More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3246 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_3246  MscS mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 381 aa  770    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00298811  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2451  small-conductance mechanosensitive channel  68.77 
 
 		 380 aa  536  1e-151  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4500  MscS Mechanosensitive ion channel  37.97 
 
 		 662 aa  236  6e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1791  small-conductance mechanosensitive channel  36.77 
 
 		 369 aa  222  7e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0722785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1752  MscS Mechanosensitive ion channel  35.03 
 
 		 356 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0942  MscS Mechanosensitive ion channel  39.06 
 
 		 377 aa  220  3e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000347454  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1154  hypothetical protein  36.95 
 
 		 363 aa  218  1e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0298455  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1462  small-conductance mechanosensitive channel protein  40.06 
 
 		 373 aa  217  2e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1936  MscS mechanosensitive ion channel  36.87 
 
 		 413 aa  211  2e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0910  MscS mechanosensitive ion channel  31.28 
 
 		 400 aa  210  3e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.505459  normal  0.0192096 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1059  MscS mechanosensitive ion channel  33.99 
 
 		 384 aa  203  4e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.196377 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3016  MscS mechanosensitive ion channel  41.63 
 
 		 426 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1791  small conductance mechanosensitive ion channel family protein  43.81 
 
 		 343 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01308  conserved inner membrane protein  44.25 
 
 		 343 aa  196  5.000000000000001e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0883  MscS mechanosensitive ion channel  33.14 
 
 		 380 aa  196  5.000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199191 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2315  MscS Mechanosensitive ion channel  44.25 
 
 		 343 aa  196  5.000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0901587  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2294  MscS mechanosensitive ion channel  44.25 
 
 		 343 aa  196  5.000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1447  small conductance mechanosensitive ion channel family protein  44.25 
 
 		 343 aa  196  5.000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1570  transporter, small conductance mechanosensitive ion channel family  44.25 
 
 		 343 aa  196  5.000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1543  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  44.25 
 
 		 343 aa  196  5.000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01318  hypothetical protein  44.25 
 
 		 343 aa  196  5.000000000000001e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.831445  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1978  transporter, small conductance mechanosensitive ion channel family  44.25 
 
 		 343 aa  196  5.000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.218747 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0195  MscS mechanosensitive ion channel  34.14 
 
 		 354 aa  196  7e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.0052728  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0935  MscS Mechanosensitive ion channel  33.04 
 
 		 433 aa  193  4e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.940167  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0938  MscS Mechanosensitive ion channel  33.04 
 
 		 433 aa  192  7e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.466834  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2117  mechanosensitive ion channel family protein  32.65 
 
 		 633 aa  192  9e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2066  MscS mechanosensitive ion channel  35.57 
 
 		 424 aa  191  2e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.838165  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001221  small-conductance mechanosensitive channel  36.49 
 
 		 367 aa  191  2e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0689  MscS mechanosensitive ion channel  34.76 
 
 		 351 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.13803  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0887  MscS mechanosensitive ion channel  32.43 
 
 		 431 aa  190  4e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0881194  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05088  hypothetical protein  39.35 
 
 		 399 aa  189  5.999999999999999e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1177  mechanosensitive ion channel  35.69 
 
 		 383 aa  189  5.999999999999999e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.180784  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1848  MscS family hypothetical protein  46.8 
 
 		 343 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.512359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0857  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  36.12 
 
 		 383 aa  187  2e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.017497  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1788  MscS family inner membrane protein YnaI  45.97 
 
 		 343 aa  187  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.150216 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1409  MscS mechanosensitive ion channel  34.76 
 
 		 351 aa  187  3e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1670  MscS family inner membrane protein YnaI  45.97 
 
 		 343 aa  187  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.107683 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1786  MscS family inner membrane protein YnaI  46.8 
 
 		 343 aa  187  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0416525  normal  0.388102 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1488  MscS family inner membrane protein YnaI  46.8 
 
 		 343 aa  186  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.445516  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2594  MscS mechanosensitive ion channel  30.79 
 
 		 388 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0922  MscS mechanosensitive ion channel  36.44 
 
 		 456 aa  184  1.0000000000000001e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.837868 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4003  MscS mechanosensitive ion channel  37.45 
 
 		 362 aa  184  2.0000000000000003e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0737574  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4048  MscS mechanosensitive ion channel  39.63 
 
 		 569 aa  182  6e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.138882  normal  0.12233 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1277  MscS mechanosensitive ion channel  43.78 
 
 		 352 aa  182  6e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1295  MscS mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 391 aa  182  7e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1504  conserved hypothetical integral membrane protein, mechanosensitive ion channel family  31.07 
 
 		 624 aa  180  2.9999999999999997e-44  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1737  mechanosensitive ion channel family protein  32.61 
 
 		 624 aa  180  2.9999999999999997e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.64597  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1267  MscS mechanosensitive ion channel  34.76 
 
 		 351 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0941  MscS mechanosensitive ion channel  31.87 
 
 		 467 aa  179  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.884334  normal  0.631146 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0013  mechanosensitive ion channel family protein  32.71 
 
 		 682 aa  179  8e-44  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4194  MscS mechanosensitive ion channel  37.29 
 
 		 562 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.674763 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0460  putative mechanosensitive ion channel  36.62 
 
 		 357 aa  174  1.9999999999999998e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0247  mechanosensitive ion channel family protein  32.58 
 
 		 378 aa  174  2.9999999999999996e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0253  mechanosensitive ion channel family protein  32.26 
 
 		 378 aa  172  1e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0042  MscS Mechanosensitive ion channel  28.46 
 
 		 375 aa  168  2e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.634821  normal  0.103785 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4873  MscS Mechanosensitive ion channel  33.76 
 
 		 567 aa  164  3e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2220  MscS Mechanosensitive ion channel  36.89 
 
 		 339 aa  162  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0289  mechanosensitive ion channel family protein  28.76 
 
 		 627 aa  154  2.9999999999999998e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.658149  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0263  mechanosensitive ion channel family protein  28.8 
 
 		 627 aa  154  2.9999999999999998e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0236  mechanosensitive ion channel family protein  28.31 
 
 		 627 aa  152  7e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1076  MscS mechanosensitive ion channel  32.73 
 
 		 378 aa  149  9e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.119695  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0691  MscS Mechanosensitive ion channel  29.56 
 
 		 362 aa  148  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2212  small mechanosensitive ion channel  31.33 
 
 		 357 aa  145  1e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.414294  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0172  MscS mechanosensitive ion channel  36.24 
 
 		 375 aa  144  3e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0430239  normal  0.753414 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0641  hypothetical protein  28.41 
 
 		 543 aa  141  1.9999999999999998e-32  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1943  MscS mechanosensitive ion channel  29.92 
 
 		 533 aa  140  3e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000658199  decreased coverage  0.00758396 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0905  MscS Mechanosensitive ion channel  29.03 
 
 		 373 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.285162  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27641  small mechanosensitive ion channel, MscS family protein  30.6 
 
 		 373 aa  139  7e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3200  MscS mechanosensitive ion channel  26.27 
 
 		 590 aa  139  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3612  MscS Mechanosensitive ion channel  29.25 
 
 		 374 aa  136  7.000000000000001e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.649067 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4689  MscS Mechanosensitive ion channel  29.25 
 
 		 374 aa  136  7.000000000000001e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1578  small-conductance mechanosensitive channel  29.91 
 
 		 534 aa  135  9e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00006998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1250  MscS mechanosensitive ion channel  30.67 
 
 		 361 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000414305  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00392  hypothetical protein  28.45 
 
 		 377 aa  133  5e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.65965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1822  MscS mechanosensitive ion channel  28.16 
 
 		 374 aa  133  6e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00396347  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3649  mechanosensitive ion channel family protein  28.29 
 
 		 374 aa  132  9e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.158368  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1500  MscS mechanosensitive ion channel  27.05 
 
 		 614 aa  132  9e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.638706  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0935  MscS Mechanosensitive ion channel  27.95 
 
 		 484 aa  132  1.0000000000000001e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2332  MscS Mechanosensitive ion channel  25.43 
 
 		 362 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0803  small mechanosensitive ion channel  27.14 
 
 		 342 aa  131  2.0000000000000002e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1900  MscS mechanosensitive ion channel  29.86 
 
 		 240 aa  130  3e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0998935  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07011  small mechanosensitive ion channel  32.73 
 
 		 343 aa  129  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.184839  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1452  MscS mechanosensitive ion channel  31.7 
 
 		 355 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.678727  normal  0.0144942 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2065  MscS mechanosensitive ion channel  28.21 
 
 		 359 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0700  hypothetical protein  33.06 
 
 		 365 aa  128  2.0000000000000002e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.744044 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1533  MscS Mechanosensitive ion channel  31.2 
 
 		 276 aa  126  6e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1942  MscS mechanosensitive ion channel  25.74 
 
 		 360 aa  125  9e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1633  hypothetical protein  27.88 
 
 		 364 aa  125  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246622  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1146  MscS mechanosensitive ion channel  29.47 
 
 		 366 aa  125  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.779955  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00921  small conductance mechanosensitive ion channel  32.24 
 
 		 322 aa  125  1e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.230623  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1888  MscS Mechanosensitive ion channel  26.76 
 
 		 362 aa  124  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1352  MscS mechanosensitive ion channel  30.7 
 
 		 376 aa  124  3e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.308859  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20120  Mechanosensitive ion channel family protein  31.78 
 
 		 418 aa  124  3e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4932  MscS Mechanosensitive ion channel  24.65 
 
 		 400 aa  123  4e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3357  MscS Mechanosensitive ion channel  30.8 
 
 		 376 aa  122  8e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4007  MscS mechanosensitive ion channel  30.8 
 
 		 376 aa  122  9e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0987654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2842  MscS mechanosensitive ion channel  27.84 
 
 		 369 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4427  MscS Mechanosensitive ion channel  26.59 
 
 		 349 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0238849  normal  0.125106 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1366  MscS Mechanosensitive ion channel  24.11 
 
 		 377 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0389612  hitchhiker  0.000813003 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0592  small conductance mechanosensitive ion channel  32.87 
 
 		 305 aa  120  3e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.311151  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>