More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2760 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_2760  MscS Mechanosensitive ion channel  100 
 
 
344 aa  681    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.394899  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2475  MscS Mechanosensitive ion channel  66.45 
 
 
334 aa  384  1e-105  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.288536  normal  0.672517 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1530  MscS Mechanosensitive ion channel  57.61 
 
 
372 aa  316  5e-85  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.421553 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0015  MscS Mechanosensitive ion channel  55.4 
 
 
339 aa  288  9e-77  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.189168  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1857  MscS Mechanosensitive ion channel  49.68 
 
 
345 aa  272  6e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1633  hypothetical protein  31.94 
 
 
364 aa  120  3e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246622  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1942  MscS mechanosensitive ion channel  35.41 
 
 
360 aa  110  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1699  MscS mechanosensitive ion channel  30.97 
 
 
456 aa  109  7.000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.254155  normal  0.22429 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2332  MscS Mechanosensitive ion channel  28.89 
 
 
362 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2646  MscS mechanosensitive ion channel  30.19 
 
 
322 aa  107  3e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2696  MscS Mechanosensitive ion channel  30.81 
 
 
369 aa  107  4e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.415509  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0444  MscS Mechanosensitive ion channel  27.97 
 
 
404 aa  105  8e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.920627  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2507  MscS mechanosensitive ion channel  27.47 
 
 
475 aa  104  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2065  MscS mechanosensitive ion channel  28.52 
 
 
359 aa  102  7e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1146  MscS mechanosensitive ion channel  30.28 
 
 
366 aa  102  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.779955  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1888  MscS Mechanosensitive ion channel  28 
 
 
362 aa  100  4e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0136  MscS mechanosensitive ion channel  26.77 
 
 
451 aa  99.8  6e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.100396  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0661  MscS Mechanosensitive ion channel  29.55 
 
 
295 aa  99.4  9e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3071  hypothetical protein  31.03 
 
 
366 aa  97.8  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.962312  normal  0.378174 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0951  MscS Mechanosensitive ion channel  27.84 
 
 
341 aa  97.8  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5091  MscS Mechanosensitive ion channel  27.98 
 
 
637 aa  97.4  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00148956  normal  0.0183068 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0209  MscS mechanosensitive ion channel  26.02 
 
 
685 aa  97.1  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0673077 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0360  MscS mechanosensitive ion channel  28.57 
 
 
393 aa  96.3  7e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1529  MscS Mechanosensitive ion channel  27.92 
 
 
385 aa  95.5  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2229  MscS Mechanosensitive ion channel  30.22 
 
 
400 aa  94.7  2e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.224666  normal  0.568068 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2105  MscS Mechanosensitive ion channel  27.07 
 
 
414 aa  94  4e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0600957  normal  0.059013 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3058  MscS mechanosensitive ion channel  32.08 
 
 
435 aa  92.8  8e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.914338 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2555  MscS mechanosensitive ion channel  29.75 
 
 
321 aa  92.4  9e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0579  MscS mechanosensitive ion channel  27.27 
 
 
440 aa  92  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0872803  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2393  MscS Mechanosensitive ion channel  29.05 
 
 
408 aa  92  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6436  MscS Mechanosensitive ion channel  29.35 
 
 
432 aa  91.3  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.227593 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0757  MscS mechanosensitive ion channel  27.43 
 
 
479 aa  91.3  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3343  mechanosensitive ion channel protein  26.73 
 
 
813 aa  91.7  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.183155 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3910  hypothetical protein  29.76 
 
 
301 aa  90.9  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1647  MscS Mechanosensitive ion channel  29.09 
 
 
429 aa  90.9  3e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0476  MscS mechanosensitive ion channel  27.4 
 
 
279 aa  90.9  3e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.139506  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1093  MscS Mechanosensitive ion channel  29.95 
 
 
389 aa  90.1  5e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.464677  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1339  MscS Mechanosensitive ion channel  29.06 
 
 
636 aa  90.1  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000323872 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3627  MscS mechanosensitive ion channel  26.17 
 
 
268 aa  90.1  5e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.143912 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1311  MscS Mechanosensitive ion channel  29.06 
 
 
636 aa  90.1  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7380  mechanosensitive ion channel protein  24.89 
 
 
439 aa  89.7  7e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31736  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0057  MscS mechanosensitive ion channel  26.85 
 
 
437 aa  89.7  7e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01467  mechanosensitive ion channel family protein  25.83 
 
 
441 aa  89.4  8e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.619169  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3013  MscS mechanosensitive ion channel  27.83 
 
 
843 aa  88.6  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1895  MscS Mechanosensitive ion channel  30.99 
 
 
286 aa  89.4  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.461855 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1417  MscS Mechanosensitive ion channel  27.88 
 
 
304 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3066  MscS mechanosensitive ion channel  31 
 
 
452 aa  88.6  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0057  MscS Mechanosensitive ion channel  27.92 
 
 
421 aa  87.8  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.185804  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1770  MscS mechanosensitive ion channel  24.8 
 
 
406 aa  88.2  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23390  MscS Mechanosensitive ion channel  28.88 
 
 
299 aa  87.8  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350298  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2331  MscS mechanosensitive ion channel  25.4 
 
 
307 aa  87.4  4e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0340157  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2568  MscS mechanosensitive ion channel  34.44 
 
 
358 aa  87  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0091  MscS Mechanosensitive ion channel  28.96 
 
 
297 aa  87  5e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0015  MscS mechanosensitive ion channel  26.09 
 
 
287 aa  87  5e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0949  MscS Mechanosensitive ion channel  26.75 
 
 
273 aa  87  5e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4892  MscS Mechanosensitive ion channel  27.8 
 
 
560 aa  86.7  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0156  MscS mechanosensitive ion channel  26.17 
 
 
437 aa  86.3  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0421972  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3168  MscS Mechanosensitive ion channel  27.21 
 
 
311 aa  85.9  9e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0116515  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1042  MscS Mechanosensitive ion channel  27.48 
 
 
310 aa  85.5  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2829  MscS mechanosensitive ion channel  23.88 
 
 
294 aa  84.7  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1162  MscS Mechanosensitive ion channel  28.52 
 
 
294 aa  84.7  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.102088  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4436  MscS mechanosensitive ion channel  26.12 
 
 
432 aa  84.7  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.506103  normal  0.992693 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0935  MscS Mechanosensitive ion channel  22.9 
 
 
484 aa  84.3  0.000000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0773  MscS mechanosensitive ion channel  25.6 
 
 
401 aa  84  0.000000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2842  MscS mechanosensitive ion channel  25.2 
 
 
369 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0955  MscS mechanosensitive ion channel  27.3 
 
 
298 aa  84.3  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1222  MscS mechanosensitive ion channel  28.32 
 
 
451 aa  84.3  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.110808  normal  0.111103 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1689  MscS mechanosensitive ion channel  25.95 
 
 
356 aa  84.3  0.000000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2101  MscS Mechanosensitive ion channel  25.55 
 
 
299 aa  84  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172333  normal  0.177745 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5283  MscS Mechanosensitive ion channel  27.59 
 
 
376 aa  84  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2284  MscS mechanosensitive ion channel  26.95 
 
 
273 aa  83.6  0.000000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0145  MscS Mechanosensitive ion channel  26.99 
 
 
795 aa  83.6  0.000000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.584574 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0767  small-conductance mechanosensitive ion channel  25.6 
 
 
401 aa  82.8  0.000000000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.967765  normal  0.366005 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01983  MscS Mechanosensitive ion channel ei VT8  25.25 
 
 
279 aa  82.8  0.000000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.865643  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1465  hypothetical protein  27.65 
 
 
753 aa  82.4  0.000000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03115  MscS Mechanosensitive ion channel  26.98 
 
 
378 aa  82.8  0.000000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2837  MscS Mechanosensitive ion channel  28.57 
 
 
366 aa  82.4  0.000000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.426677  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2316  mechanosensitive ion channel family protein  26.2 
 
 
291 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.176359  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0553  MscS mechanosensitive ion channel  29.53 
 
 
874 aa  82  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.362584 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2985  hypothetical protein  24.47 
 
 
351 aa  82.4  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0299284  normal  0.0305677 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2000  MscS Mechanosensitive ion channel  26.34 
 
 
302 aa  81.3  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.03582 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13183  putative mechanosensitive channel protein (MscS family)  26.67 
 
 
316 aa  81.6  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0390  MscS mechanosensitive ion channel  25.37 
 
 
274 aa  81.3  0.00000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.855015  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1453  MscS mechanosensitive ion channel  24.21 
 
 
1105 aa  80.9  0.00000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2581  MscS mechanosensitive ion channel  28.08 
 
 
298 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.391196  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1518  hypothetical protein  26.98 
 
 
732 aa  80.5  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2988  putative small-conductance mechanosensitive channel  26.42 
 
 
806 aa  80.1  0.00000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000510417  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0384  mechanosensitive ion channel  28.44 
 
 
752 aa  80.1  0.00000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1816  mscS family protein  28.3 
 
 
448 aa  79.7  0.00000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.316092  normal  0.285124 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3304  MscS Mechanosensitive ion channel  24.71 
 
 
1235 aa  79.7  0.00000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01095  mechanosensitive ion channel family protein  20.8 
 
 
280 aa  79.3  0.00000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1903  MscS Mechanosensitive ion channel  26.84 
 
 
303 aa  79.3  0.00000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0811  small-conductance mechanosensitive channel protein  26.15 
 
 
451 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1187  MscS Mechanosensitive ion channel  27.32 
 
 
305 aa  79.3  0.00000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0250538  hitchhiker  0.00000123969 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0101  putative AefA  28.33 
 
 
338 aa  79  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.0000000159695  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1940  MscS mechanosensitive ion channel  26.46 
 
 
489 aa  79  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1335  MscS mechanosensitive ion channel  23.83 
 
 
275 aa  78.6  0.0000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000063147 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2771  MscS Mechanosensitive ion channel  30.05 
 
 
296 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0664  cyclic nucleotide-binding  27.78 
 
 
449 aa  78.6  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0101822  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4144  MscS mechanosensitive ion channel  28.51 
 
 
311 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.789982 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>