More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3200 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3200  MscS mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 590 aa  1192    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4194  MscS mechanosensitive ion channel  40.73 
 
 		 562 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.674763 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4048  MscS mechanosensitive ion channel  41.67 
 
 		 569 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.138882  normal  0.12233 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4873  MscS Mechanosensitive ion channel  39.6 
 
 		 567 aa  388  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1650  MscS mechanosensitive ion channel  31.42 
 
 		 570 aa  253  7e-66  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.598293 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1446  MscS mechanosensitive ion channel  32.2 
 
 		 648 aa  240  5e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.770596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0970  small-conductance mechanosensitive ion channel  31.52 
 
 		 650 aa  238  3e-61  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00371389 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0887  MscS mechanosensitive ion channel  34.31 
 
 		 431 aa  199  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0881194  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0941  MscS mechanosensitive ion channel  32.36 
 
 		 467 aa  195  2e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.884334  normal  0.631146 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0935  MscS Mechanosensitive ion channel  33.24 
 
 		 433 aa  189  9e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.940167  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0938  MscS Mechanosensitive ion channel  33.24 
 
 		 433 aa  189  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.466834  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1500  MscS mechanosensitive ion channel  42.86 
 
 		 614 aa  184  4.0000000000000006e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.638706  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1578  small-conductance mechanosensitive channel  25.34 
 
 		 534 aa  179  2e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00006998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1943  MscS mechanosensitive ion channel  25.1 
 
 		 533 aa  171  3e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000658199  decreased coverage  0.00758396 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2145  MscS mechanosensitive ion channel  27.62 
 
 		 537 aa  162  2e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000018711  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0969  mechanosensitive ion channel family protein  26.04 
 
 		 554 aa  158  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2451  small-conductance mechanosensitive channel  34.06 
 
 		 380 aa  151  4e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3246  MscS mechanosensitive ion channel  26 
 
 		 381 aa  146  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00298811  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1900  MscS mechanosensitive ion channel  32.74 
 
 		 240 aa  139  2e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0998935  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0042  MscS Mechanosensitive ion channel  28.3 
 
 		 375 aa  137  4e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.634821  normal  0.103785 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1752  MscS Mechanosensitive ion channel  32.56 
 
 		 356 aa  136  9.999999999999999e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0641  hypothetical protein  24.46 
 
 		 543 aa  133  1.0000000000000001e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0942  MscS Mechanosensitive ion channel  30.09 
 
 		 377 aa  124  6e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000347454  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4003  MscS mechanosensitive ion channel  30.04 
 
 		 362 aa  120  4.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0737574  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1059  MscS mechanosensitive ion channel  26.15 
 
 		 384 aa  120  9e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.196377 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1504  conserved hypothetical integral membrane protein, mechanosensitive ion channel family  22.82 
 
 		 624 aa  119  9.999999999999999e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3016  MscS mechanosensitive ion channel  28.57 
 
 		 426 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4500  MscS Mechanosensitive ion channel  24.25 
 
 		 662 aa  116  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0013  mechanosensitive ion channel family protein  25.94 
 
 		 682 aa  116  1.0000000000000001e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1936  MscS mechanosensitive ion channel  27.35 
 
 		 413 aa  115  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0910  MscS mechanosensitive ion channel  26.74 
 
 		 400 aa  115  2.0000000000000002e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.505459  normal  0.0192096 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2117  mechanosensitive ion channel family protein  28.47 
 
 		 633 aa  114  7.000000000000001e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1462  small-conductance mechanosensitive channel protein  27.41 
 
 		 373 aa  111  4.0000000000000004e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1295  MscS mechanosensitive ion channel  28.07 
 
 		 391 aa  108  2e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0172  MscS mechanosensitive ion channel  30.6 
 
 		 375 aa  107  7e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0430239  normal  0.753414 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0236  mechanosensitive ion channel family protein  25.89 
 
 		 627 aa  106  1e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0195  MscS mechanosensitive ion channel  27.36 
 
 		 354 aa  106  1e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.0052728  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0707  MscS Mechanosensitive ion channel  27.98 
 
 		 344 aa  105  2e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000854556  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1791  small-conductance mechanosensitive channel  26.3 
 
 		 369 aa  105  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0722785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1277  MscS mechanosensitive ion channel  26.6 
 
 		 352 aa  104  4e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0883  MscS mechanosensitive ion channel  28.76 
 
 		 380 aa  104  5e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199191 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01088  hypothetical protein  38.73 
 
 		 166 aa  104  5e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2594  MscS mechanosensitive ion channel  28.57 
 
 		 388 aa  103  9e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0803  small mechanosensitive ion channel  32.65 
 
 		 342 aa  102  2e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1791  small conductance mechanosensitive ion channel family protein  26.71 
 
 		 343 aa  102  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0289  mechanosensitive ion channel family protein  26.01 
 
 		 627 aa  101  4e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.658149  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1177  mechanosensitive ion channel  25.43 
 
 		 383 aa  101  4e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.180784  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0263  mechanosensitive ion channel family protein  25.06 
 
 		 627 aa  100  7e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01308  conserved inner membrane protein  26.71 
 
 		 343 aa  100  8e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1978  transporter, small conductance mechanosensitive ion channel family  26.71 
 
 		 343 aa  100  8e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.218747 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2315  MscS Mechanosensitive ion channel  26.71 
 
 		 343 aa  100  8e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0901587  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2294  MscS mechanosensitive ion channel  26.71 
 
 		 343 aa  100  8e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1543  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  26.71 
 
 		 343 aa  100  8e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1447  small conductance mechanosensitive ion channel family protein  26.71 
 
 		 343 aa  100  8e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1570  transporter, small conductance mechanosensitive ion channel family  26.71 
 
 		 343 aa  100  8e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0247  mechanosensitive ion channel family protein  28.42 
 
 		 378 aa  100  8e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01318  hypothetical protein  26.71 
 
 		 343 aa  100  8e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.831445  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0857  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  24.93 
 
 		 383 aa  100  1e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.017497  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3649  mechanosensitive ion channel family protein  24.45 
 
 		 374 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.158368  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0253  mechanosensitive ion channel family protein  28.42 
 
 		 378 aa  100  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4007  MscS mechanosensitive ion channel  30.04 
 
 		 376 aa  99.4  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0987654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0922  MscS mechanosensitive ion channel  27.62 
 
 		 456 aa  99.4  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.837868 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0460  putative mechanosensitive ion channel  25.71 
 
 		 357 aa  99.4  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4819  MscS mechanosensitive ion channel  30.77 
 
 		 392 aa  99  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.749552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1352  MscS mechanosensitive ion channel  24.65 
 
 		 376 aa  99  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.308859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3357  MscS Mechanosensitive ion channel  30.04 
 
 		 376 aa  99  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0689  MscS mechanosensitive ion channel  23.79 
 
 		 351 aa  97.8  5e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.13803  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5006  MscS mechanosensitive ion channel  27.64 
 
 		 814 aa  97.4  6e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1409  MscS mechanosensitive ion channel  23.79 
 
 		 351 aa  97.1  7e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3612  MscS Mechanosensitive ion channel  26.02 
 
 		 374 aa  97.4  7e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.649067 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0691  MscS Mechanosensitive ion channel  26.96 
 
 		 362 aa  97.4  7e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4689  MscS Mechanosensitive ion channel  26.02 
 
 		 374 aa  97.4  7e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1822  MscS mechanosensitive ion channel  28.57 
 
 		 374 aa  96.7  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00396347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2568  MscS mechanosensitive ion channel  35.37 
 
 		 358 aa  96.3  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03115  MscS Mechanosensitive ion channel  30.04 
 
 		 378 aa  95.9  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0700  hypothetical protein  24.86 
 
 		 365 aa  95.5  2e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.744044 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05088  hypothetical protein  25.35 
 
 		 399 aa  96.3  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1848  MscS family hypothetical protein  25.62 
 
 		 343 aa  95.5  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.512359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0905  MscS Mechanosensitive ion channel  26.14 
 
 		 373 aa  95.5  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.285162  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1488  MscS family inner membrane protein YnaI  25.8 
 
 		 343 aa  95.5  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.445516  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1670  MscS family inner membrane protein YnaI  25.44 
 
 		 343 aa  95.1  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.107683 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1786  MscS family inner membrane protein YnaI  25.62 
 
 		 343 aa  95.1  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0416525  normal  0.388102 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1788  MscS family inner membrane protein YnaI  25.44 
 
 		 343 aa  95.1  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.150216 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3452  MscS mechanosensitive ion channel  28.96 
 
 		 816 aa  94.7  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00203474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2125  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  28.79 
 
 		 809 aa  94.4  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0467602  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2264  mechanosensitive ion channel family protein  28.79 
 
 		 809 aa  94.4  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2070  mechanosensitive ion channel family protein  28.79 
 
 		 809 aa  94.4  6e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.563687  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0986  mechanosensitive ion channel family protein  28.79 
 
 		 808 aa  94.4  6e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.722323  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4932  MscS Mechanosensitive ion channel  26.23 
 
 		 400 aa  94  6e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3100  MscS mechanosensitive ion channel  26.77 
 
 		 820 aa  94  6e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.416731  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5267  MscS mechanosensitive ion channel  26.77 
 
 		 820 aa  94  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.269062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0951  MscS Mechanosensitive ion channel  25.93 
 
 		 341 aa  93.6  8e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1350  MscS Mechanosensitive ion channel  24.33 
 
 		 377 aa  93.6  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000205244  normal  0.510591 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0381  MscS mechanosensitive ion channel  28.42 
 
 		 815 aa  92.8  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2316  mechanosensitive ion channel family protein  28.07 
 
 		 773 aa  92.4  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2148  small conductance mechanosensitive Ion channel  28.19 
 
 		 847 aa  92  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.667496  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2101  MscS Mechanosensitive ion channel  23.94 
 
 		 299 aa  92  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172333  normal  0.177745 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1366  MscS Mechanosensitive ion channel  24.33 
 
 		 377 aa  91.7  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0389612  hitchhiker  0.000813003 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2066  MscS mechanosensitive ion channel  26.03 
 
 		 424 aa  92  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.838165  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1920  MscS Mechanosensitive ion channel  24.33 
 
 		 377 aa  91.7  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000103017  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>