More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4608 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_4608  MscS mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 386 aa  756    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.247282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3357  MscS Mechanosensitive ion channel  62.97 
 
 		 376 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4007  MscS mechanosensitive ion channel  62.7 
 
 		 376 aa  413  1e-114  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0987654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0172  MscS mechanosensitive ion channel  61.76 
 
 		 375 aa  391  1e-108  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0430239  normal  0.753414 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1822  MscS mechanosensitive ion channel  51.62 
 
 		 374 aa  382  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00396347  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3649  mechanosensitive ion channel family protein  52.2 
 
 		 374 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.158368  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0691  MscS Mechanosensitive ion channel  60.84 
 
 		 362 aa  381  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2171  MscS mechanosensitive ion channel  54.67 
 
 		 374 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.920192  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3360  hypothetical protein  53.39 
 
 		 374 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2398  MscS mechanosensitive ion channel  53.39 
 
 		 374 aa  368  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3612  MscS Mechanosensitive ion channel  53.27 
 
 		 374 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.649067 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4689  MscS Mechanosensitive ion channel  53.27 
 
 		 374 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_003296  RS00392  hypothetical protein  50.31 
 
 		 377 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.65965  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20120  Mechanosensitive ion channel family protein  47.34 
 
 		 418 aa  295  7e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1452  MscS mechanosensitive ion channel  42.54 
 
 		 355 aa  290  2e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.678727  normal  0.0144942 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1352  MscS mechanosensitive ion channel  45.76 
 
 		 376 aa  271  2e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.308859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0905  MscS Mechanosensitive ion channel  42.98 
 
 		 373 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.285162  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2101  MscS Mechanosensitive ion channel  44.18 
 
 		 377 aa  268  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000188968 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1350  MscS Mechanosensitive ion channel  44.18 
 
 		 377 aa  268  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000205244  normal  0.510591 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1381  MscS Mechanosensitive ion channel  44.18 
 
 		 377 aa  268  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.524748 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1920  MscS Mechanosensitive ion channel  44.18 
 
 		 377 aa  268  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000103017  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1366  MscS Mechanosensitive ion channel  44.18 
 
 		 377 aa  268  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0389612  hitchhiker  0.000813003 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4932  MscS Mechanosensitive ion channel  39.27 
 
 		 400 aa  256  6e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2152  MscS mechanosensitive ion channel  45.34 
 
 		 377 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4427  MscS Mechanosensitive ion channel  45.73 
 
 		 349 aa  197  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0238849  normal  0.125106 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4819  MscS mechanosensitive ion channel  33.15 
 
 		 392 aa  169  6e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.749552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0803  small mechanosensitive ion channel  38.61 
 
 		 342 aa  168  1e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0707  MscS Mechanosensitive ion channel  38.29 
 
 		 344 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000854556  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07011  small mechanosensitive ion channel  36.06 
 
 		 343 aa  154  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.184839  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0635  small mechanosensitive ion channel  36.54 
 
 		 343 aa  154  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.352398  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07431  small mechanosensitive ion channel  32.71 
 
 		 343 aa  150  5e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.1802 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1849  small mechanosensitive ion channel  35.64 
 
 		 340 aa  148  2.0000000000000003e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  hitchhiker  0.00611524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0075  small-conductance mechanosensitive channel  34.31 
 
 		 338 aa  147  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.221122  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06981  small mechanosensitive ion channel  34.31 
 
 		 338 aa  146  5e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.247932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06911  small mechanosensitive ion channel  36.06 
 
 		 343 aa  143  4e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.412375  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06621  small mechanosensitive ion channel  36.06 
 
 		 343 aa  143  6e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.16712  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2160  MscS mechanosensitive ion channel  29.57 
 
 		 400 aa  137  4e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0650836  normal  0.851382 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4500  MscS Mechanosensitive ion channel  34.86 
 
 		 662 aa  118  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0941  MscS mechanosensitive ion channel  31.48 
 
 		 467 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.884334  normal  0.631146 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2451  small-conductance mechanosensitive channel  27.96 
 
 		 380 aa  116  5e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0887  MscS mechanosensitive ion channel  31.88 
 
 		 431 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0881194  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0935  MscS Mechanosensitive ion channel  29.26 
 
 		 433 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.940167  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3246  MscS mechanosensitive ion channel  29.44 
 
 		 381 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00298811  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0938  MscS Mechanosensitive ion channel  29.26 
 
 		 433 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.466834  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4048  MscS mechanosensitive ion channel  32.2 
 
 		 569 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.138882  normal  0.12233 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1752  MscS Mechanosensitive ion channel  31.37 
 
 		 356 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4194  MscS mechanosensitive ion channel  32.56 
 
 		 562 aa  109  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.674763 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0942  MscS Mechanosensitive ion channel  30.77 
 
 		 377 aa  105  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000347454  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0042  MscS Mechanosensitive ion channel  29.41 
 
 		 375 aa  105  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.634821  normal  0.103785 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4003  MscS mechanosensitive ion channel  29.69 
 
 		 362 aa  105  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0737574  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1578  small-conductance mechanosensitive channel  31.25 
 
 		 534 aa  102  9e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00006998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3016  MscS mechanosensitive ion channel  30.73 
 
 		 426 aa  101  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1277  MscS mechanosensitive ion channel  27.88 
 
 		 352 aa  101  2e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0641  hypothetical protein  28.92 
 
 		 543 aa  100  4e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1409  MscS mechanosensitive ion channel  28.84 
 
 		 351 aa  100  4e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0689  MscS mechanosensitive ion channel  28.84 
 
 		 351 aa  99  1e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.13803  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0922  MscS mechanosensitive ion channel  28.72 
 
 		 456 aa  99.4  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.837868 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0452  MscS mechanosensitive ion channel  30.29 
 
 		 283 aa  98.2  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00426986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2469  putative transport protein  31.32 
 
 		 269 aa  97.4  4e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0951  MscS Mechanosensitive ion channel  31.87 
 
 		 341 aa  96.7  6e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1267  MscS mechanosensitive ion channel  29.53 
 
 		 351 aa  96.7  7e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4873  MscS Mechanosensitive ion channel  30.92 
 
 		 567 aa  95.9  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1943  MscS mechanosensitive ion channel  29.27 
 
 		 533 aa  93.6  5e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000658199  decreased coverage  0.00758396 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0253  mechanosensitive ion channel family protein  31.07 
 
 		 378 aa  93.2  7e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1154  hypothetical protein  29.38 
 
 		 363 aa  93.2  7e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0298455  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0247  mechanosensitive ion channel family protein  31.07 
 
 		 378 aa  93.2  8e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5290  MscS mechanosensitive ion channel  29.88 
 
 		 371 aa  92  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.716182  normal  0.882551 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0013  mechanosensitive ion channel family protein  24.19 
 
 		 682 aa  91.7  2e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1500  MscS mechanosensitive ion channel  25.91 
 
 		 614 aa  89.4  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.638706  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1900  MscS mechanosensitive ion channel  28.43 
 
 		 240 aa  89.4  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0998935  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1350  hypothetical protein  23.64 
 
 		 292 aa  88.2  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.136839  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3521  MscS mechanosensitive ion channel  26.7 
 
 		 547 aa  88.6  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0195  MscS mechanosensitive ion channel  26.04 
 
 		 354 aa  87  5e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.0052728  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3200  MscS Mechanosensitive ion channel  26.88 
 
 		 275 aa  86.3  8e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126037  normal  0.165541 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3394  MscS mechanosensitive ion channel  26.48 
 
 		 277 aa  86.3  9e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00053127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3145  mechanosensitive ion channel  26.83 
 
 		 544 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.187903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0521  MscS mechanosensitive ion channel  26.87 
 
 		 200 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.108923  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1342  MscS Mechanosensitive ion channel  29.88 
 
 		 266 aa  85.5  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00293598  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3409  mechanosensitive channel MscS  29.54 
 
 		 286 aa  85.1  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.427229  normal  0.109816 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0236  mechanosensitive ion channel family protein  24.02 
 
 		 627 aa  84.7  0.000000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1504  conserved hypothetical integral membrane protein, mechanosensitive ion channel family  25.09 
 
 		 624 aa  84.7  0.000000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1674  MscS mechanosensitive ion channel  34.29 
 
 		 270 aa  85.1  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.702305  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1791  small-conductance mechanosensitive channel  25.7 
 
 		 369 aa  85.1  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0722785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3307  mechanosensitive channel MscS  29.54 
 
 		 286 aa  85.1  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1124  MscS Mechanosensitive ion channel  26.98 
 
 		 345 aa  84.7  0.000000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.745547  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3240  mechanosensitive channel MscS  29.54 
 
 		 286 aa  85.1  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0527  MscS mechanosensitive ion channel  32.28 
 
 		 276 aa  85.1  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.546646 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3229  mechanosensitive channel MscS  29.54 
 
 		 286 aa  85.1  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.550002  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3304  mechanosensitive channel MscS  29.11 
 
 		 286 aa  84.3  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002898  small-conductance mechanosensitive channel  25 
 
 		 532 aa  84.7  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.341732  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0562  MscS mechanosensitive ion channel  27.62 
 
 		 551 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0561  MscS mechanosensitive ion channel  27.62 
 
 		 551 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2117  mechanosensitive ion channel family protein  35 
 
 		 633 aa  84.7  0.000000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2594  MscS mechanosensitive ion channel  26.05 
 
 		 388 aa  84  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0263  mechanosensitive ion channel family protein  23.58 
 
 		 627 aa  84  0.000000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1177  mechanosensitive ion channel  26.2 
 
 		 383 aa  84.3  0.000000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.180784  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03062  hypothetical protein  24.34 
 
 		 563 aa  84  0.000000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0857  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  26.2 
 
 		 383 aa  84  0.000000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.017497  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0289  mechanosensitive ion channel family protein  23.58 
 
 		 627 aa  83.6  0.000000000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.658149  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03115  MscS Mechanosensitive ion channel  28.96 
 
 		 378 aa  84  0.000000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>