More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1464 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_1464  MscS Mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 338 aa  676    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2332  MscS Mechanosensitive ion channel  29.94 
 
 		 362 aa  146  5e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2065  MscS mechanosensitive ion channel  34.15 
 
 		 359 aa  146  5e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1633  hypothetical protein  32.11 
 
 		 364 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246622  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1888  MscS Mechanosensitive ion channel  31.28 
 
 		 362 aa  130  3e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1146  MscS mechanosensitive ion channel  29.33 
 
 		 366 aa  129  8.000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.779955  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1942  MscS mechanosensitive ion channel  28.46 
 
 		 360 aa  126  6e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2696  MscS Mechanosensitive ion channel  28.12 
 
 		 369 aa  123  4e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.415509  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0553  MscS mechanosensitive ion channel  34.95 
 
 		 874 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.362584 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1438  MscS mechanosensitive ion channel  34.03 
 
 		 840 aa  119  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.139296  normal  0.137989 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2094  MscS mechanosensitive ion channel  33.65 
 
 		 860 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.183403  normal  0.195823 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1852  MscS Mechanosensitive ion channel  32.35 
 
 		 344 aa  113  5e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.390235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0951  MscS Mechanosensitive ion channel  32.86 
 
 		 341 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3071  hypothetical protein  27.52 
 
 		 366 aa  109  6e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.962312  normal  0.378174 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0935  MscS mechanosensitive ion channel  35.12 
 
 		 845 aa  108  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1250  MscS mechanosensitive ion channel  31.58 
 
 		 361 aa  106  6e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000414305  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0209  MscS mechanosensitive ion channel  31.05 
 
 		 685 aa  106  7e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0673077 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3246  MscS mechanosensitive ion channel  32.56 
 
 		 381 aa  105  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00298811  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0935  MscS Mechanosensitive ion channel  29.53 
 
 		 484 aa  105  2e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3407  MscS mechanosensitive ion channel  34.17 
 
 		 832 aa  103  3e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.121329  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1569  MscS mechanosensitive ion channel  27.34 
 
 		 342 aa  102  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.50156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1461  MscS Mechanosensitive ion channel  32.2 
 
 		 785 aa  102  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0820  MscS mechanosensitive ion channel  30.89 
 
 		 849 aa  101  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0343003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1784  mechanosensitive ion channel family protein  32.2 
 
 		 891 aa  101  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1701  phosphoglycerate mutase  34.13 
 
 		 310 aa  100  4e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1124  MscS Mechanosensitive ion channel  29.85 
 
 		 345 aa  99.8  6e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.745547  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1411  MscS Mechanosensitive ion channel  31.27 
 
 		 373 aa  99.8  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1339  MscS Mechanosensitive ion channel  30.73 
 
 		 636 aa  98.6  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000323872 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2316  mechanosensitive ion channel family protein  34.68 
 
 		 291 aa  98.2  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.176359  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2148  small conductance mechanosensitive Ion channel  30.37 
 
 		 847 aa  98.2  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.667496  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1311  MscS Mechanosensitive ion channel  30.73 
 
 		 636 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0822  MscS mechanosensitive ion channel  30.37 
 
 		 847 aa  98.2  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0649099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2451  small-conductance mechanosensitive channel  31.84 
 
 		 380 aa  97.1  4e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3862  MscS mechanosensitive ion channel  30.46 
 
 		 830 aa  97.1  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.725538  normal  0.276406 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2581  MscS mechanosensitive ion channel  34.46 
 
 		 298 aa  96.3  6e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.391196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2101  MscS Mechanosensitive ion channel  36.2 
 
 		 299 aa  95.9  8e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172333  normal  0.177745 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4892  MscS Mechanosensitive ion channel  29.17 
 
 		 560 aa  96.3  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1518  hypothetical protein  33.14 
 
 		 732 aa  95.5  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1465  hypothetical protein  31.61 
 
 		 753 aa  95.1  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1862  MscS mechanosensitive ion channel  28.69 
 
 		 867 aa  95.5  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5308  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  30.96 
 
 		 508 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.119708 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2935  MscS Mechanosensitive ion channel  27.92 
 
 		 282 aa  95.5  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.863949  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0528  potassium efflux protein KefA  34.07 
 
 		 1120 aa  94.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2608  mechanosensitive ion channel family protein  29.67 
 
 		 825 aa  94.7  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.349131  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0522  potassium efflux protein KefA  34.07 
 
 		 1118 aa  94.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.97346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3910  hypothetical protein  30.91 
 
 		 301 aa  95.1  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0581  potassium efflux protein KefA  34.07 
 
 		 1118 aa  94.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.467495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0519  potassium efflux protein KefA  34.07 
 
 		 1120 aa  94.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0538  potassium efflux protein KefA  34.07 
 
 		 1118 aa  94.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3222  MscS mechanosensitive ion channel  32.62 
 
 		 866 aa  94.4  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5166  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  30.14 
 
 		 475 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0740457  normal  0.0860349 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1300  MscS mechanosensitive ion channel  28.87 
 
 		 343 aa  94  3e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.987941  hitchhiker  0.00895683 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2842  MscS mechanosensitive ion channel  29.76 
 
 		 369 aa  94  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5256  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  30.14 
 
 		 475 aa  94  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.584441  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3304  MscS Mechanosensitive ion channel  29.03 
 
 		 1235 aa  93.2  6e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1674  MscS mechanosensitive ion channel  33.87 
 
 		 270 aa  93.2  6e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.702305  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3013  MscS mechanosensitive ion channel  32.65 
 
 		 843 aa  92.4  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2988  putative small-conductance mechanosensitive channel  31.74 
 
 		 806 aa  92.4  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000510417  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1800  MscS mechanosensitive ion channel  33.68 
 
 		 859 aa  92  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000387595 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0533  MscS Mechanosensitive ion channel  30.73 
 
 		 472 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1335  MscS mechanosensitive ion channel  31.79 
 
 		 275 aa  91.3  2e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000063147 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2646  MscS mechanosensitive ion channel  29.31 
 
 		 322 aa  91.3  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46240  hypothetical protein  28.64 
 
 		 807 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.566889  normal  0.0303227 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3172  MscS Mechanosensitive ion channel  31.61 
 
 		 784 aa  90.9  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1994  MscS mechanosensitive ion channel  32.2 
 
 		 796 aa  90.5  4e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.952395 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0914  MscS mechanosensitive ion channel  32.57 
 
 		 842 aa  90.5  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707445 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0945  potassium efflux protein KefA  32.95 
 
 		 1115 aa  90.5  4e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.612496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3931  hypothetical protein  28.14 
 
 		 806 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.604151  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0555  potassium efflux protein KefA  31.28 
 
 		 1118 aa  89.7  6e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.364262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0500  potassium efflux protein KefA  31.28 
 
 		 1120 aa  89.7  6e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.527944  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00416  fused conserved protein  31.28 
 
 		 1120 aa  89.7  7e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3145  MscS Mechanosensitive ion channel  31.28 
 
 		 1120 aa  89.7  7e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.178032  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2479  MscS Mechanosensitive ion channel  26.52 
 
 		 383 aa  89.7  7e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.827266 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00421  hypothetical protein  31.28 
 
 		 1120 aa  89.7  7e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2326  MscS mechanosensitive ion channel  31.33 
 
 		 1127 aa  89.7  7e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0541  potassium efflux protein KefA  31.28 
 
 		 1120 aa  89.7  7e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0397  potassium efflux protein KefA  31.28 
 
 		 1120 aa  89.7  7e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2389  MscS mechanosensitive ion channel  29.35 
 
 		 429 aa  89.7  7e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3151  potassium efflux protein KefA  31.28 
 
 		 1120 aa  89.7  7e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.800258  normal  0.703774 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0508  potassium efflux protein KefA  31.28 
 
 		 1120 aa  89.7  7e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000540502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5091  MscS Mechanosensitive ion channel  28.88 
 
 		 637 aa  89.4  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00148956  normal  0.0183068 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0741  MscS mechanosensitive ion channel  27.27 
 
 		 803 aa  89.4  9e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03384  small-conductance mechanosensitive channel  28.57 
 
 		 803 aa  88.6  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.670806  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0452  MscS Mechanosensitive ion channel  31.75 
 
 		 853 aa  88.6  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.372575 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1968  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  28.5 
 
 		 475 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.805203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1752  MscS Mechanosensitive ion channel  29.33 
 
 		 356 aa  88.6  1e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1856  hypothetical protein  27.09 
 
 		 281 aa  89  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.130527  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4476  MscS mechanosensitive ion channel  27.27 
 
 		 799 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.878237 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2163  MscS Mechanosensitive ion channel  30 
 
 		 843 aa  89  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.257742  normal  0.626494 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1130  potassium efflux protein KefA  30.65 
 
 		 1130 aa  88.6  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000811569 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2422  MscS Mechanosensitive ion channel  30 
 
 		 844 aa  89  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.275364 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0707  MscS mechanosensitive ion channel  27.27 
 
 		 855 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.441898  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2295  mechanosensitive ion channel family protein  29.76 
 
 		 289 aa  88.2  2e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1709  small conductance mechanosensitive channel  29.35 
 
 		 494 aa  88.2  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0466336 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2122  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  31.69 
 
 		 489 aa  88.6  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.510942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0740  MscS mechanosensitive ion channel  27.27 
 
 		 803 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.333087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0384  mechanosensitive ion channel  30.17 
 
 		 752 aa  87.4  3e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2730  potassium efflux system KEFA  32.66 
 
 		 825 aa  87.8  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.668875  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0360  MscS mechanosensitive ion channel  35.14 
 
 		 393 aa  87.8  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1277  MscS mechanosensitive ion channel  29.43 
 
 		 352 aa  87  4e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>