More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1530 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1530  MscS Mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 372 aa  733    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.421553 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2760  MscS Mechanosensitive ion channel  57.61 
 
 		 344 aa  304  2.0000000000000002e-81  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.394899  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2475  MscS Mechanosensitive ion channel  57.58 
 
 		 334 aa  293  4e-78  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.288536  normal  0.672517 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0015  MscS Mechanosensitive ion channel  51.46 
 
 		 339 aa  285  1.0000000000000001e-75  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.189168  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1857  MscS Mechanosensitive ion channel  54.58 
 
 		 345 aa  277  2e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0951  MscS Mechanosensitive ion channel  28.84 
 
 		 341 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1895  MscS Mechanosensitive ion channel  34.31 
 
 		 286 aa  112  8.000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.461855 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5283  MscS Mechanosensitive ion channel  28.01 
 
 		 376 aa  108  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0209  MscS mechanosensitive ion channel  29.01 
 
 		 685 aa  108  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0673077 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1187  MscS Mechanosensitive ion channel  29.62 
 
 		 305 aa  105  9e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0250538  hitchhiker  0.00000123969 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0360  MscS mechanosensitive ion channel  28.22 
 
 		 393 aa  105  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1942  MscS mechanosensitive ion channel  29.04 
 
 		 360 aa  104  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0091  MscS Mechanosensitive ion channel  32.43 
 
 		 297 aa  104  3e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2646  MscS mechanosensitive ion channel  31.22 
 
 		 322 aa  104  3e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1529  MscS Mechanosensitive ion channel  29.1 
 
 		 385 aa  103  4e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2696  MscS Mechanosensitive ion channel  28.1 
 
 		 369 aa  103  7e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.415509  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2332  MscS Mechanosensitive ion channel  27.74 
 
 		 362 aa  101  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2101  MscS Mechanosensitive ion channel  29.47 
 
 		 299 aa  100  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172333  normal  0.177745 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2988  putative small-conductance mechanosensitive channel  28.63 
 
 		 806 aa  100  4e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000510417  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2479  MscS Mechanosensitive ion channel  29.25 
 
 		 383 aa  100  5e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.827266 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1465  hypothetical protein  26.8 
 
 		 753 aa  100  5e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0444  MscS Mechanosensitive ion channel  27.3 
 
 		 404 aa  98.6  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.920627  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1146  MscS mechanosensitive ion channel  29.66 
 
 		 366 aa  98.6  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.779955  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1647  MscS Mechanosensitive ion channel  29.76 
 
 		 429 aa  98.2  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5091  MscS Mechanosensitive ion channel  29.38 
 
 		 637 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00148956  normal  0.0183068 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2229  MscS Mechanosensitive ion channel  29.13 
 
 		 400 aa  98.2  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.224666  normal  0.568068 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1770  MscS mechanosensitive ion channel  25.44 
 
 		 406 aa  97.1  5e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1816  mscS family protein  30.56 
 
 		 448 aa  96.7  6e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.316092  normal  0.285124 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1800  MscS mechanosensitive ion channel  30.53 
 
 		 859 aa  96.7  6e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000387595 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1093  MscS Mechanosensitive ion channel  26.55 
 
 		 389 aa  96.7  6e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.464677  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2393  MscS Mechanosensitive ion channel  27.16 
 
 		 408 aa  96.3  8e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2829  MscS mechanosensitive ion channel  25 
 
 		 294 aa  95.9  9e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0663  MscS Mechanosensitive ion channel  29.41 
 
 		 336 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3013  MscS mechanosensitive ion channel  29.84 
 
 		 843 aa  95.1  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3058  MscS mechanosensitive ion channel  28.04 
 
 		 435 aa  94.7  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.914338 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2000  MscS Mechanosensitive ion channel  29.73 
 
 		 302 aa  94.4  3e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.03582 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1042  MscS Mechanosensitive ion channel  30.56 
 
 		 310 aa  94.4  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0145  MscS Mechanosensitive ion channel  28.74 
 
 		 795 aa  93.6  6e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.584574 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1633  hypothetical protein  27.1 
 
 		 364 aa  93.2  7e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246622  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1888  MscS Mechanosensitive ion channel  27.86 
 
 		 362 aa  92.8  9e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2326  MscS mechanosensitive ion channel  29.15 
 
 		 1127 aa  92.4  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0553  MscS mechanosensitive ion channel  27.78 
 
 		 874 aa  91.3  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.362584 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1339  MscS Mechanosensitive ion channel  30.43 
 
 		 636 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000323872 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3145  mechanosensitive ion channel  26.5 
 
 		 544 aa  91.7  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.187903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2065  MscS mechanosensitive ion channel  27.2 
 
 		 359 aa  91.7  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0767  small-conductance mechanosensitive ion channel  29.27 
 
 		 401 aa  91.3  3e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.967765  normal  0.366005 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1311  MscS Mechanosensitive ion channel  30.43 
 
 		 636 aa  91.3  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0442  MscS Mechanosensitive ion channel  26.98 
 
 		 279 aa  91.3  3e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2555  MscS mechanosensitive ion channel  28 
 
 		 321 aa  90.9  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2316  mechanosensitive ion channel family protein  27.91 
 
 		 291 aa  90.5  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.176359  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0552  MscS Mechanosensitive ion channel  28.79 
 
 		 296 aa  90.9  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1934  mechanosensitive ion channel family protein  23.42 
 
 		 287 aa  90.9  4e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.117079  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1250  MscS mechanosensitive ion channel  28.81 
 
 		 361 aa  90.9  4e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000414305  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3521  MscS mechanosensitive ion channel  26.97 
 
 		 547 aa  90.5  4e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2985  hypothetical protein  24.21 
 
 		 351 aa  90.1  5e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0299284  normal  0.0305677 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1062  MscS Mechanosensitive ion channel  25.72 
 
 		 310 aa  90.1  5e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.771269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01752  putative mechanosensitive channel protein (MscS family)  25.94 
 
 		 328 aa  90.1  5e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.249612  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0773  MscS mechanosensitive ion channel  28.78 
 
 		 401 aa  89.7  8e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0757  MscS mechanosensitive ion channel  25.08 
 
 		 479 aa  89.4  8e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2381  MscS mechanosensitive ion channel  26.22 
 
 		 287 aa  89.7  8e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.42777  hitchhiker  0.00000285336 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3168  MscS Mechanosensitive ion channel  27.27 
 
 		 311 aa  89.7  8e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0116515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1903  MscS Mechanosensitive ion channel  28.22 
 
 		 303 aa  89.4  9e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1701  phosphoglycerate mutase  26.65 
 
 		 310 aa  89  1e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1940  MscS mechanosensitive ion channel  27.24 
 
 		 489 aa  89.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2331  MscS mechanosensitive ion channel  26.33 
 
 		 307 aa  89  1e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0340157  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1438  MscS mechanosensitive ion channel  27.83 
 
 		 840 aa  89  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.139296  normal  0.137989 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1699  MscS mechanosensitive ion channel  26.87 
 
 		 456 aa  88.6  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.254155  normal  0.22429 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4274  hypothetical protein  25.45 
 
 		 368 aa  88.6  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0664  cyclic nucleotide-binding  27.44 
 
 		 449 aa  88.2  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0101822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0384  mechanosensitive ion channel  30.33 
 
 		 752 aa  88.2  2e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0890  MscS mechanosensitive ion channel  25.42 
 
 		 330 aa  87.4  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000201965 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0015  MscS mechanosensitive ion channel  27.17 
 
 		 287 aa  87.8  3e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4144  MscS mechanosensitive ion channel  26.27 
 
 		 311 aa  87  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.789982 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4255  mechanosensitive (MS) ion channel protein  26.27 
 
 		 311 aa  87.4  4e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3145  MscS Mechanosensitive ion channel  27.27 
 
 		 304 aa  87.4  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.243267  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3172  MscS Mechanosensitive ion channel  28.81 
 
 		 784 aa  87.4  4e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2837  MscS Mechanosensitive ion channel  29.11 
 
 		 366 aa  87  5e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.426677  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2105  MscS Mechanosensitive ion channel  26.3 
 
 		 414 aa  87  5e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0600957  normal  0.059013 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3910  hypothetical protein  27.78 
 
 		 301 aa  86.7  5e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3321  MscS mechanosensitive ion channel  28.16 
 
 		 1078 aa  86.7  5e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.660513  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1518  hypothetical protein  26.12 
 
 		 732 aa  86.7  6e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2094  MscS mechanosensitive ion channel  28.57 
 
 		 860 aa  86.7  6e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.183403  normal  0.195823 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4726  MscS mechanosensitive ion channel  28.48 
 
 		 325 aa  86.7  6e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.440183  normal  0.105448 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2942  MscS mechanosensitive ion channel  28.78 
 
 		 304 aa  86.3  9e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.176096  normal  0.766616 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01467  mechanosensitive ion channel family protein  25.86 
 
 		 441 aa  86.3  9e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.619169  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0661  MscS Mechanosensitive ion channel  29.25 
 
 		 295 aa  85.9  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0579  MscS mechanosensitive ion channel  25.61 
 
 		 440 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0872803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4090  MscS mechanosensitive ion channel  24.22 
 
 		 349 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0444  MscS mechanosensitive ion channel  28.71 
 
 		 540 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2608  mechanosensitive ion channel family protein  26.11 
 
 		 825 aa  84.7  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.349131  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4338  MscS mechanosensitive ion channel  26.12 
 
 		 533 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0940  MscS mechanosensitive ion channel  32.11 
 
 		 275 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.546965 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4892  MscS Mechanosensitive ion channel  27.75 
 
 		 560 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03115  MscS Mechanosensitive ion channel  23.91 
 
 		 378 aa  84.7  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1775  MscS mechanosensitive ion channel  24.82 
 
 		 283 aa  84.7  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1895  MscS Mechanosensitive ion channel  28.37 
 
 		 348 aa  85.1  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000167428  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0613  MscS mechanosensitive ion channel  28.64 
 
 		 547 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000873032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2527  MscS mechanosensitive ion channel  29.81 
 
 		 427 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23390  MscS Mechanosensitive ion channel  27.94 
 
 		 299 aa  84.3  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350298  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3012  MscS mechanosensitive ion channel  30.35 
 
 		 297 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>