More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene COXBURSA331_A0857 on replicon NC_010117
Organism: Coxiella burnetii RSA 331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009727  CBUD_1177  mechanosensitive ion channel  99.22 
 
 
383 aa  775    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.180784  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0857  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  100 
 
 
383 aa  783    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.017497  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1936  MscS mechanosensitive ion channel  44.57 
 
 
413 aa  323  3e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1791  small-conductance mechanosensitive channel  45.66 
 
 
369 aa  297  2e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0722785  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1059  MscS mechanosensitive ion channel  40.38 
 
 
384 aa  295  1e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.196377 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05088  hypothetical protein  43.92 
 
 
399 aa  294  2e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001221  small-conductance mechanosensitive channel  45.27 
 
 
367 aa  292  6e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1462  small-conductance mechanosensitive channel protein  42.52 
 
 
373 aa  291  2e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1295  MscS mechanosensitive ion channel  37.75 
 
 
391 aa  279  7e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1791  small conductance mechanosensitive ion channel family protein  42.82 
 
 
343 aa  273  5.000000000000001e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0460  putative mechanosensitive ion channel  43.37 
 
 
357 aa  273  5.000000000000001e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01308  conserved inner membrane protein  42.82 
 
 
343 aa  271  1e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2315  MscS Mechanosensitive ion channel  42.82 
 
 
343 aa  271  1e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0901587  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1978  transporter, small conductance mechanosensitive ion channel family  42.82 
 
 
343 aa  271  1e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.218747 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01318  hypothetical protein  42.82 
 
 
343 aa  271  1e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.831445  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1447  small conductance mechanosensitive ion channel family protein  42.82 
 
 
343 aa  271  1e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1543  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  42.82 
 
 
343 aa  271  1e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2294  MscS mechanosensitive ion channel  42.82 
 
 
343 aa  271  1e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1570  transporter, small conductance mechanosensitive ion channel family  42.82 
 
 
343 aa  271  1e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1848  MscS family hypothetical protein  45.12 
 
 
343 aa  267  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.512359  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1488  MscS family inner membrane protein YnaI  45.43 
 
 
343 aa  267  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.445516  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1786  MscS family inner membrane protein YnaI  45.12 
 
 
343 aa  266  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0416525  normal  0.388102 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1670  MscS family inner membrane protein YnaI  44.92 
 
 
343 aa  266  5e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.107683 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1788  MscS family inner membrane protein YnaI  44.92 
 
 
343 aa  266  5e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.150216 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2066  MscS mechanosensitive ion channel  34.15 
 
 
424 aa  250  3e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.838165  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0700  hypothetical protein  32.94 
 
 
365 aa  218  1e-55  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.744044 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2220  MscS Mechanosensitive ion channel  43.6 
 
 
339 aa  216  5.9999999999999996e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1076  MscS mechanosensitive ion channel  32.16 
 
 
378 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.119695  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3246  MscS mechanosensitive ion channel  36.12 
 
 
381 aa  187  2e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00298811  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2451  small-conductance mechanosensitive channel  43.72 
 
 
380 aa  171  1e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27641  small mechanosensitive ion channel, MscS family protein  41.1 
 
 
373 aa  169  7e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2212  small mechanosensitive ion channel  32.51 
 
 
357 aa  161  2e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.414294  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04171  small mechanosensitive ion channel, MscS family protein  34.62 
 
 
370 aa  147  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.610357 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1752  MscS Mechanosensitive ion channel  33.85 
 
 
356 aa  140  3e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0013  mechanosensitive ion channel family protein  29.76 
 
 
682 aa  140  3.9999999999999997e-32  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0883  MscS mechanosensitive ion channel  40.28 
 
 
380 aa  139  7.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.199191 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1154  hypothetical protein  40.23 
 
 
363 aa  137  2e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0298455  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0935  MscS Mechanosensitive ion channel  29.19 
 
 
433 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.940167  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0887  MscS mechanosensitive ion channel  28.07 
 
 
431 aa  137  4e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0881194  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0938  MscS Mechanosensitive ion channel  28.9 
 
 
433 aa  137  4e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.466834  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1737  mechanosensitive ion channel family protein  28.65 
 
 
624 aa  135  9.999999999999999e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.64597  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4500  MscS Mechanosensitive ion channel  29.18 
 
 
662 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0910  MscS mechanosensitive ion channel  29.18 
 
 
400 aa  134  3e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.505459  normal  0.0192096 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0942  MscS Mechanosensitive ion channel  31.23 
 
 
377 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000347454  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2117  mechanosensitive ion channel family protein  28.64 
 
 
633 aa  127  4.0000000000000003e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4003  MscS mechanosensitive ion channel  28.45 
 
 
362 aa  126  7e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0737574  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4873  MscS Mechanosensitive ion channel  29.18 
 
 
567 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0941  MscS mechanosensitive ion channel  28.95 
 
 
467 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.884334  normal  0.631146 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2594  MscS mechanosensitive ion channel  28.88 
 
 
388 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0195  MscS mechanosensitive ion channel  32.55 
 
 
354 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.0052728  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0847  mechanosensitive ion channel family protein  32.2 
 
 
337 aa  119  9.999999999999999e-26  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0334937  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3016  MscS mechanosensitive ion channel  30.32 
 
 
426 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0905  MscS Mechanosensitive ion channel  34.68 
 
 
373 aa  116  5e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.285162  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3671  MscS mechanosensitive ion channel  31.91 
 
 
277 aa  116  6e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4048  MscS mechanosensitive ion channel  24.52 
 
 
569 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.138882  normal  0.12233 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1277  MscS mechanosensitive ion channel  29.28 
 
 
352 aa  113  5e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0236  mechanosensitive ion channel family protein  27.27 
 
 
627 aa  112  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1504  conserved hypothetical integral membrane protein, mechanosensitive ion channel family  24.87 
 
 
624 aa  111  2.0000000000000002e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0042  MscS Mechanosensitive ion channel  27.76 
 
 
375 aa  110  5e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.634821  normal  0.103785 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1206  MscS mechanosensitive ion channel  29.17 
 
 
275 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0281  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0289  mechanosensitive ion channel family protein  26.63 
 
 
627 aa  109  9.000000000000001e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.658149  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1205  MscS mechanosensitive ion channel  29.17 
 
 
275 aa  109  9.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00184527  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1276  MscS mechanosensitive ion channel  29.17 
 
 
275 aa  109  9.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000188457  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0263  mechanosensitive ion channel family protein  27.93 
 
 
627 aa  108  1e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1900  MscS mechanosensitive ion channel  30.14 
 
 
240 aa  107  3e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0998935  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0689  MscS mechanosensitive ion channel  33.78 
 
 
351 aa  107  3e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.13803  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3171  MscS mechanosensitive ion channel  29.77 
 
 
275 aa  106  6e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000563606  hitchhiker  0.0000513684 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1350  MscS Mechanosensitive ion channel  29.77 
 
 
275 aa  106  6e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000676183  hitchhiker  0.0000000000523866 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3028  MscS mechanosensitive ion channel  29.17 
 
 
275 aa  105  9e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000445897  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1409  MscS mechanosensitive ion channel  29.37 
 
 
351 aa  106  9e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0691  MscS Mechanosensitive ion channel  30.61 
 
 
362 aa  105  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3340  small-conductance mechanosensitive channel  28.03 
 
 
275 aa  105  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1381  MscS Mechanosensitive ion channel  27.56 
 
 
377 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.524748 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1350  MscS Mechanosensitive ion channel  27.53 
 
 
377 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000205244  normal  0.510591 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1920  MscS Mechanosensitive ion channel  27.56 
 
 
377 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000103017  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1366  MscS Mechanosensitive ion channel  27.56 
 
 
377 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0389612  hitchhiker  0.000813003 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0247  mechanosensitive ion channel family protein  36.42 
 
 
378 aa  105  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3013  MscS mechanosensitive ion channel  29.39 
 
 
275 aa  104  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000253066  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0253  mechanosensitive ion channel family protein  35.84 
 
 
378 aa  104  3e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2101  MscS Mechanosensitive ion channel  27.56 
 
 
377 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000188968 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1500  MscS mechanosensitive ion channel  31.53 
 
 
614 aa  103  5e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.638706  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4194  MscS mechanosensitive ion channel  31.16 
 
 
562 aa  103  7e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.674763 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1943  MscS mechanosensitive ion channel  28.34 
 
 
533 aa  103  7e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000658199  decreased coverage  0.00758396 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2696  MscS Mechanosensitive ion channel  32.55 
 
 
369 aa  102  8e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.415509  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3612  MscS Mechanosensitive ion channel  28.16 
 
 
374 aa  101  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.649067 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20120  Mechanosensitive ion channel family protein  27.31 
 
 
418 aa  101  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4689  MscS Mechanosensitive ion channel  28.16 
 
 
374 aa  101  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2675  MscS mechanosensitive ion channel  27.86 
 
 
275 aa  101  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00133263  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4349  MscS Mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 
285 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4436  MscS Mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 
285 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.312478 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4433  MscS Mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 
285 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1578  small-conductance mechanosensitive channel  29.21 
 
 
534 aa  100  5e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00006998  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4503  MscS Mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 
285 aa  100  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0663  MscS Mechanosensitive ion channel  31.12 
 
 
336 aa  100  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0935  MscS Mechanosensitive ion channel  27.1 
 
 
484 aa  99.4  9e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0635  small mechanosensitive ion channel  32.04 
 
 
343 aa  99.4  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.352398  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07011  small mechanosensitive ion channel  31.55 
 
 
343 aa  98.2  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.184839  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0922  MscS mechanosensitive ion channel  32.37 
 
 
456 aa  98.2  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.837868 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10518  MscS Mechanosensitive ion channel  26.47 
 
 
591 aa  98.2  2e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.526339  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1352  MscS mechanosensitive ion channel  26.14 
 
 
376 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.308859  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>