More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1300 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1300  MscS mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 343 aa  681    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.987941  hitchhiker  0.00895683 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1569  MscS mechanosensitive ion channel  40.63 
 
 		 342 aa  251  1e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.50156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1852  MscS Mechanosensitive ion channel  37.17 
 
 		 344 aa  229  5e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.390235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0935  MscS Mechanosensitive ion channel  34.72 
 
 		 484 aa  192  9e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1633  hypothetical protein  31.19 
 
 		 364 aa  170  3e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246622  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1250  MscS mechanosensitive ion channel  35.24 
 
 		 361 aa  168  1e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000414305  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1942  MscS mechanosensitive ion channel  28.45 
 
 		 360 aa  166  8e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2065  MscS mechanosensitive ion channel  28.45 
 
 		 359 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2696  MscS Mechanosensitive ion channel  29.75 
 
 		 369 aa  162  1e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.415509  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1888  MscS Mechanosensitive ion channel  28.01 
 
 		 362 aa  159  7e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2332  MscS Mechanosensitive ion channel  28.31 
 
 		 362 aa  155  8e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1124  MscS Mechanosensitive ion channel  32.13 
 
 		 345 aa  153  4e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.745547  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4003  MscS mechanosensitive ion channel  31.89 
 
 		 362 aa  152  7e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0737574  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2101  MscS Mechanosensitive ion channel  35 
 
 		 299 aa  149  6e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172333  normal  0.177745 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2316  mechanosensitive ion channel family protein  34.46 
 
 		 291 aa  146  6e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.176359  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5283  MscS Mechanosensitive ion channel  32.15 
 
 		 376 aa  145  9e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0209  MscS mechanosensitive ion channel  33.73 
 
 		 685 aa  145  1e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0673077 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1146  MscS mechanosensitive ion channel  28.66 
 
 		 366 aa  142  9.999999999999999e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.779955  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2479  MscS Mechanosensitive ion channel  30.86 
 
 		 383 aa  138  1e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.827266 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1903  MscS Mechanosensitive ion channel  38.03 
 
 		 303 aa  137  2e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3016  MscS mechanosensitive ion channel  36.44 
 
 		 426 aa  138  2e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1409  MscS mechanosensitive ion channel  31.99 
 
 		 351 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5091  MscS Mechanosensitive ion channel  38.54 
 
 		 637 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00148956  normal  0.0183068 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1339  MscS Mechanosensitive ion channel  40 
 
 		 636 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000323872 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1311  MscS Mechanosensitive ion channel  40 
 
 		 636 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0195  MscS mechanosensitive ion channel  32.41 
 
 		 354 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.0052728  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0914  MscS mechanosensitive ion channel  37.74 
 
 		 842 aa  135  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707445 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3172  MscS Mechanosensitive ion channel  34.74 
 
 		 784 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0689  MscS mechanosensitive ion channel  31.68 
 
 		 351 aa  132  6.999999999999999e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.13803  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2842  MscS mechanosensitive ion channel  29.03 
 
 		 369 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2988  putative small-conductance mechanosensitive channel  30.65 
 
 		 806 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000510417  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2331  MscS mechanosensitive ion channel  29.68 
 
 		 307 aa  130  3e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0340157  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3246  MscS mechanosensitive ion channel  29.25 
 
 		 381 aa  130  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00298811  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2295  mechanosensitive ion channel family protein  34.03 
 
 		 289 aa  129  5.0000000000000004e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2581  MscS mechanosensitive ion channel  35.85 
 
 		 298 aa  129  9.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.391196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3013  MscS mechanosensitive ion channel  35.85 
 
 		 843 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0786  mechanosensitive channel MscS  32.89 
 
 		 286 aa  125  7e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3251  mechanosensitive channel MscS  32.89 
 
 		 286 aa  125  8.000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02755  mechanosensitive channel  32.89 
 
 		 286 aa  125  8.000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0769  MscS Mechanosensitive ion channel  32.89 
 
 		 286 aa  125  8.000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02718  hypothetical protein  32.89 
 
 		 286 aa  125  8.000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3082  mechanosensitive channel MscS  32.89 
 
 		 286 aa  125  8.000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3349  mechanosensitive channel MscS  32.89 
 
 		 286 aa  125  8.000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4221  mechanosensitive channel MscS  32.89 
 
 		 286 aa  125  8.000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2529  MscS Mechanosensitive ion channel  31.82 
 
 		 864 aa  125  9e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03290  MscS Mechanosensitive ion channel  31.95 
 
 		 280 aa  125  9e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03115  MscS Mechanosensitive ion channel  32.56 
 
 		 378 aa  125  9e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1153  MscS Mechanosensitive ion channel  28.35 
 
 		 352 aa  125  1e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0101  putative AefA  36.62 
 
 		 338 aa  125  1e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.0000000159695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3061  mechanosensitive channel MscS  32.89 
 
 		 291 aa  125  1e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.397816  normal  0.219365 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1746  mechanosensitive ion channel family protein  32.26 
 
 		 531 aa  124  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4892  MscS Mechanosensitive ion channel  35.32 
 
 		 560 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3307  mechanosensitive channel MscS  32.89 
 
 		 286 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3229  mechanosensitive channel MscS  32.89 
 
 		 286 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.550002  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3409  mechanosensitive channel MscS  32.89 
 
 		 286 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.427229  normal  0.109816 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3240  mechanosensitive channel MscS  32.89 
 
 		 286 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0940  MscS mechanosensitive ion channel  31.94 
 
 		 275 aa  123  4e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.546965 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3304  mechanosensitive channel MscS  32.89 
 
 		 286 aa  123  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0941  MscS mechanosensitive ion channel  29.37 
 
 		 467 aa  123  6e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.884334  normal  0.631146 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3168  MscS Mechanosensitive ion channel  34.55 
 
 		 311 aa  122  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0116515  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08271  hypothetical protein  33.81 
 
 		 329 aa  122  9.999999999999999e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1632  MscS mechanosensitive ion channel  32.3 
 
 		 877 aa  121  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.253181  normal  0.172693 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3719  MscS mechanosensitive ion channel  34.78 
 
 		 538 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00173633  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2469  putative transport protein  37.62 
 
 		 269 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0553  MscS mechanosensitive ion channel  37.7 
 
 		 874 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.362584 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2451  small-conductance mechanosensitive channel  25.29 
 
 		 380 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1752  MscS Mechanosensitive ion channel  25.23 
 
 		 356 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4427  MscS Mechanosensitive ion channel  25.97 
 
 		 349 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0238849  normal  0.125106 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2568  MscS mechanosensitive ion channel  34.34 
 
 		 358 aa  119  9e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2151  MscS mechanosensitive ion channel  33.64 
 
 		 1158 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1267  MscS mechanosensitive ion channel  31.06 
 
 		 351 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1154  hypothetical protein  28.31 
 
 		 363 aa  117  1.9999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0298455  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4932  MscS Mechanosensitive ion channel  27.44 
 
 		 400 aa  118  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2837  MscS Mechanosensitive ion channel  30.55 
 
 		 366 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.426677  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2357  hypothetical protein  26.73 
 
 		 348 aa  117  3e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.116724  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0691  MscS Mechanosensitive ion channel  25.31 
 
 		 362 aa  117  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3337  mechanosensitive channel MscS  30.67 
 
 		 284 aa  117  3e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.306942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1062  MscS Mechanosensitive ion channel  30.68 
 
 		 310 aa  117  3e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.771269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1438  MscS mechanosensitive ion channel  31.78 
 
 		 840 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.139296  normal  0.137989 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3071  hypothetical protein  27.88 
 
 		 366 aa  116  5e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.962312  normal  0.378174 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1277  MscS mechanosensitive ion channel  29.22 
 
 		 352 aa  116  6e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3468  MscS mechanosensitive ion channel  34.3 
 
 		 550 aa  116  6e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1934  mechanosensitive ion channel family protein  33.05 
 
 		 287 aa  115  6.9999999999999995e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.117079  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0905  MscS Mechanosensitive ion channel  26.46 
 
 		 373 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.285162  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00392  hypothetical protein  26.22 
 
 		 377 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.65965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2983  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  29.84 
 
 		 1144 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0887  MscS mechanosensitive ion channel  27.99 
 
 		 431 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0881194  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1059  MscS mechanosensitive ion channel  28.49 
 
 		 384 aa  115  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.196377 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1936  MscS mechanosensitive ion channel  28.96 
 
 		 413 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4338  MscS mechanosensitive ion channel  33.5 
 
 		 533 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4689  MscS Mechanosensitive ion channel  25.77 
 
 		 374 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0812  small-conductance mechanosensitive channel  37.06 
 
 		 274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3910  hypothetical protein  29.43 
 
 		 301 aa  114  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3612  MscS Mechanosensitive ion channel  25.77 
 
 		 374 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.649067 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0945  potassium efflux protein KefA  33.02 
 
 		 1115 aa  114  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.612496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1210  MscS mechanosensitive ion channel  26.74 
 
 		 344 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.224237  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0562  MscS mechanosensitive ion channel  34.3 
 
 		 551 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2381  MscS mechanosensitive ion channel  33.21 
 
 		 287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.42777  hitchhiker  0.00000285336 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0949  MscS Mechanosensitive ion channel  32.02 
 
 		 273 aa  114  2.0000000000000002e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0561  MscS mechanosensitive ion channel  34.3 
 
 		 551 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>