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for query gene Bcenmc03_7035 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_7035  MscS mechanosensitive ion channel  100 
 
 
493 aa  971    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.666416  normal  0.218312 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1460  MscS mechanosensitive ion channel  97.97 
 
 
493 aa  907    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6368  MscS mechanosensitive ion channel  97.97 
 
 
493 aa  907    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6131  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  46.25 
 
 
489 aa  426  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2387  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  46.34 
 
 
490 aa  412  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178532  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3626  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  44.81 
 
 
489 aa  367  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6691  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  38.48 
 
 
485 aa  319  9e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1968  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  37.02 
 
 
475 aa  279  1e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.805203  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1867  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  36.32 
 
 
480 aa  268  2e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0456814  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5166  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  34.4 
 
 
475 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0740457  normal  0.0860349 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5256  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  33.97 
 
 
475 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.584441  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5308  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  33.76 
 
 
508 aa  243  5e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.119708 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1178  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  33.41 
 
 
505 aa  243  7e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.811879  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2775  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  32.78 
 
 
493 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.85719 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2519  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  32.03 
 
 
492 aa  232  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.806579  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1534  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  33.05 
 
 
501 aa  226  6e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.231252  normal  0.283254 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0258  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  33.26 
 
 
492 aa  226  9e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.986681 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6888  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  31.07 
 
 
506 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2440  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  29.72 
 
 
509 aa  192  2e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00769093 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5823  MscS mechanosensitive ion channel  32.67 
 
 
345 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.63499  normal  0.440829 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2790  MscS mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 
335 aa  165  2.0000000000000002e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.756482  normal  0.557915 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2122  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  29.37 
 
 
489 aa  137  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.510942  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1546  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  26.52 
 
 
479 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.514924  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2712  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  25.21 
 
 
507 aa  105  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0470198  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4274  hypothetical protein  28.98 
 
 
368 aa  97.4  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4144  MscS mechanosensitive ion channel  30.74 
 
 
311 aa  97.4  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.789982 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4255  mechanosensitive (MS) ion channel protein  30.74 
 
 
311 aa  97.4  5e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12461  transmembrane protein  35.48 
 
 
481 aa  97.4  5e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4726  MscS mechanosensitive ion channel  32.19 
 
 
325 aa  93.6  8e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.440183  normal  0.105448 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0533  MscS Mechanosensitive ion channel  22.98 
 
 
472 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5091  MscS Mechanosensitive ion channel  23.97 
 
 
637 aa  84  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00148956  normal  0.0183068 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3145  MscS Mechanosensitive ion channel  30.31 
 
 
304 aa  84  0.000000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.243267  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2303  MscS Mechanosensitive ion channel  25.63 
 
 
512 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.697138  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0226  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  28.34 
 
 
473 aa  82.4  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.512445  normal  0.203081 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0914  MscS mechanosensitive ion channel  28.12 
 
 
842 aa  81.6  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00707445 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2162  periplasmic binding protein; mechanosensitive ion channel component  26.18 
 
 
794 aa  81.6  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.387859 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2730  potassium efflux system KEFA  28.5 
 
 
825 aa  80.9  0.00000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.668875  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2983  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  28.34 
 
 
1144 aa  74.7  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2608  mechanosensitive ion channel family protein  26.56 
 
 
825 aa  74.7  0.000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.349131  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3304  MscS Mechanosensitive ion channel  24.75 
 
 
1235 aa  74.7  0.000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3012  MscS mechanosensitive ion channel  31.29 
 
 
297 aa  74.3  0.000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0384  mechanosensitive ion channel  26.16 
 
 
752 aa  71.6  0.00000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1712  MscS mechanosensitive ion channel  27.98 
 
 
291 aa  71.2  0.00000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2229  MscS Mechanosensitive ion channel  28.8 
 
 
400 aa  70.9  0.00000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.224666  normal  0.568068 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0555  MscS mechanosensitive ion channel  30 
 
 
1060 aa  70.5  0.00000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0475901  normal  0.179203 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1050  MscS mechanosensitive ion channel  26.06 
 
 
481 aa  70.5  0.00000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3071  hypothetical protein  27.72 
 
 
366 aa  70.1  0.00000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.962312  normal  0.378174 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0664  cyclic nucleotide-binding  25.97 
 
 
449 aa  69.7  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0101822  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0293  MscS mechanosensitive ion channel  29.2 
 
 
447 aa  69.7  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1770  MscS mechanosensitive ion channel  31.61 
 
 
406 aa  69.3  0.0000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45100  potassium efflux protein KefA  26.47 
 
 
1117 aa  68.6  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.534635  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0935  MscS Mechanosensitive ion channel  24.66 
 
 
484 aa  68.9  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2326  MscS mechanosensitive ion channel  27.47 
 
 
1127 aa  68.9  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0308  MscS mechanosensitive ion channel  28.57 
 
 
459 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1417  MscS Mechanosensitive ion channel  28.81 
 
 
304 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1647  MscS Mechanosensitive ion channel  32.48 
 
 
429 aa  68.6  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0588  transporter, putative  28.8 
 
 
1067 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3804  MscS Mechanosensitive ion channel  19.71 
 
 
495 aa  68.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1464  MscS Mechanosensitive ion channel  27.32 
 
 
338 aa  68.2  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1447  MscS mechanosensitive ion channel  26.7 
 
 
1166 aa  68.2  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3222  MscS mechanosensitive ion channel  25.81 
 
 
866 aa  68.6  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4142  MscS mechanosensitive ion channel  24.29 
 
 
384 aa  68.2  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.93898  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0812  MscS mechanosensitive ion channel  24.5 
 
 
643 aa  68.2  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.459246  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3443  MscS mechanosensitive ion channel  28.26 
 
 
1067 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1518  hypothetical protein  25.97 
 
 
732 aa  67.8  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3291  MscS mechanosensitive ion channel  28.26 
 
 
1068 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.563171  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2829  MscS mechanosensitive ion channel  27.83 
 
 
294 aa  67.8  0.0000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2581  MscS mechanosensitive ion channel  28.12 
 
 
298 aa  67.4  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.391196  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1608  MscS mechanosensitive ion channel  27 
 
 
868 aa  67.4  0.0000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0559  potassium efflux protein KefA  26.8 
 
 
1111 aa  67.4  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000200237 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2316  mechanosensitive ion channel family protein  26.44 
 
 
291 aa  67.4  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.176359  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1342  MscS Mechanosensitive ion channel  30.86 
 
 
266 aa  67.4  0.0000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00293598  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3059  MscS mechanosensitive ion channel  29.86 
 
 
879 aa  67.4  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0365719  normal  0.0542576 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5067  potassium efflux protein KefA  27.13 
 
 
1102 aa  66.6  0.0000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0587  MscS mechanosensitive ion channel  28.26 
 
 
1067 aa  67  0.0000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0226105 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0586  MscS mechanosensitive ion channel  28.26 
 
 
1067 aa  67  0.0000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0875624 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0547  MscS mechanosensitive ion channel  27.72 
 
 
1067 aa  66.6  0.0000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3778  MscS mechanosensitive ion channel  27.72 
 
 
1072 aa  66.6  0.0000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5024  potassium efflux system protein KefA, putative  27.66 
 
 
1134 aa  66.6  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2332  MscS Mechanosensitive ion channel  30.72 
 
 
362 aa  66.6  0.0000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3721  MscS Mechanosensitive ion channel  27.72 
 
 
1072 aa  66.6  0.0000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4940  potassium efflux protein KefA  27.13 
 
 
1102 aa  66.6  0.0000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.310149  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3904  MscS mechanosensitive ion channel  27.72 
 
 
1072 aa  66.6  0.0000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5117  potassium efflux protein KefA  27.13 
 
 
1102 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.666166  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0786  MscS mechanosensitive ion channel  29.44 
 
 
1066 aa  66.6  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.213544  hitchhiker  0.000495101 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4382  MscS mechanosensitive ion channel  33.55 
 
 
262 aa  66.2  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.496887  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2105  MscS Mechanosensitive ion channel  30.32 
 
 
414 aa  66.6  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0600957  normal  0.059013 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1438  MscS mechanosensitive ion channel  25.98 
 
 
840 aa  66.6  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.139296  normal  0.137989 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1206  potassium efflux protein KefA  28.57 
 
 
1098 aa  66.2  0.000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0553  MscS mechanosensitive ion channel  28.37 
 
 
874 aa  66.2  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.362584 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1599  MscS Mechanosensitive ion channel  24.64 
 
 
862 aa  66.2  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0501  potassium efflux protein KefA  27.66 
 
 
1134 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3390  MscS mechanosensitive ion channel  28.99 
 
 
861 aa  65.5  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0102  MscS mechanosensitive ion channel  30.46 
 
 
537 aa  65.5  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.102568  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2568  MscS mechanosensitive ion channel  25.91 
 
 
358 aa  65.9  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1800  MscS mechanosensitive ion channel  29.52 
 
 
859 aa  65.5  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000387595 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0141  MscS Mechanosensitive ion channel  30.77 
 
 
373 aa  65.5  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.195967  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4017  MscS mechanosensitive ion channel  25.25 
 
 
285 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_011757  Mchl_5300  MscS Mechanosensitive ion channel  31.17 
 
 
909 aa  65.1  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.154619  normal 
 
 
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NC_011894  Mnod_4556  MscS Mechanosensitive ion channel  27.19 
 
 
883 aa  65.1  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0198839  n/a   
 
 
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