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for query gene Pfl01_1867 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



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Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1867  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  100 
 
 
480 aa  974    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0456814  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5256  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  52.3 
 
 
475 aa  473  1e-132  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.584441  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5166  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  52.3 
 
 
475 aa  474  1e-132  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0740457  normal  0.0860349 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5308  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  51.88 
 
 
508 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.119708 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1968  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  48.33 
 
 
475 aa  450  1e-125  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.805203  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3626  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  39.5 
 
 
489 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2387  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  41.37 
 
 
490 aa  347  3e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178532  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6131  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  39.29 
 
 
489 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6691  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  40.09 
 
 
485 aa  311  2e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6888  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  34.85 
 
 
506 aa  271  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7035  MscS mechanosensitive ion channel  36.47 
 
 
493 aa  257  3e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.666416  normal  0.218312 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1460  MscS mechanosensitive ion channel  35.55 
 
 
493 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6368  MscS mechanosensitive ion channel  35.55 
 
 
493 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1178  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  31.11 
 
 
505 aa  251  2e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.811879  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2775  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  31.59 
 
 
493 aa  250  5e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.85719 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2519  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  30.97 
 
 
492 aa  246  9e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.806579  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1534  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  33.19 
 
 
501 aa  242  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.231252  normal  0.283254 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0258  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  30.87 
 
 
492 aa  227  3e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.986681 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2440  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  30.12 
 
 
509 aa  206  6e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00769093 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2122  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  30.57 
 
 
489 aa  183  7e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.510942  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2790  MscS mechanosensitive ion channel  33.76 
 
 
335 aa  174  1.9999999999999998e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.756482  normal  0.557915 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5823  MscS mechanosensitive ion channel  32.87 
 
 
345 aa  167  4e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.63499  normal  0.440829 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2712  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  25.73 
 
 
507 aa  131  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0470198  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1546  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  25.37 
 
 
479 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.514924  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4144  MscS mechanosensitive ion channel  28.99 
 
 
311 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.789982 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4255  mechanosensitive (MS) ion channel protein  28.99 
 
 
311 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4274  hypothetical protein  27.62 
 
 
368 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4726  MscS mechanosensitive ion channel  27.36 
 
 
325 aa  101  4e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.440183  normal  0.105448 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3145  MscS Mechanosensitive ion channel  30.57 
 
 
304 aa  99.8  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.243267  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0226  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  25.61 
 
 
473 aa  93.6  7e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.512445  normal  0.203081 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1438  MscS mechanosensitive ion channel  31.05 
 
 
840 aa  91.3  4e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.139296  normal  0.137989 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1124  MscS Mechanosensitive ion channel  27.27 
 
 
345 aa  89.4  1e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.745547  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3071  hypothetical protein  31.9 
 
 
366 aa  88.6  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.962312  normal  0.378174 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0533  MscS Mechanosensitive ion channel  24.5 
 
 
472 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0452  MscS Mechanosensitive ion channel  29.38 
 
 
853 aa  87.8  4e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.372575 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0381  MscS mechanosensitive ion channel  31.98 
 
 
815 aa  87.4  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3452  MscS mechanosensitive ion channel  31.98 
 
 
816 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00203474  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1800  MscS mechanosensitive ion channel  30 
 
 
859 aa  86.3  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000387595 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12461  transmembrane protein  24.37 
 
 
481 aa  86.3  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3862  MscS mechanosensitive ion channel  28.79 
 
 
830 aa  85.5  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.725538  normal  0.276406 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2730  potassium efflux system KEFA  23.65 
 
 
825 aa  84  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.668875  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2163  MscS Mechanosensitive ion channel  26.29 
 
 
843 aa  84  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.257742  normal  0.626494 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2316  mechanosensitive ion channel family protein  31.18 
 
 
773 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3100  MscS mechanosensitive ion channel  30.81 
 
 
820 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.416731  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5267  MscS mechanosensitive ion channel  30.81 
 
 
820 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.269062  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2070  mechanosensitive ion channel family protein  31.18 
 
 
809 aa  83.6  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.563687  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5006  MscS mechanosensitive ion channel  30.81 
 
 
814 aa  83.6  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0986  mechanosensitive ion channel family protein  31.18 
 
 
808 aa  83.2  0.000000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.722323  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2264  mechanosensitive ion channel family protein  31.18 
 
 
809 aa  83.2  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2125  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  31.18 
 
 
809 aa  83.2  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0467602  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2608  mechanosensitive ion channel family protein  28.21 
 
 
825 aa  82  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.349131  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2303  MscS Mechanosensitive ion channel  20.49 
 
 
512 aa  81.6  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.697138  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4476  MscS mechanosensitive ion channel  27.72 
 
 
799 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.878237 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1250  MscS mechanosensitive ion channel  26.34 
 
 
361 aa  81.3  0.00000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000414305  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3222  MscS mechanosensitive ion channel  26.42 
 
 
866 aa  81.3  0.00000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0617  MscS mechanosensitive ion channel  24.53 
 
 
338 aa  80.9  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210835  normal  0.752053 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2094  MscS mechanosensitive ion channel  26.94 
 
 
860 aa  79.7  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.183403  normal  0.195823 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5154  MscS mechanosensitive ion channel  30 
 
 
814 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0457644  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0940  MscS mechanosensitive ion channel  26.53 
 
 
275 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.546965 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0741  MscS mechanosensitive ion channel  28.07 
 
 
803 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2101  MscS Mechanosensitive ion channel  24.79 
 
 
299 aa  79.7  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172333  normal  0.177745 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1862  MscS mechanosensitive ion channel  25.85 
 
 
867 aa  79.3  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46240  hypothetical protein  29.82 
 
 
807 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.566889  normal  0.0303227 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1093  MscS Mechanosensitive ion channel  25.32 
 
 
389 aa  78.6  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.464677  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3549  MscS mechanosensitive ion channel  26.11 
 
 
803 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.566467  normal  0.27975 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3482  MscS mechanosensitive ion channel  26.75 
 
 
813 aa  78.6  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.144458  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3931  hypothetical protein  29.82 
 
 
806 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.604151  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2988  putative small-conductance mechanosensitive channel  24.63 
 
 
806 aa  78.6  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000510417  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0740  MscS mechanosensitive ion channel  27.17 
 
 
803 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.333087  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1599  MscS Mechanosensitive ion channel  23.28 
 
 
862 aa  79  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4629  MscS mechanosensitive ion channel  30 
 
 
832 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0707  MscS mechanosensitive ion channel  27.17 
 
 
855 aa  78.6  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.441898  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1852  mechanosensitive ion channel family protein  26.11 
 
 
804 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0601787  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1608  MscS mechanosensitive ion channel  27.81 
 
 
868 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0360  MscS mechanosensitive ion channel  27.01 
 
 
393 aa  78.2  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2392  MscS mechanosensitive ion channel  31.21 
 
 
794 aa  77.4  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.211304  hitchhiker  0.00331512 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2422  MscS Mechanosensitive ion channel  26.7 
 
 
844 aa  77.4  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.275364 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2829  MscS mechanosensitive ion channel  27.37 
 
 
294 aa  77.4  0.0000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2842  MscS mechanosensitive ion channel  30.29 
 
 
369 aa  77.4  0.0000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1464  MscS Mechanosensitive ion channel  26.87 
 
 
338 aa  77.4  0.0000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5091  MscS Mechanosensitive ion channel  21.3 
 
 
637 aa  77  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00148956  normal  0.0183068 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0588  transporter, putative  27.65 
 
 
1067 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2393  MscS Mechanosensitive ion channel  26.43 
 
 
408 aa  76.3  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1647  MscS Mechanosensitive ion channel  28.02 
 
 
429 aa  76.3  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2389  MscS mechanosensitive ion channel  26.63 
 
 
429 aa  76.3  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0587  MscS mechanosensitive ion channel  27.65 
 
 
1067 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0226105 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3443  MscS mechanosensitive ion channel  27.65 
 
 
1067 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0586  MscS mechanosensitive ion channel  27.65 
 
 
1067 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0875624 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2528  MscS mechanosensitive ion channel  29.31 
 
 
817 aa  76.3  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.290655  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2215  MscS mechanosensitive ion channel  27.59 
 
 
820 aa  75.9  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.311174 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1404  MscS Mechanosensitive ion channel  31.79 
 
 
817 aa  75.9  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_013440  Hoch_5283  MscS Mechanosensitive ion channel  23.27 
 
 
376 aa  75.5  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0914  MscS mechanosensitive ion channel  24.87 
 
 
842 aa  75.5  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00707445 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1186  MscS mechanosensitive ion channel  28.32 
 
 
256 aa  75.9  0.000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.757811 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00165  mechanosensitive ion channel family protein  28.08 
 
 
276 aa  74.7  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1153  MscS Mechanosensitive ion channel  29.14 
 
 
352 aa  74.3  0.000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_013730  Slin_6057  MscS Mechanosensitive ion channel  23.3 
 
 
779 aa  74.3  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2869  MscS Mechanosensitive ion channel  31.21 
 
 
815 aa  74.3  0.000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.266209  n/a   
 
 
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NC_007974  Rmet_4029  putative mechanosensitive ion channel  30.56 
 
 
832 aa  74.3  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_012029  Hlac_0987  MscS Mechanosensitive ion channel  27.36 
 
 
238 aa  73.9  0.000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
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