More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1529 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_1529  MscS Mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 385 aa  773    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0444  MscS Mechanosensitive ion channel  46.61 
 
 		 404 aa  310  2.9999999999999997e-83  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.920627  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2393  MscS Mechanosensitive ion channel  42.11 
 
 		 408 aa  238  1e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1093  MscS Mechanosensitive ion channel  42.02 
 
 		 389 aa  232  8.000000000000001e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.464677  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1647  MscS Mechanosensitive ion channel  45.02 
 
 		 429 aa  232  8.000000000000001e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2105  MscS Mechanosensitive ion channel  35.52 
 
 		 414 aa  212  1e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0600957  normal  0.059013 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0057  MscS Mechanosensitive ion channel  35.31 
 
 		 421 aa  211  2e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.185804  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2229  MscS Mechanosensitive ion channel  35.07 
 
 		 400 aa  202  9.999999999999999e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.224666  normal  0.568068 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0661  MscS Mechanosensitive ion channel  33.91 
 
 		 295 aa  140  4.999999999999999e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2000  MscS Mechanosensitive ion channel  31.34 
 
 		 302 aa  139  1e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.03582 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0360  MscS mechanosensitive ion channel  30.29 
 
 		 393 aa  136  7.000000000000001e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2296  MscS mechanosensitive ion channel  30.3 
 
 		 270 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4892  MscS Mechanosensitive ion channel  28.23 
 
 		 560 aa  132  9e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0359  MscS mechanosensitive ion channel  32.6 
 
 		 360 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.821631  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1042  MscS Mechanosensitive ion channel  32.24 
 
 		 310 aa  129  6e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3627  MscS mechanosensitive ion channel  27.34 
 
 		 268 aa  129  9.000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.143912 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1074  MscS mechanosensitive ion channel  30.3 
 
 		 360 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.287098  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1888  MscS Mechanosensitive ion channel  29.13 
 
 		 362 aa  127  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0767  small-conductance mechanosensitive ion channel  29.11 
 
 		 401 aa  127  4.0000000000000003e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.967765  normal  0.366005 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1187  MscS Mechanosensitive ion channel  34.3 
 
 		 305 aa  127  4.0000000000000003e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0250538  hitchhiker  0.00000123969 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1552  MscS mechanosensitive ion channel  29.57 
 
 		 359 aa  126  5e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.101944 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0091  MscS Mechanosensitive ion channel  30.63 
 
 		 297 aa  126  6e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2332  MscS Mechanosensitive ion channel  28.89 
 
 		 362 aa  125  9e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2355  MscS mechanosensitive ion channel  29.46 
 
 		 295 aa  125  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0549147  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0773  MscS mechanosensitive ion channel  31.5 
 
 		 401 aa  125  1e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0940  MscS mechanosensitive ion channel  31.58 
 
 		 275 aa  123  6e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.546965 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2137  MscS mechanosensitive ion channel  30.21 
 
 		 288 aa  122  8e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.857102  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0527  MscS mechanosensitive ion channel  32.37 
 
 		 276 aa  122  9e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.546646 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2381  MscS mechanosensitive ion channel  29.17 
 
 		 287 aa  122  9.999999999999999e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.42777  hitchhiker  0.00000285336 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1062  MscS Mechanosensitive ion channel  28.87 
 
 		 310 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.771269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0955  MscS mechanosensitive ion channel  30.19 
 
 		 298 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0951  MscS Mechanosensitive ion channel  31.19 
 
 		 341 aa  120  3e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1533  MscS Mechanosensitive ion channel  28.88 
 
 		 276 aa  120  3e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1895  MscS Mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 286 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.461855 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0209  MscS mechanosensitive ion channel  25.93 
 
 		 685 aa  120  3.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0673077 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1689  MscS mechanosensitive ion channel  31.15 
 
 		 356 aa  119  6e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2331  MscS mechanosensitive ion channel  34.09 
 
 		 307 aa  119  9e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0340157  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01983  MscS Mechanosensitive ion channel ei VT8  30.52 
 
 		 279 aa  118  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.865643  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0390  MscS mechanosensitive ion channel  30.65 
 
 		 274 aa  118  1.9999999999999998e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.855015  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0569  MscS Mechanosensitive ion channel  28.52 
 
 		 280 aa  117  3e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.912877  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03290  MscS Mechanosensitive ion channel  32.65 
 
 		 280 aa  117  3e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1770  MscS mechanosensitive ion channel  26.34 
 
 		 406 aa  116  6.9999999999999995e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2101  MscS Mechanosensitive ion channel  27.17 
 
 		 299 aa  116  7.999999999999999e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172333  normal  0.177745 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2529  MscS Mechanosensitive ion channel  30.23 
 
 		 864 aa  116  7.999999999999999e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3778  MscS mechanosensitive ion channel  26.14 
 
 		 276 aa  116  7.999999999999999e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.981923 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1746  mechanosensitive ion channel family protein  32.2 
 
 		 531 aa  115  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2988  putative small-conductance mechanosensitive channel  30.2 
 
 		 806 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000510417  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1584  MscS mechanosensitive ion channel  29.23 
 
 		 279 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00518641  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3333  MscS mechanosensitive ion channel  31.31 
 
 		 275 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1856  hypothetical protein  28.97 
 
 		 281 aa  114  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.130527  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1633  hypothetical protein  32.68 
 
 		 364 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246622  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1701  phosphoglycerate mutase  31.6 
 
 		 310 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1942  MscS mechanosensitive ion channel  31.71 
 
 		 360 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3168  MscS Mechanosensitive ion channel  26.72 
 
 		 311 aa  114  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0116515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3427  MscS mechanosensitive ion channel  32.35 
 
 		 428 aa  113  6e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.259375  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3172  MscS Mechanosensitive ion channel  29.95 
 
 		 784 aa  113  7.000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2469  putative transport protein  27.2 
 
 		 269 aa  113  7.000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1800  MscS mechanosensitive ion channel  28.63 
 
 		 859 aa  112  8.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000387595 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57110  hypothetical protein  31.27 
 
 		 278 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1202  MscS Mechanosensitive ion channel  28.19 
 
 		 270 aa  112  8.000000000000001e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.49703  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1967  MscS Mechanosensitive ion channel  32.11 
 
 		 279 aa  112  9e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.340778 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4965  hypothetical protein  30.89 
 
 		 278 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0047  MscS mechanosensitive ion channel  29.63 
 
 		 270 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2402  hypothetical protein  30.04 
 
 		 279 aa  112  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.267781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1438  MscS mechanosensitive ion channel  28.23 
 
 		 840 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.139296  normal  0.137989 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3058  MscS mechanosensitive ion channel  31.06 
 
 		 435 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.914338 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3620  MscS mechanosensitive ion channel  29.72 
 
 		 277 aa  111  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.812148  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0553  MscS mechanosensitive ion channel  32.84 
 
 		 874 aa  110  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.362584 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1339  MscS Mechanosensitive ion channel  28.04 
 
 		 636 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000323872 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2771  MscS Mechanosensitive ion channel  32.06 
 
 		 296 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1311  MscS Mechanosensitive ion channel  28.04 
 
 		 636 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0514  MscS Mechanosensitive ion channel  25.36 
 
 		 288 aa  111  3e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00165  mechanosensitive ion channel family protein  30.92 
 
 		 276 aa  110  3e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0204  mechanosensitive ion channel family protein  26.59 
 
 		 271 aa  110  5e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.171183  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0202  mechanosensitive ion channel family protein  26.59 
 
 		 271 aa  110  5e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3521  MscS mechanosensitive ion channel  27.21 
 
 		 547 aa  110  5e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2465  putative small-conductance mechanosensitive channel  30.86 
 
 		 275 aa  110  5e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.404234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1335  MscS mechanosensitive ion channel  26.94 
 
 		 275 aa  109  8.000000000000001e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000063147 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4420  MscS mechanosensitive ion channel  29.27 
 
 		 279 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0689552  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2608  mechanosensitive ion channel family protein  30.67 
 
 		 825 aa  109  9.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.349131  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02755  mechanosensitive channel  26.15 
 
 		 286 aa  108  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0769  MscS Mechanosensitive ion channel  26.15 
 
 		 286 aa  108  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3082  mechanosensitive channel MscS  26.15 
 
 		 286 aa  108  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3061  mechanosensitive channel MscS  25.91 
 
 		 291 aa  108  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.397816  normal  0.219365 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0786  mechanosensitive channel MscS  26.15 
 
 		 286 aa  108  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4221  mechanosensitive channel MscS  26.15 
 
 		 286 aa  108  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1775  MscS mechanosensitive ion channel  25.46 
 
 		 283 aa  108  1e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3251  mechanosensitive channel MscS  26.15 
 
 		 286 aa  108  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13183  putative mechanosensitive channel protein (MscS family)  25.77 
 
 		 316 aa  108  1e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3349  mechanosensitive channel MscS  26.15 
 
 		 286 aa  108  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02718  hypothetical protein  26.15 
 
 		 286 aa  108  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2675  MscS mechanosensitive ion channel  30.5 
 
 		 275 aa  109  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00133263  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2555  MscS mechanosensitive ion channel  28.11 
 
 		 321 aa  108  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2646  MscS mechanosensitive ion channel  25.54 
 
 		 322 aa  108  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1417  MscS Mechanosensitive ion channel  29.8 
 
 		 304 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0625  small-conductance mechanosensitive ion channel  30.73 
 
 		 291 aa  107  3e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.286405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0579  MscS mechanosensitive ion channel  27.12 
 
 		 440 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0872803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0730  MscS mechanosensitive ion channel  26.52 
 
 		 267 aa  107  3e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.506108  normal  0.245277 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2755  MscS mechanosensitive ion channel:conserved TM helix  27.64 
 
 		 276 aa  107  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.661967 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1245  MscS mechanosensitive ion channel  30.53 
 
 		 274 aa  107  4e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.016266  normal  0.622604 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>