More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_4427 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_4427  MscS Mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 349 aa  709    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0238849  normal  0.125106 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4932  MscS Mechanosensitive ion channel  38.78 
 
 		 400 aa  258  1e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0691  MscS Mechanosensitive ion channel  41.61 
 
 		 362 aa  242  7.999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0905  MscS Mechanosensitive ion channel  40.18 
 
 		 373 aa  239  5e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.285162  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4689  MscS Mechanosensitive ion channel  40.39 
 
 		 374 aa  224  2e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3612  MscS Mechanosensitive ion channel  40.39 
 
 		 374 aa  224  2e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.649067 
 
 
-
 
NC_003296  RS00392  hypothetical protein  40.07 
 
 		 377 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.65965  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3360  hypothetical protein  46.88 
 
 		 374 aa  219  5e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1452  MscS mechanosensitive ion channel  47.74 
 
 		 355 aa  218  2e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.678727  normal  0.0144942 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2398  MscS mechanosensitive ion channel  46.43 
 
 		 374 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2152  MscS mechanosensitive ion channel  38.01 
 
 		 377 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20120  Mechanosensitive ion channel family protein  48.24 
 
 		 418 aa  211  1e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2171  MscS mechanosensitive ion channel  38.51 
 
 		 374 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.920192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0172  MscS mechanosensitive ion channel  46.48 
 
 		 375 aa  210  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0430239  normal  0.753414 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0803  small mechanosensitive ion channel  35.02 
 
 		 342 aa  208  1e-52  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1822  MscS mechanosensitive ion channel  32.64 
 
 		 374 aa  207  3e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00396347  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3649  mechanosensitive ion channel family protein  32.34 
 
 		 374 aa  204  2e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.158368  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1366  MscS Mechanosensitive ion channel  35.92 
 
 		 377 aa  202  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0389612  hitchhiker  0.000813003 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1381  MscS Mechanosensitive ion channel  35.92 
 
 		 377 aa  202  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.524748 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2101  MscS Mechanosensitive ion channel  35.92 
 
 		 377 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000188968 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1920  MscS Mechanosensitive ion channel  35.92 
 
 		 377 aa  202  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000103017  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1350  MscS Mechanosensitive ion channel  35.92 
 
 		 377 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000205244  normal  0.510591 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1352  MscS mechanosensitive ion channel  36 
 
 		 376 aa  200  3e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.308859  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0707  MscS Mechanosensitive ion channel  43.48 
 
 		 344 aa  197  2.0000000000000003e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000854556  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1849  small mechanosensitive ion channel  31.83 
 
 		 340 aa  193  3e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  hitchhiker  0.00611524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4608  MscS mechanosensitive ion channel  45.73 
 
 		 386 aa  191  1e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.247282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4007  MscS mechanosensitive ion channel  43.69 
 
 		 376 aa  191  2e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0987654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06981  small mechanosensitive ion channel  31.58 
 
 		 338 aa  189  8e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.247932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3357  MscS Mechanosensitive ion channel  43.24 
 
 		 376 aa  188  1e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07011  small mechanosensitive ion channel  40.89 
 
 		 343 aa  188  1e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.184839  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0075  small-conductance mechanosensitive channel  31.27 
 
 		 338 aa  187  2e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.221122  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0635  small mechanosensitive ion channel  31.1 
 
 		 343 aa  187  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.352398  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07431  small mechanosensitive ion channel  31.89 
 
 		 343 aa  187  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.1802 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06621  small mechanosensitive ion channel  31.27 
 
 		 343 aa  176  6e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.16712  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06911  small mechanosensitive ion channel  31.71 
 
 		 343 aa  171  2e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.412375  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4819  MscS mechanosensitive ion channel  30.4 
 
 		 392 aa  159  8e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.749552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0689  MscS mechanosensitive ion channel  30.84 
 
 		 351 aa  140  4.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.13803  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1409  MscS mechanosensitive ion channel  31.14 
 
 		 351 aa  137  2e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0042  MscS Mechanosensitive ion channel  28.49 
 
 		 375 aa  136  4e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.634821  normal  0.103785 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0195  MscS mechanosensitive ion channel  28.06 
 
 		 354 aa  133  5e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.0052728  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1752  MscS Mechanosensitive ion channel  28.71 
 
 		 356 aa  130  3e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1267  MscS mechanosensitive ion channel  29.94 
 
 		 351 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0941  MscS mechanosensitive ion channel  33.01 
 
 		 467 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.884334  normal  0.631146 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2451  small-conductance mechanosensitive channel  29.85 
 
 		 380 aa  124  3e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2160  MscS mechanosensitive ion channel  30.31 
 
 		 400 aa  124  3e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0650836  normal  0.851382 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1277  MscS mechanosensitive ion channel  30.14 
 
 		 352 aa  122  7e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3246  MscS mechanosensitive ion channel  26.59 
 
 		 381 aa  121  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00298811  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0938  MscS Mechanosensitive ion channel  28.88 
 
 		 433 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.466834  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0935  MscS Mechanosensitive ion channel  28.88 
 
 		 433 aa  119  6e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.940167  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2696  MscS Mechanosensitive ion channel  27.52 
 
 		 369 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.415509  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3016  MscS mechanosensitive ion channel  33.67 
 
 		 426 aa  116  6e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0887  MscS mechanosensitive ion channel  28.08 
 
 		 431 aa  115  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0881194  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4003  MscS mechanosensitive ion channel  32.65 
 
 		 362 aa  115  8.999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0737574  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0942  MscS Mechanosensitive ion channel  27.62 
 
 		 377 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000347454  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1888  MscS Mechanosensitive ion channel  25.15 
 
 		 362 aa  109  9.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2332  MscS Mechanosensitive ion channel  25.53 
 
 		 362 aa  108  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2594  MscS mechanosensitive ion channel  28.57 
 
 		 388 aa  107  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3168  MscS Mechanosensitive ion channel  28.92 
 
 		 311 aa  105  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0116515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1900  MscS mechanosensitive ion channel  25.4 
 
 		 240 aa  105  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0998935  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1936  MscS mechanosensitive ion channel  24.92 
 
 		 413 aa  105  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1154  hypothetical protein  27.91 
 
 		 363 aa  104  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0298455  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1059  MscS mechanosensitive ion channel  23.12 
 
 		 384 aa  103  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.196377 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4194  MscS mechanosensitive ion channel  29.32 
 
 		 562 aa  104  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.674763 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1943  MscS mechanosensitive ion channel  27.78 
 
 		 533 aa  103  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000658199  decreased coverage  0.00758396 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4048  MscS mechanosensitive ion channel  28.79 
 
 		 569 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.138882  normal  0.12233 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0247  mechanosensitive ion channel family protein  24.84 
 
 		 378 aa  100  3e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1578  small-conductance mechanosensitive channel  29.21 
 
 		 534 aa  100  3e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00006998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3521  MscS mechanosensitive ion channel  30.85 
 
 		 547 aa  99.8  7e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1569  MscS mechanosensitive ion channel  27.36 
 
 		 342 aa  99.4  8e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.50156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0253  mechanosensitive ion channel family protein  26.63 
 
 		 378 aa  99.4  8e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2065  MscS mechanosensitive ion channel  26.26 
 
 		 359 aa  99.4  9e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0883  MscS mechanosensitive ion channel  29.17 
 
 		 380 aa  99.4  9e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199191 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0922  MscS mechanosensitive ion channel  26.43 
 
 		 456 aa  98.6  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.837868 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0641  hypothetical protein  26.89 
 
 		 543 aa  98.6  2e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1462  small-conductance mechanosensitive channel protein  24.84 
 
 		 373 aa  96.7  5e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1791  small-conductance mechanosensitive channel  27.11 
 
 		 369 aa  96.7  5e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0722785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4500  MscS Mechanosensitive ion channel  30.56 
 
 		 662 aa  96.3  7e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3304  mechanosensitive channel MscS  32.12 
 
 		 286 aa  96.3  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1146  MscS mechanosensitive ion channel  26.2 
 
 		 366 aa  95.9  9e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.779955  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1152  MscS mechanosensitive ion channel  26.84 
 
 		 274 aa  95.5  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0163398  normal  0.0148083 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3240  mechanosensitive channel MscS  32.12 
 
 		 286 aa  95.9  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4873  MscS Mechanosensitive ion channel  27.98 
 
 		 567 aa  95.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1942  MscS mechanosensitive ion channel  25 
 
 		 360 aa  95.1  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1856  hypothetical protein  27.67 
 
 		 281 aa  95.5  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.130527  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3229  mechanosensitive channel MscS  32.12 
 
 		 286 aa  95.9  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.550002  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1500  MscS mechanosensitive ion channel  27.81 
 
 		 614 aa  95.1  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.638706  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3307  mechanosensitive channel MscS  32.12 
 
 		 286 aa  95.9  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3409  mechanosensitive channel MscS  32.12 
 
 		 286 aa  95.9  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.427229  normal  0.109816 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1633  hypothetical protein  25.57 
 
 		 364 aa  94.7  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246622  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5290  MscS mechanosensitive ion channel  34.22 
 
 		 371 aa  95.1  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.716182  normal  0.882551 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2105  MscS Mechanosensitive ion channel  26.97 
 
 		 414 aa  94.7  2e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0600957  normal  0.059013 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0910  MscS mechanosensitive ion channel  24.72 
 
 		 400 aa  94.7  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.505459  normal  0.0192096 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1300  MscS mechanosensitive ion channel  25.97 
 
 		 343 aa  94.4  3e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.987941  hitchhiker  0.00895683 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1093  MscS Mechanosensitive ion channel  25.23 
 
 		 389 aa  94.4  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.464677  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1852  MscS Mechanosensitive ion channel  27.19 
 
 		 344 aa  94.4  3e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.390235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2137  MscS mechanosensitive ion channel  31.41 
 
 		 288 aa  94  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.857102  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1848  MscS family hypothetical protein  28.12 
 
 		 343 aa  94  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.512359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1788  MscS family inner membrane protein YnaI  27.75 
 
 		 343 aa  93.6  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.150216 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1670  MscS family inner membrane protein YnaI  27.75 
 
 		 343 aa  93.6  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.107683 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4349  MscS Mechanosensitive ion channel  29.11 
 
 		 285 aa  94  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>