More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_0736 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_0765  MscS Mechanosensitive ion channel  99.59 
 
 
484 aa  977    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0736  MscS Mechanosensitive ion channel  100 
 
 
484 aa  981    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0533  MscS Mechanosensitive ion channel  46.96 
 
 
472 aa  400  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3804  MscS Mechanosensitive ion channel  38.36 
 
 
495 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5091  MscS Mechanosensitive ion channel  35.99 
 
 
637 aa  299  8e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00148956  normal  0.0183068 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0664  cyclic nucleotide-binding  36.47 
 
 
449 aa  254  3e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0101822  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2101  MscS Mechanosensitive ion channel  38.68 
 
 
299 aa  191  2e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172333  normal  0.177745 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1438  MscS mechanosensitive ion channel  36.27 
 
 
840 aa  187  5e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.139296  normal  0.137989 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2988  putative small-conductance mechanosensitive channel  34.04 
 
 
806 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000510417  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1800  MscS mechanosensitive ion channel  37.04 
 
 
859 aa  177  3e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000387595 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1311  MscS Mechanosensitive ion channel  40.15 
 
 
636 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1339  MscS Mechanosensitive ion channel  40.15 
 
 
636 aa  176  8e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000323872 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3013  MscS mechanosensitive ion channel  34.85 
 
 
843 aa  176  9e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2094  MscS mechanosensitive ion channel  37.05 
 
 
860 aa  174  3.9999999999999995e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.183403  normal  0.195823 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0935  MscS mechanosensitive ion channel  35.79 
 
 
845 aa  171  2e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0914  MscS mechanosensitive ion channel  35.74 
 
 
842 aa  171  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00707445 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3407  MscS mechanosensitive ion channel  35.77 
 
 
832 aa  171  4e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.121329  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2316  mechanosensitive ion channel family protein  35.45 
 
 
291 aa  168  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.176359  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0209  MscS mechanosensitive ion channel  35.04 
 
 
685 aa  167  2.9999999999999998e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0673077 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1994  MscS mechanosensitive ion channel  33.1 
 
 
796 aa  167  4e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.952395 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2422  MscS Mechanosensitive ion channel  37.23 
 
 
844 aa  167  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.275364 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2163  MscS Mechanosensitive ion channel  36.5 
 
 
843 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.257742  normal  0.626494 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0553  MscS mechanosensitive ion channel  38.11 
 
 
874 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.362584 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1862  MscS mechanosensitive ion channel  32.14 
 
 
867 aa  164  5.0000000000000005e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4892  MscS Mechanosensitive ion channel  37.8 
 
 
560 aa  164  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2148  small conductance mechanosensitive Ion channel  34.41 
 
 
847 aa  162  1e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.667496  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3172  MscS Mechanosensitive ion channel  35.32 
 
 
784 aa  160  4e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0822  MscS mechanosensitive ion channel  34.05 
 
 
847 aa  160  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0649099  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1903  MscS Mechanosensitive ion channel  37.76 
 
 
303 aa  160  6e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2608  mechanosensitive ion channel family protein  35.11 
 
 
825 aa  159  8e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.349131  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4343  MscS mechanosensitive ion channel  34.58 
 
 
910 aa  159  8e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2581  MscS mechanosensitive ion channel  35.32 
 
 
298 aa  159  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.391196  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2646  MscS mechanosensitive ion channel  32.97 
 
 
322 aa  158  2e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3447  mechanosensitive ion channel family protein  38.74 
 
 
816 aa  157  3e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.597927  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0820  MscS mechanosensitive ion channel  36.4 
 
 
849 aa  157  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0343003  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1587  MscS mechanosensitive ion channel  41.18 
 
 
807 aa  156  1e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.370206  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4556  MscS Mechanosensitive ion channel  35.16 
 
 
883 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0198839  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0101  putative AefA  38.08 
 
 
338 aa  153  8e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.0000000159695  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0207  MscS Mechanosensitive ion channel  32.55 
 
 
981 aa  151  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3862  MscS mechanosensitive ion channel  30.51 
 
 
830 aa  151  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.725538  normal  0.276406 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3059  MscS mechanosensitive ion channel  34.52 
 
 
879 aa  150  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0365719  normal  0.0542576 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0145  MscS Mechanosensitive ion channel  36.68 
 
 
795 aa  150  5e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.584574 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3392  MscS Mechanosensitive ion channel  29.85 
 
 
833 aa  150  6e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5378  MscS Mechanosensitive ion channel  36.36 
 
 
909 aa  149  9e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.287309  normal  0.723398 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2730  potassium efflux system KEFA  33.09 
 
 
825 aa  149  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.668875  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4833  MscS mechanosensitive ion channel  36.18 
 
 
947 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.882104  normal  0.702316 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5300  MscS Mechanosensitive ion channel  36.18 
 
 
909 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.154619  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1608  MscS mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 
868 aa  147  3e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2529  MscS Mechanosensitive ion channel  38.42 
 
 
864 aa  147  3e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0384  mechanosensitive ion channel  31.6 
 
 
752 aa  145  1e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0452  MscS Mechanosensitive ion channel  34.31 
 
 
853 aa  145  2e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.372575 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0559  potassium efflux protein KefA  31 
 
 
1111 aa  145  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000200237 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2151  MscS mechanosensitive ion channel  32.5 
 
 
1158 aa  144  4e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3910  hypothetical protein  33.09 
 
 
301 aa  143  9e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3204  potassium efflux protein KefA  31.87 
 
 
1120 aa  142  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2883  potassium efflux protein KefA  31.87 
 
 
1120 aa  142  9.999999999999999e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0991479 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3064  potassium efflux protein KefA  31.87 
 
 
1120 aa  142  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3222  MscS mechanosensitive ion channel  35.71 
 
 
866 aa  140  3.9999999999999997e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1465  hypothetical protein  29.9 
 
 
753 aa  140  4.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1130  potassium efflux protein KefA  32.53 
 
 
1130 aa  140  4.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000811569 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2035  MscS Mechanosensitive ion channel  31.87 
 
 
447 aa  140  6e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.200455  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1632  mechanosensitive ion channel family protein  35.5 
 
 
782 aa  139  1e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.274059  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0445  potassium efflux protein KefA  30.62 
 
 
1117 aa  139  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.953711  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3045  potassium efflux protein KefA  32.51 
 
 
1133 aa  139  1e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1447  MscS mechanosensitive ion channel  28.77 
 
 
1166 aa  139  1e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1784  mechanosensitive ion channel family protein  33.08 
 
 
891 aa  139  2e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3144  MscS mechanosensitive ion channel  35.24 
 
 
444 aa  138  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0287681 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2010  MscS Mechanosensitive ion channel  31.5 
 
 
447 aa  138  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2555  MscS mechanosensitive ion channel  30.53 
 
 
321 aa  138  3.0000000000000003e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1222  MscS mechanosensitive ion channel  31.6 
 
 
451 aa  137  4e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.110808  normal  0.111103 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1461  MscS Mechanosensitive ion channel  33.08 
 
 
785 aa  137  4e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3304  MscS Mechanosensitive ion channel  31.42 
 
 
1235 aa  135  9.999999999999999e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5024  potassium efflux system protein KefA, putative  29.77 
 
 
1134 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0501  potassium efflux protein KefA  29.77 
 
 
1134 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3826  MscS Mechanosensitive ion channel  34.91 
 
 
444 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1632  MscS mechanosensitive ion channel  35.42 
 
 
877 aa  135  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.253181  normal  0.172693 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1518  hypothetical protein  30.8 
 
 
732 aa  134  3e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1013  potassium efflux protein KefA  31.54 
 
 
1128 aa  133  7.999999999999999e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3931  hypothetical protein  33.73 
 
 
806 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.604151  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1599  MscS Mechanosensitive ion channel  31.72 
 
 
862 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2257  MscS mechanosensitive ion channel  29.96 
 
 
1110 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.371999  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2326  MscS mechanosensitive ion channel  32.02 
 
 
1127 aa  131  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2983  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  31.56 
 
 
1144 aa  131  3e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46240  hypothetical protein  33.73 
 
 
807 aa  131  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.566889  normal  0.0303227 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3427  MscS mechanosensitive ion channel  29.45 
 
 
428 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.259375  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0307  MscS mechanosensitive ion channel  28.74 
 
 
435 aa  130  7.000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.381926  normal  0.0553472 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7380  mechanosensitive ion channel protein  32.02 
 
 
439 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31736  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0519  potassium efflux protein KefA  31.05 
 
 
1120 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2527  MscS mechanosensitive ion channel  35.71 
 
 
427 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0945  potassium efflux protein KefA  31.45 
 
 
1115 aa  129  1.0000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.612496  normal 
 
 
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NC_011080  SNSL254_A0528  potassium efflux protein KefA  31.05 
 
 
1120 aa  129  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_011205  SeD_A0522  potassium efflux protein KefA  31.05 
 
 
1118 aa  129  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.97346  normal 
 
 
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NC_011094  SeSA_A0538  potassium efflux protein KefA  31.05 
 
 
1118 aa  129  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_011146  Gbem_2332  MscS Mechanosensitive ion channel  29.46 
 
 
362 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_007778  RPB_0057  MscS mechanosensitive ion channel  28.09 
 
 
437 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_011083  SeHA_C0581  potassium efflux protein KefA  31.05 
 
 
1118 aa  129  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.467495  normal 
 
 
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NC_011662  Tmz1t_0168  potassium efflux protein KefA  33.06 
 
 
1110 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_011071  Smal_3758  MscS Mechanosensitive ion channel  32.08 
 
 
809 aa  127  3e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.992907  normal 
 
 
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CP001637  EcDH1_3145  MscS Mechanosensitive ion channel  30.95 
 
 
1120 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.178032  n/a   
 
 
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NC_010498  EcSMS35_0508  potassium efflux protein KefA  30.95 
 
 
1120 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000540502  normal 
 
 
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