More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1295 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1295  MscS mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 391 aa  794    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1936  MscS mechanosensitive ion channel  43.62 
 
 		 413 aa  326  5e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1791  small-conductance mechanosensitive channel  45.66 
 
 		 369 aa  317  3e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0722785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1059  MscS mechanosensitive ion channel  42.38 
 
 		 384 aa  310  2e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.196377 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1462  small-conductance mechanosensitive channel protein  41.44 
 
 		 373 aa  305  8.000000000000001e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0460  putative mechanosensitive ion channel  46.63 
 
 		 357 aa  288  1e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1177  mechanosensitive ion channel  39.76 
 
 		 383 aa  281  1e-74  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.180784  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2066  MscS mechanosensitive ion channel  42.15 
 
 		 424 aa  280  2e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.838165  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0857  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  38.37 
 
 		 383 aa  277  2e-73  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.017497  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05088  hypothetical protein  42.54 
 
 		 399 aa  276  4e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001221  small-conductance mechanosensitive channel  44.26 
 
 		 367 aa  276  6e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1791  small conductance mechanosensitive ion channel family protein  49.12 
 
 		 343 aa  258  1e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01308  conserved inner membrane protein  49.12 
 
 		 343 aa  257  3e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2315  MscS Mechanosensitive ion channel  49.12 
 
 		 343 aa  257  3e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0901587  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1978  transporter, small conductance mechanosensitive ion channel family  49.12 
 
 		 343 aa  257  3e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.218747 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1447  small conductance mechanosensitive ion channel family protein  49.12 
 
 		 343 aa  257  3e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1570  transporter, small conductance mechanosensitive ion channel family  49.12 
 
 		 343 aa  257  3e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2294  MscS mechanosensitive ion channel  49.12 
 
 		 343 aa  257  3e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1543  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  49.12 
 
 		 343 aa  257  3e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01318  hypothetical protein  49.12 
 
 		 343 aa  257  3e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.831445  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1670  MscS family inner membrane protein YnaI  49.78 
 
 		 343 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.107683 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1788  MscS family inner membrane protein YnaI  49.78 
 
 		 343 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.150216 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1488  MscS family inner membrane protein YnaI  49.34 
 
 		 343 aa  253  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.445516  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1848  MscS family hypothetical protein  49.34 
 
 		 343 aa  253  5.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.512359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1786  MscS family inner membrane protein YnaI  49.34 
 
 		 343 aa  252  8.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0416525  normal  0.388102 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1076  MscS mechanosensitive ion channel  35.18 
 
 		 378 aa  206  8e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.119695  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0700  hypothetical protein  30.08 
 
 		 365 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.744044 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2220  MscS Mechanosensitive ion channel  40.59 
 
 		 339 aa  192  7e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27641  small mechanosensitive ion channel, MscS family protein  33.14 
 
 		 373 aa  192  1e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2451  small-conductance mechanosensitive channel  30.95 
 
 		 380 aa  186  5e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3246  MscS mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 381 aa  182  7e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00298811  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2212  small mechanosensitive ion channel  34.13 
 
 		 357 aa  178  1e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.414294  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1154  hypothetical protein  34.04 
 
 		 363 aa  169  8e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0298455  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04171  small mechanosensitive ion channel, MscS family protein  33.72 
 
 		 370 aa  167  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.610357 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0910  MscS mechanosensitive ion channel  29.92 
 
 		 400 aa  160  4e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.505459  normal  0.0192096 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0883  MscS mechanosensitive ion channel  30.75 
 
 		 380 aa  155  1e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199191 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0013  mechanosensitive ion channel family protein  32.89 
 
 		 682 aa  155  1e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1737  mechanosensitive ion channel family protein  36.95 
 
 		 624 aa  150  3e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.64597  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2117  mechanosensitive ion channel family protein  35.42 
 
 		 633 aa  147  4.0000000000000006e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1752  MscS Mechanosensitive ion channel  34.01 
 
 		 356 aa  145  1e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2594  MscS mechanosensitive ion channel  34.86 
 
 		 388 aa  143  6e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4003  MscS mechanosensitive ion channel  31.23 
 
 		 362 aa  140  3e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0737574  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0942  MscS Mechanosensitive ion channel  38.92 
 
 		 377 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000347454  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4500  MscS Mechanosensitive ion channel  27.49 
 
 		 662 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1504  conserved hypothetical integral membrane protein, mechanosensitive ion channel family  32.11 
 
 		 624 aa  131  2.0000000000000002e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0938  MscS Mechanosensitive ion channel  34.1 
 
 		 433 aa  120  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.466834  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0935  MscS Mechanosensitive ion channel  34.1 
 
 		 433 aa  119  7e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.940167  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0887  MscS mechanosensitive ion channel  33.93 
 
 		 431 aa  119  7e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0881194  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0847  mechanosensitive ion channel family protein  28.06 
 
 		 337 aa  119  9e-26  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0334937  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4048  MscS mechanosensitive ion channel  27.05 
 
 		 569 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.138882  normal  0.12233 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0236  mechanosensitive ion channel family protein  25.77 
 
 		 627 aa  116  7.999999999999999e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0195  MscS mechanosensitive ion channel  27.94 
 
 		 354 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.0052728  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1500  MscS mechanosensitive ion channel  32.66 
 
 		 614 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.638706  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3016  MscS mechanosensitive ion channel  29.41 
 
 		 426 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0941  MscS mechanosensitive ion channel  30.23 
 
 		 467 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.884334  normal  0.631146 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0289  mechanosensitive ion channel family protein  26.41 
 
 		 627 aa  114  4.0000000000000004e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.658149  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4873  MscS Mechanosensitive ion channel  28.47 
 
 		 567 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1943  MscS mechanosensitive ion channel  32.2 
 
 		 533 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000658199  decreased coverage  0.00758396 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0263  mechanosensitive ion channel family protein  26.42 
 
 		 627 aa  112  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0905  MscS Mechanosensitive ion channel  28.62 
 
 		 373 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.285162  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4194  MscS mechanosensitive ion channel  32.66 
 
 		 562 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.674763 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0247  mechanosensitive ion channel family protein  33.69 
 
 		 378 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0253  mechanosensitive ion channel family protein  33.69 
 
 		 378 aa  110  3e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1409  MscS mechanosensitive ion channel  32.47 
 
 		 351 aa  110  6e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0689  MscS mechanosensitive ion channel  31.6 
 
 		 351 aa  108  2e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.13803  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0514  MscS Mechanosensitive ion channel  32.61 
 
 		 288 aa  107  3e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0547  MscS mechanosensitive ion channel  32.21 
 
 		 305 aa  107  4e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.881892  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3671  MscS mechanosensitive ion channel  29.77 
 
 		 277 aa  107  4e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0592  small conductance mechanosensitive ion channel  31.3 
 
 		 305 aa  105  1e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.311151  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20120  Mechanosensitive ion channel family protein  26.69 
 
 		 418 aa  105  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1277  MscS mechanosensitive ion channel  29.03 
 
 		 352 aa  105  1e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1578  small-conductance mechanosensitive channel  25.36 
 
 		 534 aa  104  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00006998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0042  MscS Mechanosensitive ion channel  27.61 
 
 		 375 aa  103  5e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.634821  normal  0.103785 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1900  MscS mechanosensitive ion channel  29.44 
 
 		 240 aa  103  5e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0998935  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1381  MscS Mechanosensitive ion channel  25.75 
 
 		 377 aa  103  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.524748 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1366  MscS Mechanosensitive ion channel  25.75 
 
 		 377 aa  103  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0389612  hitchhiker  0.000813003 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1920  MscS Mechanosensitive ion channel  25.75 
 
 		 377 aa  103  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000103017  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1350  MscS Mechanosensitive ion channel  25.75 
 
 		 377 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000205244  normal  0.510591 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0691  MscS Mechanosensitive ion channel  28.4 
 
 		 362 aa  102  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2101  MscS Mechanosensitive ion channel  25.75 
 
 		 377 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000188968 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3200  MscS mechanosensitive ion channel  31.39 
 
 		 590 aa  102  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1650  MscS mechanosensitive ion channel  25.56 
 
 		 570 aa  100  5e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.598293 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_30945  MscS family transporter: small-conductance mechanosensitive ion channel  36.26 
 
 		 473 aa  100  5e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.111123  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0172  MscS mechanosensitive ion channel  29.63 
 
 		 375 aa  99.8  8e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0430239  normal  0.753414 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0757  MscS mechanosensitive ion channel  26.34 
 
 		 479 aa  98.2  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0707  MscS Mechanosensitive ion channel  29.91 
 
 		 344 aa  97.1  5e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000854556  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1267  MscS mechanosensitive ion channel  31.17 
 
 		 351 aa  96.7  6e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0476  MscS mechanosensitive ion channel  28.69 
 
 		 279 aa  96.7  6e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.139506  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00921  small conductance mechanosensitive ion channel  32.84 
 
 		 322 aa  95.9  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.230623  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3521  MscS mechanosensitive ion channel  28.91 
 
 		 547 aa  95.9  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4819  MscS mechanosensitive ion channel  28.79 
 
 		 392 aa  95.1  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.749552  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3649  mechanosensitive ion channel family protein  28.05 
 
 		 374 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.158368  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1533  MscS Mechanosensitive ion channel  29.96 
 
 		 276 aa  95.5  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0970  small-conductance mechanosensitive ion channel  25.48 
 
 		 650 aa  95.5  2e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00371389 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0641  hypothetical protein  30.54 
 
 		 543 aa  95.1  2e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1411  MscS Mechanosensitive ion channel  29.92 
 
 		 373 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3803  MscS mechanosensitive ion channel  27.23 
 
 		 549 aa  94.4  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.717222  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3747  MscS Mechanosensitive ion channel  27.23 
 
 		 549 aa  94.4  3e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0047  MscS mechanosensitive ion channel  29.26 
 
 		 270 aa  94.7  3e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2152  MscS mechanosensitive ion channel  28.43 
 
 		 377 aa  94.4  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>