More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0013 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0013  mechanosensitive ion channel family protein  100 
 
 		 682 aa  1354    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1737  mechanosensitive ion channel family protein  52.11 
 
 		 624 aa  584  1.0000000000000001e-165  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.64597  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2117  mechanosensitive ion channel family protein  49.24 
 
 		 633 aa  561  1e-158  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1504  conserved hypothetical integral membrane protein, mechanosensitive ion channel family  42.93 
 
 		 624 aa  470  1.0000000000000001e-131  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0289  mechanosensitive ion channel family protein  42.64 
 
 		 627 aa  457  1e-127  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.658149  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0236  mechanosensitive ion channel family protein  42.98 
 
 		 627 aa  456  1e-127  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0263  mechanosensitive ion channel family protein  42.81 
 
 		 627 aa  457  1e-127  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3246  MscS mechanosensitive ion channel  32.72 
 
 		 381 aa  183  1e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00298811  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1752  MscS Mechanosensitive ion channel  31.31 
 
 		 356 aa  179  2e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2451  small-conductance mechanosensitive channel  32.42 
 
 		 380 aa  178  3e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1791  small-conductance mechanosensitive channel  36.48 
 
 		 369 aa  166  2.0000000000000002e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0722785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1791  small conductance mechanosensitive ion channel family protein  37.55 
 
 		 343 aa  163  8.000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01308  conserved inner membrane protein  38.31 
 
 		 343 aa  162  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1447  small conductance mechanosensitive ion channel family protein  38.31 
 
 		 343 aa  162  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2315  MscS Mechanosensitive ion channel  38.31 
 
 		 343 aa  162  2e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0901587  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1978  transporter, small conductance mechanosensitive ion channel family  38.31 
 
 		 343 aa  162  2e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.218747 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2294  MscS mechanosensitive ion channel  38.31 
 
 		 343 aa  162  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1570  transporter, small conductance mechanosensitive ion channel family  38.31 
 
 		 343 aa  162  2e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1543  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  38.31 
 
 		 343 aa  162  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01318  hypothetical protein  38.31 
 
 		 343 aa  162  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.831445  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1848  MscS family hypothetical protein  37.5 
 
 		 343 aa  158  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.512359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1670  MscS family inner membrane protein YnaI  37.5 
 
 		 343 aa  158  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.107683 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1788  MscS family inner membrane protein YnaI  37.5 
 
 		 343 aa  158  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.150216 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1786  MscS family inner membrane protein YnaI  37.5 
 
 		 343 aa  158  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0416525  normal  0.388102 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1488  MscS family inner membrane protein YnaI  37.1 
 
 		 343 aa  157  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.445516  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1295  MscS mechanosensitive ion channel  32.57 
 
 		 391 aa  155  2e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2594  MscS mechanosensitive ion channel  32.27 
 
 		 388 aa  153  8.999999999999999e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1936  MscS mechanosensitive ion channel  30.58 
 
 		 413 aa  152  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0883  MscS mechanosensitive ion channel  34.12 
 
 		 380 aa  150  8e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199191 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1059  MscS mechanosensitive ion channel  30.12 
 
 		 384 aa  149  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.196377 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0910  MscS mechanosensitive ion channel  27.13 
 
 		 400 aa  148  3e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.505459  normal  0.0192096 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4500  MscS Mechanosensitive ion channel  25.1 
 
 		 662 aa  147  7.0000000000000006e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1462  small-conductance mechanosensitive channel protein  30.82 
 
 		 373 aa  146  1e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4873  MscS Mechanosensitive ion channel  25.13 
 
 		 567 aa  145  3e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0857  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  30.06 
 
 		 383 aa  141  4.999999999999999e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.017497  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1277  MscS mechanosensitive ion channel  34.06 
 
 		 352 aa  141  4.999999999999999e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1177  mechanosensitive ion channel  32.13 
 
 		 383 aa  140  1e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.180784  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0938  MscS Mechanosensitive ion channel  30.45 
 
 		 433 aa  139  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.466834  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0887  MscS mechanosensitive ion channel  30.45 
 
 		 431 aa  138  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0881194  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0935  MscS Mechanosensitive ion channel  30.04 
 
 		 433 aa  138  4e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.940167  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4048  MscS mechanosensitive ion channel  26.3 
 
 		 569 aa  137  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.138882  normal  0.12233 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0689  MscS mechanosensitive ion channel  33.45 
 
 		 351 aa  137  9e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.13803  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1409  MscS mechanosensitive ion channel  33.81 
 
 		 351 aa  136  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0460  putative mechanosensitive ion channel  35.89 
 
 		 357 aa  135  3e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05088  hypothetical protein  29.52 
 
 		 399 aa  135  3.9999999999999996e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1154  hypothetical protein  29.28 
 
 		 363 aa  133  9e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0298455  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0941  MscS mechanosensitive ion channel  28.93 
 
 		 467 aa  132  3e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.884334  normal  0.631146 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0247  mechanosensitive ion channel family protein  35.35 
 
 		 378 aa  130  6e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0253  mechanosensitive ion channel family protein  36.11 
 
 		 378 aa  130  8.000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4194  MscS mechanosensitive ion channel  24.94 
 
 		 562 aa  130  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.674763 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001221  small-conductance mechanosensitive channel  28.53 
 
 		 367 aa  129  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1267  MscS mechanosensitive ion channel  33.81 
 
 		 351 aa  125  2e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1822  MscS mechanosensitive ion channel  28.85 
 
 		 374 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00396347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4003  MscS mechanosensitive ion channel  32.66 
 
 		 362 aa  122  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0737574  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2220  MscS Mechanosensitive ion channel  32.45 
 
 		 339 aa  120  7e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1650  MscS mechanosensitive ion channel  23.33 
 
 		 570 aa  120  7e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.598293 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1500  MscS mechanosensitive ion channel  29.39 
 
 		 614 aa  118  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.638706  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1943  MscS mechanosensitive ion channel  30.6 
 
 		 533 aa  118  3e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000658199  decreased coverage  0.00758396 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0195  MscS mechanosensitive ion channel  28.75 
 
 		 354 aa  117  5e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.0052728  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3649  mechanosensitive ion channel family protein  28.02 
 
 		 374 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.158368  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0042  MscS Mechanosensitive ion channel  27.72 
 
 		 375 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.634821  normal  0.103785 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3200  MscS mechanosensitive ion channel  25.07 
 
 		 590 aa  115  4.0000000000000004e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3016  MscS mechanosensitive ion channel  27.78 
 
 		 426 aa  113  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0691  MscS Mechanosensitive ion channel  29.18 
 
 		 362 aa  112  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27641  small mechanosensitive ion channel, MscS family protein  27.33 
 
 		 373 aa  112  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1578  small-conductance mechanosensitive channel  29.55 
 
 		 534 aa  110  8.000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00006998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0360  MscS mechanosensitive ion channel  26.69 
 
 		 393 aa  110  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1352  MscS mechanosensitive ion channel  26.79 
 
 		 376 aa  108  4e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.308859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0803  small mechanosensitive ion channel  26.35 
 
 		 342 aa  108  5e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0641  hypothetical protein  25.9 
 
 		 543 aa  107  6e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0942  MscS Mechanosensitive ion channel  31.22 
 
 		 377 aa  107  6e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000347454  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0172  MscS mechanosensitive ion channel  29.96 
 
 		 375 aa  107  6e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0430239  normal  0.753414 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0707  MscS Mechanosensitive ion channel  31.75 
 
 		 344 aa  107  7e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000854556  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2066  MscS mechanosensitive ion channel  26.35 
 
 		 424 aa  106  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.838165  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0905  MscS Mechanosensitive ion channel  26.18 
 
 		 373 aa  105  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.285162  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1900  MscS mechanosensitive ion channel  38.1 
 
 		 240 aa  105  4e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0998935  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2171  MscS mechanosensitive ion channel  27.67 
 
 		 374 aa  104  5e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.920192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0935  MscS Mechanosensitive ion channel  26.52 
 
 		 484 aa  104  5e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3397  MscS mechanosensitive ion channel  28.45 
 
 		 291 aa  104  6e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03062  hypothetical protein  27.87 
 
 		 563 aa  104  6e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2398  MscS mechanosensitive ion channel  28.57 
 
 		 374 aa  104  7e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1446  MscS mechanosensitive ion channel  25.29 
 
 		 648 aa  103  1e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.770596  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3360  hypothetical protein  27.65 
 
 		 374 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2212  small mechanosensitive ion channel  29.81 
 
 		 357 aa  102  2e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.414294  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4932  MscS Mechanosensitive ion channel  25.93 
 
 		 400 aa  102  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00392  hypothetical protein  26 
 
 		 377 aa  102  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.65965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1366  MscS Mechanosensitive ion channel  24.93 
 
 		 377 aa  102  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0389612  hitchhiker  0.000813003 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0970  small-conductance mechanosensitive ion channel  24.63 
 
 		 650 aa  102  3e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00371389 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1920  MscS Mechanosensitive ion channel  24.93 
 
 		 377 aa  102  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000103017  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1452  MscS mechanosensitive ion channel  26.77 
 
 		 355 aa  102  3e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.678727  normal  0.0144942 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1381  MscS Mechanosensitive ion channel  24.93 
 
 		 377 aa  102  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.524748 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1350  MscS Mechanosensitive ion channel  24.66 
 
 		 377 aa  101  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000205244  normal  0.510591 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0209  MscS mechanosensitive ion channel  25.93 
 
 		 685 aa  101  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0673077 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0207  MscS Mechanosensitive ion channel  32.79 
 
 		 283 aa  101  4e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4689  MscS Mechanosensitive ion channel  25.2 
 
 		 374 aa  101  5e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3612  MscS Mechanosensitive ion channel  25.2 
 
 		 374 aa  101  5e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.649067 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0032  hypothetical protein  26.6 
 
 		 287 aa  100  6e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.20954  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1076  MscS mechanosensitive ion channel  27.46 
 
 		 378 aa  100  6e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.119695  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2101  MscS Mechanosensitive ion channel  28.74 
 
 		 377 aa  100  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000188968 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002898  small-conductance mechanosensitive channel  28.22 
 
 		 532 aa  100  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.341732  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>