More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_0707 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_0707  MscS Mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 344 aa  673    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000854556  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0905  MscS Mechanosensitive ion channel  37.14 
 
 		 373 aa  210  3e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.285162  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4427  MscS Mechanosensitive ion channel  33.03 
 
 		 349 aa  201  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0238849  normal  0.125106 
 
 
-
 
NC_003296  RS00392  hypothetical protein  42.79 
 
 		 377 aa  197  3e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.65965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1452  MscS mechanosensitive ion channel  42.69 
 
 		 355 aa  197  3e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.678727  normal  0.0144942 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0691  MscS Mechanosensitive ion channel  41.83 
 
 		 362 aa  189  5e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0172  MscS mechanosensitive ion channel  44.29 
 
 		 375 aa  187  2e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0430239  normal  0.753414 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3612  MscS Mechanosensitive ion channel  36.3 
 
 		 374 aa  187  3e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.649067 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4689  MscS Mechanosensitive ion channel  36.3 
 
 		 374 aa  187  3e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4932  MscS Mechanosensitive ion channel  36.86 
 
 		 400 aa  183  4.0000000000000006e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1920  MscS Mechanosensitive ion channel  35.34 
 
 		 377 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000103017  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1366  MscS Mechanosensitive ion channel  35.34 
 
 		 377 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0389612  hitchhiker  0.000813003 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1381  MscS Mechanosensitive ion channel  35.34 
 
 		 377 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.524748 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1350  MscS Mechanosensitive ion channel  35.34 
 
 		 377 aa  179  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000205244  normal  0.510591 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2101  MscS Mechanosensitive ion channel  34.98 
 
 		 377 aa  179  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000188968 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4819  MscS mechanosensitive ion channel  33.43 
 
 		 392 aa  176  4e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.749552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2171  MscS mechanosensitive ion channel  39.9 
 
 		 374 aa  175  8e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.920192  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3360  hypothetical protein  39.42 
 
 		 374 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07431  small mechanosensitive ion channel  33.53 
 
 		 343 aa  174  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.1802 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2398  MscS mechanosensitive ion channel  39.42 
 
 		 374 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2152  MscS mechanosensitive ion channel  42.93 
 
 		 377 aa  171  2e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1352  MscS mechanosensitive ion channel  37.72 
 
 		 376 aa  171  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.308859  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20120  Mechanosensitive ion channel family protein  38.16 
 
 		 418 aa  171  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1822  MscS mechanosensitive ion channel  38.28 
 
 		 374 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00396347  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3649  mechanosensitive ion channel family protein  38.28 
 
 		 374 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.158368  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1849  small mechanosensitive ion channel  30.09 
 
 		 340 aa  167  2.9999999999999998e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  hitchhiker  0.00611524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06981  small mechanosensitive ion channel  31.07 
 
 		 338 aa  165  9e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.247932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0075  small-conductance mechanosensitive channel  31.21 
 
 		 338 aa  164  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.221122  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0803  small mechanosensitive ion channel  31.53 
 
 		 342 aa  163  3e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0635  small mechanosensitive ion channel  39.71 
 
 		 343 aa  162  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.352398  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4007  MscS mechanosensitive ion channel  35.97 
 
 		 376 aa  160  3e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0987654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07011  small mechanosensitive ion channel  38.32 
 
 		 343 aa  160  4e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.184839  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4608  MscS mechanosensitive ion channel  38.29 
 
 		 386 aa  159  9e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.247282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3357  MscS Mechanosensitive ion channel  35.18 
 
 		 376 aa  155  1e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1752  MscS Mechanosensitive ion channel  31.85 
 
 		 356 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06911  small mechanosensitive ion channel  39.15 
 
 		 343 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.412375  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06621  small mechanosensitive ion channel  39.71 
 
 		 343 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.16712  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0195  MscS mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 354 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.0052728  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2160  MscS mechanosensitive ion channel  31.44 
 
 		 400 aa  144  2e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0650836  normal  0.851382 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0689  MscS mechanosensitive ion channel  32.38 
 
 		 351 aa  143  4e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.13803  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1409  MscS mechanosensitive ion channel  32.06 
 
 		 351 aa  142  9e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0938  MscS Mechanosensitive ion channel  34.11 
 
 		 433 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.466834  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0935  MscS Mechanosensitive ion channel  33.64 
 
 		 433 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.940167  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0887  MscS mechanosensitive ion channel  34.11 
 
 		 431 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0881194  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3016  MscS mechanosensitive ion channel  37.67 
 
 		 426 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4500  MscS Mechanosensitive ion channel  28.12 
 
 		 662 aa  131  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0941  MscS mechanosensitive ion channel  34.6 
 
 		 467 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.884334  normal  0.631146 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1277  MscS mechanosensitive ion channel  31.51 
 
 		 352 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2451  small-conductance mechanosensitive channel  27.19 
 
 		 380 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0042  MscS Mechanosensitive ion channel  26.45 
 
 		 375 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.634821  normal  0.103785 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1267  MscS mechanosensitive ion channel  28.74 
 
 		 351 aa  126  6e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3246  MscS mechanosensitive ion channel  25.44 
 
 		 381 aa  126  6e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00298811  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2594  MscS mechanosensitive ion channel  34.53 
 
 		 388 aa  124  3e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0910  MscS mechanosensitive ion channel  26.15 
 
 		 400 aa  123  4e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.505459  normal  0.0192096 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4003  MscS mechanosensitive ion channel  30.28 
 
 		 362 aa  120  3e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0737574  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1936  MscS mechanosensitive ion channel  28.05 
 
 		 413 aa  116  6.9999999999999995e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1791  small-conductance mechanosensitive channel  29.46 
 
 		 369 aa  114  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0722785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4194  MscS mechanosensitive ion channel  31 
 
 		 562 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.674763 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4873  MscS Mechanosensitive ion channel  26.98 
 
 		 567 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1942  MscS mechanosensitive ion channel  26.23 
 
 		 360 aa  108  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1059  MscS mechanosensitive ion channel  28.63 
 
 		 384 aa  107  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.196377 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0883  MscS mechanosensitive ion channel  31.51 
 
 		 380 aa  107  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199191 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0942  MscS Mechanosensitive ion channel  28.4 
 
 		 377 aa  107  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000347454  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3012  MscS mechanosensitive ion channel  30.24 
 
 		 297 aa  105  8e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0013  mechanosensitive ion channel family protein  31.75 
 
 		 682 aa  105  1e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4048  MscS mechanosensitive ion channel  26.76 
 
 		 569 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.138882  normal  0.12233 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2117  mechanosensitive ion channel family protein  31.51 
 
 		 633 aa  103  4e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1801  MscS Mechanosensitive ion channel  25.51 
 
 		 335 aa  103  5e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5290  MscS mechanosensitive ion channel  32.76 
 
 		 371 aa  102  9e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.716182  normal  0.882551 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1504  conserved hypothetical integral membrane protein, mechanosensitive ion channel family  29.57 
 
 		 624 aa  102  1e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1250  MscS mechanosensitive ion channel  33.9 
 
 		 361 aa  100  3e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000414305  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2332  MscS Mechanosensitive ion channel  24.38 
 
 		 362 aa  100  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0641  hypothetical protein  31.52 
 
 		 543 aa  100  4e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0236  mechanosensitive ion channel family protein  32.43 
 
 		 627 aa  100  4e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1737  mechanosensitive ion channel family protein  29.59 
 
 		 624 aa  100  4e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.64597  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0289  mechanosensitive ion channel family protein  29.27 
 
 		 627 aa  100  5e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.658149  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0263  mechanosensitive ion channel family protein  29.27 
 
 		 627 aa  100  5e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2829  MscS mechanosensitive ion channel  29.41 
 
 		 294 aa  99.8  7e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0949  MscS Mechanosensitive ion channel  28.95 
 
 		 273 aa  98.6  1e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1177  mechanosensitive ion channel  24.38 
 
 		 383 aa  98.6  1e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.180784  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1670  MscS family inner membrane protein YnaI  25.99 
 
 		 343 aa  98.6  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.107683 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1788  MscS family inner membrane protein YnaI  25.99 
 
 		 343 aa  98.6  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.150216 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1786  MscS family inner membrane protein YnaI  30.28 
 
 		 343 aa  98.6  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0416525  normal  0.388102 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1848  MscS family hypothetical protein  30.28 
 
 		 343 aa  99  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.512359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1488  MscS family inner membrane protein YnaI  25.99 
 
 		 343 aa  99  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.445516  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0857  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  25.97 
 
 		 383 aa  98.6  1e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.017497  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1500  MscS mechanosensitive ion channel  29.65 
 
 		 614 aa  98.2  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.638706  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2696  MscS Mechanosensitive ion channel  27.91 
 
 		 369 aa  97.1  4e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.415509  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1124  MscS Mechanosensitive ion channel  27.83 
 
 		 345 aa  96.7  5e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.745547  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1295  MscS mechanosensitive ion channel  29.91 
 
 		 391 aa  96.7  5e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3200  MscS mechanosensitive ion channel  25.78 
 
 		 590 aa  96.3  6e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1791  small conductance mechanosensitive ion channel family protein  27.2 
 
 		 343 aa  95.9  8e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1154  hypothetical protein  29.28 
 
 		 363 aa  95.9  9e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0298455  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1633  hypothetical protein  25.74 
 
 		 364 aa  95.5  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246622  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0585  putative small-conductance mechanosensitive channel  30.49 
 
 		 277 aa  95.5  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000591532  normal  0.0145572 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1462  small-conductance mechanosensitive channel protein  25.85 
 
 		 373 aa  94.7  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0617  MscS mechanosensitive ion channel  26.71 
 
 		 338 aa  95.1  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210835  normal  0.752053 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1359  MscS mechanosensitive ion channel  25.75 
 
 		 275 aa  94.4  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1543  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  27.2 
 
 		 343 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1570  transporter, small conductance mechanosensitive ion channel family  27.2 
 
 		 343 aa  94.7  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>