More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_3397 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_3397  MscS mechanosensitive ion channel  100 
 
 
291 aa  597  1e-169  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4436  MscS Mechanosensitive ion channel  58.16 
 
 
285 aa  331  9e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.312478 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4433  MscS Mechanosensitive ion channel  58.16 
 
 
285 aa  331  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4503  MscS Mechanosensitive ion channel  57.8 
 
 
285 aa  329  3e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4349  MscS Mechanosensitive ion channel  57.8 
 
 
285 aa  328  7e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0556  MscS Mechanosensitive ion channel  55.02 
 
 
293 aa  318  5e-86  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3942  MscS mechanosensitive ion channel  57.62 
 
 
288 aa  317  1e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.639966 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0851  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  55.02 
 
 
289 aa  309  2.9999999999999997e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.17895  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0854  MscS mechanosensitive ion channel  55.02 
 
 
289 aa  309  2.9999999999999997e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.11552  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3818  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  55.02 
 
 
289 aa  309  2.9999999999999997e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.905722  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3699  MscS Mechanosensitive ion channel  53.82 
 
 
283 aa  309  4e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3896  MscS Mechanosensitive ion channel  51.79 
 
 
283 aa  301  6.000000000000001e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0515  MscS Mechanosensitive ion channel  51.97 
 
 
292 aa  300  1e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0786  mechanosensitive channel MscS  51.91 
 
 
286 aa  295  9e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02755  mechanosensitive channel  51.53 
 
 
286 aa  293  3e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0769  MscS Mechanosensitive ion channel  51.53 
 
 
286 aa  293  3e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3251  mechanosensitive channel MscS  51.53 
 
 
286 aa  293  3e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02718  hypothetical protein  51.53 
 
 
286 aa  293  3e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3061  mechanosensitive channel MscS  51.53 
 
 
291 aa  293  3e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.397816  normal  0.219365 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3082  mechanosensitive channel MscS  51.53 
 
 
286 aa  293  3e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3349  mechanosensitive channel MscS  51.53 
 
 
286 aa  293  3e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4221  mechanosensitive channel MscS  51.53 
 
 
286 aa  293  3e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002474  small-conductance mechanosensitive channel  48.52 
 
 
288 aa  281  8.000000000000001e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3337  mechanosensitive channel MscS  50.75 
 
 
284 aa  280  2e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.306942  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03562  hypothetical protein  47.78 
 
 
288 aa  279  4e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0032  hypothetical protein  47.19 
 
 
287 aa  274  1.0000000000000001e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.20954  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3240  mechanosensitive channel MscS  51.72 
 
 
286 aa  271  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3307  mechanosensitive channel MscS  51.72 
 
 
286 aa  271  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3409  mechanosensitive channel MscS  51.72 
 
 
286 aa  271  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.427229  normal  0.109816 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3229  mechanosensitive channel MscS  51.72 
 
 
286 aa  271  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.550002  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2546  small-conductance mechanosensitive channel  45.79 
 
 
286 aa  270  2e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.748104  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3304  mechanosensitive channel MscS  51.34 
 
 
286 aa  270  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2469  putative transport protein  45.16 
 
 
269 aa  249  4e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3171  MscS mechanosensitive ion channel  47.08 
 
 
275 aa  246  2e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000563606  hitchhiker  0.0000513684 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1350  MscS Mechanosensitive ion channel  47.08 
 
 
275 aa  246  2e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000676183  hitchhiker  0.0000000000523866 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3028  MscS mechanosensitive ion channel  47.08 
 
 
275 aa  246  3e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000445897  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2465  putative small-conductance mechanosensitive channel  46.33 
 
 
275 aa  245  4.9999999999999997e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.404234  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3013  MscS mechanosensitive ion channel  47.08 
 
 
275 aa  245  6.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000253066  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1205  MscS mechanosensitive ion channel  46.27 
 
 
275 aa  245  6.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00184527  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1276  MscS mechanosensitive ion channel  46.27 
 
 
275 aa  245  6.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000188457  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1206  MscS mechanosensitive ion channel  46.27 
 
 
275 aa  245  6.999999999999999e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0281  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3340  small-conductance mechanosensitive channel  45.88 
 
 
275 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1359  MscS mechanosensitive ion channel  45.35 
 
 
275 aa  242  5e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2675  MscS mechanosensitive ion channel  45.53 
 
 
275 aa  241  9e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00133263  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2803  MscS mechanosensitive ion channel  45.97 
 
 
277 aa  241  1e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1152  MscS mechanosensitive ion channel  44.79 
 
 
274 aa  238  1e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0163398  normal  0.0148083 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1245  MscS mechanosensitive ion channel  42.32 
 
 
274 aa  237  2e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.016266  normal  0.622604 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3778  MscS mechanosensitive ion channel  42.64 
 
 
276 aa  233  4.0000000000000004e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.981923 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2296  MscS mechanosensitive ion channel  43.14 
 
 
270 aa  232  6e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1140  MscS mechanosensitive ion channel  42.47 
 
 
274 aa  227  1e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.15609  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0585  putative small-conductance mechanosensitive channel  42.04 
 
 
277 aa  224  1e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000591532  normal  0.0145572 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1345  MscS mechanosensitive ion channel  40.93 
 
 
274 aa  223  3e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000767633  hitchhiker  0.0000248019 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3333  MscS mechanosensitive ion channel  40.77 
 
 
275 aa  221  7e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0047  MscS mechanosensitive ion channel  40.16 
 
 
270 aa  217  2e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1533  MscS Mechanosensitive ion channel  40.32 
 
 
276 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3200  MscS Mechanosensitive ion channel  40.15 
 
 
275 aa  211  2e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126037  normal  0.165541 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03290  MscS Mechanosensitive ion channel  38.31 
 
 
280 aa  211  2e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1584  MscS mechanosensitive ion channel  40.98 
 
 
279 aa  203  2e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00518641  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1967  MscS Mechanosensitive ion channel  40.76 
 
 
279 aa  201  9e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.340778 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0940  MscS mechanosensitive ion channel  40.62 
 
 
275 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.546965 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4603  mechanosensitive ion channel family protein  39.76 
 
 
275 aa  197  1.0000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0527  MscS mechanosensitive ion channel  39.22 
 
 
276 aa  197  1.0000000000000001e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.546646 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0812  small-conductance mechanosensitive channel  35.48 
 
 
274 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0797  MscS Mechanosensitive ion channel  38.78 
 
 
268 aa  196  4.0000000000000005e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01095  mechanosensitive ion channel family protein  35.41 
 
 
280 aa  194  2e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0625  small-conductance mechanosensitive ion channel  34.38 
 
 
291 aa  193  4e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.286405  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0955  MscS mechanosensitive ion channel  36.98 
 
 
298 aa  189  4e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0202  mechanosensitive ion channel family protein  34.78 
 
 
271 aa  189  4e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0204  mechanosensitive ion channel family protein  35.04 
 
 
271 aa  189  5e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.171183  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0452  MscS mechanosensitive ion channel  40.18 
 
 
283 aa  189  7e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00426986  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2565  hypothetical protein  35.85 
 
 
283 aa  187  2e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0541  MscS mechanosensitive ion channel  34.8 
 
 
273 aa  187  2e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00165  mechanosensitive ion channel family protein  38.56 
 
 
276 aa  184  1.0000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1419  mechanosensitive ion channel family protein  38.52 
 
 
278 aa  182  5.0000000000000004e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3671  MscS mechanosensitive ion channel  33.61 
 
 
277 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3627  MscS mechanosensitive ion channel  34.8 
 
 
268 aa  182  6e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.143912 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0589  MscS mechanosensitive ion channel  33.2 
 
 
291 aa  182  8.000000000000001e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.516163  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1709  small conductance mechanosensitive channel  34.92 
 
 
494 aa  181  1e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0466336 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3620  MscS mechanosensitive ion channel  34.18 
 
 
277 aa  179  5.999999999999999e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.812148  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0561  MscS mechanosensitive ion channel  33.73 
 
 
551 aa  177  2e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0562  MscS mechanosensitive ion channel  33.73 
 
 
551 aa  177  3e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01983  MscS Mechanosensitive ion channel ei VT8  36.82 
 
 
279 aa  176  4e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.865643  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3719  MscS mechanosensitive ion channel  33.21 
 
 
538 aa  176  5e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00173633  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0390  MscS mechanosensitive ion channel  32.13 
 
 
274 aa  175  8e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.855015  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0592  small conductance mechanosensitive ion channel  32.8 
 
 
305 aa  174  9.999999999999999e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.311151  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1674  MscS mechanosensitive ion channel  35.34 
 
 
270 aa  174  9.999999999999999e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.702305  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3468  MscS mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 
550 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0613  MscS mechanosensitive ion channel  33.59 
 
 
547 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000873032  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1034  MscS mechanosensitive ion channel  35.1 
 
 
288 aa  173  2.9999999999999996e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1342  MscS Mechanosensitive ion channel  36.48 
 
 
266 aa  172  3.9999999999999995e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00293598  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4338  MscS mechanosensitive ion channel  30.37 
 
 
533 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3145  mechanosensitive ion channel  32.21 
 
 
544 aa  171  2e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.187903  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2402  hypothetical protein  35.74 
 
 
279 aa  170  2e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.267781  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0547  MscS mechanosensitive ion channel  32.8 
 
 
305 aa  171  2e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.881892  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3521  MscS mechanosensitive ion channel  31.84 
 
 
547 aa  171  2e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1856  hypothetical protein  33.33 
 
 
281 aa  169  4e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.130527  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3803  MscS mechanosensitive ion channel  33.94 
 
 
549 aa  169  4e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.717222  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3747  MscS Mechanosensitive ion channel  33.94 
 
 
549 aa  169  4e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3929  MscS mechanosensitive ion channel  33.94 
 
 
549 aa  169  4e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1162  MscS Mechanosensitive ion channel  37.35 
 
 
294 aa  169  7e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.102088  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>