More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0042 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0042  MscS Mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 375 aa  756    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.634821  normal  0.103785 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0442  MscS Mechanosensitive ion channel  33.62 
 
 		 363 aa  182  7e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1752  MscS Mechanosensitive ion channel  28.61 
 
 		 356 aa  168  2e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3246  MscS mechanosensitive ion channel  28.46 
 
 		 381 aa  168  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00298811  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2451  small-conductance mechanosensitive channel  28.3 
 
 		 380 aa  166  8e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0941  MscS mechanosensitive ion channel  32.57 
 
 		 467 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.884334  normal  0.631146 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0883  MscS mechanosensitive ion channel  31.3 
 
 		 380 aa  144  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199191 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4003  MscS mechanosensitive ion channel  30.74 
 
 		 362 aa  144  3e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0737574  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4500  MscS Mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 662 aa  140  4.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0689  MscS mechanosensitive ion channel  34.86 
 
 		 351 aa  136  5e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.13803  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4427  MscS Mechanosensitive ion channel  28.49 
 
 		 349 aa  136  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0238849  normal  0.125106 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0935  MscS Mechanosensitive ion channel  31.35 
 
 		 433 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.940167  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2152  MscS mechanosensitive ion channel  28.27 
 
 		 377 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0938  MscS Mechanosensitive ion channel  31.35 
 
 		 433 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.466834  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3016  MscS mechanosensitive ion channel  30.51 
 
 		 426 aa  134  3e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0887  MscS mechanosensitive ion channel  30 
 
 		 431 aa  133  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0881194  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1409  MscS mechanosensitive ion channel  34.15 
 
 		 351 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0942  MscS Mechanosensitive ion channel  33.07 
 
 		 377 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000347454  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2332  MscS Mechanosensitive ion channel  28.61 
 
 		 362 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4873  MscS Mechanosensitive ion channel  31.05 
 
 		 567 aa  129  6e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1943  MscS mechanosensitive ion channel  30.74 
 
 		 533 aa  129  9.000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000658199  decreased coverage  0.00758396 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0905  MscS Mechanosensitive ion channel  34.13 
 
 		 373 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.285162  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4932  MscS Mechanosensitive ion channel  29.08 
 
 		 400 aa  128  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4194  MscS mechanosensitive ion channel  26.65 
 
 		 562 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.674763 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4048  MscS mechanosensitive ion channel  28.52 
 
 		 569 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.138882  normal  0.12233 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20120  Mechanosensitive ion channel family protein  34.92 
 
 		 418 aa  127  5e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0910  MscS mechanosensitive ion channel  24.45 
 
 		 400 aa  125  1e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.505459  normal  0.0192096 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3612  MscS Mechanosensitive ion channel  28.08 
 
 		 374 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.649067 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4689  MscS Mechanosensitive ion channel  28.08 
 
 		 374 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2594  MscS mechanosensitive ion channel  28.52 
 
 		 388 aa  124  3e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0172  MscS mechanosensitive ion channel  29.61 
 
 		 375 aa  123  4e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0430239  normal  0.753414 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1352  MscS mechanosensitive ion channel  31.12 
 
 		 376 aa  123  6e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.308859  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0691  MscS Mechanosensitive ion channel  32.8 
 
 		 362 aa  122  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2171  MscS mechanosensitive ion channel  32.31 
 
 		 374 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.920192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1267  MscS mechanosensitive ion channel  34.86 
 
 		 351 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0707  MscS Mechanosensitive ion channel  32.84 
 
 		 344 aa  120  3.9999999999999996e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000854556  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3200  MscS mechanosensitive ion channel  27.27 
 
 		 590 aa  120  3.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1578  small-conductance mechanosensitive channel  34.72 
 
 		 534 aa  120  6e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00006998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1277  MscS mechanosensitive ion channel  37.27 
 
 		 352 aa  119  7.999999999999999e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3360  hypothetical protein  30.81 
 
 		 374 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00392  hypothetical protein  30.37 
 
 		 377 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.65965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1452  MscS mechanosensitive ion channel  33.51 
 
 		 355 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.678727  normal  0.0144942 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2398  MscS mechanosensitive ion channel  31.28 
 
 		 374 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1888  MscS Mechanosensitive ion channel  26.54 
 
 		 362 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1822  MscS mechanosensitive ion channel  30.41 
 
 		 374 aa  117  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00396347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0195  MscS mechanosensitive ion channel  29.38 
 
 		 354 aa  116  7.999999999999999e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.0052728  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1900  MscS mechanosensitive ion channel  31.96 
 
 		 240 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0998935  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3649  mechanosensitive ion channel family protein  28.87 
 
 		 374 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.158368  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0013  mechanosensitive ion channel family protein  27.72 
 
 		 682 aa  115  1.0000000000000001e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1154  hypothetical protein  28.9 
 
 		 363 aa  115  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0298455  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0803  small mechanosensitive ion channel  30.12 
 
 		 342 aa  114  2.0000000000000002e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0635  small mechanosensitive ion channel  32.39 
 
 		 343 aa  112  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.352398  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0922  MscS mechanosensitive ion channel  27.45 
 
 		 456 aa  112  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.837868 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0641  hypothetical protein  26.83 
 
 		 543 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1462  small-conductance mechanosensitive channel protein  31.25 
 
 		 373 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001221  small-conductance mechanosensitive channel  30.1 
 
 		 367 aa  110  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06981  small mechanosensitive ion channel  30.04 
 
 		 338 aa  110  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.247932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2065  MscS mechanosensitive ion channel  27.55 
 
 		 359 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0857  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  27.76 
 
 		 383 aa  110  5e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.017497  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0075  small-conductance mechanosensitive channel  29.66 
 
 		 338 aa  109  9.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.221122  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2696  MscS Mechanosensitive ion channel  31.73 
 
 		 369 aa  109  9.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.415509  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1177  mechanosensitive ion channel  27.76 
 
 		 383 aa  109  1e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.180784  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07011  small mechanosensitive ion channel  32.2 
 
 		 343 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.184839  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1500  MscS mechanosensitive ion channel  34.39 
 
 		 614 aa  108  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.638706  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4819  MscS mechanosensitive ion channel  31.03 
 
 		 392 aa  108  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.749552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1942  MscS mechanosensitive ion channel  24.23 
 
 		 360 aa  108  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1504  conserved hypothetical integral membrane protein, mechanosensitive ion channel family  25 
 
 		 624 aa  108  2e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4007  MscS mechanosensitive ion channel  31.02 
 
 		 376 aa  108  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0987654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1848  MscS family hypothetical protein  29.53 
 
 		 343 aa  106  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.512359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0247  mechanosensitive ion channel family protein  31.84 
 
 		 378 aa  105  9e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3357  MscS Mechanosensitive ion channel  31.02 
 
 		 376 aa  105  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1788  MscS family inner membrane protein YnaI  29.53 
 
 		 343 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.150216 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0253  mechanosensitive ion channel family protein  31.84 
 
 		 378 aa  105  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1786  MscS family inner membrane protein YnaI  29.53 
 
 		 343 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0416525  normal  0.388102 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1670  MscS family inner membrane protein YnaI  29.53 
 
 		 343 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.107683 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1350  MscS Mechanosensitive ion channel  30.81 
 
 		 377 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000205244  normal  0.510591 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1920  MscS Mechanosensitive ion channel  30.81 
 
 		 377 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000103017  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06911  small mechanosensitive ion channel  31.92 
 
 		 343 aa  105  2e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.412375  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06621  small mechanosensitive ion channel  31.92 
 
 		 343 aa  104  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.16712  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1381  MscS Mechanosensitive ion channel  30.81 
 
 		 377 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.524748 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1488  MscS family inner membrane protein YnaI  29.13 
 
 		 343 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.445516  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1366  MscS Mechanosensitive ion channel  30.81 
 
 		 377 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0389612  hitchhiker  0.000813003 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2101  MscS Mechanosensitive ion channel  30.98 
 
 		 377 aa  104  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000188968 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1059  MscS mechanosensitive ion channel  27.91 
 
 		 384 aa  103  4e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.196377 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07431  small mechanosensitive ion channel  29.89 
 
 		 343 aa  103  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.1802 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1633  hypothetical protein  29.78 
 
 		 364 aa  103  5e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246622  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1295  MscS mechanosensitive ion channel  27.61 
 
 		 391 aa  103  5e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2117  mechanosensitive ion channel family protein  27.97 
 
 		 633 aa  103  7e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01308  conserved inner membrane protein  27.07 
 
 		 343 aa  100  4e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2315  MscS Mechanosensitive ion channel  27.07 
 
 		 343 aa  100  4e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0901587  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1543  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  27.07 
 
 		 343 aa  100  4e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1447  small conductance mechanosensitive ion channel family protein  27.07 
 
 		 343 aa  100  4e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01318  hypothetical protein  27.07 
 
 		 343 aa  100  4e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.831445  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2294  MscS mechanosensitive ion channel  27.07 
 
 		 343 aa  100  4e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05088  hypothetical protein  26.85 
 
 		 399 aa  100  4e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1978  transporter, small conductance mechanosensitive ion channel family  27.07 
 
 		 343 aa  100  4e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.218747 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1570  transporter, small conductance mechanosensitive ion channel family  27.07 
 
 		 343 aa  100  4e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1737  mechanosensitive ion channel family protein  23 
 
 		 624 aa  100  5e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.64597  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4608  MscS mechanosensitive ion channel  29.41 
 
 		 386 aa  99.8  8e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.247282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0951  MscS Mechanosensitive ion channel  29.92 
 
 		 341 aa  99  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>