 
 
 		 287 aa  273  3e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.20954  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2546  small-conductance mechanosensitive channel  47.17 
 
 		 286 aa  271  1e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.748104  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1245  MscS mechanosensitive ion channel  45.38 
 
 		 274 aa  247  1e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.016266  normal  0.622604 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1140  MscS mechanosensitive ion channel  45.8 
 
 		 274 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.15609  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0585  putative small-conductance mechanosensitive channel  43.08 
 
 		 277 aa  242  3.9999999999999997e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000591532  normal  0.0145572 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1345  MscS mechanosensitive ion channel  44.79 
 
 		 274 aa  242  5e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000767633  hitchhiker  0.0000248019 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3778  MscS mechanosensitive ion channel  42.45 
 
 		 276 aa  240  2e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.981923 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1350  MscS Mechanosensitive ion channel  45.08 
 
 		 275 aa  238  5.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000676183  hitchhiker  0.0000000000523866 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3171  MscS mechanosensitive ion channel  45.08 
 
 		 275 aa  238  5.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000563606  hitchhiker  0.0000513684 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3028  MscS mechanosensitive ion channel  45.08 
 
 		 275 aa  238  1e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000445897  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1205  MscS mechanosensitive ion channel  43.94 
 
 		 275 aa  238  1e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00184527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1276  MscS mechanosensitive ion channel  43.94 
 
 		 275 aa  238  1e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000188457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2469  putative transport protein  45.02 
 
 		 269 aa  237  2e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3013  MscS mechanosensitive ion channel  45.08 
 
 		 275 aa  236  2e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000253066  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2296  MscS mechanosensitive ion channel  43.43 
 
 		 270 aa  236  3e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1206  MscS mechanosensitive ion channel  43.18 
 
 		 275 aa  235  5.0000000000000005e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0281  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3340  small-conductance mechanosensitive channel  43.18 
 
 		 275 aa  235  7e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1152  MscS mechanosensitive ion channel  44.32 
 
 		 274 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0163398  normal  0.0148083 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2803  MscS mechanosensitive ion channel  43.96 
 
 		 277 aa  233  3e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2465  putative small-conductance mechanosensitive channel  42.8 
 
 		 275 aa  232  5e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.404234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2675  MscS mechanosensitive ion channel  43.18 
 
 		 275 aa  229  4e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00133263  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1359  MscS mechanosensitive ion channel  44.36 
 
 		 275 aa  229  5e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0047  MscS mechanosensitive ion channel  40.98 
 
 		 270 aa  226  5.0000000000000005e-58  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0797  MscS Mechanosensitive ion channel  42.8 
 
 		 268 aa  221  9.999999999999999e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3333  MscS mechanosensitive ion channel  39.31 
 
 		 275 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03290  MscS Mechanosensitive ion channel  38.93 
 
 		 280 aa  216  2.9999999999999998e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1533  MscS Mechanosensitive ion channel  40.87 
 
 		 276 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1967  MscS Mechanosensitive ion channel  41.02 
 
 		 279 aa  213  2.9999999999999995e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.340778 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1584  MscS mechanosensitive ion channel  40.86 
 
 		 279 aa  202  4e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00518641  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0527  MscS mechanosensitive ion channel  40.98 
 
 		 276 aa  200  3e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.546646 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3200  MscS Mechanosensitive ion channel  38.04 
 
 		 275 aa  199  3.9999999999999996e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126037  normal  0.165541 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0812  small-conductance mechanosensitive channel  36.23 
 
 		 274 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0452  MscS mechanosensitive ion channel  42.73 
 
 		 283 aa  196  5.000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00426986  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4603  mechanosensitive ion channel family protein  36.19 
 
 		 275 aa  195  6e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0390  MscS mechanosensitive ion channel  39.26 
 
 		 274 aa  194  1e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.855015  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0202  mechanosensitive ion channel family protein  37.96 
 
 		 271 aa  194  2e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0204  mechanosensitive ion channel family protein  37.59 
 
 		 271 aa  193  3e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.171183  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3627  MscS mechanosensitive ion channel  39.33 
 
 		 268 aa  191  1e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.143912 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01095  mechanosensitive ion channel family protein  36.19 
 
 		 280 aa  190  2e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0940  MscS mechanosensitive ion channel  40.96 
 
 		 275 aa  187  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.546965 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1419  mechanosensitive ion channel family protein  38.06 
 
 		 278 aa  185  6e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0541  MscS mechanosensitive ion channel  34.12 
 
 		 273 aa  185  8e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0955  MscS mechanosensitive ion channel  35.42 
 
 		 298 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1856  hypothetical protein  36.23 
 
 		 281 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.130527  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2565  hypothetical protein  35.79 
 
 		 283 aa  181  9.000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2402  hypothetical protein  41.13 
 
 		 279 aa  181  1e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.267781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2423  MscS Mechanosensitive ion channel  37.05 
 
 		 297 aa  181  2e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.591216  normal  0.0692547 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3620  MscS mechanosensitive ion channel  35.16 
 
 		 277 aa  179  5.999999999999999e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.812148  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0625  small-conductance mechanosensitive ion channel  34.01 
 
 		 291 aa  177  2e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.286405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00165  mechanosensitive ion channel family protein  39.55 
 
 		 276 aa  175  9.999999999999999e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01983  MscS Mechanosensitive ion channel ei VT8  35.52 
 
 		 279 aa  174  9.999999999999999e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.865643  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1674  MscS mechanosensitive ion channel  33.6 
 
 		 270 aa  174  9.999999999999999e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.702305  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2740  MscS mechanosensitive ion channel  33.21 
 
 		 288 aa  174  1.9999999999999998e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1342  MscS Mechanosensitive ion channel  37.71 
 
 		 266 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00293598  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1034  MscS mechanosensitive ion channel  35.58 
 
 		 288 aa  174  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2137  MscS mechanosensitive ion channel  36.58 
 
 		 288 aa  172  7.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.857102  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0589  MscS mechanosensitive ion channel  32.21 
 
 		 291 aa  170  2e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.516163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0949  MscS Mechanosensitive ion channel  34.34 
 
 		 273 aa  170  2e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3375  MscS mechanosensitive ion channel  33.98 
 
 		 302 aa  168  1e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.190462  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3671  MscS mechanosensitive ion channel  33.73 
 
 		 277 aa  167  2e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1746  mechanosensitive ion channel family protein  32.48 
 
 		 531 aa  164  1.0000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0592  small conductance mechanosensitive ion channel  33.99 
 
 		 305 aa  164  1.0000000000000001e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.311151  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00921  small conductance mechanosensitive ion channel  34.54 
 
 		 322 aa  160  3e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.230623  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1162  MscS Mechanosensitive ion channel  34.94 
 
 		 294 aa  159  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.102088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0547  MscS mechanosensitive ion channel  33.99 
 
 		 305 aa  158  9e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.881892  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3521  MscS mechanosensitive ion channel  31.34 
 
 		 547 aa  158  1e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1036  putative mechanosensitive ion channel protein  31.34 
 
 		 534 aa  156  3e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2641  MscS Mechanosensitive ion channel  33.59 
 
 		 280 aa  156  3e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5331  MscS mechanosensitive ion channel  32.55 
 
 		 301 aa  156  4e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4338  MscS mechanosensitive ion channel  30.74 
 
 		 533 aa  154  1e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>