More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0444 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_0444  MscS Mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 404 aa  815    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.920627  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1529  MscS Mechanosensitive ion channel  49.01 
 
 		 385 aa  310  4e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2393  MscS Mechanosensitive ion channel  36.7 
 
 		 408 aa  246  6.999999999999999e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1093  MscS Mechanosensitive ion channel  34.36 
 
 		 389 aa  238  2e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.464677  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1647  MscS Mechanosensitive ion channel  35.86 
 
 		 429 aa  233  3e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2105  MscS Mechanosensitive ion channel  36.82 
 
 		 414 aa  216  4e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0600957  normal  0.059013 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0057  MscS Mechanosensitive ion channel  42.74 
 
 		 421 aa  211  2e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.185804  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2229  MscS Mechanosensitive ion channel  37.5 
 
 		 400 aa  206  5e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.224666  normal  0.568068 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1187  MscS Mechanosensitive ion channel  33.09 
 
 		 305 aa  130  3e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0250538  hitchhiker  0.00000123969 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0940  MscS mechanosensitive ion channel  36.41 
 
 		 275 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.546965 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1552  MscS mechanosensitive ion channel  30.89 
 
 		 359 aa  127  5e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.101944 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1074  MscS mechanosensitive ion channel  30.89 
 
 		 360 aa  126  6e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.287098  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0359  MscS mechanosensitive ion channel  32.42 
 
 		 360 aa  126  8.000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.821631  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2381  MscS mechanosensitive ion channel  31.9 
 
 		 287 aa  125  2e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.42777  hitchhiker  0.00000285336 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2296  MscS mechanosensitive ion channel  29.66 
 
 		 270 aa  124  4e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1042  MscS Mechanosensitive ion channel  38.51 
 
 		 310 aa  123  6e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0661  MscS Mechanosensitive ion channel  33.61 
 
 		 295 aa  121  1.9999999999999998e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2000  MscS Mechanosensitive ion channel  37.14 
 
 		 302 aa  120  3e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.03582 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0360  MscS mechanosensitive ion channel  29.76 
 
 		 393 aa  120  3.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0091  MscS Mechanosensitive ion channel  35.61 
 
 		 297 aa  120  6e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0390  MscS mechanosensitive ion channel  33.5 
 
 		 274 aa  119  9.999999999999999e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.855015  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0951  MscS Mechanosensitive ion channel  31.66 
 
 		 341 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3627  MscS mechanosensitive ion channel  27.56 
 
 		 268 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.143912 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0527  MscS mechanosensitive ion channel  29.87 
 
 		 276 aa  117  3.9999999999999997e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.546646 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2771  MscS Mechanosensitive ion channel  31.43 
 
 		 296 aa  116  5e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1417  MscS Mechanosensitive ion channel  35.68 
 
 		 304 aa  117  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0209  MscS mechanosensitive ion channel  27.98 
 
 		 685 aa  116  7.999999999999999e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0673077 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2646  MscS mechanosensitive ion channel  33.5 
 
 		 322 aa  116  7.999999999999999e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57110  hypothetical protein  34.67 
 
 		 278 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2529  MscS Mechanosensitive ion channel  30.42 
 
 		 864 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03290  MscS Mechanosensitive ion channel  28.46 
 
 		 280 aa  114  4.0000000000000004e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4892  MscS Mechanosensitive ion channel  31.02 
 
 		 560 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4965  hypothetical protein  34.17 
 
 		 278 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0960  MscS mechanosensitive ion channel  35.38 
 
 		 280 aa  113  5e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1689  MscS mechanosensitive ion channel  26.44 
 
 		 356 aa  114  5e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3168  MscS Mechanosensitive ion channel  26.59 
 
 		 311 aa  113  6e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0116515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01983  MscS Mechanosensitive ion channel ei VT8  30.12 
 
 		 279 aa  113  7.000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.865643  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4496  MscS mechanosensitive ion channel  35.03 
 
 		 280 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.737667  normal  0.727724 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0569  MscS Mechanosensitive ion channel  29.03 
 
 		 280 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.912877  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3058  MscS mechanosensitive ion channel  31.98 
 
 		 435 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.914338 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3333  MscS mechanosensitive ion channel  27.91 
 
 		 275 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1888  MscS Mechanosensitive ion channel  30.38 
 
 		 362 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1942  MscS mechanosensitive ion channel  31.4 
 
 		 360 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1770  MscS mechanosensitive ion channel  30.24 
 
 		 406 aa  112  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2137  MscS mechanosensitive ion channel  28.37 
 
 		 288 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.857102  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1250  MscS mechanosensitive ion channel  30.05 
 
 		 361 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000414305  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1062  MscS Mechanosensitive ion channel  27.02 
 
 		 310 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.771269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4371  MscS mechanosensitive ion channel  34.87 
 
 		 280 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.053495 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1353  MscS mechanosensitive ion channel  34.87 
 
 		 282 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.512703  normal  0.132094 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1533  MscS Mechanosensitive ion channel  29.17 
 
 		 276 aa  111  3e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4420  MscS mechanosensitive ion channel  35.44 
 
 		 279 aa  110  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0689552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0452  MscS mechanosensitive ion channel  28.63 
 
 		 283 aa  110  4.0000000000000004e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00426986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1152  MscS mechanosensitive ion channel  33.16 
 
 		 274 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0163398  normal  0.0148083 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1438  MscS mechanosensitive ion channel  27.95 
 
 		 840 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.139296  normal  0.137989 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3778  MscS mechanosensitive ion channel  27.42 
 
 		 276 aa  110  5e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.981923 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0955  MscS mechanosensitive ion channel  28.64 
 
 		 298 aa  110  5e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2332  MscS Mechanosensitive ion channel  29.34 
 
 		 362 aa  109  8.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01752  putative mechanosensitive channel protein (MscS family)  29.46 
 
 		 328 aa  109  8.000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.249612  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1335  MscS mechanosensitive ion channel  24.71 
 
 		 275 aa  108  1e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000063147 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2696  MscS Mechanosensitive ion channel  30.23 
 
 		 369 aa  108  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.415509  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2740  MscS mechanosensitive ion channel  26.84 
 
 		 288 aa  108  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01095  mechanosensitive ion channel family protein  23.7 
 
 		 280 aa  108  1e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0949  MscS Mechanosensitive ion channel  32.2 
 
 		 273 aa  108  1e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2803  MscS mechanosensitive ion channel  30.1 
 
 		 277 aa  108  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3521  MscS mechanosensitive ion channel  26.69 
 
 		 547 aa  109  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2465  putative small-conductance mechanosensitive channel  33.16 
 
 		 275 aa  109  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.404234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0514  MscS Mechanosensitive ion channel  28.27 
 
 		 288 aa  108  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1994  MscS mechanosensitive ion channel  29.75 
 
 		 796 aa  108  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.952395 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3172  MscS Mechanosensitive ion channel  29.49 
 
 		 784 aa  108  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2675  MscS mechanosensitive ion channel  31.09 
 
 		 275 aa  108  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00133263  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1530  MscS Mechanosensitive ion channel  28.25 
 
 		 372 aa  108  2e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.421553 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2942  MscS mechanosensitive ion channel  33.67 
 
 		 304 aa  108  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.176096  normal  0.766616 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3200  MscS Mechanosensitive ion channel  29.34 
 
 		 275 aa  107  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126037  normal  0.165541 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0204  mechanosensitive ion channel family protein  32.98 
 
 		 271 aa  107  3e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.171183  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1712  MscS mechanosensitive ion channel  29.91 
 
 		 291 aa  107  3e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1699  MscS mechanosensitive ion channel  30.58 
 
 		 456 aa  107  3e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.254155  normal  0.22429 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3013  MscS mechanosensitive ion channel  33.5 
 
 		 843 aa  107  4e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1146  MscS mechanosensitive ion channel  31.17 
 
 		 366 aa  107  4e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.779955  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1633  hypothetical protein  30.92 
 
 		 364 aa  107  5e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246622  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0444  MscS mechanosensitive ion channel  28.29 
 
 		 540 aa  107  5e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2479  MscS Mechanosensitive ion channel  29.85 
 
 		 383 aa  107  5e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.827266 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1140  MscS mechanosensitive ion channel  31.09 
 
 		 274 aa  107  5e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.15609  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0202  mechanosensitive ion channel family protein  32.98 
 
 		 271 aa  107  5e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2760  MscS Mechanosensitive ion channel  32.42 
 
 		 344 aa  107  5e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.394899  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0625  small-conductance mechanosensitive ion channel  27.31 
 
 		 291 aa  106  7e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.286405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1034  MscS mechanosensitive ion channel  29.29 
 
 		 288 aa  106  7e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2507  MscS mechanosensitive ion channel  28.57 
 
 		 475 aa  106  7e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1465  hypothetical protein  29.73 
 
 		 753 aa  106  9e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0015  MscS Mechanosensitive ion channel  30.38 
 
 		 339 aa  106  9e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.189168  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00678  mechanosensitive ion channel family protein  31 
 
 		 271 aa  105  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.096226  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2837  MscS Mechanosensitive ion channel  29.64 
 
 		 366 aa  105  1e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.426677  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3397  MscS mechanosensitive ion channel  31.94 
 
 		 291 aa  105  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1206  MscS mechanosensitive ion channel  30.57 
 
 		 275 aa  105  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1453  MscS mechanosensitive ion channel  28.4 
 
 		 1105 aa  105  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3620  MscS mechanosensitive ion channel  30.24 
 
 		 277 aa  105  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.812148  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2469  putative transport protein  26.61 
 
 		 269 aa  105  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13183  putative mechanosensitive channel protein (MscS family)  27.07 
 
 		 316 aa  104  2e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0384  mechanosensitive ion channel  26.69 
 
 		 752 aa  104  2e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00921  small conductance mechanosensitive ion channel  29.53 
 
 		 322 aa  105  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.230623  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0589  MscS mechanosensitive ion channel  28.71 
 
 		 291 aa  104  3e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.516163  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>