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for query gene Rsph17029_4144 on replicon NC_009040
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



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Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009040  Rsph17029_4144  MscS mechanosensitive ion channel  100 
 
 
311 aa  606  9.999999999999999e-173  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.789982 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4255  mechanosensitive (MS) ion channel protein  99.68 
 
 
311 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4274  hypothetical protein  92.28 
 
 
368 aa  545  1e-154  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3145  MscS Mechanosensitive ion channel  48.39 
 
 
304 aa  229  5e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.243267  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4726  MscS mechanosensitive ion channel  50.48 
 
 
325 aa  204  2e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.440183  normal  0.105448 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6888  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  30.14 
 
 
506 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1867  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  28.99 
 
 
480 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0456814  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1178  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  28.98 
 
 
505 aa  110  3e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.811879  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5823  MscS mechanosensitive ion channel  29.83 
 
 
345 aa  110  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.63499  normal  0.440829 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2775  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  29.79 
 
 
493 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.85719 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2790  MscS mechanosensitive ion channel  27.95 
 
 
335 aa  105  7e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.756482  normal  0.557915 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1968  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  29.72 
 
 
475 aa  105  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.805203  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1770  MscS mechanosensitive ion channel  25.9 
 
 
406 aa  103  3e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3071  hypothetical protein  28.8 
 
 
366 aa  103  4e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.962312  normal  0.378174 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1534  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  27.27 
 
 
501 aa  103  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.231252  normal  0.283254 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2519  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  30.19 
 
 
492 aa  103  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.806579  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1250  MscS mechanosensitive ion channel  24.89 
 
 
361 aa  100  4e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000414305  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0360  MscS mechanosensitive ion channel  30.14 
 
 
393 aa  100  4e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2712  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  26.64 
 
 
507 aa  96.3  6e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0470198  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5308  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  31.08 
 
 
508 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.119708 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6131  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  29.29 
 
 
489 aa  95.9  9e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5256  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  30.4 
 
 
475 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.584441  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5166  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  30.4 
 
 
475 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0740457  normal  0.0860349 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2332  MscS Mechanosensitive ion channel  23.57 
 
 
362 aa  95.1  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1460  MscS mechanosensitive ion channel  30 
 
 
493 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6368  MscS mechanosensitive ion channel  30 
 
 
493 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7035  MscS mechanosensitive ion channel  30.41 
 
 
493 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.666416  normal  0.218312 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5283  MscS Mechanosensitive ion channel  29.84 
 
 
376 aa  94.4  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1888  MscS Mechanosensitive ion channel  23.58 
 
 
362 aa  92.8  7e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0258  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  26.94 
 
 
492 aa  92.4  9e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.986681 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2122  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  33.91 
 
 
489 aa  92  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.510942  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2065  MscS mechanosensitive ion channel  25.21 
 
 
359 aa  92  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1633  hypothetical protein  25.99 
 
 
364 aa  89.4  7e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246622  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1189  MscS Mechanosensitive ion channel  27.14 
 
 
445 aa  89  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2387  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  28.98 
 
 
490 aa  88.6  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178532  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2440  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  28.96 
 
 
509 aa  88.6  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00769093 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2326  MscS mechanosensitive ion channel  28.42 
 
 
1127 aa  88.6  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0773  MscS mechanosensitive ion channel  29.85 
 
 
401 aa  88.2  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1709  small conductance mechanosensitive channel  25.98 
 
 
494 aa  87.8  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0466336 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2479  MscS Mechanosensitive ion channel  28.22 
 
 
383 aa  87.4  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.827266 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3659  MscS mechanosensitive ion channel  30.2 
 
 
439 aa  87.4  3e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.19276  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2829  MscS mechanosensitive ion channel  27.14 
 
 
294 aa  87  3e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3626  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  28.77 
 
 
489 aa  87  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1530  MscS Mechanosensitive ion channel  26.27 
 
 
372 aa  87  4e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.421553 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6057  MscS Mechanosensitive ion channel  25.19 
 
 
779 aa  86.7  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0767  small-conductance mechanosensitive ion channel  29.35 
 
 
401 aa  85.9  7e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.967765  normal  0.366005 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1124  MscS Mechanosensitive ion channel  23.28 
 
 
345 aa  86.3  7e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.745547  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2842  MscS mechanosensitive ion channel  28.72 
 
 
369 aa  86.3  7e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2229  MscS Mechanosensitive ion channel  29.03 
 
 
400 aa  85.9  7e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.224666  normal  0.568068 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2105  MscS Mechanosensitive ion channel  25.19 
 
 
414 aa  85.9  9e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0600957  normal  0.059013 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1942  MscS mechanosensitive ion channel  22.96 
 
 
360 aa  85.9  9e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0935  MscS Mechanosensitive ion channel  29.67 
 
 
433 aa  84.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.940167  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2696  MscS Mechanosensitive ion channel  24.77 
 
 
369 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.415509  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1546  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  26.36 
 
 
479 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.514924  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0938  MscS Mechanosensitive ion channel  29.67 
 
 
433 aa  84.3  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.466834  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1940  MscS mechanosensitive ion channel  26.89 
 
 
489 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2273  MscS mechanosensitive ion channel  25.76 
 
 
258 aa  83.2  0.000000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1140  MscS mechanosensitive ion channel  27.35 
 
 
274 aa  82.8  0.000000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.15609  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3862  MscS mechanosensitive ion channel  29.88 
 
 
830 aa  83.2  0.000000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.725538  normal  0.276406 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1438  MscS mechanosensitive ion channel  26.81 
 
 
840 aa  82.4  0.000000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.139296  normal  0.137989 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2837  MscS Mechanosensitive ion channel  30.67 
 
 
366 aa  82  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.426677  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1797  mechanosensitive ion channel  28.26 
 
 
561 aa  81.3  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.433096  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1647  MscS Mechanosensitive ion channel  25.58 
 
 
429 aa  80.9  0.00000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2581  MscS mechanosensitive ion channel  29.08 
 
 
298 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.391196  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0914  MscS mechanosensitive ion channel  26.69 
 
 
842 aa  80.5  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00707445 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0797  MscS Mechanosensitive ion channel  25.62 
 
 
268 aa  80.5  0.00000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2284  MscS mechanosensitive ion channel  25.56 
 
 
273 aa  80.1  0.00000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1599  MscS Mechanosensitive ion channel  26.76 
 
 
862 aa  79.7  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1486  MscS Mechanosensitive ion channel  26.52 
 
 
272 aa  79.7  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0743  MscS Mechanosensitive ion channel  27.68 
 
 
460 aa  79.7  0.00000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3100  MscS mechanosensitive ion channel  30.77 
 
 
820 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.416731  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5267  MscS mechanosensitive ion channel  30.77 
 
 
820 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.269062  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5006  MscS mechanosensitive ion channel  30.77 
 
 
814 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03062  hypothetical protein  26.56 
 
 
563 aa  79  0.00000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3343  mechanosensitive ion channel protein  30.64 
 
 
813 aa  79  0.00000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.183155 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1775  MscS mechanosensitive ion channel  27.13 
 
 
283 aa  79  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0663  MscS Mechanosensitive ion channel  27.73 
 
 
336 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5331  MscS mechanosensitive ion channel  25.7 
 
 
301 aa  79  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1350  hypothetical protein  23.91 
 
 
292 aa  79  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.136839  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1856  hypothetical protein  28.64 
 
 
281 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.130527  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1569  MscS mechanosensitive ion channel  26.52 
 
 
342 aa  78.6  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.50156  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1674  MscS mechanosensitive ion channel  26.98 
 
 
270 aa  79  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.702305  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1529  MscS Mechanosensitive ion channel  22.89 
 
 
385 aa  78.2  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1417  MscS Mechanosensitive ion channel  29.84 
 
 
304 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2316  mechanosensitive ion channel family protein  30.18 
 
 
773 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4142  MscS mechanosensitive ion channel  26.92 
 
 
384 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.93898  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0955  MscS mechanosensitive ion channel  29.06 
 
 
298 aa  78.2  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2760  MscS Mechanosensitive ion channel  28.51 
 
 
344 aa  77.8  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.394899  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4629  MscS mechanosensitive ion channel  30.18 
 
 
832 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3452  MscS mechanosensitive ion channel  29.59 
 
 
816 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00203474  normal 
 
 
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NC_013440  Hoch_3168  MscS Mechanosensitive ion channel  27.23 
 
 
311 aa  77.4  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0116515  normal 
 
 
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NC_010676  Bphyt_6691  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  27.17 
 
 
485 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_002939  GSU2316  mechanosensitive ion channel family protein  28.37 
 
 
291 aa  77  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.176359  n/a   
 
 
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NC_006348  BMA0986  mechanosensitive ion channel family protein  29.59 
 
 
808 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.722323  n/a   
 
 
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NC_007434  BURPS1710b_2264  mechanosensitive ion channel family protein  29.59 
 
 
809 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009074  BURPS668_2070  mechanosensitive ion channel family protein  29.59 
 
 
809 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.563687  n/a   
 
 
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NC_010552  BamMC406_5154  MscS mechanosensitive ion channel  30.18 
 
 
814 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0457644  normal 
 
 
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NC_009076  BURPS1106A_2125  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  29.59 
 
 
809 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0467602  n/a   
 
 
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NC_011663  Sbal223_3747  MscS Mechanosensitive ion channel  26.64 
 
 
549 aa  77  0.0000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_008345  Sfri_3321  MscS mechanosensitive ion channel  28.57 
 
 
1078 aa  77  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.660513  n/a   
 
 
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