More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2229 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_2229  MscS Mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 400 aa  791    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.224666  normal  0.568068 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1647  MscS Mechanosensitive ion channel  44.67 
 
 		 429 aa  330  3e-89  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0057  MscS Mechanosensitive ion channel  43.38 
 
 		 421 aa  299  6e-80  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.185804  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2393  MscS Mechanosensitive ion channel  47.31 
 
 		 408 aa  269  5.9999999999999995e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2105  MscS Mechanosensitive ion channel  41.03 
 
 		 414 aa  268  1e-70  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0600957  normal  0.059013 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1093  MscS Mechanosensitive ion channel  42.91 
 
 		 389 aa  266  5.999999999999999e-70  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.464677  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1529  MscS Mechanosensitive ion channel  34.36 
 
 		 385 aa  201  1.9999999999999998e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0444  MscS Mechanosensitive ion channel  35.79 
 
 		 404 aa  193  6e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.920627  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1074  MscS mechanosensitive ion channel  33.62 
 
 		 360 aa  143  5e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.287098  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0359  MscS mechanosensitive ion channel  32.63 
 
 		 360 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.821631  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1552  MscS mechanosensitive ion channel  31.64 
 
 		 359 aa  140  3e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.101944 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1770  MscS mechanosensitive ion channel  30.21 
 
 		 406 aa  138  1e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0360  MscS mechanosensitive ion channel  33.94 
 
 		 393 aa  137  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1856  hypothetical protein  30.65 
 
 		 281 aa  136  6.0000000000000005e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.130527  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1689  MscS mechanosensitive ion channel  29.66 
 
 		 356 aa  136  8e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0955  MscS mechanosensitive ion channel  28.57 
 
 		 298 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2000  MscS Mechanosensitive ion channel  34.07 
 
 		 302 aa  133  6.999999999999999e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.03582 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1775  MscS mechanosensitive ion channel  30.8 
 
 		 283 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0091  MscS Mechanosensitive ion channel  38.01 
 
 		 297 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0951  MscS Mechanosensitive ion channel  33.06 
 
 		 341 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2137  MscS mechanosensitive ion channel  31.56 
 
 		 288 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.857102  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0767  small-conductance mechanosensitive ion channel  32.29 
 
 		 401 aa  128  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.967765  normal  0.366005 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1187  MscS Mechanosensitive ion channel  37.43 
 
 		 305 aa  127  4.0000000000000003e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0250538  hitchhiker  0.00000123969 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0773  MscS mechanosensitive ion channel  31.84 
 
 		 401 aa  127  4.0000000000000003e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2332  MscS Mechanosensitive ion channel  31.36 
 
 		 362 aa  126  6e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2981  hypothetical protein  29.25 
 
 		 298 aa  125  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0759175  normal  0.0858863 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2646  MscS mechanosensitive ion channel  29.3 
 
 		 322 aa  125  1e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1417  MscS Mechanosensitive ion channel  29.46 
 
 		 304 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0444  MscS mechanosensitive ion channel  27.75 
 
 		 540 aa  124  4e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2740  MscS mechanosensitive ion channel  26.54 
 
 		 288 aa  123  5e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03062  hypothetical protein  29.75 
 
 		 563 aa  122  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3168  MscS Mechanosensitive ion channel  31.16 
 
 		 311 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0116515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0613  MscS mechanosensitive ion channel  29.56 
 
 		 547 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000873032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1042  MscS Mechanosensitive ion channel  37.87 
 
 		 310 aa  120  3.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01752  putative mechanosensitive channel protein (MscS family)  31.9 
 
 		 328 aa  120  4.9999999999999996e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.249612  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1888  MscS Mechanosensitive ion channel  28.87 
 
 		 362 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2296  MscS mechanosensitive ion channel  28.52 
 
 		 270 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0476  MscS mechanosensitive ion channel  31.53 
 
 		 279 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.139506  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1036  putative mechanosensitive ion channel protein  28.57 
 
 		 534 aa  118  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0514  MscS Mechanosensitive ion channel  30.38 
 
 		 288 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0940  MscS mechanosensitive ion channel  31.08 
 
 		 275 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.546965 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4090  MscS mechanosensitive ion channel  30.93 
 
 		 349 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2771  MscS Mechanosensitive ion channel  32.02 
 
 		 296 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1062  MscS Mechanosensitive ion channel  33.18 
 
 		 310 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.771269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0306  small-conductance mechanosensitive channel  31.13 
 
 		 284 aa  117  3e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000279081  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01095  mechanosensitive ion channel family protein  30.04 
 
 		 280 aa  117  3e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3058  MscS mechanosensitive ion channel  31.82 
 
 		 435 aa  117  3e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.914338 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3521  MscS mechanosensitive ion channel  29.7 
 
 		 547 aa  117  3e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1533  MscS Mechanosensitive ion channel  31.6 
 
 		 276 aa  117  3e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1701  phosphoglycerate mutase  28.32 
 
 		 310 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0047  MscS mechanosensitive ion channel  27.75 
 
 		 270 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1895  MscS Mechanosensitive ion channel  33.5 
 
 		 286 aa  116  6e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.461855 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1350  hypothetical protein  29.5 
 
 		 292 aa  115  8.999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.136839  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2295  mechanosensitive ion channel family protein  26.09 
 
 		 289 aa  115  1.0000000000000001e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0390  MscS mechanosensitive ion channel  29.44 
 
 		 274 aa  115  1.0000000000000001e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.855015  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0661  MscS Mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 295 aa  115  1.0000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002898  small-conductance mechanosensitive channel  30.28 
 
 		 532 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.341732  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1250  MscS mechanosensitive ion channel  29.95 
 
 		 361 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000414305  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2330  MscS Mechanosensitive ion channel  30.16 
 
 		 458 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.194216  normal  0.152351 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2381  MscS mechanosensitive ion channel  27.95 
 
 		 287 aa  115  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.42777  hitchhiker  0.00000285336 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1189  MscS Mechanosensitive ion channel  35.05 
 
 		 445 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2696  MscS Mechanosensitive ion channel  31.84 
 
 		 369 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.415509  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4338  MscS mechanosensitive ion channel  24 
 
 		 533 aa  114  3e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01983  MscS Mechanosensitive ion channel ei VT8  31.28 
 
 		 279 aa  114  3e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.865643  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00921  small conductance mechanosensitive ion channel  28 
 
 		 322 aa  114  4.0000000000000004e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.230623  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3778  MscS mechanosensitive ion channel  30.53 
 
 		 276 aa  114  4.0000000000000004e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.981923 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0890  MscS mechanosensitive ion channel  29.57 
 
 		 330 aa  113  5e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000201965 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3719  MscS mechanosensitive ion channel  23.71 
 
 		 538 aa  113  6e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00173633  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3627  MscS mechanosensitive ion channel  28.51 
 
 		 268 aa  113  7.000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.143912 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03290  MscS Mechanosensitive ion channel  32.33 
 
 		 280 aa  113  8.000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3012  MscS mechanosensitive ion channel  31.65 
 
 		 297 aa  112  9e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1342  MscS Mechanosensitive ion channel  32.35 
 
 		 266 aa  112  9e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00293598  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3929  MscS mechanosensitive ion channel  28.57 
 
 		 549 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3803  MscS mechanosensitive ion channel  28.57 
 
 		 549 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.717222  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3747  MscS Mechanosensitive ion channel  28.57 
 
 		 549 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2719  MscS Mechanosensitive ion channel  29.76 
 
 		 457 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3200  MscS Mechanosensitive ion channel  29.68 
 
 		 275 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126037  normal  0.165541 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3061  mechanosensitive channel MscS  31.38 
 
 		 291 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.397816  normal  0.219365 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3333  MscS mechanosensitive ion channel  32.59 
 
 		 275 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2355  MscS mechanosensitive ion channel  29.55 
 
 		 295 aa  111  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0549147  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1335  MscS mechanosensitive ion channel  28.89 
 
 		 275 aa  111  3e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000063147 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2273  MscS mechanosensitive ion channel  28.44 
 
 		 258 aa  111  3e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0786  mechanosensitive channel MscS  31.11 
 
 		 286 aa  110  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02755  mechanosensitive channel  31.11 
 
 		 286 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0769  MscS Mechanosensitive ion channel  31.11 
 
 		 286 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3145  mechanosensitive ion channel  27.32 
 
 		 544 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.187903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1797  mechanosensitive ion channel  30.69 
 
 		 561 aa  110  4.0000000000000004e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.433096  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3082  mechanosensitive channel MscS  31.11 
 
 		 286 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3251  mechanosensitive channel MscS  31.11 
 
 		 286 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4221  mechanosensitive channel MscS  31.11 
 
 		 286 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1967  MscS Mechanosensitive ion channel  33.71 
 
 		 279 aa  110  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.340778 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3349  mechanosensitive channel MscS  31.11 
 
 		 286 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02718  hypothetical protein  31.11 
 
 		 286 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0663  MscS Mechanosensitive ion channel  29.78 
 
 		 336 aa  110  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1934  mechanosensitive ion channel family protein  25.84 
 
 		 287 aa  110  5e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.117079  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3468  MscS mechanosensitive ion channel  25.1 
 
 		 550 aa  110  5e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3343  mechanosensitive ion channel protein  28.57 
 
 		 813 aa  110  6e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.183155 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2942  MscS mechanosensitive ion channel  34.01 
 
 		 304 aa  110  6e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.176096  normal  0.766616 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4603  mechanosensitive ion channel family protein  27.55 
 
 		 275 aa  109  7.000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0561  MscS mechanosensitive ion channel  27.59 
 
 		 551 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>