More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1546 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1546  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  100 
 
 
479 aa  968    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.514924  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12461  transmembrane protein  28.93 
 
 
481 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6131  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  24.71 
 
 
489 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2712  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  25.96 
 
 
507 aa  142  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0470198  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1178  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  26.12 
 
 
505 aa  139  2e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.811879  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0226  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  25.61 
 
 
473 aa  134  3e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.512445  normal  0.203081 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2519  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  24.64 
 
 
492 aa  133  7.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.806579  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2775  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  23.47 
 
 
493 aa  125  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.85719 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2387  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  25.96 
 
 
490 aa  123  6e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178532  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1867  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  25.37 
 
 
480 aa  123  9e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0456814  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6888  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  23.88 
 
 
506 aa  121  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0664  cyclic nucleotide-binding  26.88 
 
 
449 aa  120  4.9999999999999996e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0101822  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2303  MscS Mechanosensitive ion channel  26.45 
 
 
512 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.697138  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2122  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  25.4 
 
 
489 aa  120  6e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.510942  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2440  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  24.02 
 
 
509 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00769093 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2332  MscS Mechanosensitive ion channel  30.85 
 
 
362 aa  117  5e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0258  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  24.93 
 
 
492 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.986681 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1888  MscS Mechanosensitive ion channel  30.85 
 
 
362 aa  113  6e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1800  MscS mechanosensitive ion channel  30.35 
 
 
859 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000387595 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0533  MscS Mechanosensitive ion channel  24.59 
 
 
472 aa  110  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1529  MscS Mechanosensitive ion channel  27.31 
 
 
385 aa  110  5e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5283  MscS Mechanosensitive ion channel  25.67 
 
 
376 aa  109  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1942  MscS mechanosensitive ion channel  29.26 
 
 
360 aa  108  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1460  MscS mechanosensitive ion channel  25.28 
 
 
493 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2696  MscS Mechanosensitive ion channel  31 
 
 
369 aa  108  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.415509  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6368  MscS mechanosensitive ion channel  25.28 
 
 
493 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1146  MscS mechanosensitive ion channel  30.87 
 
 
366 aa  108  3e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.779955  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3626  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  24.39 
 
 
489 aa  107  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1124  MscS Mechanosensitive ion channel  31.17 
 
 
345 aa  107  6e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.745547  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2229  MscS Mechanosensitive ion channel  28.4 
 
 
400 aa  106  1e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.224666  normal  0.568068 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5091  MscS Mechanosensitive ion channel  24.64 
 
 
637 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00148956  normal  0.0183068 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6691  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  23.03 
 
 
485 aa  106  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2357  hypothetical protein  29.37 
 
 
348 aa  105  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.116724  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0617  MscS mechanosensitive ion channel  33.76 
 
 
338 aa  105  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210835  normal  0.752053 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1438  MscS mechanosensitive ion channel  32.07 
 
 
840 aa  104  4e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.139296  normal  0.137989 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1633  hypothetical protein  30.1 
 
 
364 aa  103  5e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246622  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2608  mechanosensitive ion channel family protein  32.32 
 
 
825 aa  103  6e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.349131  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5166  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  24.73 
 
 
475 aa  103  8e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0740457  normal  0.0860349 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7035  MscS mechanosensitive ion channel  25.28 
 
 
493 aa  103  9e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.666416  normal  0.218312 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2065  MscS mechanosensitive ion channel  30.16 
 
 
359 aa  103  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5256  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  26.9 
 
 
475 aa  101  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.584441  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1534  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  25 
 
 
501 aa  101  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.231252  normal  0.283254 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0951  MscS Mechanosensitive ion channel  25.6 
 
 
341 aa  100  4e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2730  potassium efflux system KEFA  33.14 
 
 
825 aa  100  5e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.668875  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5308  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  26.9 
 
 
508 aa  100  7e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.119708 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2295  mechanosensitive ion channel family protein  29.52 
 
 
289 aa  100  8e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0970  small-conductance mechanosensitive ion channel  34.21 
 
 
650 aa  99.8  9e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00371389 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2451  small-conductance mechanosensitive channel  31.68 
 
 
380 aa  99.4  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1446  MscS mechanosensitive ion channel  34.21 
 
 
648 aa  99.4  1e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.770596  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1599  MscS Mechanosensitive ion channel  25.93 
 
 
862 aa  99  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1647  MscS Mechanosensitive ion channel  30.77 
 
 
429 aa  99  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03290  MscS Mechanosensitive ion channel  27.71 
 
 
280 aa  98.6  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1895  MscS Mechanosensitive ion channel  30 
 
 
348 aa  98.6  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000167428  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1994  MscS mechanosensitive ion channel  28.72 
 
 
796 aa  97.8  4e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.952395 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0360  MscS mechanosensitive ion channel  28.53 
 
 
393 aa  97.8  4e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1862  MscS mechanosensitive ion channel  30.65 
 
 
867 aa  97.4  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1650  MscS mechanosensitive ion channel  30.32 
 
 
570 aa  96.7  8e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.598293 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1153  MscS Mechanosensitive ion channel  34.9 
 
 
352 aa  96.7  8e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1062  MscS Mechanosensitive ion channel  29.1 
 
 
310 aa  96.3  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.771269  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1770  MscS mechanosensitive ion channel  24.58 
 
 
406 aa  96.3  1e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0914  MscS mechanosensitive ion channel  29.27 
 
 
842 aa  95.9  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00707445 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0209  MscS mechanosensitive ion channel  26.34 
 
 
685 aa  95.9  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0673077 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2988  putative small-conductance mechanosensitive channel  29.06 
 
 
806 aa  95.5  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000510417  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2581  MscS mechanosensitive ion channel  30.69 
 
 
298 aa  95.5  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.391196  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2162  periplasmic binding protein; mechanosensitive ion channel component  30.94 
 
 
794 aa  95.9  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.387859 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2296  MscS mechanosensitive ion channel  30.84 
 
 
270 aa  95.1  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1504  conserved hypothetical integral membrane protein, mechanosensitive ion channel family  27.45 
 
 
624 aa  94.7  3e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1210  MscS mechanosensitive ion channel  31.94 
 
 
344 aa  94.7  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.224237  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2101  MscS Mechanosensitive ion channel  30.65 
 
 
299 aa  94.7  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172333  normal  0.177745 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1968  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  20.75 
 
 
475 aa  94.4  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.805203  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3246  MscS mechanosensitive ion channel  31.65 
 
 
381 aa  93.6  6e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00298811  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03062  hypothetical protein  27.16 
 
 
563 aa  93.6  7e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1350  hypothetical protein  29.9 
 
 
292 aa  93.6  7e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.136839  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3375  MscS mechanosensitive ion channel  29.82 
 
 
302 aa  93.6  7e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.190462  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03115  MscS Mechanosensitive ion channel  28.18 
 
 
378 aa  93.2  8e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2316  mechanosensitive ion channel family protein  30.61 
 
 
291 aa  92.8  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.176359  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2381  MscS mechanosensitive ion channel  29.1 
 
 
287 aa  93.2  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.42777  hitchhiker  0.00000285336 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0289  mechanosensitive ion channel family protein  25.85 
 
 
627 aa  92  2e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.658149  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3719  MscS mechanosensitive ion channel  28.57 
 
 
538 aa  91.7  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00173633  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0013  mechanosensitive ion channel family protein  28.76 
 
 
682 aa  91.7  2e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0236  mechanosensitive ion channel family protein  33.9 
 
 
627 aa  92.4  2e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0263  mechanosensitive ion channel family protein  25.85 
 
 
627 aa  91.7  2e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3337  mechanosensitive channel MscS  27.06 
 
 
284 aa  91.7  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.306942  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002898  small-conductance mechanosensitive channel  26.52 
 
 
532 aa  91.7  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.341732  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2117  mechanosensitive ion channel family protein  28.57 
 
 
633 aa  91.7  3e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00165  mechanosensitive ion channel family protein  30.63 
 
 
276 aa  91.3  3e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0822  MscS mechanosensitive ion channel  27.59 
 
 
847 aa  90.9  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0649099  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2148  small conductance mechanosensitive Ion channel  27.59 
 
 
847 aa  90.9  5e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.667496  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1852  MscS Mechanosensitive ion channel  28.34 
 
 
344 aa  90.9  5e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.390235  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0975  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  26.37 
 
 
450 aa  90.1  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3071  hypothetical protein  29.35 
 
 
366 aa  90.1  8e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.962312  normal  0.378174 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0820  MscS mechanosensitive ion channel  27.59 
 
 
849 aa  90.1  8e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0343003  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3291  MscS mechanosensitive ion channel  27.36 
 
 
1068 aa  90.1  9e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.563171  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3240  mechanosensitive channel MscS  27.98 
 
 
286 aa  89.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3307  mechanosensitive channel MscS  27.98 
 
 
286 aa  89.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2163  MscS Mechanosensitive ion channel  26.97 
 
 
843 aa  89.7  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.257742  normal  0.626494 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0057  MscS Mechanosensitive ion channel  26.7 
 
 
421 aa  89.4  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.185804  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3229  mechanosensitive channel MscS  27.98 
 
 
286 aa  89.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.550002  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3304  mechanosensitive channel MscS  27.98 
 
 
286 aa  89.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3409  mechanosensitive channel MscS  27.98 
 
 
286 aa  89.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.427229  normal  0.109816 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>