More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6691 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6691  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 485 aa  985    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3626  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  54.9 
 
 		 489 aa  532  1e-150  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6131  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  44.15 
 
 		 489 aa  434  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2387  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  44.74 
 
 		 490 aa  423  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1968  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  42.17 
 
 		 475 aa  345  1e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.805203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1867  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  40.09 
 
 		 480 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0456814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1460  MscS mechanosensitive ion channel  39.22 
 
 		 493 aa  327  3e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6368  MscS mechanosensitive ion channel  39.22 
 
 		 493 aa  327  3e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7035  MscS mechanosensitive ion channel  38.4 
 
 		 493 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.666416  normal  0.218312 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5256  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  39.33 
 
 		 475 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.584441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5166  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  39.56 
 
 		 475 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0740457  normal  0.0860349 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5308  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  40.23 
 
 		 508 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.119708 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1534  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  35.17 
 
 		 501 aa  265  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.231252  normal  0.283254 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0258  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  32.54 
 
 		 492 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.986681 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6888  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  34.63 
 
 		 506 aa  258  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2440  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  32.98 
 
 		 509 aa  250  3e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00769093 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1178  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  34.87 
 
 		 505 aa  243  6e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.811879  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2775  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  32.24 
 
 		 493 aa  242  9e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.85719 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2519  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  31.39 
 
 		 492 aa  225  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.806579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5823  MscS mechanosensitive ion channel  33.68 
 
 		 345 aa  178  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.63499  normal  0.440829 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2790  MscS mechanosensitive ion channel  31.63 
 
 		 335 aa  164  3e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.756482  normal  0.557915 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2122  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  30.83 
 
 		 489 aa  163  7e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.510942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2712  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  25.07 
 
 		 507 aa  118  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0470198  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1546  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  23.76 
 
 		 479 aa  113  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.514924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5091  MscS Mechanosensitive ion channel  23.61 
 
 		 637 aa  104  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00148956  normal  0.0183068 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4274  hypothetical protein  29.91 
 
 		 368 aa  97.1  7e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12461  transmembrane protein  23.66 
 
 		 481 aa  92.8  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009040  Rsph17029_4144  MscS mechanosensitive ion channel  27.95 
 
 		 311 aa  92  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.789982 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4255  mechanosensitive (MS) ion channel protein  27.95 
 
 		 311 aa  92  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4726  MscS mechanosensitive ion channel  28.3 
 
 		 325 aa  89  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.440183  normal  0.105448 
 
 
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NC_012669  Bcav_0226  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  28.71 
 
 		 473 aa  84.3  0.000000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.512445  normal  0.203081 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1770  MscS mechanosensitive ion channel  29.95 
 
 		 406 aa  81.6  0.00000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2303  MscS Mechanosensitive ion channel  23.29 
 
 		 512 aa  80.9  0.00000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.697138  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2392  MscS mechanosensitive ion channel  31.36 
 
 		 794 aa  80.1  0.00000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.211304  hitchhiker  0.00331512 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3145  MscS Mechanosensitive ion channel  30.6 
 
 		 304 aa  79.3  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.243267  n/a   
 
 
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NC_013161  Cyan8802_0765  MscS Mechanosensitive ion channel  19.78 
 
 		 484 aa  79  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3222  MscS mechanosensitive ion channel  27.7 
 
 		 866 aa  79  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011726  PCC8801_0736  MscS Mechanosensitive ion channel  19.78 
 
 		 484 aa  78.2  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2162  periplasmic binding protein; mechanosensitive ion channel component  26.06 
 
 		 794 aa  78.2  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.387859 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0664  cyclic nucleotide-binding  22.16 
 
 		 449 aa  77.4  0.0000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0101822  normal  1 
 
 
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NC_009656  PSPA7_3931  hypothetical protein  28.21 
 
 		 806 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.604151  n/a   
 
 
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NC_011989  Avi_2730  potassium efflux system KEFA  24.5 
 
 		 825 aa  76.6  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.668875  n/a   
 
 
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NC_008463  PA14_46240  hypothetical protein  28.21 
 
 		 807 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.566889  normal  0.0303227 
 
 
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NC_009667  Oant_1862  MscS mechanosensitive ion channel  25.71 
 
 		 867 aa  75.9  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007651  BTH_I2316  mechanosensitive ion channel family protein  30.77 
 
 		 773 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0360  MscS mechanosensitive ion channel  29.72 
 
 		 393 aa  75.1  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011126  HY04AAS1_1153  MscS Mechanosensitive ion channel  36.27 
 
 		 352 aa  75.1  0.000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012029  Hlac_2229  MscS Mechanosensitive ion channel  28.05 
 
 		 400 aa  75.1  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.224666  normal  0.568068 
 
 
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NC_004578  PSPTO_1852  mechanosensitive ion channel family protein  27.32 
 
 		 804 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0601787  n/a   
 
 
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NC_011666  Msil_0452  MscS Mechanosensitive ion channel  25.93 
 
 		 853 aa  74.3  0.000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.372575 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0381  MscS mechanosensitive ion channel  30.18 
 
 		 815 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009832  Spro_2528  MscS mechanosensitive ion channel  31.43 
 
 		 817 aa  73.9  0.000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.290655  normal  1 
 
 
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NC_007355  Mbar_A3071  hypothetical protein  35.51 
 
 		 366 aa  73.6  0.000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.962312  normal  0.378174 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2264  mechanosensitive ion channel family protein  30.18 
 
 		 809 aa  73.6  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010322  PputGB1_0741  MscS mechanosensitive ion channel  27.86 
 
 		 803 aa  73.6  0.000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009076  BURPS1106A_2125  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  30.18 
 
 		 809 aa  73.6  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0467602  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2070  mechanosensitive ion channel family protein  30.18 
 
 		 809 aa  73.6  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.563687  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0986  mechanosensitive ion channel family protein  30.18 
 
 		 808 aa  73.6  0.000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.722323  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4476  MscS mechanosensitive ion channel  27.2 
 
 		 799 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.878237 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0707  MscS mechanosensitive ion channel  27.86 
 
 		 855 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.441898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3452  MscS mechanosensitive ion channel  30.18 
 
 		 816 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00203474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3549  MscS mechanosensitive ion channel  27.98 
 
 		 803 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.566467  normal  0.27975 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0740  MscS mechanosensitive ion channel  27.86 
 
 		 803 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.333087  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2479  MscS Mechanosensitive ion channel  27.05 
 
 		 383 aa  72  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.827266 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08271  hypothetical protein  32.45 
 
 		 329 aa  72  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0940  MscS mechanosensitive ion channel  26.86 
 
 		 275 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.546965 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3291  MscS mechanosensitive ion channel  27.5 
 
 		 1068 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.563171  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3100  MscS mechanosensitive ion channel  28.99 
 
 		 820 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.416731  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5006  MscS mechanosensitive ion channel  28.99 
 
 		 814 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0587  MscS mechanosensitive ion channel  27.5 
 
 		 1067 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0226105 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5267  MscS mechanosensitive ion channel  28.99 
 
 		 820 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.269062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0586  MscS mechanosensitive ion channel  27.5 
 
 		 1067 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0875624 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3862  MscS mechanosensitive ion channel  27.5 
 
 		 830 aa  71.6  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.725538  normal  0.276406 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0935  MscS Mechanosensitive ion channel  27.13 
 
 		 484 aa  71.2  0.00000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1647  MscS Mechanosensitive ion channel  30.97 
 
 		 429 aa  71.2  0.00000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1093  MscS mechanosensitive ion channel  31.51 
 
 		 271 aa  71.2  0.00000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.746887  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2608  mechanosensitive ion channel family protein  27.72 
 
 		 825 aa  70.9  0.00000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.349131  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1210  MscS mechanosensitive ion channel  25.13 
 
 		 344 aa  70.9  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.224237  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5283  MscS Mechanosensitive ion channel  21.72 
 
 		 376 aa  70.5  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3443  MscS mechanosensitive ion channel  27.5 
 
 		 1067 aa  70.1  0.00000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0588  transporter, putative  27.5 
 
 		 1067 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3721  MscS Mechanosensitive ion channel  27 
 
 		 1072 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0547  MscS mechanosensitive ion channel  27 
 
 		 1067 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3904  MscS mechanosensitive ion channel  27 
 
 		 1072 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3778  MscS mechanosensitive ion channel  27 
 
 		 1072 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0141  MscS Mechanosensitive ion channel  29.52 
 
 		 373 aa  68.9  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.195967  n/a   
 
 
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NC_010001  Cphy_3375  MscS mechanosensitive ion channel  33.68 
 
 		 302 aa  68.9  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.190462  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23390  MscS Mechanosensitive ion channel  29.41 
 
 		 299 aa  68.6  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350298  n/a   
 
 
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NC_008044  TM1040_1438  MscS mechanosensitive ion channel  24.56 
 
 		 840 aa  68.6  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.139296  normal  0.137989 
 
 
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NC_008345  Sfri_0849  MscS mechanosensitive ion channel  31.36 
 
 		 270 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.925309  n/a   
 
 
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NC_012029  Hlac_0987  MscS Mechanosensitive ion channel  29.14 
 
 		 238 aa  68.6  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008391  Bamb_4629  MscS mechanosensitive ion channel  28.4 
 
 		 832 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008781  Pnap_2215  MscS mechanosensitive ion channel  25.91 
 
 		 820 aa  67.8  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.311174 
 
 
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NC_008255  CHU_3343  mechanosensitive ion channel protein  30.67 
 
 		 813 aa  67.8  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.183155 
 
 
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NC_007348  Reut_B3482  MscS mechanosensitive ion channel  26.72 
 
 		 813 aa  67.4  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.144458  n/a   
 
 
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NC_012029  Hlac_2105  MscS Mechanosensitive ion channel  31.88 
 
 		 414 aa  67.4  0.0000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0600957  normal  0.059013 
 
 
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NC_011138  MADE_00165  mechanosensitive ion channel family protein  31.21 
 
 		 276 aa  67.4  0.0000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010511  M446_3059  MscS mechanosensitive ion channel  26.81 
 
 		 879 aa  67  0.0000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0365719  normal  0.0542576 
 
 
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NC_007413  Ava_0617  MscS mechanosensitive ion channel  28.74 
 
 		 338 aa  67  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210835  normal  0.752053 
 
 
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NC_009440  Msed_1186  MscS mechanosensitive ion channel  26.85 
 
 		 256 aa  67  0.0000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.757811 
 
 
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