More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2519 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2519  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 492 aa  980    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.806579  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2775  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  88.64 
 
 		 493 aa  874    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.85719 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6888  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  48.61 
 
 		 506 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1178  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  44.49 
 
 		 505 aa  406  1.0000000000000001e-112  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.811879  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1534  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  45.49 
 
 		 501 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.231252  normal  0.283254 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5823  MscS mechanosensitive ion channel  57.41 
 
 		 345 aa  369  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.63499  normal  0.440829 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2790  MscS mechanosensitive ion channel  56.25 
 
 		 335 aa  357  1.9999999999999998e-97  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.756482  normal  0.557915 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2440  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  39.1 
 
 		 509 aa  319  7.999999999999999e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00769093 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3626  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  33.06 
 
 		 489 aa  257  4e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6131  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  32.77 
 
 		 489 aa  250  4e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2387  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  33.86 
 
 		 490 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1867  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  30.97 
 
 		 480 aa  246  9e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0456814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5166  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  31.33 
 
 		 475 aa  227  3e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0740457  normal  0.0860349 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5256  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  31.78 
 
 		 475 aa  226  7e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.584441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5308  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  32.22 
 
 		 508 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.119708 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1460  MscS mechanosensitive ion channel  32.24 
 
 		 493 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6368  MscS mechanosensitive ion channel  32.24 
 
 		 493 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7035  MscS mechanosensitive ion channel  32.03 
 
 		 493 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.666416  normal  0.218312 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1968  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  30.52 
 
 		 475 aa  219  8.999999999999998e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.805203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6691  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  31.39 
 
 		 485 aa  209  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0258  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  30.79 
 
 		 492 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.986681 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2122  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  30.54 
 
 		 489 aa  157  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.510942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2712  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  26.15 
 
 		 507 aa  135  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0470198  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1546  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  24.32 
 
 		 479 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.514924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2303  MscS Mechanosensitive ion channel  27.73 
 
 		 512 aa  123  9e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.697138  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3145  MscS Mechanosensitive ion channel  33.64 
 
 		 304 aa  111  3e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.243267  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4726  MscS mechanosensitive ion channel  30.43 
 
 		 325 aa  103  5e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.440183  normal  0.105448 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4144  MscS mechanosensitive ion channel  30.19 
 
 		 311 aa  103  8e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.789982 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4255  mechanosensitive (MS) ion channel protein  30.19 
 
 		 311 aa  103  8e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12461  transmembrane protein  27.86 
 
 		 481 aa  101  3e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0533  MscS Mechanosensitive ion channel  25.92 
 
 		 472 aa  101  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1250  MscS mechanosensitive ion channel  28.37 
 
 		 361 aa  100  5e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000414305  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4274  hypothetical protein  29.25 
 
 		 368 aa  100  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1124  MscS Mechanosensitive ion channel  26.75 
 
 		 345 aa  94.7  3e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.745547  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5091  MscS Mechanosensitive ion channel  22.72 
 
 		 637 aa  91.3  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00148956  normal  0.0183068 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0736  MscS Mechanosensitive ion channel  25.14 
 
 		 484 aa  88.2  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2696  MscS Mechanosensitive ion channel  28.24 
 
 		 369 aa  87  6e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.415509  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2842  MscS mechanosensitive ion channel  30.56 
 
 		 369 aa  87  6e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2229  MscS Mechanosensitive ion channel  28.17 
 
 		 400 aa  86.3  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.224666  normal  0.568068 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0765  MscS Mechanosensitive ion channel  25.71 
 
 		 484 aa  86.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0664  cyclic nucleotide-binding  25.08 
 
 		 449 aa  85.9  0.000000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0101822  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2479  MscS Mechanosensitive ion channel  27.84 
 
 		 383 aa  85.9  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.827266 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1146  MscS mechanosensitive ion channel  28.16 
 
 		 366 aa  85.9  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.779955  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1770  MscS mechanosensitive ion channel  26.57 
 
 		 406 aa  86.7  0.000000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2065  MscS mechanosensitive ion channel  26.43 
 
 		 359 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1895  MscS Mechanosensitive ion channel  27.89 
 
 		 348 aa  84  0.000000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000167428  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0617  MscS mechanosensitive ion channel  25.53 
 
 		 338 aa  83.6  0.000000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210835  normal  0.752053 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03115  MscS Mechanosensitive ion channel  26.36 
 
 		 378 aa  83.6  0.000000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1210  MscS mechanosensitive ion channel  23.74 
 
 		 344 aa  82.8  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.224237  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2568  MscS mechanosensitive ion channel  25.6 
 
 		 358 aa  83.2  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3071  hypothetical protein  33.14 
 
 		 366 aa  81.6  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.962312  normal  0.378174 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0226  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  35.29 
 
 		 473 aa  81.6  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.512445  normal  0.203081 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5283  MscS Mechanosensitive ion channel  23.65 
 
 		 376 aa  81.6  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2730  potassium efflux system KEFA  26.37 
 
 		 825 aa  79.7  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.668875  n/a   
 
 
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NC_011729  PCC7424_3804  MscS Mechanosensitive ion channel  20.98 
 
 		 495 aa  79.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2837  MscS Mechanosensitive ion channel  28.32 
 
 		 366 aa  79  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.426677  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1942  MscS mechanosensitive ion channel  25.49 
 
 		 360 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008044  TM1040_1438  MscS mechanosensitive ion channel  28.63 
 
 		 840 aa  78.2  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.139296  normal  0.137989 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1633  hypothetical protein  25.62 
 
 		 364 aa  77.8  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246622  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0360  MscS mechanosensitive ion channel  28.42 
 
 		 393 aa  77.8  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1852  mechanosensitive ion channel family protein  27.35 
 
 		 804 aa  77  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0601787  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2332  MscS Mechanosensitive ion channel  25.56 
 
 		 362 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0452  MscS Mechanosensitive ion channel  24.39 
 
 		 853 aa  75.9  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.372575 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0767  small-conductance mechanosensitive ion channel  35.34 
 
 		 401 aa  75.5  0.000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.967765  normal  0.366005 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0935  MscS Mechanosensitive ion channel  25.59 
 
 		 484 aa  74.7  0.000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0773  MscS mechanosensitive ion channel  34.59 
 
 		 401 aa  74.3  0.000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2162  periplasmic binding protein; mechanosensitive ion channel component  24.44 
 
 		 794 aa  74.7  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.387859 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5378  MscS Mechanosensitive ion channel  29.09 
 
 		 909 aa  74.7  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.287309  normal  0.723398 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0857  MscS mechanosensitive ion channel  28.29 
 
 		 840 aa  74.3  0.000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0786  MscS Mechanosensitive ion channel  27.49 
 
 		 840 aa  74.3  0.000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3246  MscS mechanosensitive ion channel  26.71 
 
 		 381 aa  74.3  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00298811  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1464  MscS Mechanosensitive ion channel  26.07 
 
 		 338 aa  73.9  0.000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1153  MscS Mechanosensitive ion channel  28.57 
 
 		 352 aa  73.9  0.000000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5470  MscS mechanosensitive ion channel  30.56 
 
 		 835 aa  73.9  0.000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2326  MscS mechanosensitive ion channel  27.78 
 
 		 1127 aa  73.6  0.000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3549  MscS mechanosensitive ion channel  26.98 
 
 		 803 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.566467  normal  0.27975 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2316  mechanosensitive ion channel family protein  27.62 
 
 		 773 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4833  MscS mechanosensitive ion channel  28.48 
 
 		 947 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.882104  normal  0.702316 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4556  MscS Mechanosensitive ion channel  24.09 
 
 		 883 aa  73.2  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0198839  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0707  MscS mechanosensitive ion channel  26.52 
 
 		 855 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.441898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5300  MscS Mechanosensitive ion channel  28.48 
 
 		 909 aa  72.4  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.154619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3222  MscS mechanosensitive ion channel  25.48 
 
 		 866 aa  72.4  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3375  MscS mechanosensitive ion channel  32.76 
 
 		 302 aa  71.6  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.190462  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2357  hypothetical protein  38.95 
 
 		 348 aa  71.2  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.116724  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0623  MscS Mechanosensitive ion channel  25.6 
 
 		 337 aa  71.2  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3659  MscS mechanosensitive ion channel  25 
 
 		 439 aa  71.2  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.19276  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2608  mechanosensitive ion channel family protein  25.25 
 
 		 825 aa  70.9  0.00000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.349131  n/a   
 
 
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NC_009512  Pput_0740  MscS mechanosensitive ion channel  26.09 
 
 		 803 aa  70.9  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.333087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2148  small conductance mechanosensitive Ion channel  26.11 
 
 		 847 aa  70.9  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.667496  n/a   
 
 
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NC_009049  Rsph17029_0822  MscS mechanosensitive ion channel  26.11 
 
 		 847 aa  70.9  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0649099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3862  MscS mechanosensitive ion channel  25.89 
 
 		 830 aa  70.5  0.00000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.725538  normal  0.276406 
 
 
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NC_007498  Pcar_2451  small-conductance mechanosensitive channel  25.79 
 
 		 380 aa  70.5  0.00000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009428  Rsph17025_0820  MscS mechanosensitive ion channel  26.6 
 
 		 849 aa  70.1  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0343003  normal  1 
 
 
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NC_008009  Acid345_4074  MscS mechanosensitive ion channel  24.38 
 
 		 572 aa  70.1  0.00000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012918  GM21_1888  MscS Mechanosensitive ion channel  24.44 
 
 		 362 aa  70.1  0.00000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_013202  Hmuk_2000  MscS Mechanosensitive ion channel  26.96 
 
 		 302 aa  70.1  0.00000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.03582 
 
 
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NC_012850  Rleg_2422  MscS Mechanosensitive ion channel  24.09 
 
 		 844 aa  70.1  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.275364 
 
 
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NC_010501  PputW619_4476  MscS mechanosensitive ion channel  25.43 
 
 		 799 aa  70.1  0.00000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.878237 
 
 
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NC_009012  Cthe_2775  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 232 aa  70.1  0.00000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.9012  n/a   
 
 
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NC_013501  Rmar_0951  MscS Mechanosensitive ion channel  25.81 
 
 		 341 aa  69.3  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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