More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1534 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_1534  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  100 
 
 
501 aa  1012    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.231252  normal  0.283254 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6888  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  51.4 
 
 
506 aa  511  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1178  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  48.29 
 
 
505 aa  471  1.0000000000000001e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.811879  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2775  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  47.25 
 
 
493 aa  409  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.85719 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2519  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  45.49 
 
 
492 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.806579  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2440  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  41.31 
 
 
509 aa  335  1e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00769093 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5823  MscS mechanosensitive ion channel  44.84 
 
 
345 aa  261  3e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.63499  normal  0.440829 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2790  MscS mechanosensitive ion channel  45.36 
 
 
335 aa  257  3e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.756482  normal  0.557915 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3626  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  33.8 
 
 
489 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6691  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  35.17 
 
 
485 aa  247  3e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6131  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  33.55 
 
 
489 aa  247  4e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1867  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  33.19 
 
 
480 aa  242  1e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0456814  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2387  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  35.61 
 
 
490 aa  242  1e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178532  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5166  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  32.72 
 
 
475 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0740457  normal  0.0860349 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5256  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  32.49 
 
 
475 aa  226  6e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.584441  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1968  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 
475 aa  226  9e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.805203  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5308  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  32.27 
 
 
508 aa  226  1e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.119708 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1460  MscS mechanosensitive ion channel  33.19 
 
 
493 aa  216  8e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6368  MscS mechanosensitive ion channel  33.19 
 
 
493 aa  216  8e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7035  MscS mechanosensitive ion channel  33.05 
 
 
493 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.666416  normal  0.218312 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0258  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  32.46 
 
 
492 aa  206  9e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.986681 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2122  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  27.31 
 
 
489 aa  160  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.510942  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2712  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  27.59 
 
 
507 aa  152  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0470198  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2303  MscS Mechanosensitive ion channel  26.17 
 
 
512 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.697138  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3145  MscS Mechanosensitive ion channel  30.18 
 
 
304 aa  110  7.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.243267  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4726  MscS mechanosensitive ion channel  27.31 
 
 
325 aa  105  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.440183  normal  0.105448 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4274  hypothetical protein  27.27 
 
 
368 aa  104  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4255  mechanosensitive (MS) ion channel protein  27.27 
 
 
311 aa  103  6e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4144  MscS mechanosensitive ion channel  27.27 
 
 
311 aa  103  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.789982 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12461  transmembrane protein  26.63 
 
 
481 aa  103  9e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1546  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  25.27 
 
 
479 aa  100  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.514924  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1124  MscS Mechanosensitive ion channel  29.26 
 
 
345 aa  95.5  2e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.745547  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0533  MscS Mechanosensitive ion channel  25.79 
 
 
472 aa  91.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5091  MscS Mechanosensitive ion channel  22.12 
 
 
637 aa  91.3  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00148956  normal  0.0183068 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2696  MscS Mechanosensitive ion channel  25.82 
 
 
369 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.415509  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1146  MscS mechanosensitive ion channel  26.53 
 
 
366 aa  84.3  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.779955  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0765  MscS Mechanosensitive ion channel  22.01 
 
 
484 aa  80.9  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0736  MscS Mechanosensitive ion channel  22.01 
 
 
484 aa  81.3  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0664  cyclic nucleotide-binding  24.34 
 
 
449 aa  78.2  0.0000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0101822  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03115  MscS Mechanosensitive ion channel  29.05 
 
 
378 aa  78.2  0.0000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1633  hypothetical protein  25.12 
 
 
364 aa  77.4  0.0000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246622  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1250  MscS mechanosensitive ion channel  27.08 
 
 
361 aa  77.4  0.0000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000414305  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1770  MscS mechanosensitive ion channel  27.04 
 
 
406 aa  77.8  0.0000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2065  MscS mechanosensitive ion channel  24.14 
 
 
359 aa  77  0.0000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0452  MscS Mechanosensitive ion channel  25.49 
 
 
853 aa  76.3  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.372575 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3659  MscS mechanosensitive ion channel  30.6 
 
 
439 aa  76.3  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.19276  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5283  MscS Mechanosensitive ion channel  24.36 
 
 
376 aa  74.3  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3222  MscS mechanosensitive ion channel  29.14 
 
 
866 aa  74.7  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0226  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  28.71 
 
 
473 aa  74.7  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.512445  normal  0.203081 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2162  periplasmic binding protein; mechanosensitive ion channel component  24.18 
 
 
794 aa  74.3  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.387859 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1599  MscS Mechanosensitive ion channel  25.79 
 
 
862 aa  74.3  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0767  small-conductance mechanosensitive ion channel  28.57 
 
 
401 aa  73.9  0.000000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.967765  normal  0.366005 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1210  MscS mechanosensitive ion channel  40.91 
 
 
344 aa  73.6  0.000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.224237  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3071  hypothetical protein  26.06 
 
 
366 aa  73.6  0.000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.962312  normal  0.378174 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1942  MscS mechanosensitive ion channel  25.12 
 
 
360 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0207  MscS Mechanosensitive ion channel  29.82 
 
 
981 aa  72.8  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0820  MscS mechanosensitive ion channel  27 
 
 
849 aa  72.8  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0343003  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0360  MscS mechanosensitive ion channel  26.46 
 
 
393 aa  72.8  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2479  MscS Mechanosensitive ion channel  25.87 
 
 
383 aa  72.4  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.827266 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0617  MscS mechanosensitive ion channel  42.17 
 
 
338 aa  72  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210835  normal  0.752053 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0381  MscS mechanosensitive ion channel  28.9 
 
 
815 aa  72  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0773  MscS mechanosensitive ion channel  28.04 
 
 
401 aa  72.4  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1888  MscS Mechanosensitive ion channel  27.81 
 
 
362 aa  72  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2842  MscS mechanosensitive ion channel  27.65 
 
 
369 aa  71.6  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1106  small-conductance mechanosensitive channel  25.77 
 
 
265 aa  71.2  0.00000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2568  MscS mechanosensitive ion channel  33 
 
 
358 aa  70.9  0.00000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1895  MscS Mechanosensitive ion channel  25.53 
 
 
348 aa  70.9  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000167428  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6057  MscS Mechanosensitive ion channel  24.73 
 
 
779 aa  70.1  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3304  MscS Mechanosensitive ion channel  26.79 
 
 
1235 aa  69.3  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3452  MscS mechanosensitive ion channel  26.88 
 
 
816 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00203474  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3100  MscS mechanosensitive ion channel  26.34 
 
 
820 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.416731  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5267  MscS mechanosensitive ion channel  26.34 
 
 
820 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.269062  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4556  MscS Mechanosensitive ion channel  26.09 
 
 
883 aa  69.3  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0198839  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3059  MscS mechanosensitive ion channel  27.23 
 
 
879 aa  68.9  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0365719  normal  0.0542576 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2101  MscS Mechanosensitive ion channel  26.24 
 
 
299 aa  68.6  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172333  normal  0.177745 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0822  MscS mechanosensitive ion channel  25.5 
 
 
847 aa  68.2  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0649099  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5006  MscS mechanosensitive ion channel  27.75 
 
 
814 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2148  small conductance mechanosensitive Ion channel  25.5 
 
 
847 aa  68.2  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.667496  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2730  potassium efflux system KEFA  26.86 
 
 
825 aa  68.6  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.668875  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5378  MscS Mechanosensitive ion channel  28.19 
 
 
909 aa  67.8  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.287309  normal  0.723398 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1438  MscS mechanosensitive ion channel  24.77 
 
 
840 aa  67.8  0.0000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.139296  normal  0.137989 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1153  MscS Mechanosensitive ion channel  30.13 
 
 
352 aa  67.4  0.0000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3804  MscS Mechanosensitive ion channel  23.37 
 
 
495 aa  67.8  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2316  mechanosensitive ion channel family protein  28.32 
 
 
773 aa  67.4  0.0000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2125  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  27.75 
 
 
809 aa  67  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0467602  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0986  mechanosensitive ion channel family protein  27.75 
 
 
808 aa  67  0.0000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.722323  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2264  mechanosensitive ion channel family protein  27.75 
 
 
809 aa  67  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2070  mechanosensitive ion channel family protein  27.75 
 
 
809 aa  67  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.563687  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3862  MscS mechanosensitive ion channel  28.43 
 
 
830 aa  67  0.0000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.725538  normal  0.276406 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4343  MscS mechanosensitive ion channel  28.34 
 
 
910 aa  67  0.0000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2332  MscS Mechanosensitive ion channel  26.34 
 
 
362 aa  67  0.0000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2229  MscS Mechanosensitive ion channel  27.04 
 
 
400 aa  66.6  0.0000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.224666  normal  0.568068 
 
 
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NC_002977  MCA2608  mechanosensitive ion channel family protein  29.06 
 
 
825 aa  66.6  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.349131  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1464  MscS Mechanosensitive ion channel  27.07 
 
 
338 aa  66.2  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4833  MscS mechanosensitive ion channel  26.92 
 
 
947 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.882104  normal  0.702316 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1712  MscS mechanosensitive ion channel  27.78 
 
 
291 aa  65.9  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_011757  Mchl_5300  MscS Mechanosensitive ion channel  26.92 
 
 
909 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.154619  normal 
 
 
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NC_011138  MADE_00165  mechanosensitive ion channel family protein  30.39 
 
 
276 aa  64.7  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_010001  Cphy_3375  MscS mechanosensitive ion channel  33.02 
 
 
302 aa  65.1  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.190462  n/a   
 
 
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NC_009636  Smed_1800  MscS mechanosensitive ion channel  23.68 
 
 
859 aa  64.7  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000387595 
 
 
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