More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_04171 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_04171  small mechanosensitive ion channel, MscS family protein  100 
 
 		 370 aa  746    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.610357 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1791  small conductance mechanosensitive ion channel family protein  33.87 
 
 		 343 aa  172  7.999999999999999e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01308  conserved inner membrane protein  33.87 
 
 		 343 aa  171  2e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2315  MscS Mechanosensitive ion channel  33.87 
 
 		 343 aa  171  2e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0901587  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2294  MscS mechanosensitive ion channel  33.87 
 
 		 343 aa  171  2e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1543  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  33.87 
 
 		 343 aa  171  2e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1447  small conductance mechanosensitive ion channel family protein  33.87 
 
 		 343 aa  171  2e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1978  transporter, small conductance mechanosensitive ion channel family  33.87 
 
 		 343 aa  171  2e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.218747 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01318  hypothetical protein  33.87 
 
 		 343 aa  171  2e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.831445  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1570  transporter, small conductance mechanosensitive ion channel family  33.87 
 
 		 343 aa  171  2e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1295  MscS mechanosensitive ion channel  33.72 
 
 		 391 aa  167  2e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1936  MscS mechanosensitive ion channel  32.06 
 
 		 413 aa  165  1.0000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1462  small-conductance mechanosensitive channel protein  29.66 
 
 		 373 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1791  small-conductance mechanosensitive channel  35.38 
 
 		 369 aa  162  7e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0722785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1670  MscS family inner membrane protein YnaI  32.38 
 
 		 343 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.107683 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1788  MscS family inner membrane protein YnaI  32.38 
 
 		 343 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.150216 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1848  MscS family hypothetical protein  32.84 
 
 		 343 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.512359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1786  MscS family inner membrane protein YnaI  32.84 
 
 		 343 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0416525  normal  0.388102 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1488  MscS family inner membrane protein YnaI  32.09 
 
 		 343 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.445516  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1076  MscS mechanosensitive ion channel  31.5 
 
 		 378 aa  160  4e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.119695  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1059  MscS mechanosensitive ion channel  29.04 
 
 		 384 aa  156  6e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.196377 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27641  small mechanosensitive ion channel, MscS family protein  32.54 
 
 		 373 aa  153  4e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0460  putative mechanosensitive ion channel  36.67 
 
 		 357 aa  153  5.9999999999999996e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1177  mechanosensitive ion channel  35.1 
 
 		 383 aa  150  5e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.180784  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0857  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  34.62 
 
 		 383 aa  146  5e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.017497  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05088  hypothetical protein  37 
 
 		 399 aa  143  4e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001221  small-conductance mechanosensitive channel  36.5 
 
 		 367 aa  142  9.999999999999999e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2220  MscS Mechanosensitive ion channel  34.01 
 
 		 339 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2212  small mechanosensitive ion channel  32.06 
 
 		 357 aa  133  5e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.414294  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2066  MscS mechanosensitive ion channel  30 
 
 		 424 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.838165  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0700  hypothetical protein  28.37 
 
 		 365 aa  119  7e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.744044 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3246  MscS mechanosensitive ion channel  29.08 
 
 		 381 aa  117  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00298811  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1154  hypothetical protein  30.81 
 
 		 363 aa  107  4e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0298455  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0941  MscS mechanosensitive ion channel  30.85 
 
 		 467 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.884334  normal  0.631146 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0887  MscS mechanosensitive ion channel  29.22 
 
 		 431 aa  103  7e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0881194  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2451  small-conductance mechanosensitive channel  27.75 
 
 		 380 aa  102  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2594  MscS mechanosensitive ion channel  26.81 
 
 		 388 aa  101  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0938  MscS Mechanosensitive ion channel  28.77 
 
 		 433 aa  99.8  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.466834  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0935  MscS Mechanosensitive ion channel  28.31 
 
 		 433 aa  99  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.940167  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1888  MscS Mechanosensitive ion channel  29.39 
 
 		 362 aa  98.2  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1752  MscS Mechanosensitive ion channel  27.36 
 
 		 356 aa  98.2  2e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0910  MscS mechanosensitive ion channel  26.14 
 
 		 400 aa  96.7  6e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.505459  normal  0.0192096 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2381  MscS mechanosensitive ion channel  30 
 
 		 287 aa  96.3  8e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.42777  hitchhiker  0.00000285336 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00921  small conductance mechanosensitive ion channel  27.8 
 
 		 322 aa  94.7  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.230623  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1943  MscS mechanosensitive ion channel  27.94 
 
 		 533 aa  94.4  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000658199  decreased coverage  0.00758396 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0883  MscS mechanosensitive ion channel  27.23 
 
 		 380 aa  94.4  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199191 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2332  MscS Mechanosensitive ion channel  28.82 
 
 		 362 aa  94  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1320  MscS Mechanosensitive ion channel  28.62 
 
 		 300 aa  93.2  7e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.23225 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0803  small mechanosensitive ion channel  32.08 
 
 		 342 aa  92  1e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2117  mechanosensitive ion channel family protein  24.13 
 
 		 633 aa  92.4  1e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0905  MscS Mechanosensitive ion channel  26.26 
 
 		 373 aa  90.9  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.285162  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1034  MscS mechanosensitive ion channel  29.21 
 
 		 288 aa  90.1  5e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0691  MscS Mechanosensitive ion channel  28.37 
 
 		 362 aa  90.1  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2988  putative small-conductance mechanosensitive channel  29.95 
 
 		 806 aa  90.1  6e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000510417  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4182  MscS mechanosensitive ion channel  31.34 
 
 		 324 aa  90.1  6e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.774704 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0625  small-conductance mechanosensitive ion channel  28.31 
 
 		 291 aa  89.4  8e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.286405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2065  MscS mechanosensitive ion channel  29.24 
 
 		 359 aa  89.4  9e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2101  MscS Mechanosensitive ion channel  31.03 
 
 		 299 aa  89.4  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172333  normal  0.177745 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0514  MscS Mechanosensitive ion channel  33.51 
 
 		 288 aa  88.2  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3200  MscS mechanosensitive ion channel  30.65 
 
 		 590 aa  87.8  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2152  MscS mechanosensitive ion channel  27.67 
 
 		 377 aa  87  4e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0757  MscS mechanosensitive ion channel  25.43 
 
 		 479 aa  87.4  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1062  MscS Mechanosensitive ion channel  30.52 
 
 		 310 aa  87.4  4e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.771269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0091  MscS mechanosensitive ion channel  30.11 
 
 		 267 aa  87  4e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0569  MscS Mechanosensitive ion channel  32.31 
 
 		 280 aa  87  5e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.912877  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1942  MscS mechanosensitive ion channel  31.28 
 
 		 360 aa  86.7  6e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0589  MscS mechanosensitive ion channel  28.85 
 
 		 291 aa  86.7  6e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.516163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0940  MscS mechanosensitive ion channel  25.79 
 
 		 275 aa  86.3  7e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.546965 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0707  MscS Mechanosensitive ion channel  24.02 
 
 		 344 aa  86.3  8e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000854556  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1500  MscS mechanosensitive ion channel  29.08 
 
 		 614 aa  85.9  9e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.638706  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3612  MscS Mechanosensitive ion channel  26.09 
 
 		 374 aa  86.3  9e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.649067 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4689  MscS Mechanosensitive ion channel  26.09 
 
 		 374 aa  86.3  9e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1709  small conductance mechanosensitive channel  26.98 
 
 		 494 aa  85.5  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0466336 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0108  MscS mechanosensitive ion channel  26.89 
 
 		 304 aa  85.5  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1849  small mechanosensitive ion channel  25.81 
 
 		 340 aa  85.5  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  hitchhiker  0.00611524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0955  MscS mechanosensitive ion channel  28.93 
 
 		 298 aa  85.9  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0730  MscS mechanosensitive ion channel  30.11 
 
 		 267 aa  84.7  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.506108  normal  0.245277 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0047  MscS mechanosensitive ion channel  27.1 
 
 		 270 aa  85.1  0.000000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1569  MscS mechanosensitive ion channel  25 
 
 		 342 aa  85.1  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.50156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2646  MscS mechanosensitive ion channel  28.37 
 
 		 322 aa  84.7  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1775  MscS mechanosensitive ion channel  28.57 
 
 		 283 aa  84.3  0.000000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00392  hypothetical protein  25.59 
 
 		 377 aa  84.3  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.65965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0013  mechanosensitive ion channel family protein  23.05 
 
 		 682 aa  84.3  0.000000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1533  MscS Mechanosensitive ion channel  29.02 
 
 		 276 aa  84.7  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1036  putative mechanosensitive ion channel protein  28.65 
 
 		 534 aa  84.7  0.000000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2696  MscS Mechanosensitive ion channel  30.15 
 
 		 369 aa  84  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.415509  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1633  hypothetical protein  26.89 
 
 		 364 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246622  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1900  MscS mechanosensitive ion channel  26.5 
 
 		 240 aa  83.6  0.000000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0998935  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0407  MscS mechanosensitive ion channel  32.16 
 
 		 315 aa  83.6  0.000000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.323817  normal  0.0164618 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2296  MscS mechanosensitive ion channel  27.6 
 
 		 270 aa  83.6  0.000000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0935  MscS Mechanosensitive ion channel  25.6 
 
 		 484 aa  83.6  0.000000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2295  mechanosensitive ion channel family protein  25.35 
 
 		 289 aa  83.2  0.000000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2675  MscS mechanosensitive ion channel  27.8 
 
 		 275 aa  83.2  0.000000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00133263  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3016  MscS mechanosensitive ion channel  27.91 
 
 		 426 aa  83.2  0.000000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10253  hypothetical protein  30.59 
 
 		 307 aa  83.2  0.000000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00229932  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1335  MscS mechanosensitive ion channel  29.76 
 
 		 275 aa  82.8  0.000000000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000063147 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3171  MscS mechanosensitive ion channel  28.42 
 
 		 275 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000563606  hitchhiker  0.0000513684 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4338  MscS mechanosensitive ion channel  26.67 
 
 		 533 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0014  MscS Mechanosensitive ion channel  24.38 
 
 		 289 aa  82.4  0.00000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1578  small-conductance mechanosensitive channel  27 
 
 		 534 aa  82  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00006998  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>