More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_4007 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_3357  MscS Mechanosensitive ion channel  99.2 
 
 		 376 aa  737    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4007  MscS mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 376 aa  744    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0987654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0172  MscS mechanosensitive ion channel  68.3 
 
 		 375 aa  417  9.999999999999999e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0430239  normal  0.753414 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4608  MscS mechanosensitive ion channel  62.16 
 
 		 386 aa  398  9.999999999999999e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.247282  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0691  MscS Mechanosensitive ion channel  55.81 
 
 		 362 aa  387  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2171  MscS mechanosensitive ion channel  59.28 
 
 		 374 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.920192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1822  MscS mechanosensitive ion channel  57.33 
 
 		 374 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00396347  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3649  mechanosensitive ion channel family protein  57.58 
 
 		 374 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.158368  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3360  hypothetical protein  53.22 
 
 		 374 aa  354  2e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2398  MscS mechanosensitive ion channel  52.76 
 
 		 374 aa  353  2e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3612  MscS Mechanosensitive ion channel  51.5 
 
 		 374 aa  319  3.9999999999999996e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.649067 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4689  MscS Mechanosensitive ion channel  51.5 
 
 		 374 aa  319  3.9999999999999996e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_003296  RS00392  hypothetical protein  47.48 
 
 		 377 aa  316  4e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.65965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1452  MscS mechanosensitive ion channel  44.83 
 
 		 355 aa  310  2e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.678727  normal  0.0144942 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20120  Mechanosensitive ion channel family protein  47.96 
 
 		 418 aa  286  2.9999999999999996e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1352  MscS mechanosensitive ion channel  51.41 
 
 		 376 aa  281  1e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.308859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1366  MscS Mechanosensitive ion channel  43.19 
 
 		 377 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0389612  hitchhiker  0.000813003 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1350  MscS Mechanosensitive ion channel  43.19 
 
 		 377 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000205244  normal  0.510591 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1920  MscS Mechanosensitive ion channel  43.19 
 
 		 377 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000103017  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2101  MscS Mechanosensitive ion channel  43.19 
 
 		 377 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000188968 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1381  MscS Mechanosensitive ion channel  43.19 
 
 		 377 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.524748 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0905  MscS Mechanosensitive ion channel  46.39 
 
 		 373 aa  265  1e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.285162  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4932  MscS Mechanosensitive ion channel  40.28 
 
 		 400 aa  257  2e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2152  MscS mechanosensitive ion channel  41.46 
 
 		 377 aa  256  5e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4427  MscS Mechanosensitive ion channel  43.69 
 
 		 349 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0238849  normal  0.125106 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4819  MscS mechanosensitive ion channel  34.45 
 
 		 392 aa  173  3.9999999999999995e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.749552  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0707  MscS Mechanosensitive ion channel  41.58 
 
 		 344 aa  166  5e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000854556  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0803  small mechanosensitive ion channel  29.55 
 
 		 342 aa  163  4.0000000000000004e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0075  small-conductance mechanosensitive channel  36.76 
 
 		 338 aa  157  3e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.221122  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06981  small mechanosensitive ion channel  36.76 
 
 		 338 aa  156  5.0000000000000005e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.247932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07431  small mechanosensitive ion channel  36.36 
 
 		 343 aa  156  7e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.1802 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07011  small mechanosensitive ion channel  36.54 
 
 		 343 aa  155  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.184839  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2160  MscS mechanosensitive ion channel  31.43 
 
 		 400 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0650836  normal  0.851382 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0635  small mechanosensitive ion channel  35.68 
 
 		 343 aa  153  4e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.352398  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1849  small mechanosensitive ion channel  28.99 
 
 		 340 aa  152  8.999999999999999e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  hitchhiker  0.00611524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06911  small mechanosensitive ion channel  35.21 
 
 		 343 aa  143  5e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.412375  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06621  small mechanosensitive ion channel  35.21 
 
 		 343 aa  142  8e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.16712  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2451  small-conductance mechanosensitive channel  32.27 
 
 		 380 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3246  MscS mechanosensitive ion channel  30.8 
 
 		 381 aa  127  3e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00298811  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5290  MscS mechanosensitive ion channel  31.14 
 
 		 371 aa  126  5e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.716182  normal  0.882551 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4500  MscS Mechanosensitive ion channel  34.72 
 
 		 662 aa  124  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0922  MscS mechanosensitive ion channel  33.64 
 
 		 456 aa  119  7e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.837868 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3016  MscS mechanosensitive ion channel  32.86 
 
 		 426 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0941  MscS mechanosensitive ion channel  31.07 
 
 		 467 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.884334  normal  0.631146 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1752  MscS Mechanosensitive ion channel  30.7 
 
 		 356 aa  116  6.9999999999999995e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0935  MscS Mechanosensitive ion channel  30.62 
 
 		 433 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.940167  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0938  MscS Mechanosensitive ion channel  30.62 
 
 		 433 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.466834  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0042  MscS Mechanosensitive ion channel  31.02 
 
 		 375 aa  114  3e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.634821  normal  0.103785 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0887  MscS mechanosensitive ion channel  29.61 
 
 		 431 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0881194  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4048  MscS mechanosensitive ion channel  32.37 
 
 		 569 aa  109  6e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.138882  normal  0.12233 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4194  MscS mechanosensitive ion channel  31.6 
 
 		 562 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.674763 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1277  MscS mechanosensitive ion channel  29.95 
 
 		 352 aa  107  3e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0942  MscS Mechanosensitive ion channel  28.48 
 
 		 377 aa  106  5e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000347454  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1409  MscS mechanosensitive ion channel  30.09 
 
 		 351 aa  103  7e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4003  MscS mechanosensitive ion channel  29.69 
 
 		 362 aa  101  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0737574  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1888  MscS Mechanosensitive ion channel  24.71 
 
 		 362 aa  100  5e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0689  MscS mechanosensitive ion channel  29.63 
 
 		 351 aa  100  5e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.13803  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2332  MscS Mechanosensitive ion channel  24.57 
 
 		 362 aa  99.8  7e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1500  MscS mechanosensitive ion channel  28.1 
 
 		 614 aa  99.4  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.638706  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2469  putative transport protein  30.23 
 
 		 269 aa  98.6  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1059  MscS mechanosensitive ion channel  28.74 
 
 		 384 aa  98.6  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.196377 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4873  MscS Mechanosensitive ion channel  28.37 
 
 		 567 aa  98.2  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1791  small-conductance mechanosensitive channel  28.5 
 
 		 369 aa  97.8  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0722785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0452  MscS mechanosensitive ion channel  29.95 
 
 		 283 aa  97.8  3e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00426986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1350  hypothetical protein  28.91 
 
 		 292 aa  97.1  4e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.136839  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1154  hypothetical protein  30.96 
 
 		 363 aa  97.4  4e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0298455  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002898  small-conductance mechanosensitive channel  29.86 
 
 		 532 aa  95.5  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.341732  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1504  conserved hypothetical integral membrane protein, mechanosensitive ion channel family  28.12 
 
 		 624 aa  95.9  1e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0641  hypothetical protein  28.91 
 
 		 543 aa  95.5  1e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0857  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  27 
 
 		 383 aa  95.1  2e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.017497  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1177  mechanosensitive ion channel  27 
 
 		 383 aa  95.1  2e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.180784  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3397  MscS mechanosensitive ion channel  28.57 
 
 		 291 aa  95.1  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03062  hypothetical protein  29.05 
 
 		 563 aa  95.1  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3200  MscS mechanosensitive ion channel  29.19 
 
 		 590 aa  94.7  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1267  MscS mechanosensitive ion channel  29.53 
 
 		 351 aa  94.4  3e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3304  mechanosensitive channel MscS  33.64 
 
 		 286 aa  94.4  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3307  mechanosensitive channel MscS  33.18 
 
 		 286 aa  94  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3409  mechanosensitive channel MscS  33.18 
 
 		 286 aa  94  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.427229  normal  0.109816 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3240  mechanosensitive channel MscS  33.18 
 
 		 286 aa  94  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3229  mechanosensitive channel MscS  33.18 
 
 		 286 aa  94  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.550002  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0951  MscS Mechanosensitive ion channel  28.79 
 
 		 341 aa  93.6  6e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2117  mechanosensitive ion channel family protein  34.78 
 
 		 633 aa  92.8  9e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2696  MscS Mechanosensitive ion channel  25.96 
 
 		 369 aa  92  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.415509  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0195  MscS mechanosensitive ion channel  26.19 
 
 		 354 aa  91.3  2e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.0052728  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3200  MscS Mechanosensitive ion channel  29.69 
 
 		 275 aa  91.3  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126037  normal  0.165541 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1533  MscS Mechanosensitive ion channel  31.48 
 
 		 276 aa  90.5  4e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2296  MscS mechanosensitive ion channel  31.41 
 
 		 270 aa  90.5  5e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1578  small-conductance mechanosensitive channel  27.23 
 
 		 534 aa  90.1  5e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00006998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1709  small conductance mechanosensitive channel  26.92 
 
 		 494 aa  89.7  7e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0466336 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0521  MscS mechanosensitive ion channel  26.13 
 
 		 200 aa  89.4  9e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.108923  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0253  mechanosensitive ion channel family protein  28.88 
 
 		 378 aa  89.4  9e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1462  small-conductance mechanosensitive channel protein  27.23 
 
 		 373 aa  89  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0013  mechanosensitive ion channel family protein  34.29 
 
 		 682 aa  89.4  1e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0910  MscS mechanosensitive ion channel  22.52 
 
 		 400 aa  89.4  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.505459  normal  0.0192096 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1942  MscS mechanosensitive ion channel  24.36 
 
 		 360 aa  88.2  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3803  MscS mechanosensitive ion channel  26.44 
 
 		 549 aa  88.2  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.717222  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1438  MscS mechanosensitive ion channel  23.64 
 
 		 840 aa  88.2  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.139296  normal  0.137989 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3719  MscS mechanosensitive ion channel  27.88 
 
 		 538 aa  88.2  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00173633  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3747  MscS Mechanosensitive ion channel  26.44 
 
 		 549 aa  87.8  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1943  MscS mechanosensitive ion channel  26.44 
 
 		 533 aa  88.2  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000658199  decreased coverage  0.00758396 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>