More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0226 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



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Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0226  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  100 
 
 
473 aa  910    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.512445  normal  0.203081 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12461  transmembrane protein  41.09 
 
 
481 aa  326  6e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1546  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  25.59 
 
 
479 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.514924  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1867  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  25.61 
 
 
480 aa  93.6  6e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0456814  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2122  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  29.33 
 
 
489 aa  93.6  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.510942  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1178  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  27.82 
 
 
505 aa  90.1  8e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.811879  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2712  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  22.2 
 
 
507 aa  88.2  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0470198  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1250  MscS mechanosensitive ion channel  25.21 
 
 
361 aa  87.4  5e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000414305  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1770  MscS mechanosensitive ion channel  30.06 
 
 
406 aa  87  6e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0514  MscS Mechanosensitive ion channel  28.5 
 
 
288 aa  84.7  0.000000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2229  MscS Mechanosensitive ion channel  30 
 
 
400 aa  83.6  0.000000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.224666  normal  0.568068 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2775  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  39.1 
 
 
493 aa  83.2  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.85719 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1968  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  26.84 
 
 
475 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.805203  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5256  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  32.52 
 
 
475 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.584441  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6691  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  28.64 
 
 
485 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5308  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  32.52 
 
 
508 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.119708 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5166  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  32.52 
 
 
475 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0740457  normal  0.0860349 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2519  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  35.29 
 
 
492 aa  81.3  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.806579  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0444  MscS mechanosensitive ion channel  29.27 
 
 
540 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3521  MscS mechanosensitive ion channel  27.81 
 
 
547 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7035  MscS mechanosensitive ion channel  33.13 
 
 
493 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.666416  normal  0.218312 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4726  MscS mechanosensitive ion channel  30.72 
 
 
325 aa  79  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.440183  normal  0.105448 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2790  MscS mechanosensitive ion channel  39.53 
 
 
335 aa  78.6  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.756482  normal  0.557915 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1856  hypothetical protein  28.57 
 
 
281 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.130527  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1460  MscS mechanosensitive ion channel  33.13 
 
 
493 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6368  MscS mechanosensitive ion channel  33.13 
 
 
493 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5823  MscS mechanosensitive ion channel  31.85 
 
 
345 aa  77  0.0000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.63499  normal  0.440829 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3145  MscS Mechanosensitive ion channel  32.05 
 
 
304 aa  76.6  0.0000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.243267  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0767  small-conductance mechanosensitive ion channel  34.96 
 
 
401 aa  76.6  0.000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.967765  normal  0.366005 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4274  hypothetical protein  28.64 
 
 
368 aa  76.3  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0533  MscS Mechanosensitive ion channel  25.57 
 
 
472 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4382  MscS mechanosensitive ion channel  28.85 
 
 
262 aa  75.5  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.496887  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3747  MscS Mechanosensitive ion channel  30.41 
 
 
549 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3803  MscS mechanosensitive ion channel  30.41 
 
 
549 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.717222  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2101  MscS Mechanosensitive ion channel  31.17 
 
 
299 aa  75.5  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172333  normal  0.177745 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3929  MscS mechanosensitive ion channel  30.41 
 
 
549 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0773  MscS mechanosensitive ion channel  34.15 
 
 
401 aa  75.9  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3145  mechanosensitive ion channel  30.92 
 
 
544 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.187903  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1640  mechanosensitive ion channel  41.25 
 
 
173 aa  75.1  0.000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0204845  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6888  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  30.97 
 
 
506 aa  74.7  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1534  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  28.71 
 
 
501 aa  74.7  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.231252  normal  0.283254 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0540  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  41.25 
 
 
173 aa  74.3  0.000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000231888  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4338  MscS mechanosensitive ion channel  28.05 
 
 
533 aa  74.3  0.000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3468  MscS mechanosensitive ion channel  26.83 
 
 
550 aa  74.3  0.000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4255  mechanosensitive (MS) ion channel protein  31.41 
 
 
311 aa  73.9  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0579  MscS mechanosensitive ion channel  26.46 
 
 
440 aa  73.9  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0872803  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4144  MscS mechanosensitive ion channel  31.41 
 
 
311 aa  73.6  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.789982 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2730  potassium efflux system KEFA  35.71 
 
 
825 aa  73.6  0.000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.668875  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0562  MscS mechanosensitive ion channel  30.95 
 
 
551 aa  73.6  0.000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0561  MscS mechanosensitive ion channel  30.95 
 
 
551 aa  73.6  0.000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0613  MscS mechanosensitive ion channel  28.4 
 
 
547 aa  73.6  0.000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000873032  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3071  hypothetical protein  36.45 
 
 
366 aa  73.6  0.000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.962312  normal  0.378174 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2842  MscS mechanosensitive ion channel  26.64 
 
 
369 aa  73.2  0.000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1486  MscS Mechanosensitive ion channel  25.12 
 
 
272 aa  73.2  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0521  MscS mechanosensitive ion channel  28.99 
 
 
200 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.108923  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23390  MscS Mechanosensitive ion channel  28.27 
 
 
299 aa  72.8  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350298  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2440  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  27.82 
 
 
509 aa  72.8  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00769093 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3482  MscS mechanosensitive ion channel  28.69 
 
 
813 aa  72  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.144458  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0935  MscS Mechanosensitive ion channel  28.09 
 
 
484 aa  72.4  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1162  MscS Mechanosensitive ion channel  29.23 
 
 
294 aa  72  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.102088  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2332  MscS Mechanosensitive ion channel  29.03 
 
 
362 aa  71.6  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2316  mechanosensitive ion channel family protein  33.59 
 
 
291 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.176359  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0360  MscS mechanosensitive ion channel  37.01 
 
 
393 aa  71.6  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5091  MscS Mechanosensitive ion channel  22.82 
 
 
637 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00148956  normal  0.0183068 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2389  MscS mechanosensitive ion channel  27.56 
 
 
429 aa  71.6  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1888  MscS Mechanosensitive ion channel  29.84 
 
 
362 aa  70.9  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0955  MscS mechanosensitive ion channel  28.57 
 
 
298 aa  71.2  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3719  MscS mechanosensitive ion channel  24.71 
 
 
538 aa  71.2  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00173633  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2065  MscS mechanosensitive ion channel  28.07 
 
 
359 aa  70.9  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5331  MscS mechanosensitive ion channel  30.06 
 
 
301 aa  70.9  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5803  Small-conductance mechanosensitive channel  28.4 
 
 
284 aa  70.9  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.528701 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2696  MscS Mechanosensitive ion channel  27.04 
 
 
369 aa  70.5  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.415509  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2393  MscS Mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 
408 aa  70.5  0.00000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0258  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  36.63 
 
 
492 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.986681 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6131  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  31.58 
 
 
489 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2568  MscS mechanosensitive ion channel  24.84 
 
 
358 aa  70.5  0.00000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0209  MscS mechanosensitive ion channel  28.85 
 
 
685 aa  70.1  0.00000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0673077 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1746  mechanosensitive ion channel family protein  28.07 
 
 
531 aa  70.1  0.00000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7380  mechanosensitive ion channel protein  25.45 
 
 
439 aa  70.1  0.00000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31736  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1350  hypothetical protein  28.24 
 
 
292 aa  69.7  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.136839  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1797  mechanosensitive ion channel  30 
 
 
561 aa  69.3  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.433096  n/a   
 
 
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NC_011313  VSAL_II1036  putative mechanosensitive ion channel protein  25.77 
 
 
534 aa  69.3  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1124  MscS Mechanosensitive ion channel  28.32 
 
 
345 aa  69.3  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.745547  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2740  MscS mechanosensitive ion channel  27.32 
 
 
288 aa  69.3  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1775  MscS mechanosensitive ion channel  36.56 
 
 
283 aa  68.9  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2581  MscS mechanosensitive ion channel  32.85 
 
 
298 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.391196  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3013  MscS mechanosensitive ion channel  32.14 
 
 
843 aa  68.9  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_007955  Mbur_2273  MscS mechanosensitive ion channel  28.93 
 
 
258 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
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NC_008261  CPF_0204  mechanosensitive ion channel family protein  29.35 
 
 
271 aa  68.9  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.171183  n/a   
 
 
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NC_013385  Adeg_1464  MscS Mechanosensitive ion channel  27.33 
 
 
338 aa  68.9  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_007355  Mbar_A2981  hypothetical protein  29.76 
 
 
298 aa  68.6  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0759175  normal  0.0858863 
 
 
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NC_007517  Gmet_1942  MscS mechanosensitive ion channel  27.74 
 
 
360 aa  68.6  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_011138  MADE_00165  mechanosensitive ion channel family protein  33.33 
 
 
276 aa  68.2  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009634  Mevan_1689  MscS mechanosensitive ion channel  33.06 
 
 
356 aa  68.2  0.0000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
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NC_009636  Smed_1800  MscS mechanosensitive ion channel  31.91 
 
 
859 aa  68.2  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000387595 
 
 
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NC_007955  Mbur_0476  MscS mechanosensitive ion channel  24.18 
 
 
279 aa  67.8  0.0000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.139506  n/a   
 
 
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NC_009636  Smed_0553  MscS mechanosensitive ion channel  33.06 
 
 
874 aa  67.8  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.362584 
 
 
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NC_010623  Bphy_3626  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  27.78 
 
 
489 aa  67.8  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_007952  Bxe_B2387  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 
490 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178532  normal 
 
 
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NC_007954  Sden_1359  MscS mechanosensitive ion channel  35.19 
 
 
275 aa  67.4  0.0000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124466  n/a   
 
 
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