More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0664 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0664  cyclic nucleotide-binding  100 
 
 		 449 aa  892    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0101822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5091  MscS Mechanosensitive ion channel  44.74 
 
 		 637 aa  377  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00148956  normal  0.0183068 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0533  MscS Mechanosensitive ion channel  36.62 
 
 		 472 aa  261  2e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0736  MscS Mechanosensitive ion channel  36.66 
 
 		 484 aa  253  6e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0765  MscS Mechanosensitive ion channel  36.83 
 
 		 484 aa  253  7e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3804  MscS Mechanosensitive ion channel  35.58 
 
 		 495 aa  248  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0209  MscS mechanosensitive ion channel  41.11 
 
 		 685 aa  213  7e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0673077 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2316  mechanosensitive ion channel family protein  40 
 
 		 291 aa  202  8e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.176359  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4892  MscS Mechanosensitive ion channel  44.17 
 
 		 560 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2101  MscS Mechanosensitive ion channel  40 
 
 		 299 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172333  normal  0.177745 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2581  MscS mechanosensitive ion channel  39.05 
 
 		 298 aa  192  9e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.391196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1339  MscS Mechanosensitive ion channel  42.47 
 
 		 636 aa  192  9e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000323872 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1311  MscS Mechanosensitive ion channel  42.08 
 
 		 636 aa  190  5e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3013  MscS mechanosensitive ion channel  37.02 
 
 		 843 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1903  MscS Mechanosensitive ion channel  37.18 
 
 		 303 aa  174  3.9999999999999995e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2608  mechanosensitive ion channel family protein  33 
 
 		 825 aa  173  5e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.349131  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1438  MscS mechanosensitive ion channel  36.86 
 
 		 840 aa  172  7.999999999999999e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.139296  normal  0.137989 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0914  MscS mechanosensitive ion channel  37.93 
 
 		 842 aa  172  1e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707445 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2988  putative small-conductance mechanosensitive channel  36.43 
 
 		 806 aa  171  3e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000510417  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2422  MscS Mechanosensitive ion channel  37.17 
 
 		 844 aa  170  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.275364 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0101  putative AefA  39.58 
 
 		 338 aa  170  5e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.0000000159695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1800  MscS mechanosensitive ion channel  35.66 
 
 		 859 aa  169  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000387595 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2163  MscS Mechanosensitive ion channel  36.8 
 
 		 843 aa  168  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.257742  normal  0.626494 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3910  hypothetical protein  32.97 
 
 		 301 aa  164  3e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0559  potassium efflux protein KefA  36.55 
 
 		 1111 aa  162  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000200237 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0445  potassium efflux protein KefA  33.33 
 
 		 1117 aa  161  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.953711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3064  potassium efflux protein KefA  35.34 
 
 		 1120 aa  160  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2883  potassium efflux protein KefA  35.34 
 
 		 1120 aa  160  4e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0991479 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3204  potassium efflux protein KefA  35.34 
 
 		 1120 aa  160  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0786  MscS mechanosensitive ion channel  32.27 
 
 		 1066 aa  159  7e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.213544  hitchhiker  0.000495101 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3045  potassium efflux protein KefA  35.5 
 
 		 1133 aa  159  1e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1994  MscS mechanosensitive ion channel  36.19 
 
 		 796 aa  159  1e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.952395 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0587  MscS mechanosensitive ion channel  32.68 
 
 		 1067 aa  157  4e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0226105 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0586  MscS mechanosensitive ion channel  33.07 
 
 		 1067 aa  157  4e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0875624 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3443  MscS mechanosensitive ion channel  32.68 
 
 		 1067 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2094  MscS mechanosensitive ion channel  32.83 
 
 		 860 aa  156  8e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.183403  normal  0.195823 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0588  transporter, putative  30.94 
 
 		 1067 aa  155  1e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5024  potassium efflux system protein KefA, putative  32.96 
 
 		 1134 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0555  MscS mechanosensitive ion channel  30.94 
 
 		 1060 aa  155  1e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0475901  normal  0.179203 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0553  MscS mechanosensitive ion channel  33.76 
 
 		 874 aa  155  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.362584 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00416  fused conserved protein  34.55 
 
 		 1120 aa  155  2e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3145  MscS Mechanosensitive ion channel  34.55 
 
 		 1120 aa  155  2e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.178032  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0547  MscS mechanosensitive ion channel  31.89 
 
 		 1067 aa  155  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3721  MscS Mechanosensitive ion channel  31.89 
 
 		 1072 aa  155  2e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3151  potassium efflux protein KefA  34.55 
 
 		 1120 aa  155  2e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.800258  normal  0.703774 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0501  potassium efflux protein KefA  32.96 
 
 		 1134 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0508  potassium efflux protein KefA  34.55 
 
 		 1120 aa  155  2e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000540502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0500  potassium efflux protein KefA  34.55 
 
 		 1120 aa  155  2e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.527944  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0397  potassium efflux protein KefA  34.55 
 
 		 1120 aa  155  2e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3904  MscS mechanosensitive ion channel  31.89 
 
 		 1072 aa  155  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00421  hypothetical protein  34.55 
 
 		 1120 aa  155  2e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0555  potassium efflux protein KefA  34.55 
 
 		 1118 aa  155  2e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.364262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0541  potassium efflux protein KefA  34.55 
 
 		 1120 aa  155  2e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1587  MscS mechanosensitive ion channel  37.25 
 
 		 807 aa  154  2e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.370206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3778  MscS mechanosensitive ion channel  31.89 
 
 		 1072 aa  155  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3447  mechanosensitive ion channel family protein  37.33 
 
 		 816 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.597927  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3291  MscS mechanosensitive ion channel  32.28 
 
 		 1068 aa  154  4e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.563171  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0145  MscS Mechanosensitive ion channel  33.21 
 
 		 795 aa  153  5e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.584574 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1632  MscS mechanosensitive ion channel  35.08 
 
 		 877 aa  153  5.9999999999999996e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.253181  normal  0.172693 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0207  MscS Mechanosensitive ion channel  38.57 
 
 		 981 aa  153  7e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1862  MscS mechanosensitive ion channel  34.13 
 
 		 867 aa  153  8e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2148  small conductance mechanosensitive Ion channel  30.65 
 
 		 847 aa  152  1e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.667496  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0822  MscS mechanosensitive ion channel  30.65 
 
 		 847 aa  152  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0649099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0528  potassium efflux protein KefA  34.6 
 
 		 1120 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0538  potassium efflux protein KefA  34.6 
 
 		 1118 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0581  potassium efflux protein KefA  34.6 
 
 		 1118 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.467495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0522  potassium efflux protein KefA  34.6 
 
 		 1118 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.97346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0519  potassium efflux protein KefA  34.6 
 
 		 1120 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2035  MscS Mechanosensitive ion channel  31.38 
 
 		 447 aa  151  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.200455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3058  MscS mechanosensitive ion channel  36.02 
 
 		 435 aa  150  3e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.914338 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4182  MscS mechanosensitive ion channel  31.18 
 
 		 1070 aa  150  3e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3826  MscS Mechanosensitive ion channel  32.27 
 
 		 444 aa  150  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1013  potassium efflux protein KefA  36.96 
 
 		 1128 aa  150  5e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5117  potassium efflux protein KefA  34.26 
 
 		 1102 aa  150  6e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.666166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3036  transporter, putative  29.82 
 
 		 1080 aa  150  6e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0415629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0399  potassium efflux protein KefA  33.86 
 
 		 1102 aa  149  9e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2646  MscS mechanosensitive ion channel  34.47 
 
 		 322 aa  149  9e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3304  MscS Mechanosensitive ion channel  34.45 
 
 		 1235 aa  149  1.0000000000000001e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2010  MscS Mechanosensitive ion channel  31.03 
 
 		 447 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45100  potassium efflux protein KefA  34.12 
 
 		 1117 aa  148  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.534635  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0820  MscS mechanosensitive ion channel  32.14 
 
 		 849 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0343003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1130  potassium efflux protein KefA  35.74 
 
 		 1130 aa  146  7.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000811569 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3551  MscS mechanosensitive ion channel  33.04 
 
 		 1062 aa  146  8.000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0945  potassium efflux protein KefA  33.69 
 
 		 1115 aa  146  9e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.612496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2151  MscS mechanosensitive ion channel  37 
 
 		 1158 aa  145  1e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2529  MscS Mechanosensitive ion channel  38.99 
 
 		 864 aa  145  1e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2983  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  33.85 
 
 		 1144 aa  145  2e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5067  potassium efflux protein KefA  34.66 
 
 		 1102 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2527  MscS mechanosensitive ion channel  34.21 
 
 		 427 aa  144  3e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3862  MscS mechanosensitive ion channel  30.08 
 
 		 830 aa  144  3e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.725538  normal  0.276406 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3321  MscS mechanosensitive ion channel  31.89 
 
 		 1078 aa  144  3e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.660513  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1934  mechanosensitive ion channel family protein  27.82 
 
 		 287 aa  144  4e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.117079  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4940  potassium efflux protein KefA  34.66 
 
 		 1102 aa  144  4e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.310149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1699  MscS mechanosensitive ion channel  33.72 
 
 		 456 aa  144  4e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.254155  normal  0.22429 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0168  potassium efflux protein KefA  36.24 
 
 		 1110 aa  143  7e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4556  MscS Mechanosensitive ion channel  35.8 
 
 		 883 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0198839  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1206  potassium efflux protein KefA  33.2 
 
 		 1098 aa  142  9.999999999999999e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2326  MscS mechanosensitive ion channel  32.57 
 
 		 1127 aa  142  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1447  MscS mechanosensitive ion channel  29.9 
 
 		 1166 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0935  MscS mechanosensitive ion channel  31.18 
 
 		 845 aa  140  3e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>