More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1106 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1106  small-conductance mechanosensitive channel  100 
 
 		 265 aa  525  1e-148  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0383  MscS Mechanosensitive ion channel  39.32 
 
 		 260 aa  145  6e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19990  small-conductance mechanosensitive channel  33.47 
 
 		 264 aa  145  7.0000000000000006e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2569  MscS Mechanosensitive ion channel  35.75 
 
 		 321 aa  140  1.9999999999999998e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08200  small-conductance mechanosensitive channel  34.11 
 
 		 257 aa  120  3e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.335106 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2357  hypothetical protein  31.4 
 
 		 348 aa  110  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.116724  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0617  MscS mechanosensitive ion channel  31.34 
 
 		 338 aa  103  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210835  normal  0.752053 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1124  MscS Mechanosensitive ion channel  28.12 
 
 		 345 aa  96.3  4e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.745547  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1153  MscS Mechanosensitive ion channel  26.59 
 
 		 352 aa  95.5  8e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0207  MscS Mechanosensitive ion channel  28.02 
 
 		 283 aa  90.1  3e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1210  MscS mechanosensitive ion channel  31.22 
 
 		 344 aa  87.8  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.224237  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1895  MscS Mechanosensitive ion channel  31.44 
 
 		 348 aa  86.3  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000167428  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2332  MscS Mechanosensitive ion channel  30.2 
 
 		 362 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0104  MscS mechanosensitive ion channel  21.48 
 
 		 278 aa  78.6  0.0000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00989653  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4003  MscS mechanosensitive ion channel  29.14 
 
 		 362 aa  78.6  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0737574  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0108  MscS mechanosensitive ion channel  32.85 
 
 		 304 aa  76.3  0.0000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2392  MscS mechanosensitive ion channel  29 
 
 		 794 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.211304  hitchhiker  0.00331512 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0042  MscS Mechanosensitive ion channel  30.19 
 
 		 375 aa  75.5  0.0000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.634821  normal  0.103785 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1036  putative mechanosensitive ion channel protein  33.54 
 
 		 534 aa  74.7  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1146  MscS mechanosensitive ion channel  34.21 
 
 		 366 aa  74.3  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.779955  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2696  MscS Mechanosensitive ion channel  32.52 
 
 		 369 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.415509  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1066  MscS Mechanosensitive ion channel  34.62 
 
 		 261 aa  74.3  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4090  MscS mechanosensitive ion channel  29.52 
 
 		 349 aa  73.9  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1888  MscS Mechanosensitive ion channel  32.26 
 
 		 362 aa  73.2  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03062  hypothetical protein  25.61 
 
 		 563 aa  73.2  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2740  MscS mechanosensitive ion channel  33.95 
 
 		 288 aa  72.4  0.000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0951  MscS Mechanosensitive ion channel  33.83 
 
 		 341 aa  72.4  0.000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1856  hypothetical protein  32.45 
 
 		 281 aa  71.6  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.130527  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002898  small-conductance mechanosensitive channel  26.83 
 
 		 532 aa  71.6  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.341732  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1534  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  25.77 
 
 		 501 aa  71.2  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.231252  normal  0.283254 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3016  MscS mechanosensitive ion channel  26.01 
 
 		 426 aa  71.2  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1752  MscS Mechanosensitive ion channel  36.19 
 
 		 356 aa  70.5  0.00000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3200  MscS mechanosensitive ion channel  26.03 
 
 		 590 aa  69.7  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1546  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  23.67 
 
 		 479 aa  70.1  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.514924  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1504  conserved hypothetical integral membrane protein, mechanosensitive ion channel family  37.78 
 
 		 624 aa  69.7  0.00000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1942  MscS mechanosensitive ion channel  42.06 
 
 		 360 aa  69.7  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2316  mechanosensitive ion channel family protein  29.15 
 
 		 773 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0987  MscS Mechanosensitive ion channel  35.11 
 
 		 238 aa  70.1  0.00000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1801  MscS Mechanosensitive ion channel  28.63 
 
 		 335 aa  69.3  0.00000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2065  MscS mechanosensitive ion channel  32.12 
 
 		 359 aa  69.3  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1770  MscS mechanosensitive ion channel  27.8 
 
 		 406 aa  68.2  0.0000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2451  small-conductance mechanosensitive channel  26.2 
 
 		 380 aa  68.6  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0015  MscS mechanosensitive ion channel  30.83 
 
 		 287 aa  68.6  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4382  MscS mechanosensitive ion channel  28.26 
 
 		 262 aa  68.2  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.496887  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3355  MscS Mechanosensitive ion channel  23.85 
 
 		 278 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00921  small conductance mechanosensitive ion channel  27.71 
 
 		 322 aa  68.2  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.230623  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0910  MscS mechanosensitive ion channel  39.29 
 
 		 400 aa  68.6  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.505459  normal  0.0192096 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2295  mechanosensitive ion channel family protein  30.99 
 
 		 289 aa  67  0.0000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00392  hypothetical protein  24.42 
 
 		 377 aa  67  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.65965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3482  MscS mechanosensitive ion channel  30.06 
 
 		 813 aa  66.6  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.144458  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1853  MscS mechanosensitive ion channel  29.86 
 
 		 290 aa  67  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03115  MscS Mechanosensitive ion channel  22.9 
 
 		 378 aa  67.4  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0360  MscS mechanosensitive ion channel  30.11 
 
 		 393 aa  67  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4029  putative mechanosensitive ion channel  31.03 
 
 		 832 aa  67  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3620  MscS mechanosensitive ion channel  27.62 
 
 		 277 aa  67  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.812148  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0533  MscS Mechanosensitive ion channel  28.57 
 
 		 472 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1633  hypothetical protein  37.38 
 
 		 364 aa  66.6  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246622  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1943  MscS mechanosensitive ion channel  30.94 
 
 		 533 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000658199  decreased coverage  0.00758396 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1320  MscS Mechanosensitive ion channel  25.11 
 
 		 300 aa  66.6  0.0000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.23225 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3058  MscS mechanosensitive ion channel  32.58 
 
 		 435 aa  66.2  0.0000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.914338 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1900  MscS mechanosensitive ion channel  29.26 
 
 		 240 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0998935  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0986  mechanosensitive ion channel family protein  31.47 
 
 		 808 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.722323  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2264  mechanosensitive ion channel family protein  31.47 
 
 		 809 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2070  mechanosensitive ion channel family protein  31.47 
 
 		 809 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.563687  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2125  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  31.47 
 
 		 809 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0467602  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0444  MscS mechanosensitive ion channel  29.01 
 
 		 540 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1250  MscS mechanosensitive ion channel  23.86 
 
 		 361 aa  65.9  0.0000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000414305  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1936  MscS mechanosensitive ion channel  30.25 
 
 		 413 aa  65.9  0.0000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1737  mechanosensitive ion channel family protein  40.51 
 
 		 624 aa  65.9  0.0000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.64597  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23390  MscS Mechanosensitive ion channel  25.81 
 
 		 299 aa  65.9  0.0000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350298  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4603  mechanosensitive ion channel family protein  28.4 
 
 		 275 aa  65.5  0.0000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0226  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  31.4 
 
 		 473 aa  65.5  0.0000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.512445  normal  0.203081 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0236  mechanosensitive ion channel family protein  37.04 
 
 		 627 aa  65.5  0.0000000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0883  MscS mechanosensitive ion channel  29.07 
 
 		 380 aa  65.1  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199191 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3145  mechanosensitive ion channel  29.29 
 
 		 544 aa  64.7  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.187903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1404  MscS Mechanosensitive ion channel  32.87 
 
 		 817 aa  65.1  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0571  MscS Mechanosensitive ion channel  23.5 
 
 		 260 aa  65.1  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000639441  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3452  MscS mechanosensitive ion channel  30.61 
 
 		 816 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00203474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1916  MscS mechanosensitive ion channel  27.88 
 
 		 308 aa  64.7  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.944422 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3246  MscS mechanosensitive ion channel  25 
 
 		 381 aa  65.1  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00298811  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01095  mechanosensitive ion channel family protein  27.52 
 
 		 280 aa  64.3  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1293  MscS Mechanosensitive ion channel  31.07 
 
 		 814 aa  64.3  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2869  MscS Mechanosensitive ion channel  32.87 
 
 		 815 aa  64.3  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.266209  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0082  MscS mechanosensitive ion channel  31.54 
 
 		 303 aa  63.9  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0423997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2519  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  27.31 
 
 		 492 aa  64.3  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.806579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1701  phosphoglycerate mutase  29.22 
 
 		 310 aa  64.3  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0613  MscS mechanosensitive ion channel  26.76 
 
 		 547 aa  64.3  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000873032  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1518  hypothetical protein  28.26 
 
 		 732 aa  63.5  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1867  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  27.75 
 
 		 480 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0456814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0381  MscS mechanosensitive ion channel  29.93 
 
 		 815 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1674  MscS mechanosensitive ion channel  24.53 
 
 		 270 aa  63.9  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.702305  n/a   
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5329  mechanosensitive ion channel protein MscS  39.51 
 
 		 331 aa  63.5  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12461  transmembrane protein  28.57 
 
 		 481 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0579  MscS mechanosensitive ion channel  28.82 
 
 		 440 aa  63.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0872803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1059  MscS mechanosensitive ion channel  31.58 
 
 		 384 aa  63.5  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.196377 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2568  MscS mechanosensitive ion channel  23.91 
 
 		 358 aa  63.5  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2594  MscS mechanosensitive ion channel  33.61 
 
 		 388 aa  63.9  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5154  MscS mechanosensitive ion channel  30.07 
 
 		 814 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0457644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0263  mechanosensitive ion channel family protein  35.8 
 
 		 627 aa  63.5  0.000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7380  mechanosensitive ion channel protein  27.06 
 
 		 439 aa  63.2  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31736  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>