More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_2117 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_2117  mechanosensitive ion channel family protein  100 
 
 		 633 aa  1258    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1737  mechanosensitive ion channel family protein  48.73 
 
 		 624 aa  581  1e-164  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.64597  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0013  mechanosensitive ion channel family protein  48.75 
 
 		 682 aa  535  1e-150  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1504  conserved hypothetical integral membrane protein, mechanosensitive ion channel family  41.6 
 
 		 624 aa  467  9.999999999999999e-131  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0236  mechanosensitive ion channel family protein  41.49 
 
 		 627 aa  448  1.0000000000000001e-124  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0289  mechanosensitive ion channel family protein  40.95 
 
 		 627 aa  447  1.0000000000000001e-124  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.658149  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0263  mechanosensitive ion channel family protein  41.18 
 
 		 627 aa  448  1.0000000000000001e-124  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3246  MscS mechanosensitive ion channel  32.65 
 
 		 381 aa  192  2e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00298811  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2451  small-conductance mechanosensitive channel  33.33 
 
 		 380 aa  180  5.999999999999999e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1791  small conductance mechanosensitive ion channel family protein  38.46 
 
 		 343 aa  169  1e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01308  conserved inner membrane protein  38.1 
 
 		 343 aa  169  2e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2315  MscS Mechanosensitive ion channel  38.1 
 
 		 343 aa  169  2e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0901587  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01318  hypothetical protein  38.1 
 
 		 343 aa  169  2e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.831445  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1978  transporter, small conductance mechanosensitive ion channel family  38.1 
 
 		 343 aa  169  2e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.218747 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2294  MscS mechanosensitive ion channel  38.1 
 
 		 343 aa  169  2e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1570  transporter, small conductance mechanosensitive ion channel family  38.1 
 
 		 343 aa  169  2e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1543  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  38.1 
 
 		 343 aa  169  2e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1447  small conductance mechanosensitive ion channel family protein  38.1 
 
 		 343 aa  169  2e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1848  MscS family hypothetical protein  38.37 
 
 		 343 aa  164  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.512359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1786  MscS family inner membrane protein YnaI  38.37 
 
 		 343 aa  163  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0416525  normal  0.388102 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1788  MscS family inner membrane protein YnaI  37.98 
 
 		 343 aa  162  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.150216 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1670  MscS family inner membrane protein YnaI  37.98 
 
 		 343 aa  162  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.107683 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1488  MscS family inner membrane protein YnaI  37.6 
 
 		 343 aa  161  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.445516  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1752  MscS Mechanosensitive ion channel  36.95 
 
 		 356 aa  158  2e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1936  MscS mechanosensitive ion channel  31.34 
 
 		 413 aa  158  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2594  MscS mechanosensitive ion channel  32.37 
 
 		 388 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4048  MscS mechanosensitive ion channel  26.89 
 
 		 569 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.138882  normal  0.12233 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1295  MscS mechanosensitive ion channel  35.42 
 
 		 391 aa  146  1e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1791  small-conductance mechanosensitive channel  34.68 
 
 		 369 aa  144  6e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0722785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4873  MscS Mechanosensitive ion channel  25.94 
 
 		 567 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1462  small-conductance mechanosensitive channel protein  32.87 
 
 		 373 aa  140  6e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1059  MscS mechanosensitive ion channel  30.46 
 
 		 384 aa  139  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.196377 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05088  hypothetical protein  31.7 
 
 		 399 aa  137  6.0000000000000005e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0910  MscS mechanosensitive ion channel  28.37 
 
 		 400 aa  134  3.9999999999999996e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.505459  normal  0.0192096 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1154  hypothetical protein  30.13 
 
 		 363 aa  131  3e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0298455  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0460  putative mechanosensitive ion channel  31.27 
 
 		 357 aa  130  5.0000000000000004e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0883  MscS mechanosensitive ion channel  35 
 
 		 380 aa  130  6e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199191 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0942  MscS Mechanosensitive ion channel  27.51 
 
 		 377 aa  128  4.0000000000000003e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000347454  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001221  small-conductance mechanosensitive channel  30.19 
 
 		 367 aa  128  4.0000000000000003e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0887  MscS mechanosensitive ion channel  28.79 
 
 		 431 aa  128  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0881194  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0938  MscS Mechanosensitive ion channel  27.82 
 
 		 433 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.466834  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1177  mechanosensitive ion channel  28.8 
 
 		 383 aa  127  6e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.180784  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0935  MscS Mechanosensitive ion channel  27.44 
 
 		 433 aa  127  9e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.940167  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0857  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  28.53 
 
 		 383 aa  125  2e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.017497  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0941  MscS mechanosensitive ion channel  26.36 
 
 		 467 aa  124  4e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.884334  normal  0.631146 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4194  MscS mechanosensitive ion channel  29.93 
 
 		 562 aa  124  7e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.674763 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4500  MscS Mechanosensitive ion channel  26.75 
 
 		 662 aa  123  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1500  MscS mechanosensitive ion channel  27.18 
 
 		 614 aa  122  3e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.638706  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0689  MscS mechanosensitive ion channel  33.13 
 
 		 351 aa  120  6e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.13803  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1409  MscS mechanosensitive ion channel  35.77 
 
 		 351 aa  120  9e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1277  MscS mechanosensitive ion channel  33.06 
 
 		 352 aa  118  3e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3016  MscS mechanosensitive ion channel  31.56 
 
 		 426 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2332  MscS Mechanosensitive ion channel  29.41 
 
 		 362 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1650  MscS mechanosensitive ion channel  23.3 
 
 		 570 aa  114  5e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.598293 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1888  MscS Mechanosensitive ion channel  27.74 
 
 		 362 aa  113  8.000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0247  mechanosensitive ion channel family protein  31.65 
 
 		 378 aa  111  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0253  mechanosensitive ion channel family protein  31.65 
 
 		 378 aa  111  5e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2220  MscS Mechanosensitive ion channel  31.68 
 
 		 339 aa  110  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1452  MscS mechanosensitive ion channel  29.08 
 
 		 355 aa  109  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.678727  normal  0.0144942 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4003  MscS mechanosensitive ion channel  30.56 
 
 		 362 aa  109  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0737574  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0691  MscS Mechanosensitive ion channel  26.84 
 
 		 362 aa  108  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1267  MscS mechanosensitive ion channel  34.62 
 
 		 351 aa  108  4e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1900  MscS mechanosensitive ion channel  31.3 
 
 		 240 aa  108  4e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0998935  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27641  small mechanosensitive ion channel, MscS family protein  28 
 
 		 373 aa  107  7e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03062  hypothetical protein  25.81 
 
 		 563 aa  106  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3200  MscS mechanosensitive ion channel  31.03 
 
 		 590 aa  105  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2212  small mechanosensitive ion channel  28.85 
 
 		 357 aa  105  3e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.414294  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1446  MscS mechanosensitive ion channel  33.67 
 
 		 648 aa  105  3e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.770596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0922  MscS mechanosensitive ion channel  28.46 
 
 		 456 aa  105  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.837868 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4689  MscS Mechanosensitive ion channel  26.25 
 
 		 374 aa  105  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_003296  RS00392  hypothetical protein  27.03 
 
 		 377 aa  104  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.65965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0970  small-conductance mechanosensitive ion channel  33.17 
 
 		 650 aa  105  4e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00371389 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1920  MscS Mechanosensitive ion channel  29.07 
 
 		 377 aa  104  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000103017  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3612  MscS Mechanosensitive ion channel  26.25 
 
 		 374 aa  105  4e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.649067 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2065  MscS mechanosensitive ion channel  29.55 
 
 		 359 aa  104  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1381  MscS Mechanosensitive ion channel  29.07 
 
 		 377 aa  104  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.524748 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1366  MscS Mechanosensitive ion channel  29.07 
 
 		 377 aa  104  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0389612  hitchhiker  0.000813003 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1350  MscS Mechanosensitive ion channel  29.07 
 
 		 377 aa  104  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000205244  normal  0.510591 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0195  MscS mechanosensitive ion channel  28.1 
 
 		 354 aa  104  5e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.0052728  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0641  hypothetical protein  34.64 
 
 		 543 aa  104  5e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0172  MscS mechanosensitive ion channel  30.21 
 
 		 375 aa  104  5e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0430239  normal  0.753414 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0707  MscS Mechanosensitive ion channel  31.51 
 
 		 344 aa  103  6e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000854556  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2101  MscS Mechanosensitive ion channel  25.34 
 
 		 299 aa  103  8e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172333  normal  0.177745 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002898  small-conductance mechanosensitive channel  26.22 
 
 		 532 aa  103  8e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.341732  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1770  MscS mechanosensitive ion channel  28.91 
 
 		 406 aa  103  9e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2101  MscS Mechanosensitive ion channel  28.78 
 
 		 377 aa  103  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000188968 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1076  MscS mechanosensitive ion channel  28.63 
 
 		 378 aa  103  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.119695  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1350  hypothetical protein  27.62 
 
 		 292 aa  103  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.136839  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0042  MscS Mechanosensitive ion channel  27.97 
 
 		 375 aa  102  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.634821  normal  0.103785 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1943  MscS mechanosensitive ion channel  30.71 
 
 		 533 aa  101  4e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000658199  decreased coverage  0.00758396 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3521  MscS mechanosensitive ion channel  29.05 
 
 		 547 aa  100  5e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0592  small conductance mechanosensitive ion channel  28.74 
 
 		 305 aa  100  7e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.311151  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0547  MscS mechanosensitive ion channel  28.74 
 
 		 305 aa  100  9e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.881892  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1822  MscS mechanosensitive ion channel  30.52 
 
 		 374 aa  100  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00396347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0700  hypothetical protein  27.8 
 
 		 365 aa  99.8  1e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.744044 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3649  mechanosensitive ion channel family protein  29.85 
 
 		 374 aa  99.4  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.158368  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3719  MscS mechanosensitive ion channel  27.84 
 
 		 538 aa  99  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00173633  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2171  MscS mechanosensitive ion channel  30.17 
 
 		 374 aa  99  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.920192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0514  MscS Mechanosensitive ion channel  25.09 
 
 		 288 aa  98.6  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2066  MscS mechanosensitive ion channel  27.38 
 
 		 424 aa  97.8  5e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.838165  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>