More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6888 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012858  Rleg_6888  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  100 
 
 
506 aa  1004    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1178  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  60.08 
 
 
505 aa  590  1e-167  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.811879  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1534  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  51.4 
 
 
501 aa  511  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.231252  normal  0.283254 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2775  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  47.99 
 
 
493 aa  455  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.85719 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2519  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  48.61 
 
 
492 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.806579  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2440  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  42.51 
 
 
509 aa  366  1e-100  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00769093 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5823  MscS mechanosensitive ion channel  48.22 
 
 
345 aa  295  1e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.63499  normal  0.440829 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2790  MscS mechanosensitive ion channel  47.39 
 
 
335 aa  290  5.0000000000000004e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.756482  normal  0.557915 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6131  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  35.33 
 
 
489 aa  279  8e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1867  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  34.85 
 
 
480 aa  271  2e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0456814  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3626  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  34.27 
 
 
489 aa  268  1e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2387  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  34.67 
 
 
490 aa  263  6e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178532  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5256  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  33.55 
 
 
475 aa  257  3e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.584441  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5166  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  34.58 
 
 
475 aa  257  4e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0740457  normal  0.0860349 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5308  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  35.48 
 
 
508 aa  256  5e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.119708 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6691  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  34.63 
 
 
485 aa  243  6e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1968  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  30.94 
 
 
475 aa  239  8e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.805203  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0258  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  33.79 
 
 
492 aa  227  3e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.986681 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1460  MscS mechanosensitive ion channel  31 
 
 
493 aa  210  5e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6368  MscS mechanosensitive ion channel  31 
 
 
493 aa  210  5e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7035  MscS mechanosensitive ion channel  31.07 
 
 
493 aa  209  7e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.666416  normal  0.218312 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2122  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  30.64 
 
 
489 aa  170  5e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.510942  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2712  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  26.78 
 
 
507 aa  138  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0470198  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2303  MscS Mechanosensitive ion channel  27.73 
 
 
512 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.697138  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1546  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  24.66 
 
 
479 aa  118  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.514924  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4144  MscS mechanosensitive ion channel  30.14 
 
 
311 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.789982 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4255  mechanosensitive (MS) ion channel protein  30.14 
 
 
311 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4274  hypothetical protein  29.67 
 
 
368 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3145  MscS Mechanosensitive ion channel  29.67 
 
 
304 aa  105  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.243267  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12461  transmembrane protein  25.77 
 
 
481 aa  102  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0533  MscS Mechanosensitive ion channel  24.44 
 
 
472 aa  93.2  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2696  MscS Mechanosensitive ion channel  28.57 
 
 
369 aa  87.4  5e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.415509  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1250  MscS mechanosensitive ion channel  27.05 
 
 
361 aa  85.9  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000414305  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4726  MscS mechanosensitive ion channel  27.27 
 
 
325 aa  86.3  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.440183  normal  0.105448 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1124  MscS Mechanosensitive ion channel  29.91 
 
 
345 aa  85.5  0.000000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.745547  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1210  MscS mechanosensitive ion channel  28.34 
 
 
344 aa  83.6  0.000000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.224237  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1633  hypothetical protein  29.95 
 
 
364 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246622  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1599  MscS Mechanosensitive ion channel  25.65 
 
 
862 aa  82.8  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3071  hypothetical protein  27.6 
 
 
366 aa  81.6  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.962312  normal  0.378174 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1770  MscS mechanosensitive ion channel  31.93 
 
 
406 aa  81.6  0.00000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2229  MscS Mechanosensitive ion channel  27.9 
 
 
400 aa  80.9  0.00000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.224666  normal  0.568068 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5091  MscS Mechanosensitive ion channel  21.63 
 
 
637 aa  80.1  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00148956  normal  0.0183068 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1942  MscS mechanosensitive ion channel  26.92 
 
 
360 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03115  MscS Mechanosensitive ion channel  26.58 
 
 
378 aa  79.7  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0360  MscS mechanosensitive ion channel  31.38 
 
 
393 aa  79.7  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1800  MscS mechanosensitive ion channel  25.68 
 
 
859 aa  79  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000387595 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0773  MscS mechanosensitive ion channel  28.57 
 
 
401 aa  78.6  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1146  MscS mechanosensitive ion channel  27.5 
 
 
366 aa  78.6  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.779955  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0381  MscS mechanosensitive ion channel  30.64 
 
 
815 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3862  MscS mechanosensitive ion channel  30.1 
 
 
830 aa  78.2  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.725538  normal  0.276406 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2065  MscS mechanosensitive ion channel  26.29 
 
 
359 aa  78.2  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0767  small-conductance mechanosensitive ion channel  28.96 
 
 
401 aa  77.8  0.0000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.967765  normal  0.366005 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2479  MscS Mechanosensitive ion channel  27.13 
 
 
383 aa  77.8  0.0000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.827266 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5283  MscS Mechanosensitive ion channel  22.82 
 
 
376 aa  77  0.0000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2568  MscS mechanosensitive ion channel  24.62 
 
 
358 aa  77  0.0000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0617  MscS mechanosensitive ion channel  26.09 
 
 
338 aa  76.3  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210835  normal  0.752053 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2842  MscS mechanosensitive ion channel  28.81 
 
 
369 aa  76.6  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2162  periplasmic binding protein; mechanosensitive ion channel component  26.15 
 
 
794 aa  76.6  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.387859 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0452  MscS Mechanosensitive ion channel  27.72 
 
 
853 aa  75.5  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.372575 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0226  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  30.97 
 
 
473 aa  74.7  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.512445  normal  0.203081 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3222  MscS mechanosensitive ion channel  28.92 
 
 
866 aa  75.1  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1888  MscS Mechanosensitive ion channel  25.57 
 
 
362 aa  74.3  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2837  MscS Mechanosensitive ion channel  28.42 
 
 
366 aa  73.9  0.000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.426677  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0664  cyclic nucleotide-binding  23.05 
 
 
449 aa  73.6  0.000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0101822  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2316  mechanosensitive ion channel family protein  29.19 
 
 
773 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3452  MscS mechanosensitive ion channel  29.48 
 
 
816 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00203474  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0765  MscS Mechanosensitive ion channel  23.74 
 
 
484 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0736  MscS Mechanosensitive ion channel  24.11 
 
 
484 aa  72.8  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0935  MscS Mechanosensitive ion channel  28.88 
 
 
484 aa  71.6  0.00000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2392  MscS mechanosensitive ion channel  29.48 
 
 
794 aa  71.2  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.211304  hitchhiker  0.00331512 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1438  MscS mechanosensitive ion channel  26.11 
 
 
840 aa  71.2  0.00000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.139296  normal  0.137989 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0822  MscS mechanosensitive ion channel  25.29 
 
 
847 aa  70.9  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0649099  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1895  MscS Mechanosensitive ion channel  25.84 
 
 
348 aa  70.9  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000167428  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2608  mechanosensitive ion channel family protein  26 
 
 
825 aa  70.5  0.00000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.349131  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2332  MscS Mechanosensitive ion channel  24.51 
 
 
362 aa  70.1  0.00000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2070  mechanosensitive ion channel family protein  28.26 
 
 
809 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.563687  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0986  mechanosensitive ion channel family protein  28.11 
 
 
808 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.722323  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2264  mechanosensitive ion channel family protein  28.11 
 
 
809 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2125  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  28.11 
 
 
809 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0467602  n/a   
 
 
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NC_009428  Rsph17025_0820  MscS mechanosensitive ion channel  27.09 
 
 
849 aa  68.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0343003  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3482  MscS mechanosensitive ion channel  26.67 
 
 
813 aa  68.9  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.144458  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2163  MscS Mechanosensitive ion channel  25 
 
 
843 aa  69.3  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.257742  normal  0.626494 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2422  MscS Mechanosensitive ion channel  25.37 
 
 
844 aa  68.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.275364 
 
 
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NC_007493  RSP_2148  small conductance mechanosensitive Ion channel  25.67 
 
 
847 aa  68.6  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.667496  n/a   
 
 
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NC_007974  Rmet_4029  putative mechanosensitive ion channel  28.32 
 
 
832 aa  68.2  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_008061  Bcen_3100  MscS mechanosensitive ion channel  27.75 
 
 
820 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.416731  n/a   
 
 
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NC_010515  Bcenmc03_5006  MscS mechanosensitive ion channel  27.75 
 
 
814 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5267  MscS mechanosensitive ion channel  27.75 
 
 
820 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.269062  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1465  hypothetical protein  28.09 
 
 
753 aa  67.8  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_010511  M446_3059  MscS mechanosensitive ion channel  26.53 
 
 
879 aa  67.4  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0365719  normal  0.0542576 
 
 
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NC_009719  Plav_0452  MscS mechanosensitive ion channel  25.34 
 
 
283 aa  66.6  0.0000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00426986  normal 
 
 
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NC_002939  GSU2357  hypothetical protein  34.38 
 
 
348 aa  66.2  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.116724  n/a   
 
 
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NC_011729  PCC7424_1417  MscS Mechanosensitive ion channel  30.38 
 
 
304 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
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NC_007498  Pcar_2451  small-conductance mechanosensitive channel  29.71 
 
 
380 aa  65.9  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_010501  PputW619_0399  potassium efflux protein KefA  28.02 
 
 
1102 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_008391  Bamb_4629  MscS mechanosensitive ion channel  27.75 
 
 
832 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_013922  Nmag_1093  MscS Mechanosensitive ion channel  24.17 
 
 
389 aa  65.9  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.464677  n/a   
 
 
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NC_011205  SeD_A1670  MscS family inner membrane protein YnaI  33.1 
 
 
343 aa  65.1  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.107683 
 
 
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NC_007964  Nham_3407  MscS mechanosensitive ion channel  26.09 
 
 
832 aa  65.1  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.121329  n/a   
 
 
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NC_007974  Rmet_5803  Small-conductance mechanosensitive channel  28.16 
 
 
284 aa  65.1  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.528701 
 
 
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